EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOMEG00000010076 (Gene tree)
Gene ID: 112160924
Gene Symbol: urb2
Alias: -
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_melastigma
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 18948 bases
Position: chrNVQA01000027.1:13898627-13917574
Accession: 112160924
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOMEP00000027553	Urb2	PF10441.9	7.1e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOMET00000001687	-	9249	-	ENSOMEP00000027553	1603 (aa)	XP_024151601	UPI000CF7DC22

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.409	ENSG00000135763	URB2	99	59.302	Homo_sapiens
ENSOMEG00000010076	urb2	91	61.679	ENSAPOG00000000608	urb2	100	61.498	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	34.875	ENSAMEG00000009206	URB2	100	34.854	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOMEG00000010076	urb2	100	63.523	ENSAOCG00000019961	urb2	100	63.658	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000010076	urb2	100	63.464	ENSAPEG00000005263	urb2	100	63.599	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000010076	urb2	100	61.029	ENSATEG00000020930	urb2	100	61.029	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000010076	urb2	97	35.786	ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.723	Anas_platyrhynchos
ENSOMEG00000010076	urb2	99	35.925	ENSACAG00000001285	URB2	99	35.860	Anolis_carolinensis
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.531	ENSANAG00000033963	URB2	99	34.409	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000010076	urb2	91	61.347	ENSACLG00000009254	urb2	100	61.151	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000010076	urb2	99	39.744	ENSAMXG00000003474	urb2	99	39.466	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	34.662	ENSBTAG00000010180	URB2	100	34.481	Bos_taurus
ENSOMEG00000010076	urb2	95	58.865	ENSCJAG00000010968	URB2	99	58.865	Callithrix_jacchus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	33.962	ENSCAFG00000012118	URB2	99	33.942	Canis_familiaris
ENSOMEG00000010076	urb2	93	32.700	ENSCAFG00020027217	URB2	98	32.678	Canis_lupus_dingo
ENSOMEG00000010076	urb2	100	34.401	ENSCHIG00000014513	URB2	100	34.160	Capra_hircus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	34.301	ENSTSYG00000006924	URB2	100	34.401	Carlito_syrichta
ENSOMEG00000010076	urb2	59	41.274	ENSCPOG00000020777	-	99	41.274	Cavia_porcellus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.791	ENSCCAG00000023932	URB2	99	34.669	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.388	ENSCATG00000043366	URB2	99	34.388	Cercocebus_atys
ENSOMEG00000010076	urb2	99	35.269	ENSCLAG00000006268	URB2	99	35.269	Chinchilla_lanigera
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.307	ENSCSAG00000010599	URB2	99	34.307	Chlorocebus_sabaeus
ENSOMEG00000010076	urb2	69	42.484	ENSCHOG00000010163	URB2	70	42.484	Choloepus_hoffmanni
ENSOMEG00000010076	urb2	99	36.196	ENSCPBG00000006191	URB2	99	36.033	Chrysemys_picta_bellii
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.244	ENSCANG00000023711	URB2	99	34.326	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.827	ENSCGRG00001009591	Urb2	99	34.827	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.827	ENSCGRG00000011259	Urb2	99	34.827	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOMEG00000010076	urb2	100	53.366	ENSCSEG00000000299	urb2	100	53.366	Cynoglossus_semilaevis
ENSOMEG00000010076	urb2	100	62.302	ENSCVAG00000011011	urb2	100	62.157	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	42.725	ENSDARG00000003217	urb2	100	67.308	Danio_rerio
ENSOMEG00000010076	urb2	97	32.725	ENSDNOG00000043064	URB2	99	32.432	Dasypus_novemcinctus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	33.920	ENSDORG00000014975	Urb2	99	33.920	Dipodomys_ordii
ENSOMEG00000010076	urb2	95	38.732	ENSETEG00000002869	URB2	95	38.732	Echinops_telfairi
ENSOMEG00000010076	urb2	100	34.907	ENSEASG00005012060	URB2	100	34.928	Equus_asinus_asinus
ENSOMEG00000010076	urb2	93	59.310	ENSECAG00000012338	URB2	100	59.310	Equus_caballus
ENSOMEG00000010076	urb2	92	55.245	ENSEEUG00000002669	URB2	92	55.245	Erinaceus_europaeus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	46.805	ENSELUG00000014647	urb2	100	46.865	Esox_lucius
