EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOMEG00000001230 (Gene tree)
Gene ID: 112145084
Gene Symbol: rybpb
Alias: -
Full Name: RING1 and YY1 binding protein
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_melastigma
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 23295 bases
Position: chrNVQA01000009.1:24614111-24637405
Accession: 112145084
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOMEP00000021960	zf-RanBP	PF00641.18	5.2e-07	1	1
ENSOMEP00000000336	zf-RanBP	PF00641.18	7.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOMET00000016013	-	4293	-	ENSOMEP00000000336	414 (aa)	-	-
ENSOMET00000016011	-	3855	XM_024270116	ENSOMEP00000021960	268 (aa)	XP_024125884	UPI000CF81167

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOMEG00000001230	rybpb	57	78.873	ENSOMEG00000010094	YAF2	99	41.418
ENSOMEG00000001230	rybpb	56	73.611	ENSOMEG00000000289	yaf2	96	39.231

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOMEG00000001230	rybpb	97	59.615	ENSG00000163602	RYBP	99	61.923	Homo_sapiens
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	80.282	ENSG00000015153	YAF2	98	78.182	Homo_sapiens
ENSOMEG00000001230	rybpb	54	81.690	ENSAPOG00000016986	YAF2	99	42.751	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	91.045	ENSAPOG00000014342	rybpb	100	91.045	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000001230	rybpb	99	41.264	ENSAPOG00000012651	yaf2	99	39.777	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000001230	rybpb	53	81.481	ENSAMEG00000013846	YAF2	99	56.818	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOMEG00000001230	rybpb	97	62.835	ENSAMEG00000015131	RYBP	70	61.364	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	70.149	ENSACIG00000021280	rybpb	99	73.507	Amphilophus_citrinellus
ENSOMEG00000001230	rybpb	57	80.282	ENSACIG00000002635	YAF2	99	43.123	Amphilophus_citrinellus
ENSOMEG00000001230	rybpb	99	41.264	ENSAOCG00000015759	yaf2	99	39.777	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	90.672	ENSAOCG00000001679	rybpb	100	90.672	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000001230	rybpb	57	81.690	ENSAOCG00000024572	YAF2	99	43.494	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000001230	rybpb	99	41.264	ENSAPEG00000017939	yaf2	99	39.777	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000001230	rybpb	55	81.690	ENSAPEG00000005856	YAF2	99	43.494	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	90.672	ENSAPEG00000021704	rybpb	100	90.672	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	89.179	ENSATEG00000008482	rybpb	100	89.179	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000001230	rybpb	54	81.690	ENSATEG00000018504	YAF2	96	44.656	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000001230	rybpb	99	41.636	ENSATEG00000012513	yaf2	99	40.149	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000001230	rybpb	97	62.977	ENSAPLG00000013882	RYBP	97	62.977	Anas_platyrhynchos
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	61.338	ENSACAG00000014789	RYBP	99	63.569	Anolis_carolinensis
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	80.282	ENSACAG00000003204	YAF2	99	60.952	Anolis_carolinensis
ENSOMEG00000001230	rybpb	61	64.444	ENSANAG00000021963	YAF2	99	39.259	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	60.967	ENSANAG00000027832	RYBP	99	63.197	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000001230	rybpb	58	82.192	ENSACLG00000000456	YAF2	99	42.751	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	90.672	ENSACLG00000023062	rybpb	100	90.672	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	73.611	ENSACLG00000001098	yaf2	99	40.520	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000001230	rybpb	94	82.143	ENSAMXG00000043350	rybpa	63	82.143	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000001230	rybpb	56	77.465	ENSAMXG00000035723	YAF2	95	41.538	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	78.873	ENSAMXG00000036088	YAF2	99	43.123	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	71.269	ENSAMXG00000034604	rybpb	100	74.182	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	60.967	ENSBTAG00000022689	RYBP	99	63.197	Bos_taurus
