EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOMEG00000002022 (Gene tree)
Gene ID: 112160188
Gene Symbol: mtrf1
Alias: -
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_melastigma
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8448 bases
Position: chrNVQA01000025.1:10668811-10677258
Accession: 112160188
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOMEP00000022458	RF-1	PF00472.20	2.6e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOMET00000014693	-	4454	-	ENSOMEP00000022458	437 (aa)	XP_024150361	UPI000CF833ED

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOMEG00000002022	mtrf1	83	44.715	ENSOMEG00000013067	mtrf1l	87	44.531

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.579	ENSG00000120662	MTRF1	85	56.579	Homo_sapiens
ENSOMEG00000002022	mtrf1	89	73.980	ENSAPOG00000010181	mtrf1	96	73.980	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	88	57.180	ENSAMEG00000008696	MTRF1	85	57.180	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOMEG00000002022	mtrf1	56	83.065	ENSACIG00000001495	mtrf1	100	83.065	Amphilophus_citrinellus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	99	72.686	ENSAOCG00000002832	mtrf1	99	72.686	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000002022	mtrf1	99	72.009	ENSAPEG00000014844	mtrf1	99	72.009	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000002022	mtrf1	90	72.525	ENSATEG00000017403	mtrf1	97	72.525	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.955	ENSAPLG00000009317	MTRF1	88	57.218	Anas_platyrhynchos
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.105	ENSACAG00000000897	MTRF1	85	57.105	Anolis_carolinensis
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	53.281	ENSANAG00000023063	-	84	53.281	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000002022	mtrf1	76	58.735	ENSANAG00000025310	-	91	58.735	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	73.942	ENSACLG00000023945	mtrf1	100	73.942	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000002022	mtrf1	53	78.788	ENSAMXG00000031859	mtrf1	96	78.788	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.632	ENSBTAG00000012260	MTRF1	85	57.632	Bos_taurus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.105	ENSCJAG00000017739	MTRF1	95	65.663	Callithrix_jacchus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.180	ENSCAFG00000004795	MTRF1	86	57.180	Canis_familiaris
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.180	ENSCAFG00020018178	MTRF1	86	57.180	Canis_lupus_dingo
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.632	ENSCHIG00000011810	MTRF1	85	57.632	Capra_hircus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.842	ENSTSYG00000006976	MTRF1	85	56.842	Carlito_syrichta
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.743	ENSCAPG00000013163	MTRF1	88	57.743	Cavia_aperea
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.480	ENSCPOG00000005264	MTRF1	85	57.480	Cavia_porcellus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.895	ENSCCAG00000035116	MTRF1	85	57.895	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.592	ENSCATG00000009909	MTRF1	85	57.592	Cercocebus_atys
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.743	ENSCLAG00000000582	MTRF1	85	57.743	Chinchilla_lanigera
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.330	ENSCSAG00000017835	MTRF1	85	57.330	Chlorocebus_sabaeus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	80	54.701	ENSCHOG00000011915	-	85	54.701	Choloepus_hoffmanni
ENSOMEG00000002022	mtrf1	89	55.270	ENSCPBG00000007969	MTRF1	86	55.527	Chrysemys_picta_bellii
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.368	ENSCANG00000040353	MTRF1	85	57.368	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.256	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	85	57.256	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.256	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	85	57.256	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOMEG00000002022	mtrf1	98	66.820	ENSCSEG00000005667	mtrf1	97	66.820	Cynoglossus_semilaevis
ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	69.091	ENSCVAG00000021729	mtrf1	100	69.091	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	54	66.383	ENSDARG00000033579	mtrf1	100	66.383	Danio_rerio
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	55.236	ENSDNOG00000034196	MTRF1	96	61.616	Dasypus_novemcinctus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	91	56.533	ENSDORG00000016429	Mtrf1	87	56.533	Dipodomys_ordii
ENSOMEG00000002022	mtrf1	88	56.623	ENSETEG00000014811	MTRF1	86	56.623	Echinops_telfairi
ENSOMEG00000002022	mtrf1	52	55.947	ENSEBUG00000000778	mtrf1	93	55.947	Eptatretus_burgeri