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.369	ENSFCAG00000007662	URB2	99	34.491	Felis_catus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	35.835	ENSFALG00000003385	URB2	99	35.693	Ficedula_albicollis
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.711	ENSFDAG00000021079	URB2	99	34.590	Fukomys_damarensis
ENSOMEG00000010076	urb2	100	61.919	ENSFHEG00000010357	urb2	100	61.919	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	51.005	ENSGMOG00000012459	urb2	100	50.793	Gadus_morhua
ENSOMEG00000010076	urb2	99	36.759	ENSGALG00000011101	URB2	99	36.715	Gallus_gallus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	58.967	ENSGACG00000016179	urb2	100	58.991	Gasterosteus_aculeatus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	36.732	ENSGAGG00000021879	URB2	99	36.450	Gopherus_agassizii
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.491	ENSGGOG00000025643	URB2	99	34.369	Gorilla_gorilla
ENSOMEG00000010076	urb2	100	62.291	ENSHBUG00000018469	urb2	100	62.112	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000010076	urb2	97	34.391	ENSHGLG00000016561	URB2	99	34.389	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.909	ENSHGLG00100001838	URB2	99	34.627	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000010076	urb2	100	41.590	ENSIPUG00000020315	urb2	100	40.545	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	35.262	ENSSTOG00000025323	URB2	99	35.262	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOMEG00000010076	urb2	57	37.419	ENSJJAG00000011998	Urb2	99	34.751	Jaculus_jaculus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	63.488	ENSKMAG00000020129	urb2	100	63.494	Kryptolebias_marmoratus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	38.150	ENSLACG00000002038	URB2	99	37.742	Latimeria_chalumnae
ENSOMEG00000010076	urb2	99	41.323	ENSLOCG00000015462	urb2	99	41.819	Lepisosteus_oculatus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.548	ENSLAFG00000012484	URB2	100	34.510	Loxodonta_africana
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.449	ENSMFAG00000039905	URB2	99	34.449	Macaca_fascicularis
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.327	ENSMMUG00000009509	URB2	99	34.327	Macaca_mulatta
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.267	ENSMNEG00000038762	URB2	99	34.267	Macaca_nemestrina
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.388	ENSMLEG00000043252	URB2	99	34.388	Mandrillus_leucophaeus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	59.598	ENSMAMG00000020365	urb2	100	59.360	Mastacembelus_armatus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	62.172	ENSMZEG00005011027	urb2	100	61.993	Maylandia_zebra
ENSOMEG00000010076	urb2	92	34.483	ENSMGAG00000012073	URB2	98	34.308	Meleagris_gallopavo
ENSOMEG00000010076	urb2	95	58.865	ENSMAUG00000017980	Urb2	99	58.865	Mesocricetus_auratus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	34.188	ENSMICG00000033302	URB2	100	34.246	Microcebus_murinus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.860	ENSMOCG00000020369	Urb2	99	34.820	Microtus_ochrogaster
ENSOMEG00000010076	urb2	100	61.848	ENSMALG00000006529	urb2	100	61.671	Monopterus_albus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.388	ENSMUSG00000031976	Urb2	99	34.388	Mus_musculus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	35.076	ENSMPUG00000012438	URB2	99	35.015	Mustela_putorius_furo
ENSOMEG00000010076	urb2	99	35.040	ENSNGAG00000016524	Urb2	99	35.097	Nannospalax_galili
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.307	ENSNLEG00000014450	URB2	99	34.388	Nomascus_leucogenys
ENSOMEG00000010076	urb2	90	46.847	ENSMEUG00000016434	URB2	92	46.847	Notamacropus_eugenii
ENSOMEG00000010076	urb2	87	78.571	ENSOPRG00000009906	URB2	86	78.571	Ochotona_princeps
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.966	ENSODEG00000005593	URB2	99	34.945	Octodon_degus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	60.846	ENSONIG00000017078	urb2	100	61.029	Oreochromis_niloticus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.839	ENSOANG00000013732	URB2	99	35.272	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	35.009	ENSOCUG00000010700	URB2	100	35.009	Oryctolagus_cuniculus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	84.454	ENSORLG00000010915	urb2	100	84.207	Oryzias_latipes