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	80.282	ENSBTAG00000015025	YAF2	99	60.952	Bos_taurus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	60.967	ENSCJAG00000045849	RYBP	99	63.197	Callithrix_jacchus
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	80.282	ENSCJAG00000017762	YAF2	85	77.193	Callithrix_jacchus
ENSOMEG00000001230	rybpb	97	59.770	ENSCAFG00000006441	RYBP	94	60.741	Canis_familiaris
ENSOMEG00000001230	rybpb	56	56.322	ENSCAFG00000009789	YAF2	99	37.786	Canis_familiaris
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	60.967	ENSCAFG00020016734	RYBP	99	63.197	Canis_lupus_dingo
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	60.967	ENSCHIG00000026041	RYBP	99	63.197	Capra_hircus
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	80.282	ENSCHIG00000025941	YAF2	99	60.952	Capra_hircus
ENSOMEG00000001230	rybpb	56	77.419	ENSCPOG00000015156	YAF2	100	56.701	Cavia_porcellus
ENSOMEG00000001230	rybpb	96	59.459	ENSCPOG00000032177	RYBP	95	61.776	Cavia_porcellus
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	80.282	ENSCCAG00000018849	YAF2	85	77.193	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	60.967	ENSCCAG00000025583	RYBP	99	63.197	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000001230	rybpb	61	80.282	ENSCATG00000034263	YAF2	85	77.193	Cercocebus_atys
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	60.967	ENSCATG00000034872	RYBP	99	63.197	Cercocebus_atys
ENSOMEG00000001230	rybpb	97	59.615	ENSCLAG00000006008	RYBP	100	61.923	Chinchilla_lanigera
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	60.967	ENSCSAG00000011518	RYBP	99	63.197	Chlorocebus_sabaeus
ENSOMEG00000001230	rybpb	66	47.458	ENSCHOG00000011528	RYBP	100	50.847	Choloepus_hoffmanni
ENSOMEG00000001230	rybpb	52	81.132	ENSCHOG00000002266	YAF2	100	56.322	Choloepus_hoffmanni
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	80.282	ENSCPBG00000015509	YAF2	95	82.692	Chrysemys_picta_bellii
ENSOMEG00000001230	rybpb	97	62.977	ENSCPBG00000006439	RYBP	88	63.218	Chrysemys_picta_bellii
ENSOMEG00000001230	rybpb	61	80.282	ENSCANG00000042756	YAF2	85	77.193	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOMEG00000001230	rybpb	99	57.934	ENSCANG00000013251	RYBP	99	60.148	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	61.710	ENSCGRG00001020152	Rybp	99	63.569	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	80.282	ENSCGRG00001021765	Yaf2	99	60.952	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOMEG00000001230	rybpb	97	60.536	ENSCGRG00000009553	Rybp	93	61.567	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOMEG00000001230	rybpb	99	41.111	ENSCSEG00000010509	yaf2	99	39.630	Cynoglossus_semilaevis
ENSOMEG00000001230	rybpb	57	80.282	ENSCSEG00000004331	YAF2	99	42.751	Cynoglossus_semilaevis
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	84.229	ENSCSEG00000007805	rybpb	100	84.229	Cynoglossus_semilaevis
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	73.611	ENSCVAG00000001056	yaf2	99	39.033	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	88.433	ENSCVAG00000020045	rybpb	100	88.433	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000001230	rybpb	56	77.465	ENSCVAG00000002793	YAF2	90	65.169	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	74.539	ENSDARG00000053459	rybpb	100	74.908	Danio_rerio
ENSOMEG00000001230	rybpb	85	75.229	ENSDARG00000037773	rybpa	64	68.148	Danio_rerio
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	78.378	ENSDARG00000015966	yaf2	99	42.379	Danio_rerio
ENSOMEG00000001230	rybpb	55	76.667	ENSDORG00000024619	Yaf2	100	55.319	Dipodomys_ordii