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.368	ENSEASG00005015715	MTRF1	85	57.368	Equus_asinus_asinus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.105	ENSECAG00000014389	MTRF1	83	57.105	Equus_caballus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	45.573	ENSEEUG00000004450	-	85	45.833	Erinaceus_europaeus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	99	66.204	ENSELUG00000006544	mtrf1	98	66.204	Esox_lucius
ENSOMEG00000002022	mtrf1	89	56.061	ENSFCAG00000031635	MTRF1	88	56.061	Felis_catus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	88	55.181	ENSFALG00000008036	MTRF1	95	55.181	Ficedula_albicollis
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	58.158	ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	58.158	Fukomys_damarensis
ENSOMEG00000002022	mtrf1	97	69.037	ENSFHEG00000019043	mtrf1	99	69.037	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	86	68.966	ENSGMOG00000008608	mtrf1	98	68.966	Gadus_morhua
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.430	ENSGALG00000016951	MTRF1	83	56.693	Gallus_gallus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	70.917	ENSGAFG00000007093	mtrf1	100	70.917	Gambusia_affinis
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	76.378	ENSGACG00000013728	mtrf1	99	76.378	Gasterosteus_aculeatus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	72	58.861	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	58.861	Gopherus_agassizii
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.316	ENSGGOG00000002529	MTRF1	85	56.316	Gorilla_gorilla
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.579	ENSHGLG00000003210	MTRF1	85	56.579	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.579	ENSHGLG00100011843	MTRF1	85	56.579	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000002022	mtrf1	99	67.043	ENSHCOG00000009449	mtrf1	99	67.043	Hippocampus_comes
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.520	ENSSTOG00000021682	MTRF1	85	57.520	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	58.158	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	85	58.158	Jaculus_jaculus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	97	72.874	ENSKMAG00000003231	mtrf1	96	72.874	Kryptolebias_marmoratus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	53	87.013	ENSLBEG00000027169	-	93	87.013	Labrus_bergylta
ENSOMEG00000002022	mtrf1	53	87.013	ENSLBEG00000023151	mtrf1	93	87.013	Labrus_bergylta
ENSOMEG00000002022	mtrf1	86	60.533	ENSLACG00000010582	MTRF1	83	60.533	Latimeria_chalumnae
ENSOMEG00000002022	mtrf1	93	57.683	ENSLOCG00000005937	MTRF1	94	57.683	Lepisosteus_oculatus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	91	55.808	ENSLAFG00000022177	-	87	55.808	Loxodonta_africana
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	43.684	ENSLAFG00000030499	-	83	43.684	Loxodonta_africana
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.592	ENSMFAG00000037972	MTRF1	85	57.592	Macaca_fascicularis
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.592	ENSMNEG00000035487	MTRF1	85	57.592	Macaca_nemestrina
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.592	ENSMLEG00000033582	MTRF1	85	57.592	Mandrillus_leucophaeus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	70.824	ENSMAMG00000022048	mtrf1	100	70.824	Mastacembelus_armatus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	73.942	ENSMZEG00005017922	mtrf1	100	73.942	Maylandia_zebra
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.218	ENSMGAG00000014971	MTRF1	91	57.218	Meleagris_gallopavo
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	58.311	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	85	58.311	Mesocricetus_auratus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.842	ENSMICG00000033131	MTRF1	85	56.842	Microcebus_murinus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	58.047	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	85	58.047	Microtus_ochrogaster
ENSOMEG00000002022	mtrf1	55	70.661	ENSMMOG00000013394	mtrf1	99	70.661	Mola_mola
ENSOMEG00000002022	mtrf1	96	51.522	ENSMODG00000014772	MTRF1	96	51.522	Monodelphis_domestica
ENSOMEG00000002022	mtrf1	97	73.782	ENSMALG00000013274	mtrf1	98	73.782	Monopterus_albus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	84	59.350	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	82	59.350	Mus_caroli
ENSOMEG00000002022	mtrf1	86	59.151	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	84	59.151	Mus_musculus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	86	58.355	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	84	58.355	Mus_pahari
ENSOMEG00000002022	mtrf1	86	58.933	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	84	58.933	Mus_spretus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	88	57.441	ENSMPUG00000001874	MTRF1	86	57.441	Mustela_putorius_furo
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.105	ENSMLUG00000017237	MTRF1	85	57.105	Myotis_lucifugus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.368	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	85	57.368	Nannospalax_galili
