EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOMEG00000010070 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_melastigma
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2876 bases
Position: chrNVQA01004965.1:7254-10129
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOMEP00000008899	RVT_1	PF00078.27	8.8e-42	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOMET00000001692	-	2876	-	ENSOMEP00000008899	675 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOMEG00000010070	-	61	43.237	ENSOMEG00000018553	-	96	43.478
ENSOMEG00000010070	-	93	40.694	ENSOMEG00000014758	-	73	40.532
ENSOMEG00000010070	-	65	44.098	ENSOMEG00000002430	-	63	44.098
ENSOMEG00000010070	-	100	40.616	ENSOMEG00000001464	-	74	40.466
ENSOMEG00000010070	-	80	41.026	ENSOMEG00000012712	-	79	41.209
ENSOMEG00000010070	-	100	39.260	ENSOMEG00000020877	-	70	39.260
ENSOMEG00000010070	-	100	40.469	ENSOMEG00000018973	-	76	40.320
ENSOMEG00000010070	-	100	40.616	ENSOMEG00000018218	-	75	40.466
ENSOMEG00000010070	-	57	45.897	ENSOMEG00000005833	-	62	45.897
ENSOMEG00000010070	-	80	41.035	ENSOMEG00000022566	-	70	41.035
ENSOMEG00000010070	-	100	46.793	ENSOMEG00000002654	-	60	46.647
ENSOMEG00000010070	-	99	44.609	ENSOMEG00000011087	-	60	44.461
ENSOMEG00000010070	-	57	45.128	ENSOMEG00000011330	-	99	45.128
ENSOMEG00000010070	-	61	43.029	ENSOMEG00000006273	-	87	43.128
ENSOMEG00000010070	-	91	41.046	ENSOMEG00000021672	-	73	40.981
ENSOMEG00000010070	-	100	40.469	ENSOMEG00000017996	-	75	40.320
ENSOMEG00000010070	-	65	44.321	ENSOMEG00000004029	-	64	44.321
ENSOMEG00000010070	-	61	45.433	ENSOMEG00000004664	-	72	45.433
ENSOMEG00000010070	-	99	42.313	ENSOMEG00000012480	-	64	41.056
ENSOMEG00000010070	-	73	42.545	ENSOMEG00000013776	-	99	42.828
ENSOMEG00000010070	-	59	44.612	ENSOMEG00000008893	-	64	44.307
ENSOMEG00000010070	-	100	39.239	ENSOMEG00000015779	-	71	39.385
ENSOMEG00000010070	-	99	40.784	ENSOMEG00000003257	-	63	40.784
ENSOMEG00000010070	-	69	43.644	ENSOMEG00000019368	-	68	43.396
ENSOMEG00000010070	-	97	36.066	ENSOMEG00000000808	-	96	36.066
ENSOMEG00000010070	-	50	45.858	ENSOMEG00000006289	-	59	46.154
ENSOMEG00000010070	-	53	33.858	ENSOMEG00000023554	-	57	31.414
ENSOMEG00000010070	-	57	44.898	ENSOMEG00000011373	-	62	44.898
ENSOMEG00000010070	-	100	40.616	ENSOMEG00000019543	-	75	40.466
ENSOMEG00000010070	-	85	44.845	ENSOMEG00000014203	-	82	44.234
ENSOMEG00000010070	-	56	45.573	ENSOMEG00000004562	-	60	45.244

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOMEG00000010070	-	57	51.804	ENSATEG00000002739	-	63	51.804	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000010070	-	92	35.962	ENSATEG00000005707	-	75	36.364	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000010070	-	57	51.546	ENSATEG00000015490	-	63	51.546	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000010070	-	92	46.984	ENSATEG00000010674	-	73	46.984	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000010070	-	100	36.155	ENSATEG00000012907	-	69	36.075	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000010070	-	92	46.984	ENSATEG00000019512	-	73	46.984	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000010070	-	65	41.256	ENSATEG00000023197	-	68	41.124	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000010070	-	100	41.056	ENSACLG00000005662	-	75	40.616	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	66	53.363	ENSACLG00000014413	-	66	53.363	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	65	44.667	ENSACLG00000001405	-	66	44.494	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	74	44.862	ENSACLG00000008832	-	99	45.059	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	100	41.414	ENSACLG00000018252	-	86	41.279	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	100	45.899	ENSACLG00000007643	-	63	45.612	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	92	41.066	ENSACLG00000009850	-	71	40.916	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	65	44.218	ENSACLG00000005212	-	66	43.537	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	77	45.421	ENSACLG00000020248	-	69	44.944	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	100	40.145	ENSACLG00000008383	-	82	39.826	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	100	41.558	ENSACLG00000012014	-	75	41.424	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	77	45.880	ENSACLG00000012019	-	69	45.506	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	99	44.772	ENSACLG00000017412	-	72	44.772	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	66	57.303	ENSACLG00000013805	-	53	57.303	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	65	44.000	ENSACLG00000008571	-	66	43.820	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	65	44.444	ENSACLG00000020183	-	66	44.270	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	71	43.595	ENSACLG00000013061	-	66	43.388	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	56	50.663	ENSACLG00000014642	-	62	50.663	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	72	46.421	ENSACLG00000009807	-	67	46.012	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	89	40.033	ENSACLG00000012279	-	98	39.901	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	64	47.552	ENSACLG00000007654	-	94	47.552	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	91	46.302	ENSACLG00000009590	-	73	45.968	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	100	41.414	ENSACLG00000022844	-	75	41.279	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	57	50.258	ENSACLG00000008218	-	83	50.258	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	95	46.390	ENSACLG00000000734	-	74	46.390	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	100	41.254	ENSACLG00000003857	-	60	41.254	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	61	45.324	ENSACLG00000023557	-	64	45.146	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	56	51.459	ENSACLG00000012352	-	76	51.194	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	74	41.487	ENSACLG00000018945	-	85	41.304	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	63	48.009	ENSACLG00000005570	-	66	47.887	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	54	45.699	ENSACLG00000019110	-	89	45.504	