ENSOMEG00000001230	rybpb	97	57.692	ENSDORG00000015021	Rybp	96	59.231	Dipodomys_ordii
ENSOMEG00000001230	rybpb	50	63.636	ENSEBUG00000010088	RYBP	52	65.789	Eptatretus_burgeri
ENSOMEG00000001230	rybpb	51	73.846	ENSEBUG00000004738	RYBP	62	71.875	Eptatretus_burgeri
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	60.967	ENSEASG00005002228	RYBP	99	63.197	Equus_asinus_asinus
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	80.282	ENSEASG00005023490	YAF2	99	61.905	Equus_asinus_asinus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	60.967	ENSECAG00000000266	RYBP	99	63.197	Equus_caballus
ENSOMEG00000001230	rybpb	51	59.854	ENSEEUG00000011620	-	100	55.556	Erinaceus_europaeus
ENSOMEG00000001230	rybpb	51	82.353	ENSEEUG00000004713	YAF2	100	56.471	Erinaceus_europaeus
ENSOMEG00000001230	rybpb	66	65.591	ENSELUG00000020855	yaf2	94	65.591	Esox_lucius
ENSOMEG00000001230	rybpb	99	44.074	ENSELUG00000009802	YAF2	99	43.333	Esox_lucius
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	72.963	ENSELUG00000003503	rybpb	92	92.857	Esox_lucius
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	80.282	ENSFCAG00000030082	YAF2	99	60.952	Felis_catus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	60.967	ENSFCAG00000043691	RYBP	99	63.197	Felis_catus
ENSOMEG00000001230	rybpb	96	62.934	ENSFALG00000013425	RYBP	84	63.218	Ficedula_albicollis
ENSOMEG00000001230	rybpb	98	58.712	ENSFDAG00000012183	RYBP	100	61.923	Fukomys_damarensis
ENSOMEG00000001230	rybpb	99	40.892	ENSFHEG00000007387	yaf2	99	39.405	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000001230	rybpb	58	81.690	ENSFHEG00000005397	YAF2	91	75.000	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	88.806	ENSFHEG00000017560	rybpb	100	88.806	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000001230	rybpb	82	92.000	ENSGMOG00000007374	rybpb	75	92.000	Gadus_morhua
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	80.282	ENSGALG00000009540	YAF2	99	60.952	Gallus_gallus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	64.312	ENSGALG00000033025	RYBP	99	64.312	Gallus_gallus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	89.925	ENSGAFG00000015676	rybpb	100	89.925	Gambusia_affinis
ENSOMEG00000001230	rybpb	57	78.873	ENSGAFG00000001176	YAF2	96	72.619	Gambusia_affinis
ENSOMEG00000001230	rybpb	82	67.778	ENSGAFG00000017418	yaf2	94	63.333	Gambusia_affinis
ENSOMEG00000001230	rybpb	63	61.342	ENSGACG00000011809	rybpb	100	63.190	Gasterosteus_aculeatus
ENSOMEG00000001230	rybpb	51	72.993	ENSGAGG00000004755	RYBP	91	63.218	Gopherus_agassizii
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	80.282	ENSGAGG00000000538	YAF2	99	60.952	Gopherus_agassizii
ENSOMEG00000001230	rybpb	56	77.419	ENSGGOG00000007230	-	99	57.292	Gorilla_gorilla
ENSOMEG00000001230	rybpb	58	82.192	ENSHBUG00000001690	YAF2	99	42.751	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	73.611	ENSHBUG00000006345	yaf2	99	40.520	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	90.299	ENSHBUG00000010844	rybpb	100	90.299	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	80.282	ENSHGLG00000001299	YAF2	99	60.952	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000001230	rybpb	99	52.273	ENSHGLG00000009354	-	99	52.273	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	60.967	ENSHGLG00000003273	RYBP	99	63.197	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000001230	rybpb	99	52.273	ENSHGLG00100001264	-	99	52.273	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000001230	rybpb	52	81.132	ENSHGLG00100016138	YAF2	96	56.818	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000001230	rybpb	97	62.835	ENSHGLG00100010608	-	96	61.923	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	85.978	ENSHCOG00000010777	rybpb	100	85.978	Hippocampus_comes
ENSOMEG00000001230	rybpb	54	82.192	ENSHCOG00000006027	YAF2	82	72.222	Hippocampus_comes