ENSOMEG00000010076	urb2	100	84.331	ENSORLG00020003361	urb2	100	84.084	Oryzias_latipes_hni
ENSOMEG00000010076	urb2	100	84.269	ENSORLG00015001534	urb2	100	84.022	Oryzias_latipes_hsok
ENSOMEG00000010076	urb2	100	34.367	ENSOGAG00000003021	URB2	100	34.407	Otolemur_garnettii
ENSOMEG00000010076	urb2	100	34.585	ENSOARG00000003102	URB2	100	34.525	Ovis_aries
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.613	ENSPPAG00000040629	URB2	99	34.491	Pan_paniscus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.512	ENSPPRG00000012767	URB2	99	34.613	Panthera_pardus
ENSOMEG00000010076	urb2	97	56.250	ENSPTIG00000012577	URB2	99	56.250	Panthera_tigris_altaica
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.613	ENSPTRG00000002092	URB2	99	34.491	Pan_troglodytes
ENSOMEG00000010076	urb2	99	33.414	ENSPANG00000002245	URB2	99	33.414	Papio_anubis
ENSOMEG00000010076	urb2	99	42.156	ENSPKIG00000005787	urb2	99	42.277	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOMEG00000010076	urb2	99	36.380	ENSPSIG00000002690	URB2	99	36.336	Pelodiscus_sinensis
ENSOMEG00000010076	urb2	96	33.692	ENSPEMG00000019551	Urb2	100	33.692	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOMEG00000010076	urb2	99	35.355	ENSPCIG00000030071	URB2	99	35.294	Phascolarctos_cinereus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	61.543	ENSPFOG00000014330	urb2	100	61.336	Poecilia_formosa
ENSOMEG00000010076	urb2	100	61.115	ENSPLAG00000014654	urb2	100	60.600	Poecilia_latipinna
ENSOMEG00000010076	urb2	100	61.666	ENSPMEG00000012356	urb2	100	61.458	Poecilia_mexicana
ENSOMEG00000010076	urb2	100	61.359	ENSPREG00000010268	urb2	100	61.275	Poecilia_reticulata
ENSOMEG00000010076	urb2	100	33.881	ENSPPYG00000000123	URB2	100	34.023	Pongo_abelii
ENSOMEG00000010076	urb2	100	34.585	ENSPCOG00000023537	URB2	100	34.685	Propithecus_coquereli
ENSOMEG00000010076	urb2	99	33.090	ENSPVAG00000002108	URB2	99	33.109	Pteropus_vampyrus
ENSOMEG00000010076	urb2	91	61.282	ENSPNYG00000016840	urb2	100	61.086	Pundamilia_nyererei
ENSOMEG00000010076	urb2	99	41.616	ENSPNAG00000013684	urb2	99	41.616	Pygocentrus_nattereri
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.632	ENSRNOG00000026853	Urb2	97	34.632	Rattus_norvegicus
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.690	ENSRBIG00000037937	URB2	99	34.772	Rhinopithecus_bieti
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.791	ENSRROG00000039854	URB2	99	34.872	Rhinopithecus_roxellana
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.428	ENSSBOG00000023055	URB2	99	34.225	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.764	ENSSHAG00000014735	URB2	99	34.704	Sarcophilus_harrisii
ENSOMEG00000010076	urb2	97	42.653	ENSSFOG00015015432	urb2	98	42.458	Scleropages_formosus
ENSOMEG00000010076	urb2	91	60.129	ENSSMAG00000004984	urb2	100	59.846	Scophthalmus_maximus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	63.620	ENSSDUG00000000902	urb2	100	63.503	Seriola_dumerili
ENSOMEG00000010076	urb2	99	36.544	ENSSPUG00000018549	URB2	99	36.643	Sphenodon_punctatus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	63.669	ENSSPAG00000013632	urb2	100	63.669	Stegastes_partitus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	35.119	ENSSSCG00000010186	URB2	100	35.119	Sus_scrofa
ENSOMEG00000010076	urb2	99	35.836	ENSTGUG00000009990	URB2	99	35.741	Taeniopygia_guttata
ENSOMEG00000010076	urb2	100	54.848	ENSTRUG00000008173	urb2	100	54.551	Takifugu_rubripes
ENSOMEG00000010076	urb2	91	57.399	ENSTNIG00000017689	urb2	95	57.315	Tetraodon_nigroviridis
ENSOMEG00000010076	urb2	95	78.571	ENSTTRG00000014864	URB2	95	78.571	Tursiops_truncatus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	34.756	ENSUAMG00000015022	URB2	100	34.735	Ursus_americanus
ENSOMEG00000010076	urb2	100	34.860	ENSUMAG00000004728	URB2	100	34.838	Ursus_maritimus
ENSOMEG00000010076	urb2	53	59.155	ENSVPAG00000001750	-	52	59.155	Vicugna_pacos
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.227	ENSVVUG00000006747	URB2	99	34.206	Vulpes_vulpes
ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.949	ENSXETG00000023331	urb2	99	34.830	Xenopus_tropicalis
ENSOMEG00000010076	urb2	100	61.152	ENSXMAG00000015059	urb2	100	61.067	Xiphophorus_maculatus