EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOMEG00000003154 (Gene tree)
Gene ID: 112148236
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC112148236
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_melastigma
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12694 bases
Position: chrNVQA01000012.1:14093545-14106238
Accession: 112148236
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOMEP00000023190	MMR_HSR1	PF01926.23	9.9e-07	1	1
ENSOMEP00000002213	MMR_HSR1	PF01926.23	1.1e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOMET00000012874	-	3731	-	ENSOMEP00000002213	448 (aa)	XP_024130930	UPI000CF7D758
ENSOMET00000012855	-	3878	-	ENSOMEP00000023190	434 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSOMEG00000003154's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOMEG00000003154's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	60.550	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	60.444

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	58.945	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Amphilophus_citrinellus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	58.093	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.093	Amphilophus_citrinellus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	59.174	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	58.945	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	60.092	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	88.839	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	88.839	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	99	58.469	ENSACAG00000028632	-	99	58.444	Anolis_carolinensis
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	58.219	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	58.186	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	59.471	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.471	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	80.846	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	80.846	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	79	62.899	ENSCING00000020807	-	91	62.899	Ciona_intestinalis
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	98	55.455	ENSCSAVG00000009987	-	98	55.682	Ciona_savignyi
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	58.028	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Cynoglossus_semilaevis
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	87.946	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	85.142	Cynoglossus_semilaevis
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	89.509	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	89.509	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	60.321	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	74.490	Danio_rerio
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	99	83.796	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.636	Danio_rerio
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	81	56.338	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	95	56.338	Eptatretus_burgeri
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	99	82.367	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.839	Esox_lucius
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	99	60.000	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	58.315	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	93	54.455	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	100	54.455	Gadus_morhua
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Gambusia_affinis
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	90.402	Gambusia_affinis
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	85	65.946	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	100	62.069	Gasterosteus_aculeatus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	59	93.798	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	93.798	Gasterosteus_aculeatus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	58.447	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	58.407	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	99	83.108	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	83.108	Hippocampus_comes
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	58.028	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	58.000	Hippocampus_comes
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	99	58.756	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	58.756	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	87	57.181	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	57.181	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	77.951	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.951	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	58.716	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Kryptolebias_marmoratus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Labrus_bergylta
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	99	68.468	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	68.468	Latimeria_chalumnae
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	99	61.949	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	61.798	Latimeria_chalumnae
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	61.609	ENSLACG00000004899	-	99	61.470	Latimeria_chalumnae
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	99	73.378	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	73.378	Lepisosteus_oculatus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	89.732	Mastacembelus_armatus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	99	59.677	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	59.677	Mastacembelus_armatus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Maylandia_zebra
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	57.991	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	57.965	Maylandia_zebra
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	56.984	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	56.984	Mola_mola
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	88.479	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	89.066	Monopterus_albus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	59.633	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Monopterus_albus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Neolamprologus_brichardi
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	99	58.986	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	99	58.986	Neolamprologus_brichardi
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	58.219	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	58.186	Oreochromis_niloticus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Oreochromis_niloticus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	60.092	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Oryzias_latipes
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Oryzias_latipes
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	59.862	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Oryzias_latipes_hni
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	95.982	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	95.982	Oryzias_latipes_hni
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	60.550	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Oryzias_latipes_hsok
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	95.982	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	95.982	Oryzias_latipes_hsok
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	57.238	ENSPKIG00000023918	-	98	57.238	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	59.039	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	78.396	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	78.396	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	85.045	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	85.045	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	58.447	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	58.407	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Poecilia_formosa
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	90.022	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	90.022	Poecilia_formosa
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSPLAG00000019794	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Poecilia_latipinna
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Poecilia_latipinna
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSPMEG00000024198	si:ch211-11k18.4	99	61.290	Poecilia_mexicana
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	90.179	Poecilia_mexicana
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	87.788	ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	88.383	Poecilia_reticulata
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	97	58.701	ENSPREG00000015319	si:ch211-11k18.4	98	58.701	Poecilia_reticulata
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	58.447	ENSPNYG00000017099	si:ch211-11k18.4	99	58.407	Pundamilia_nyererei
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSPNYG00000017266	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Pundamilia_nyererei
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	80.690	ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	80.624	Pygocentrus_nattereri
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	59.031	ENSPNAG00000022138	si:ch211-11k18.4	99	59.251	Pygocentrus_nattereri
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	59.430	ENSSFOG00015000985	si:ch211-11k18.4	94	59.430	Scleropages_formosus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	74.833	ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	74.833	Scleropages_formosus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	58.667	ENSSMAG00000009651	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Scophthalmus_maximus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	88.616	ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	88.616	Scophthalmus_maximus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	60.183	ENSSDUG00000016411	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Seriola_dumerili
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	88.839	ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	88.839	Seriola_dumerili
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	58.716	ENSSLDG00000019145	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	89.062	ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	89.062	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	88	59.091	ENSSPUG00000010096	-	99	59.698	Sphenodon_punctatus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	58.945	ENSSPAG00000010697	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Stegastes_partitus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Stegastes_partitus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	88.170	ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	88.170	Takifugu_rubripes
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSTRUG00000020291	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Takifugu_rubripes
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	58.499	ENSXETG00000031783	-	99	58.499	Xenopus_tropicalis
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	58.315	ENSXCOG00000018094	si:ch211-11k18.4	99	58.315	Xiphophorus_couchianus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	88.393	ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	88.393	Xiphophorus_couchianus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSXMAG00000021235	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Xiphophorus_maculatus
ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSXMAG00000007688	si:dkey-98f17.5	95	89.732	Xiphophorus_maculatus