ENSOMEG00000001230	rybpb	97	43.130	ENSHCOG00000009074	yaf2	95	41.221	Hippocampus_comes
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	61.852	ENSIPUG00000007091	rybpa	99	81.609	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	75.093	ENSIPUG00000001221	rybpb	100	75.093	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	80.282	ENSSTOG00000007224	YAF2	99	60.952	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOMEG00000001230	rybpb	51	70.073	ENSJJAG00000017045	Rybp	100	61.538	Jaculus_jaculus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	90.299	ENSKMAG00000004423	rybpb	100	90.299	Kryptolebias_marmoratus
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ENSOMEG00000001230	rybpb	100	61.710	ENSMUSG00000072872	Rybp	99	63.569	Mus_musculus
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ENSOMEG00000001230	rybpb	100	91.418	ENSSLDG00000013888	rybpb	100	91.418	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOMEG00000001230	rybpb	99	41.111	ENSSLDG00000012171	yaf2	99	39.630	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOMEG00000001230	rybpb	55	81.081	ENSSLDG00000022945	YAF2	98	84.615	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	80.282	ENSSPUG00000009968	YAF2	99	60.952	Sphenodon_punctatus
ENSOMEG00000001230	rybpb	99	41.636	ENSSPAG00000013452	yaf2	99	40.149	Stegastes_partitus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	90.672	ENSSPAG00000004173	rybpb	100	90.672	Stegastes_partitus
ENSOMEG00000001230	rybpb	54	81.690	ENSSPAG00000003132	YAF2	89	43.494	Stegastes_partitus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	60.967	ENSSSCG00000025053	RYBP	99	63.197	Sus_scrofa
ENSOMEG00000001230	rybpb	61	80.282	ENSSSCG00000031775	YAF2	99	68.817	Sus_scrofa
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	80.282	ENSTGUG00000005817	YAF2	99	60.952	Taeniopygia_guttata
ENSOMEG00000001230	rybpb	97	62.977	ENSTGUG00000009932	-	99	63.218	Taeniopygia_guttata
ENSOMEG00000001230	rybpb	70	76.136	ENSTRUG00000016786	YAF2	97	76.136	Takifugu_rubripes
ENSOMEG00000001230	rybpb	81	94.828	ENSTRUG00000009347	rybpb	100	66.352	Takifugu_rubripes
ENSOMEG00000001230	rybpb	99	41.573	ENSTRUG00000016767	yaf2	99	41.111	Takifugu_rubripes
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	86.245	ENSTNIG00000007355	rybpb	100	86.245	Tetraodon_nigroviridis
ENSOMEG00000001230	rybpb	99	41.573	ENSTNIG00000018505	yaf2	99	40.075	Tetraodon_nigroviridis
ENSOMEG00000001230	rybpb	97	59.770	ENSTBEG00000003789	RYBP	100	62.069	Tupaia_belangeri
ENSOMEG00000001230	rybpb	56	79.032	ENSTTRG00000001376	YAF2	99	57.895	Tursiops_truncatus
ENSOMEG00000001230	rybpb	97	59.770	ENSTTRG00000005375	RYBP	100	62.069	Tursiops_truncatus
ENSOMEG00000001230	rybpb	95	58.594	ENSUAMG00000008323	RYBP	99	60.938	Ursus_americanus
ENSOMEG00000001230	rybpb	59	76.389	ENSUAMG00000016872	YAF2	90	78.846	Ursus_americanus
ENSOMEG00000001230	rybpb	97	62.835	ENSUMAG00000024028	RYBP	77	61.364	Ursus_maritimus
ENSOMEG00000001230	rybpb	56	77.419	ENSVPAG00000012039	YAF2	100	56.701	Vicugna_pacos
ENSOMEG00000001230	rybpb	64	45.349	ENSVPAG00000007715	RYBP	100	48.837	Vicugna_pacos
ENSOMEG00000001230	rybpb	97	62.692	ENSVVUG00000013920	RYBP	98	59.420	Vulpes_vulpes
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	53.116	ENSXETG00000015914	rybp	89	64.234	Xenopus_tropicalis
ENSOMEG00000001230	rybpb	61	78.873	ENSXETG00000006795	yaf2	99	67.416	Xenopus_tropicalis
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	73.881	ENSXCOG00000009651	rybpb	100	72.761	Xiphophorus_couchianus
ENSOMEG00000001230	rybpb	61	80.882	ENSXCOG00000020837	YAF2	89	85.185	Xiphophorus_couchianus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	89.552	ENSXMAG00000027089	rybpb	100	89.552	Xiphophorus_maculatus
ENSOMEG00000001230	rybpb	100	41.111	ENSXMAG00000009358	yaf2	100	39.630	Xiphophorus_maculatus
ENSOMEG00000001230	rybpb	56	78.873	ENSXMAG00000025433	YAF2	96	39.163	Xiphophorus_maculatus