ENSOMEG00000002022	mtrf1	54	84.681	ENSNBRG00000004634	mtrf1	99	84.681	Neolamprologus_brichardi
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.842	ENSNLEG00000001236	MTRF1	85	56.842	Nomascus_leucogenys
ENSOMEG00000002022	mtrf1	96	50.824	ENSMEUG00000001846	MTRF1	95	50.824	Notamacropus_eugenii
ENSOMEG00000002022	mtrf1	62	33.824	ENSOPRG00000006450	-	82	33.824	Ochotona_princeps
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.105	ENSODEG00000005782	MTRF1	85	57.105	Octodon_degus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	88	79.427	ENSONIG00000012476	mtrf1	99	79.427	Oreochromis_niloticus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	68	58.054	ENSOANG00000003383	-	95	58.054	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	58.005	ENSOCUG00000025207	MTRF1	85	58.005	Oryctolagus_cuniculus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	89.569	ENSORLG00000003225	mtrf1	100	89.569	Oryzias_latipes
ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	88.713	ENSORLG00020021048	mtrf1	100	88.713	Oryzias_latipes_hni
ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	89.569	ENSORLG00015020957	mtrf1	100	89.569	Oryzias_latipes_hsok
ENSOMEG00000002022	mtrf1	74	50.769	ENSOGAG00000026411	-	99	50.769	Otolemur_garnettii
ENSOMEG00000002022	mtrf1	80	59.091	ENSOGAG00000009719	-	78	59.091	Otolemur_garnettii
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.632	ENSOARG00000006994	MTRF1	85	57.632	Ovis_aries
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.579	ENSPPAG00000000050	MTRF1	85	56.579	Pan_paniscus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	88	57.702	ENSPPRG00000009511	MTRF1	85	57.702	Panthera_pardus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	89	56.313	ENSPTIG00000006673	MTRF1	88	56.313	Panthera_tigris_altaica
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.579	ENSPTRG00000005815	MTRF1	85	56.579	Pan_troglodytes
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.592	ENSPANG00000010809	MTRF1	85	57.592	Papio_anubis
ENSOMEG00000002022	mtrf1	86	61.905	ENSPKIG00000015711	mtrf1	87	61.905	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOMEG00000002022	mtrf1	92	53.713	ENSPSIG00000004773	MTRF1	90	53.960	Pelodiscus_sinensis
ENSOMEG00000002022	mtrf1	53	84.848	ENSPMGG00000006724	mtrf1	94	84.848	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	58.901	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	85	58.901	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOMEG00000002022	mtrf1	77	51.445	ENSPMAG00000009849	mtrf1	99	51.734	Petromyzon_marinus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.330	ENSPCIG00000012940	MTRF1	86	57.330	Phascolarctos_cinereus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	69.595	ENSPFOG00000000254	mtrf1	100	69.595	Poecilia_formosa
ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	69.820	ENSPLAG00000014280	mtrf1	100	69.820	Poecilia_latipinna
ENSOMEG00000002022	mtrf1	97	69.816	ENSPMEG00000023245	mtrf1	98	69.816	Poecilia_mexicana
ENSOMEG00000002022	mtrf1	54	72.199	ENSPREG00000018619	mtrf1	99	72.199	Poecilia_reticulata
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	55.526	ENSPPYG00000005313	MTRF1	85	55.526	Pongo_abelii
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.316	ENSPCOG00000018133	MTRF1	85	56.316	Propithecus_coquereli
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.316	ENSPVAG00000008573	MTRF1	85	56.316	Pteropus_vampyrus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	56	83.806	ENSPNYG00000004357	mtrf1	100	83.806	Pundamilia_nyererei
ENSOMEG00000002022	mtrf1	88	65.544	ENSPNAG00000010682	mtrf1	88	65.544	Pygocentrus_nattereri
ENSOMEG00000002022	mtrf1	85	59.030	ENSRNOG00000047106	Mtrf1	93	70.796	Rattus_norvegicus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.842	ENSRBIG00000007069	MTRF1	85	56.842	Rhinopithecus_bieti
ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.842	ENSRROG00000035345	MTRF1	85	56.842	Rhinopithecus_roxellana
ENSOMEG00000002022	mtrf1	85	57.682	ENSSBOG00000004572	MTRF1	98	57.682	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOMEG00000002022	mtrf1	80	57.102	ENSSHAG00000018109	MTRF1	86	56.941	Sarcophilus_harrisii
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ENSOMEG00000002022	mtrf1	97	68.326	ENSSMAG00000015740	mtrf1	99	68.326	Scophthalmus_maximus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	71.333	ENSSDUG00000022608	mtrf1	88	71.333	Seriola_dumerili
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ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.728	ENSXETG00000018904	mtrf1	97	56.728	Xenopus_tropicalis
ENSOMEG00000002022	mtrf1	50	82.110	ENSXCOG00000020386	mtrf1	93	82.110	Xiphophorus_couchianus
ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	68.694	ENSXMAG00000009853	mtrf1	100	68.694	Xiphophorus_maculatus