EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOMEG00000007917 (Gene tree)
Gene ID: 112163088
Gene Symbol: ctif
Alias: -
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_melastigma
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 59941 bases
Position: chrNVQA01000031.1:9450477-9510417
Accession: 112163088
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOMEP00000026208	MIF4G	PF02854.19	4.1e-24	1	1
ENSOMEP00000006856	MIF4G	PF02854.19	4.4e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOMET00000005136	-	5775	-	ENSOMEP00000026208	667 (aa)	XP_024155004	UPI000CF83A03
ENSOMET00000005105	-	5856	-	ENSOMEP00000006856	694 (aa)	XP_024155003	UPI000CF7FB32

Gene Model

Click here to download ENSOMEG00000007917's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOMEG00000007917's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOMEG00000007917	ctif	99	55.507	ENSG00000134030	CTIF	99	55.147	Homo_sapiens
ENSOMEG00000007917	ctif	90	81.148	ENSAPOG00000020192	ctif	100	80.415	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000007917	ctif	81	55.714	ENSAMEG00000006759	CTIF	79	55.596	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOMEG00000007917	ctif	100	79.267	ENSACIG00000017099	ctif	100	78.702	Amphilophus_citrinellus
ENSOMEG00000007917	ctif	100	71.245	ENSAOCG00000014275	ctif	82	92.982	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000007917	ctif	100	77.840	ENSAPEG00000016975	ctif	100	82.692	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000007917	ctif	100	80.737	ENSATEG00000016752	ctif	100	81.591	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	59.412	ENSACAG00000018006	CTIF	99	58.382	Anolis_carolinensis
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.599	ENSANAG00000024925	CTIF	99	54.173	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000007917	ctif	100	79.603	ENSACLG00000005956	ctif	100	79.745	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000007917	ctif	53	61.326	ENSAMXG00000015964	ctif	100	61.399	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000007917	ctif	88	87.500	ENSBTAG00000018901	CTIF	98	87.500	Bos_taurus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.215	ENSCJAG00000004729	CTIF	99	53.857	Callithrix_jacchus
ENSOMEG00000007917	ctif	97	53.134	ENSCAFG00000019076	CTIF	99	53.914	Canis_familiaris
ENSOMEG00000007917	ctif	97	53.284	ENSCAFG00020026482	CTIF	99	54.062	Canis_lupus_dingo
ENSOMEG00000007917	ctif	99	53.891	ENSCHIG00000014455	CTIF	99	53.598	Capra_hircus
ENSOMEG00000007917	ctif	81	56.420	ENSTSYG00000030461	CTIF	96	56.036	Carlito_syrichta
ENSOMEG00000007917	ctif	99	50.949	ENSCAPG00000011865	CTIF	99	50.729	Cavia_aperea
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.545	ENSCPOG00000001049	CTIF	99	53.980	Cavia_porcellus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.148	ENSCCAG00000022758	CTIF	99	53.790	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.585	ENSCATG00000038134	CTIF	99	54.227	Cercocebus_atys
ENSOMEG00000007917	ctif	99	55.036	ENSCLAG00000008174	CTIF	99	54.319	Chinchilla_lanigera
ENSOMEG00000007917	ctif	99	53.770	ENSCSAG00000018021	CTIF	99	53.419	Chlorocebus_sabaeus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	59.618	ENSCPBG00000025654	CTIF	98	89.583	Chrysemys_picta_bellii
