EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000034076 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 483 bases
Position: chrGL873613.1:4823796-4824278
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000018721	Ribosomal_L21e	PF01157.18	2.6e-47	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000027437	-	483	-	ENSOGAP00000018721	160 (aa)	-	H0XRH9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000034076	-	100	86.875	ENSOGAG00000024836	-	100	86.875
ENSOGAG00000034076	-	100	90.625	ENSOGAG00000033479	-	100	90.625
ENSOGAG00000034076	-	97	71.613	ENSOGAG00000012452	-	97	71.613
ENSOGAG00000034076	-	98	84.615	ENSOGAG00000027182	-	98	84.615
ENSOGAG00000034076	-	99	74.684	ENSOGAG00000033936	-	99	74.684
ENSOGAG00000034076	-	93	77.027	ENSOGAG00000025213	-	100	77.027
ENSOGAG00000034076	-	95	61.184	ENSOGAG00000031179	-	94	61.184
ENSOGAG00000034076	-	93	86.486	ENSOGAG00000010179	-	100	86.486
ENSOGAG00000034076	-	98	87.179	ENSOGAG00000030812	-	98	87.179
ENSOGAG00000034076	-	99	67.485	ENSOGAG00000000555	-	99	67.485
ENSOGAG00000034076	-	100	85.625	ENSOGAG00000026698	-	100	85.625
ENSOGAG00000034076	-	100	81.875	ENSOGAG00000030151	-	98	81.875
ENSOGAG00000034076	-	92	86.395	ENSOGAG00000000212	-	100	86.395
ENSOGAG00000034076	-	100	86.875	ENSOGAG00000026636	-	100	86.875
ENSOGAG00000034076	-	93	77.181	ENSOGAG00000034423	-	93	77.181
ENSOGAG00000034076	-	100	89.375	ENSOGAG00000027159	-	100	89.375
ENSOGAG00000034076	-	93	73.154	ENSOGAG00000033882	-	100	73.154
ENSOGAG00000034076	-	83	68.421	ENSOGAG00000032000	-	98	63.636
ENSOGAG00000034076	-	100	83.125	ENSOGAG00000030115	-	100	83.125
ENSOGAG00000034076	-	82	90.076	ENSOGAG00000008181	-	100	90.076
ENSOGAG00000034076	-	99	74.684	ENSOGAG00000032866	-	99	74.684
ENSOGAG00000034076	-	100	88.750	ENSOGAG00000029441	-	100	88.750
ENSOGAG00000034076	-	93	71.895	ENSOGAG00000032711	-	100	71.895
ENSOGAG00000034076	-	80	83.594	ENSOGAG00000034285	-	100	83.594
ENSOGAG00000034076	-	97	74.839	ENSOGAG00000034390	-	100	74.839

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000034076	-	100	90.625	ENSG00000122026	RPL21	100	90.625	Homo_sapiens
ENSOGAG00000034076	-	100	79.375	ENSAPOG00000024402	rpl21	100	79.375	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000034076	-	100	73.292	ENSAMEG00000004710	-	100	73.292	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000034076	-	51	86.420	ENSAMEG00000016455	-	100	84.270	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000034076	-	100	59.375	ENSAMEG00000004632	-	100	59.375	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000034076	-	100	87.500	ENSAMEG00000018663	RPL21	98	87.500	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000034076	-	100	80.000	ENSACIG00000021885	rpl21	100	80.000	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000034076	-	100	79.375	ENSAOCG00000017829	rpl21	100	79.375	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000034076	-	100	79.375	ENSAPEG00000019936	rpl21	100	79.375	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000034076	-	100	80.000	ENSATEG00000010524	rpl21	100	80.000	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000034076	-	100	85.000	ENSAPLG00000005641	RPL21	98	85.000	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000034076	-	100	84.375	ENSACAG00000003169	RPL21	100	84.375	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000034076	-	100	89.375	ENSANAG00000031513	-	100	89.375	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000034076	-	100	85.625	ENSANAG00000019962	-	100	85.625	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000034076	-	100	88.125	ENSANAG00000020005	-	100	88.125	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000034076	-	100	88.750	ENSANAG00000006331	-	100	88.750	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000034076	-	100	90.625	ENSANAG00000031230	-	100	90.625	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000034076	-	100	90.625	ENSANAG00000023031	-	100	90.625	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000034076	-	97	89.677	ENSANAG00000012283	-	100	89.677	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000034076	-	100	80.000	ENSACLG00000026444	rpl21	100	80.000	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000034076	-	100	78.125	ENSAMXG00000041892	rpl21	100	78.125	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000034076	-	100	89.375	ENSBTAG00000001648	RPL21	100	89.375	Bos_taurus
ENSOGAG00000034076	-	100	88.750	ENSBTAG00000038379	-	100	88.750	Bos_taurus
ENSOGAG00000034076	-	51	83.951	ENSBTAG00000048537	-	84	83.951	Bos_taurus
ENSOGAG00000034076	-	100	56.522	WBGene00004433	rpl-21	100	56.522	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000034076	-	100	84.375	ENSCJAG00000019734	-	100	84.375	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000034076	-	100	89.375	ENSCJAG00000038205	-	100	89.375	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000034076	-	100	65.625	ENSCJAG00000044477	-	100	65.625	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000034076	-	67	75.701	ENSCJAG00000041707	-	98	75.701	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000034076	-	83	88.722	ENSCJAG00000044684	-	93	88.722	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000034076	-	92	89.796	ENSCJAG00000039102	-	100	89.796	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000034076	-	100	74.375	ENSCJAG00000044730	-	100	74.375	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000034076	-	100	90.625	ENSCJAG00000043116	-	100	90.625	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000034076	-	99	84.277	ENSCAFG00000001564	-	99	84.277	Canis_familiaris
