EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOMEG00000007564 (Gene tree)
Gene ID: 112142956
Gene Symbol: htatsf1
Alias: -
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_melastigma
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7202 bases
Position: chrNVQA01000005.1:16454776-16461977
Accession: 112142956
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOMEP00000025997	RRM_1	PF00076.22	2.7e-17	1	2
ENSOMEP00000025997	RRM_1	PF00076.22	2.7e-17	2	2
ENSOMEP00000006508	RRM_1	PF00076.22	4.3e-17	1	2
ENSOMEP00000006508	RRM_1	PF00076.22	4.3e-17	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOMET00000005719	-	4324	-	ENSOMEP00000025997	453 (aa)	XP_024122420	UPI000CF83A71
ENSOMET00000005691	-	4342	-	ENSOMEP00000006508	519 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	59.954	ENSG00000102241	HTATSF1	97	58.333	Homo_sapiens
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	79.736	ENSAPOG00000009823	htatsf1	100	79.736	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	77.143	ENSACIG00000020459	htatsf1	100	80.220	Amphilophus_citrinellus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	78.091	ENSAOCG00000020994	htatsf1	100	78.525	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	79.258	ENSAPEG00000016432	htatsf1	100	79.476	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000007564	htatsf1	92	80.288	ENSATEG00000008903	htatsf1	93	80.288	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	92	63.981	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.744	Anas_platyrhynchos
ENSOMEG00000007564	htatsf1	79	64.706	ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	61.634	Anolis_carolinensis
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	76.805	ENSACLG00000008096	htatsf1	100	78.775	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	69.697	ENSAMXG00000008387	htatsf1	99	70.130	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	92	58.140	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	56	58.140	Bos_taurus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	76	39.601	WBGene00022025	Y65B4A.1	75	39.377	Caenorhabditis_elegans
ENSOMEG00000007564	htatsf1	95	59.091	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	55	58.770	Canis_familiaris
ENSOMEG00000007564	htatsf1	95	59.091	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	54	58.770	Canis_lupus_dingo
ENSOMEG00000007564	htatsf1	80	62.534	ENSCCAG00000022701	-	50	63.239	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	80	62.198	ENSCCAG00000025329	-	58	60.048	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	60.183	ENSCATG00000029963	HTATSF1	54	60.183	Cercocebus_atys
ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	60.183	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	54	60.183	Chlorocebus_sabaeus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	98	62.611	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	98	62.611	Chrysemys_picta_bellii
ENSOMEG00000007564	htatsf1	83	44.444	ENSCING00000005914	-	96	44.180	Ciona_intestinalis
ENSOMEG00000007564	htatsf1	91	44.301	ENSCSAVG00000000371	-	94	43.264	Ciona_savignyi
ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	59.725	ENSCANG00000028495	HTATSF1	54	59.725	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	79.249	ENSCVAG00000014070	htatsf1	99	80.574	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	66.377	ENSDARG00000056649	htatsf1	100	67.028	Danio_rerio
ENSOMEG00000007564	htatsf1	81	44.687	FBgn0037081	barc	65	46.341	Drosophila_melanogaster
ENSOMEG00000007564	htatsf1	88	52.019	ENSEBUG00000001534	htatsf1	92	48.491	Eptatretus_burgeri
ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	60.277	ENSEASG00005003440	HTATSF1	53	60.277	Equus_asinus_asinus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	60.277	ENSECAG00000009156	HTATSF1	53	60.277	Equus_caballus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	61.422	ENSELUG00000005486	htatsf1	91	63.057	Esox_lucius
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	60.262	ENSFALG00000003728	HTATSF1	99	60.262	Ficedula_albicollis
ENSOMEG00000007564	htatsf1	95	57.883	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	53	58.565	Fukomys_damarensis
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	78.681	ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	78.681	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	80	73.901	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	73.901	Gadus_morhua
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	61.957	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	61.957	Gallus_gallus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	79.029	ENSGAFG00000003041	htatsf1	99	78.478	Gambusia_affinis
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	77.263	ENSGACG00000020459	htatsf1	100	77.263	Gasterosteus_aculeatus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	59.954	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	54	59.954	Gorilla_gorilla
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	76.586	ENSHBUG00000004392	htatsf1	100	78.556	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000007564	htatsf1	92	59.861	ENSHGLG00000005328	HTATSF1	52	60.714	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	68.433	ENSHCOG00000009056	htatsf1	99	69.757	Hippocampus_comes
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	63.636	ENSIPUG00000017828	htatsf1	99	63.983	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	59.725	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	56	59.725	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	81.457	ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	81.678	Kryptolebias_marmoratus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	77.342	ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	77.342	Labrus_bergylta
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	60.526	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	60.526	Latimeria_chalumnae
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	46.170	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	45.359	Lepisosteus_oculatus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	84	64.541	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	63.520	Loxodonta_africana
ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	60.183	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	54	60.183	Macaca_fascicularis
ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	60.183	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	54	60.183	Macaca_mulatta
ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	60.183	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	60	60.183	Macaca_nemestrina
ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	60.183	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	54	60.183	Mandrillus_leucophaeus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	75.885	ENSMAMG00000021225	htatsf1	99	76.106	Mastacembelus_armatus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	77.024	ENSMZEG00005000485	htatsf1	100	78.993	Maylandia_zebra