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.585	ENSCANG00000030916	CTIF	99	56.909	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	56.047	ENSCGRG00001020158	Ctif	99	55.687	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOMEG00000007917	ctif	99	52.292	ENSCGRG00000000052	Ctif	99	51.937	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOMEG00000007917	ctif	100	75.281	ENSCSEG00000019857	ctif	100	77.107	Cynoglossus_semilaevis
ENSOMEG00000007917	ctif	100	78.014	ENSCVAG00000017158	ctif	100	78.014	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	67.376	ENSDARG00000090617	ctif	100	67.139	Danio_rerio
ENSOMEG00000007917	ctif	68	55.626	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	55.106	Dasypus_novemcinctus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.118	ENSDORG00000003221	Ctif	99	53.756	Dipodomys_ordii
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.453	ENSEASG00005016094	CTIF	81	87.500	Equus_asinus_asinus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.876	ENSECAG00000020473	CTIF	100	54.373	Equus_caballus
ENSOMEG00000007917	ctif	77	55.678	ENSEEUG00000012451	CTIF	91	55.311	Erinaceus_europaeus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	63.867	ENSELUG00000008733	ctif	100	64.189	Esox_lucius
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.665	ENSFCAG00000000664	CTIF	98	87.500	Felis_catus
ENSOMEG00000007917	ctif	97	53.858	ENSFALG00000008943	CTIF	92	60.465	Ficedula_albicollis
ENSOMEG00000007917	ctif	99	53.934	ENSFDAG00000017379	CTIF	99	52.950	Fukomys_damarensis
ENSOMEG00000007917	ctif	100	77.935	ENSFHEG00000004334	ctif	100	77.935	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000007917	ctif	89	89.583	ENSGALG00000035912	-	95	65.385	Gallus_gallus
ENSOMEG00000007917	ctif	92	84.746	ENSGAFG00000011896	ctif	100	84.746	Gambusia_affinis
ENSOMEG00000007917	ctif	64	52.955	ENSGAGG00000020663	CTIF	92	57.403	Gopherus_agassizii
ENSOMEG00000007917	ctif	99	55.279	ENSGGOG00000015204	CTIF	99	54.985	Gorilla_gorilla
ENSOMEG00000007917	ctif	100	79.745	ENSHBUG00000018092	ctif	100	79.887	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000007917	ctif	99	55.030	ENSHGLG00000005663	CTIF	99	54.451	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.882	ENSHGLG00100006976	CTIF	99	54.303	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000007917	ctif	99	61.203	ENSHCOG00000011784	ctif	98	70.000	Hippocampus_comes
ENSOMEG00000007917	ctif	99	66.419	ENSIPUG00000014050	ctif	99	64.266	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.282	ENSSTOG00000001967	CTIF	99	53.790	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	53.566	ENSJJAG00000013706	Ctif	99	53.207	Jaculus_jaculus
ENSOMEG00000007917	ctif	100	77.500	ENSKMAG00000014651	ctif	100	77.794	Kryptolebias_marmoratus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	64.181	ENSLOCG00000011697	ctif	100	64.286	Lepisosteus_oculatus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	47.566	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	75.000	Loxodonta_africana
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.585	ENSMFAG00000037903	CTIF	99	54.227	Macaca_fascicularis
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.585	ENSMMUG00000020898	CTIF	99	54.227	Macaca_mulatta
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.585	ENSMNEG00000039395	CTIF	99	54.227	Macaca_nemestrina
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.427	ENSMLEG00000041132	CTIF	99	54.070	Mandrillus_leucophaeus
ENSOMEG00000007917	ctif	100	80.560	ENSMAMG00000014741	ctif	100	81.001	Mastacembelus_armatus
