EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSOMEG00000000660 (Gene tree)
Gene ID: 112140640
Gene Symbol: aco1
Alias: -
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_melastigma
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 41316 bases
Position: chrNVQA01005203.1:514591-555906
Accession: 112140640
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOMEP00000026015	Aconitase	PF00330.20	2.2e-179	1	1
ENSOMEP00000026015	Aconitase_C	PF00694.19	1.2e-43	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOMET00000005641	-	3496	-	ENSOMEP00000026015	892 (aa)	XP_024119406	UPI000CF817A2

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOMEG00000000660	aco1	99	60.345	ENSOMEG00000005120	ireb2	90	60.345

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.339	ENSG00000122729	ACO1	99	80.339	Homo_sapiens
ENSOMEG00000000660	aco1	99	88.103	ENSAPOG00000008670	aco1	99	88.103	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.248	ENSAMEG00000003746	ACO1	99	80.248	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOMEG00000000660	aco1	99	88.328	ENSACIG00000014377	aco1	99	88.328	Amphilophus_citrinellus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	88.552	ENSAOCG00000007699	aco1	99	88.552	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000000660	aco1	99	88.440	ENSAPEG00000014370	aco1	99	88.440	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000000660	aco1	99	89.226	ENSATEG00000000560	aco1	99	89.226	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.435	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	79.435	Anas_platyrhynchos
ENSOMEG00000000660	aco1	95	79.318	ENSACAG00000001541	ACO1	99	79.318	Anolis_carolinensis
ENSOMEG00000000660	aco1	99	78.757	ENSANAG00000003359	ACO1	99	78.757	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000000660	aco1	99	87.879	ENSACLG00000007755	aco1	99	87.879	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000000660	aco1	99	84.520	ENSAMXG00000002499	aco1	99	84.520	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.113	ENSBTAG00000000555	ACO1	99	80.113	Bos_taurus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.548	ENSCJAG00000007687	ACO1	99	79.548	Callithrix_jacchus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.910	ENSCAFG00000001786	ACO1	98	79.910	Canis_familiaris
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.000	ENSCAFG00020014553	ACO1	99	80.000	Canis_lupus_dingo
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.339	ENSCHIG00000007667	ACO1	99	80.339	Capra_hircus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.678	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	80.678	Carlito_syrichta
ENSOMEG00000000660	aco1	99	65.576	ENSCAPG00000007254	ACO1	99	65.463	Cavia_aperea
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.135	ENSCPOG00000003768	ACO1	99	80.135	Cavia_porcellus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.209	ENSCCAG00000022465	ACO1	99	79.209	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.226	ENSCATG00000045333	ACO1	99	80.226	Cercocebus_atys
ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.797	ENSCLAG00000002487	ACO1	99	79.797	Chinchilla_lanigera
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.226	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	80.226	Chlorocebus_sabaeus
ENSOMEG00000000660	aco1	90	63.118	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	62.952	Choloepus_hoffmanni
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.339	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	80.339	Chrysemys_picta_bellii
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.204	ENSCANG00000014847	ACO1	99	80.204	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.038	ENSCGRG00001024337	Aco1	99	81.038	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.248	ENSCGRG00000004877	-	99	80.248	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOMEG00000000660	aco1	99	84.400	ENSCSEG00000018262	aco1	99	84.400	Cynoglossus_semilaevis
ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.930	ENSCVAG00000020264	aco1	99	81.930	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	83.616	ENSDARG00000026376	aco1	99	83.616	Danio_rerio
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.226	ENSDNOG00000003951	ACO1	99	80.226	Dasypus_novemcinctus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.264	ENSDORG00000014246	Aco1	99	81.264	Dipodomys_ordii
ENSOMEG00000000660	aco1	85	64.171	ENSETEG00000012415	-	84	64.171	Echinops_telfairi