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	100	65.333	ENSACLG00000015331	-	85	65.185	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	56	44.675	ENSACLG00000022994	-	92	44.125	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	89	43.842	ENSACLG00000021051	-	72	43.464	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	61	42.721	ENSACLG00000022841	-	53	42.206	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	100	50.222	ENSACLG00000027511	-	59	50.222	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	56	54.111	ENSACLG00000022169	-	63	54.111	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	100	41.270	ENSACLG00000025119	-	75	41.134	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	93	40.867	ENSACLG00000013844	-	82	40.718	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	65	44.000	ENSACLG00000001758	-	66	43.820	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	71	43.595	ENSACLG00000017692	-	66	43.388	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	65	43.778	ENSACLG00000009903	-	78	43.596	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	100	41.558	ENSACLG00000000395	-	78	41.254	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	100	41.270	ENSACLG00000000393	-	75	41.134	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	61	43.405	ENSACLG00000014911	-	64	42.892	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	65	44.196	ENSACLG00000014915	-	68	44.018	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	100	41.558	ENSACLG00000015667	-	75	41.424	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	66	53.363	ENSACLG00000005017	-	66	53.363	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	57	50.000	ENSACLG00000001035	-	98	50.000	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	88	40.692	ENSACLG00000017448	-	72	40.532	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	65	44.667	ENSACLG00000015507	-	81	44.494	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	65	44.369	ENSACLG00000000536	-	66	44.369	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	99	45.906	ENSACLG00000009939	-	68	45.601	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	100	41.558	ENSACLG00000015650	-	75	41.424	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	56	54.111	ENSACLG00000015659	-	63	54.111	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	98	48.645	ENSACLG00000019519	-	81	48.494	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	100	41.414	ENSACLG00000025376	-	75	41.142	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	77	43.126	ENSACLG00000019194	-	69	43.126	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	100	41.558	ENSACLG00000010900	-	75	41.424	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010070	-	91	36.102	ENSAMXG00000040053	-	69	35.766	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	85	43.103	ENSAMXG00000043574	-	70	42.586	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	65	40.492	ENSAMXG00000035634	-	94	40.492	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	65	41.084	ENSAMXG00000035505	-	92	41.084	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	57	46.292	ENSAMXG00000040370	-	96	45.547	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	71	42.008	ENSAMXG00000040860	-	86	41.393	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	91	36.693	ENSAMXG00000036646	-	75	36.152	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	100	41.496	ENSAMXG00000033551	-	81	41.202	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	63	46.154	ENSAMXG00000032588	-	65	45.476	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	60	41.667	ENSAMXG00000040733	-	91	41.667	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	97	35.364	ENSAMXG00000033415	-	89	35.460	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	84	43.576	ENSAMXG00000039914	-	70	43.056	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	67	38.344	ENSAMXG00000041363	-	77	38.562	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	57	42.092	ENSAMXG00000032548	-	83	42.184	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	60	45.411	ENSAMXG00000041791	-	61	44.952	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	71	39.264	ENSAMXG00000030246	-	67	39.425	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	54	47.482	ENSAMXG00000041299	-	84	47.653	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	77	42.639	ENSAMXG00000043096	-	69	42.256	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	71	40.041	ENSAMXG00000037974	-	92	40.246	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	59	39.303	ENSAMXG00000031724	-	92	39.221	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010070	-	73	41.535	ENSFHEG00000008959	-	99	41.365	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000010070	-	56	44.828	ENSHBUG00000006181	-	93	44.022	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000010070	-	56	50.398	ENSHBUG00000007584	-	98	50.133	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000010070	-	85	44.786	ENSHBUG00000016298	-	98	44.274	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000010070	-	56	46.134	ENSHBUG00000015916	-	81	46.134	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000010070	-	80	36.881	ENSIPUG00000013060	-	64	36.871	Ictalurus_punctatus
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ENSOMEG00000010070	-	55	42.400	ENSPREG00000018383	-	93	42.400	Poecilia_reticulata
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ENSOMEG00000010070	-	65	44.420	ENSPNYG00000008434	-	66	44.244	Pundamilia_nyererei
ENSOMEG00000010070	-	63	46.838	ENSPNAG00000001796	-	80	46.370	Pygocentrus_nattereri
ENSOMEG00000010070	-	77	33.582	ENSSFOG00015004172	-	90	33.333	Scleropages_formosus
ENSOMEG00000010070	-	88	44.592	ENSSLDG00000007615	-	98	44.759	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOMEG00000010070	-	52	51.977	ENSXMAG00000025482	-	96	51.977	Xiphophorus_maculatus
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ENSOMEG00000010070	-	57	50.515	ENSXMAG00000027958	-	59	50.515	Xiphophorus_maculatus
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ENSOMEG00000010070	-	81	46.209	ENSXMAG00000020920	-	77	46.209	Xiphophorus_maculatus