ENSOMEG00000007917	ctif	91	76.899	ENSMZEG00005019767	ctif	92	77.054	Maylandia_zebra
ENSOMEG00000007917	ctif	89	40.426	ENSMGAG00000001378	CTIF	65	68.116	Meleagris_gallopavo
ENSOMEG00000007917	ctif	99	55.457	ENSMAUG00000000656	Ctif	99	55.096	Mesocricetus_auratus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.425	ENSMICG00000010167	CTIF	99	54.197	Microcebus_murinus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	55.000	ENSMOCG00000020507	Ctif	99	54.639	Microtus_ochrogaster
ENSOMEG00000007917	ctif	100	76.547	ENSMMOG00000000831	ctif	100	76.990	Mola_mola
ENSOMEG00000007917	ctif	99	51.765	ENSMODG00000003464	CTIF	99	51.324	Monodelphis_domestica
ENSOMEG00000007917	ctif	66	91.026	ENSMALG00000020553	ctif	99	91.026	Monopterus_albus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	53.495	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	99	53.143	Mus_caroli
ENSOMEG00000007917	ctif	99	53.627	ENSMUSG00000052928	Ctif	99	53.276	Mus_musculus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.876	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	99	54.519	Mus_pahari
ENSOMEG00000007917	ctif	99	53.627	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	88	87.500	Mus_spretus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.853	ENSMPUG00000000844	CTIF	99	54.425	Mustela_putorius_furo
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.505	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	54.130	Myotis_lucifugus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	55.882	ENSNGAG00000011452	Ctif	99	55.523	Nannospalax_galili
ENSOMEG00000007917	ctif	100	79.234	ENSNBRG00000008679	ctif	100	79.381	Neolamprologus_brichardi
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.003	ENSNLEG00000011503	CTIF	99	53.353	Nomascus_leucogenys
ENSOMEG00000007917	ctif	99	49.190	ENSMEUG00000000218	CTIF	86	87.500	Notamacropus_eugenii
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.185	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	53.824	Ochotona_princeps
ENSOMEG00000007917	ctif	99	53.324	ENSODEG00000018390	CTIF	99	52.833	Octodon_degus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	72.024	ENSONIG00000007750	ctif	100	72.849	Oreochromis_niloticus
ENSOMEG00000007917	ctif	69	65.625	ENSOANG00000001337	CTIF	94	65.625	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.148	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	53.936	Oryctolagus_cuniculus
ENSOMEG00000007917	ctif	100	93.276	ENSORLG00000005786	ctif	100	93.276	Oryzias_latipes
ENSOMEG00000007917	ctif	100	93.247	ENSORLG00020005385	ctif	100	93.247	Oryzias_latipes_hni
ENSOMEG00000007917	ctif	100	93.123	ENSORLG00015011872	ctif	100	93.123	Oryzias_latipes_hsok
ENSOMEG00000007917	ctif	99	53.869	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	53.431	Otolemur_garnettii
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.559	ENSOARG00000003754	CTIF	99	54.265	Ovis_aries
ENSOMEG00000007917	ctif	99	55.344	ENSPPAG00000023554	CTIF	99	54.985	Pan_paniscus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.360	ENSPPRG00000002265	CTIF	99	54.227	Panthera_pardus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.506	ENSPTIG00000013761	CTIF	99	54.082	Panthera_tigris_altaica
ENSOMEG00000007917	ctif	99	55.198	ENSPTRG00000010009	CTIF	99	54.839	Pan_troglodytes
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.427	ENSPANG00000017087	CTIF	99	54.070	Papio_anubis