ENSOGAG00000034076	-	100	90.000	ENSCAFG00000008805	-	100	90.000	Canis_familiaris
ENSOGAG00000034076	-	100	89.375	ENSCAFG00000028744	-	100	89.375	Canis_familiaris
ENSOGAG00000034076	-	96	58.228	ENSCAFG00000018881	-	97	58.861	Canis_familiaris
ENSOGAG00000034076	-	99	64.557	ENSCAFG00000024055	-	99	64.557	Canis_familiaris
ENSOGAG00000034076	-	100	90.000	ENSCAFG00000015987	-	100	90.000	Canis_familiaris
ENSOGAG00000034076	-	100	89.506	ENSCAFG00000006810	RPL21	100	89.506	Canis_familiaris
ENSOGAG00000034076	-	73	88.034	ENSCAFG00000029659	-	99	88.034	Canis_familiaris
ENSOGAG00000034076	-	100	89.375	ENSCAFG00000032537	-	100	89.375	Canis_familiaris
ENSOGAG00000034076	-	76	84.298	ENSCAFG00000015533	-	88	84.298	Canis_familiaris
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ENSOGAG00000034076	-	100	90.625	ENSCAFG00020024203	-	100	90.625	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000034076	-	100	89.375	ENSCAFG00020011527	-	100	89.375	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000034076	-	100	89.375	ENSCAFG00020026205	-	100	89.375	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000034076	-	100	90.625	ENSCAFG00020004535	-	100	90.625	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000034076	-	100	89.375	ENSCAFG00020020914	-	100	89.375	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000034076	-	100	91.250	ENSCAFG00020024181	-	100	91.250	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000034076	-	100	90.625	ENSCAFG00020025313	-	100	90.625	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000034076	-	100	89.375	ENSCAFG00020008146	-	100	89.375	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000034076	-	100	89.375	ENSCAFG00020012834	-	100	89.375	Canis_lupus_dingo
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ENSOGAG00000034076	-	51	85.185	ENSCHIG00000012074	-	68	85.185	Capra_hircus
ENSOGAG00000034076	-	100	86.250	ENSCHIG00000010112	-	100	86.250	Capra_hircus
ENSOGAG00000034076	-	100	89.375	ENSCHIG00000019833	-	100	89.375	Capra_hircus
ENSOGAG00000034076	-	100	82.500	ENSCHIG00000008368	-	100	82.500	Capra_hircus
ENSOGAG00000034076	-	100	89.375	ENSCHIG00000021720	RPL21	100	89.375	Capra_hircus
ENSOGAG00000034076	-	100	86.250	ENSCHIG00000009094	-	100	86.250	Capra_hircus
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ENSOGAG00000034076	-	51	83.951	ENSTSYG00000036592	-	92	83.951	Carlito_syrichta
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ENSOGAG00000034076	-	100	90.625	ENSTSYG00000007868	-	100	90.625	Carlito_syrichta
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ENSOGAG00000034076	-	100	86.875	ENSTSYG00000028179	-	100	86.875	Carlito_syrichta
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ENSOGAG00000034076	-	100	80.745	ENSCPOG00000023041	-	100	80.745	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000034076	-	100	90.625	ENSCPOG00000008784	RPL21	100	90.625	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000034076	-	92	78.912	ENSCPOG00000022769	-	100	78.912	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000034076	-	100	81.250	ENSCCAG00000033290	-	100	81.250	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000034076	-	100	90.625	ENSCCAG00000031101	-	100	90.625	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000034076	-	100	90.000	ENSCCAG00000000258	-	100	90.000	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000034076	-	99	90.566	ENSCCAG00000009412	-	96	90.566	Cebus_capucinus
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ENSOGAG00000034076	-	100	86.250	ENSCATG00000005782	-	100	86.250	Cercocebus_atys
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ENSOGAG00000034076	-	100	68.750	ENSCLAG00000009326	-	100	68.750	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000034076	-	100	76.250	ENSCLAG00000009584	-	100	76.250	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000034076	-	100	90.625	ENSCLAG00000003656	Rpl21	100	90.625	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000034076	-	100	71.875	ENSCLAG00000001174	-	100	71.875	Chinchilla_lanigera
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ENSOGAG00000034076	-	100	90.625	ENSMMUG00000028889	-	100	90.625	Macaca_mulatta
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ENSOGAG00000034076	-	86	76.087	ENSMMOG00000002967	rpl21	97	76.087	Mola_mola
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ENSOGAG00000034076	-	85	77.206	ENSMALG00000021841	rpl21	86	77.206	Monopterus_albus
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ENSOGAG00000034076	-	100	88.750	ENSNLEG00000033807	-	100	88.750	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000034076	-	55	85.227	ENSMEUG00000006895	-	100	85.227	Notamacropus_eugenii
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ENSOGAG00000034076	-	100	80.625	ENSORLG00020014331	rpl21	100	80.625	Oryzias_latipes_hni
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