ENSOMEG00000007564	htatsf1	95	64.073	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	99	64.073	Meleagris_gallopavo
ENSOMEG00000007564	htatsf1	80	64.000	ENSMICG00000009348	HTATSF1	50	64.631	Microcebus_murinus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	80	62.534	ENSMOCG00000022370	-	52	60.476	Microtus_ochrogaster
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	75.717	ENSMMOG00000011013	htatsf1	100	75.938	Mola_mola
ENSOMEG00000007564	htatsf1	56	59.398	ENSMODG00000000199	-	91	57.551	Monodelphis_domestica
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	60.259	ENSMODG00000014087	-	97	60.259	Monodelphis_domestica
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	77.042	ENSMALG00000019977	htatsf1	100	77.042	Monopterus_albus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	93	57.710	ENSMLUG00000009234	-	51	61.183	Myotis_lucifugus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	80	63.342	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	50	64.416	Nannospalax_galili
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	77.243	ENSNBRG00000003818	htatsf1	100	79.212	Neolamprologus_brichardi
ENSOMEG00000007564	htatsf1	92	59.954	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	54	59.954	Nomascus_leucogenys
ENSOMEG00000007564	htatsf1	91	62.322	ENSMEUG00000004133	-	97	62.322	Notamacropus_eugenii
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	77.681	ENSONIG00000008638	htatsf1	100	79.431	Oreochromis_niloticus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	91	60.382	ENSOANG00000011674	-	99	60.382	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	90.308	ENSORLG00000002356	htatsf1	100	90.308	Oryzias_latipes
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	90.132	ENSORLG00020017818	htatsf1	98	89.371	Oryzias_latipes_hni
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	89.451	ENSORLG00015002268	htatsf1	100	89.451	Oryzias_latipes_hsok
ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	59.954	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	54	59.954	Pan_paniscus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	59.954	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	54	59.954	Pan_troglodytes
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	64.847	ENSPKIG00000024852	htatsf1	99	64.847	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOMEG00000007564	htatsf1	75	68.012	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	98	68.012	Pelodiscus_sinensis
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	70.933	ENSPMGG00000006172	htatsf1	99	70.933	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	57.081	ENSPCIG00000018896	-	99	57.081	Phascolarctos_cinereus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	91	61.321	ENSPCIG00000030173	-	93	61.321	Phascolarctos_cinereus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	79.249	ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	79.249	Poecilia_formosa
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	79.029	ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	79.029	Poecilia_latipinna
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	79.470	ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	79.470	Poecilia_mexicana
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	79.912	ENSPREG00000007811	htatsf1	100	79.912	Poecilia_reticulata
ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	59.725	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	54	59.725	Pongo_abelii
ENSOMEG00000007564	htatsf1	84	57.732	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	52	57.732	Procavia_capensis
ENSOMEG00000007564	htatsf1	93	59.070	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	59	59.070	Pteropus_vampyrus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	76.805	ENSPNYG00000016693	htatsf1	100	78.775	Pundamilia_nyererei
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	67.089	ENSPNAG00000006166	htatsf1	99	67.722	Pygocentrus_nattereri
ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	60.183	ENSRROG00000021939	HTATSF1	54	60.183	Rhinopithecus_roxellana
ENSOMEG00000007564	htatsf1	80	63.200	ENSSBOG00000027186	-	50	63.868	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOMEG00000007564	htatsf1	83	66.138	ENSSHAG00000006440	-	94	66.138	Sarcophilus_harrisii
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	58.190	ENSSHAG00000018908	-	98	58.190	Sarcophilus_harrisii
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	61.603	ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.766	Scleropages_formosus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	75.817	ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	76.906	Scophthalmus_maximus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	75.497	ENSSDUG00000020002	htatsf1	99	75.497	Seriola_dumerili
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	79.470	ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	79.691	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOMEG00000007564	htatsf1	83	62.760	ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	62.760	Sorex_araneus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	60.573	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	98	60.573	Sphenodon_punctatus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	80.568	ENSSPAG00000000732	htatsf1	100	80.568	Stegastes_partitus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	80	63.978	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	67	57.143	Sus_scrofa
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	61.522	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	99	60.652	Taeniopygia_guttata
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	72.848	ENSTRUG00000013383	htatsf1	100	73.510	Takifugu_rubripes
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	73.568	ENSTNIG00000016140	htatsf1	100	73.362	Tetraodon_nigroviridis
ENSOMEG00000007564	htatsf1	77	62.849	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	58	62.849	Tursiops_truncatus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	95	58.636	ENSUAMG00000012048	HTATSF1	55	58.542	Ursus_americanus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	95	58.636	ENSUMAG00000010393	HTATSF1	54	58.314	Ursus_maritimus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	95	59.091	ENSVVUG00000024802	HTATSF1	54	59.174	Vulpes_vulpes
ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	58.462	ENSXETG00000019749	htatsf1	89	56.198	Xenopus_tropicalis
ENSOMEG00000007564	htatsf1	96	78.111	ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	78.111	Xiphophorus_couchianus
ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	78.808	ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	78.808	Xiphophorus_maculatus