ENSOMEG00000007917	ctif	80	57.196	ENSPKIG00000011234	ctif	96	64.230	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOMEG00000007917	ctif	81	58.664	ENSPSIG00000006508	CTIF	94	60.519	Pelodiscus_sinensis
ENSOMEG00000007917	ctif	100	70.555	ENSPMGG00000022958	ctif	100	70.413	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	55.376	ENSPEMG00000022746	Ctif	99	54.559	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOMEG00000007917	ctif	72	55.488	ENSPCIG00000026247	CTIF	82	68.000	Phascolarctos_cinereus
ENSOMEG00000007917	ctif	100	77.574	ENSPFOG00000009243	ctif	100	77.574	Poecilia_formosa
ENSOMEG00000007917	ctif	100	77.715	ENSPLAG00000019171	ctif	100	77.715	Poecilia_latipinna
ENSOMEG00000007917	ctif	100	77.715	ENSPMEG00000020089	ctif	100	77.715	Poecilia_mexicana
ENSOMEG00000007917	ctif	100	75.672	ENSPREG00000017326	ctif	100	75.672	Poecilia_reticulata
ENSOMEG00000007917	ctif	80	56.261	ENSPPYG00000009147	CTIF	99	56.545	Pongo_abelii
ENSOMEG00000007917	ctif	99	52.493	ENSPCOG00000013391	CTIF	99	52.129	Propithecus_coquereli
ENSOMEG00000007917	ctif	99	55.198	ENSPVAG00000001965	CTIF	99	54.692	Pteropus_vampyrus
ENSOMEG00000007917	ctif	100	79.745	ENSPNYG00000007879	ctif	100	79.887	Pundamilia_nyererei
ENSOMEG00000007917	ctif	99	65.689	ENSPNAG00000029174	ctif	100	68.543	Pygocentrus_nattereri
ENSOMEG00000007917	ctif	99	55.605	ENSRNOG00000018342	Ctif	99	55.244	Rattus_norvegicus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.427	ENSRBIG00000043937	CTIF	99	54.070	Rhinopithecus_bieti
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.282	ENSRROG00000006039	CTIF	99	53.924	Rhinopithecus_roxellana
ENSOMEG00000007917	ctif	89	86.000	ENSSBOG00000028468	CTIF	98	86.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOMEG00000007917	ctif	99	51.241	ENSSHAG00000016321	CTIF	99	50.803	Sarcophilus_harrisii
ENSOMEG00000007917	ctif	99	66.222	ENSSFOG00015022594	ctif	100	66.370	Scleropages_formosus
ENSOMEG00000007917	ctif	100	79.764	ENSSMAG00000005707	ctif	100	82.570	Scophthalmus_maximus
ENSOMEG00000007917	ctif	100	79.694	ENSSDUG00000016033	ctif	100	80.668	Seriola_dumerili
ENSOMEG00000007917	ctif	100	79.468	ENSSLDG00000007282	ctif	100	82.474	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOMEG00000007917	ctif	99	56.573	ENSSPUG00000014734	CTIF	96	70.769	Sphenodon_punctatus
ENSOMEG00000007917	ctif	100	69.706	ENSSPAG00000003721	ctif	96	79.040	Stegastes_partitus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.227	ENSSSCG00000004506	CTIF	99	53.869	Sus_scrofa
ENSOMEG00000007917	ctif	99	53.143	ENSTGUG00000000030	CTIF	95	56.863	Taeniopygia_guttata
ENSOMEG00000007917	ctif	51	70.725	ENSTRUG00000002320	ctif	99	70.725	Takifugu_rubripes
ENSOMEG00000007917	ctif	99	63.585	ENSTNIG00000018763	ctif	95	71.576	Tetraodon_nigroviridis
ENSOMEG00000007917	ctif	84	66.250	ENSTBEG00000002613	CTIF	89	66.250	Tupaia_belangeri
ENSOMEG00000007917	ctif	99	51.825	ENSTTRG00000004347	CTIF	99	51.884	Tursiops_truncatus
ENSOMEG00000007917	ctif	87	50.000	ENSUAMG00000007299	CTIF	88	49.583	Ursus_americanus
ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.519	ENSUMAG00000002735	CTIF	98	87.500	Ursus_maritimus
ENSOMEG00000007917	ctif	97	53.134	ENSVVUG00000014347	CTIF	98	85.417	Vulpes_vulpes
ENSOMEG00000007917	ctif	74	68.846	ENSXETG00000026836	ctif	71	68.846	Xenopus_tropicalis
ENSOMEG00000007917	ctif	60	68.127	ENSXCOG00000002477	ctif	91	68.127	Xiphophorus_couchianus
ENSOMEG00000007917	ctif	100	74.540	ENSXMAG00000004236	ctif	100	76.662	Xiphophorus_maculatus