ENSOMEG00000000660	aco1	99	56.342	ENSEBUG00000015441	aco1	97	56.342	Eptatretus_burgeri
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.452	ENSEASG00005004602	ACO1	99	80.452	Equus_asinus_asinus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.339	ENSECAG00000014846	ACO1	99	80.339	Equus_caballus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	69.266	ENSEEUG00000015174	ACO1	99	69.266	Erinaceus_europaeus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	84.520	ENSELUG00000016812	aco1	97	84.520	Esox_lucius
ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.548	ENSFCAG00000001293	ACO1	99	79.548	Felis_catus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.000	ENSFALG00000001167	ACO1	99	80.000	Ficedula_albicollis
ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.797	ENSFDAG00000016058	ACO1	99	79.797	Fukomys_damarensis
ENSOMEG00000000660	aco1	99	87.162	ENSFHEG00000005619	aco1	99	87.162	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	82.340	ENSGMOG00000005514	aco1	99	82.340	Gadus_morhua
ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.774	ENSGALG00000002162	ACO1	99	79.774	Gallus_gallus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	87.430	ENSGACG00000001637	aco1	99	87.430	Gasterosteus_aculeatus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.226	ENSGAGG00000023315	ACO1	99	80.226	Gopherus_agassizii
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.226	ENSGGOG00000016306	ACO1	99	80.226	Gorilla_gorilla
ENSOMEG00000000660	aco1	99	87.767	ENSHBUG00000008952	aco1	99	87.767	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.910	ENSHGLG00000018922	Aco1	99	79.910	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.910	ENSHGLG00100000149	Aco1	99	79.910	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000000660	aco1	99	84.287	ENSHCOG00000015881	aco1	99	84.287	Hippocampus_comes
ENSOMEG00000000660	aco1	99	82.938	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.938	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.151	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	81.151	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.926	ENSJJAG00000013824	Aco1	99	80.926	Jaculus_jaculus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	88.103	ENSKMAG00000015759	aco1	99	88.103	Kryptolebias_marmoratus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	82.960	ENSLBEG00000013866	aco1	99	82.960	Labrus_bergylta
ENSOMEG00000000660	aco1	75	67.459	ENSLACG00000000936	ACO1	99	67.265	Latimeria_chalumnae
ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.038	ENSLOCG00000011082	aco1	99	81.038	Lepisosteus_oculatus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	78.079	ENSLAFG00000013470	ACO1	99	78.079	Loxodonta_africana
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.113	ENSMFAG00000001702	ACO1	99	80.113	Macaca_fascicularis
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.226	ENSMMUG00000008196	ACO1	99	80.226	Macaca_mulatta
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.000	ENSMNEG00000045040	ACO1	99	80.000	Macaca_nemestrina
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.113	ENSMLEG00000005636	ACO1	99	80.113	Mandrillus_leucophaeus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	89.450	ENSMAMG00000002915	aco1	99	89.450	Mastacembelus_armatus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	84.263	ENSMZEG00005012733	aco1	99	83.929	Maylandia_zebra
ENSOMEG00000000660	aco1	99	64.922	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	64.922	Meleagris_gallopavo
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.700	ENSMAUG00000021408	Aco1	99	80.700	Mesocricetus_auratus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.452	ENSMICG00000006540	ACO1	99	80.452	Microcebus_murinus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.926	ENSMOCG00000015393	Aco1	99	80.926	Microtus_ochrogaster
ENSOMEG00000000660	aco1	99	86.795	ENSMMOG00000020282	aco1	99	86.795	Mola_mola
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.904	ENSMODG00000004463	ACO1	99	80.904	Monodelphis_domestica
ENSOMEG00000000660	aco1	99	88.889	ENSMALG00000019764	aco1	99	88.889	Monopterus_albus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.490	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	99	81.490	Mus_caroli
ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.603	ENSMUSG00000028405	Aco1	99	81.603	Mus_musculus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.151	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	81.151	Mus_pahari
ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.490	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	81.490	Mus_spretus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.226	ENSMPUG00000004340	ACO1	99	80.226	Mustela_putorius_furo
ENSOMEG00000000660	aco1	99	78.531	ENSMLUG00000003029	ACO1	99	78.531	Myotis_lucifugus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.813	ENSNGAG00000005703	Aco1	99	80.813	Nannospalax_galili
ENSOMEG00000000660	aco1	99	64.725	ENSNBRG00000008973	aco1	99	64.505	Neolamprologus_brichardi
ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.887	ENSNLEG00000003409	ACO1	99	79.887	Nomascus_leucogenys
ENSOMEG00000000660	aco1	89	74.429	ENSMEUG00000014756	ACO1	89	74.429	Notamacropus_eugenii
ENSOMEG00000000660	aco1	99	76.949	ENSOPRG00000016791	ACO1	99	76.949	Ochotona_princeps
ENSOMEG00000000660	aco1	99	75.621	ENSODEG00000015432	-	99	75.282	Octodon_degus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	77.765	ENSODEG00000001240	-	99	77.765	Octodon_degus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	88.215	ENSONIG00000019869	aco1	99	88.215	Oreochromis_niloticus
ENSOMEG00000000660	aco1	81	80.721	ENSOANG00000012132	ACO1	99	80.721	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.888	ENSOCUG00000015960	ACO1	99	79.665	Oryctolagus_cuniculus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	93.341	ENSORLG00000020656	aco1	99	93.341	Oryzias_latipes
ENSOMEG00000000660	aco1	99	93.341	ENSORLG00020010991	aco1	99	93.341	Oryzias_latipes_hni
ENSOMEG00000000660	aco1	99	93.603	ENSORLG00015011785	aco1	99	93.603	Oryzias_latipes_hsok
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.565	ENSOGAG00000010522	ACO1	99	80.565	Otolemur_garnettii
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.339	ENSOARG00000014707	ACO1	98	80.339	Ovis_aries
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.339	ENSPPAG00000033498	ACO1	99	80.339	Pan_paniscus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.661	ENSPPRG00000009875	ACO1	99	79.661	Panthera_pardus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.548	ENSPTIG00000016606	ACO1	98	79.548	Panthera_tigris_altaica
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.339	ENSPTRG00000020843	ACO1	99	80.339	Pan_troglodytes
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.113	ENSPANG00000025270	ACO1	99	80.113	Papio_anubis
ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.369	ENSPKIG00000023168	aco1	99	81.369	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.113	ENSPSIG00000008030	ACO1	99	80.113	Pelodiscus_sinensis
ENSOMEG00000000660	aco1	99	87.318	ENSPMGG00000020708	aco1	99	87.318	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.038	ENSPEMG00000018464	Aco1	99	81.038	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOMEG00000000660	aco1	99	78.668	ENSPCIG00000029321	ACO1	99	79.609	Phascolarctos_cinereus
ENSOMEG00000000660	aco1	100	87.892	ENSPFOG00000013405	aco1	99	87.892	Poecilia_formosa
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ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.774	ENSPPYG00000019150	ACO1	95	79.774	Pongo_abelii
ENSOMEG00000000660	aco1	77	85.849	ENSPCAG00000013222	ACO1	91	85.849	Procavia_capensis
ENSOMEG00000000660	aco1	88	81.472	ENSPCOG00000021198	ACO1	99	81.472	Propithecus_coquereli
ENSOMEG00000000660	aco1	96	74.503	ENSPVAG00000002372	ACO1	99	74.503	Pteropus_vampyrus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	87.767	ENSPNYG00000009425	aco1	99	87.767	Pundamilia_nyererei
ENSOMEG00000000660	aco1	99	84.181	ENSPNAG00000017918	aco1	99	84.181	Pygocentrus_nattereri
ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.813	ENSRNOG00000005849	Aco1	99	80.813	Rattus_norvegicus
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ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.000	ENSRROG00000042672	ACO1	99	80.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.548	ENSSBOG00000026008	ACO1	99	79.548	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.707	ENSSHAG00000008924	ACO1	99	79.707	Sarcophilus_harrisii
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ENSOMEG00000000660	aco1	75	88.323	ENSSMAG00000018908	aco1	80	88.253	Scophthalmus_maximus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	89.113	ENSSDUG00000002984	aco1	99	89.113	Seriola_dumerili
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ENSOMEG00000000660	aco1	50	90.045	ENSXCOG00000005638	aco1	96	90.045	Xiphophorus_couchianus
ENSOMEG00000000660	aco1	99	87.879	ENSXMAG00000023603	aco1	99	87.879	Xiphophorus_maculatus