EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOMEG00000010078 (Gene tree)
Gene ID: 112162584
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: gastrula zinc finger protein XlCGF57.1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_melastigma
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2987 bases
Position: chrNVQA01000030.1:2920014-2923000
Accession: 112162584
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOMEP00000027554	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	1	12
ENSOMEP00000027554	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	2	12
ENSOMEP00000027554	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	3	12
ENSOMEP00000027554	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	4	12
ENSOMEP00000027554	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	5	12
ENSOMEP00000027554	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	6	12
ENSOMEP00000027554	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	7	12
ENSOMEP00000027554	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	8	12
ENSOMEP00000027554	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	9	12
ENSOMEP00000027554	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	10	12
ENSOMEP00000027554	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	11	12
ENSOMEP00000027554	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	12	12
ENSOMEP00000027554	zf-met	PF12874.7	2.2e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOMET00000001674	-	2044	-	ENSOMEP00000027554	620 (aa)	XP_024154170	UPI000CF7C246

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOMEG00000010078	-	75	36.842	ENSOMEG00000000630	-	70	36.842
ENSOMEG00000010078	-	85	46.154	ENSOMEG00000012220	e4f1	55	46.154
ENSOMEG00000010078	-	78	35.422	ENSOMEG00000011926	zbtb17	60	33.032
ENSOMEG00000010078	-	75	46.330	ENSOMEG00000007919	-	74	46.330
ENSOMEG00000010078	-	76	51.923	ENSOMEG00000009568	-	97	51.923
ENSOMEG00000010078	-	78	36.975	ENSOMEG00000023310	-	91	36.975
ENSOMEG00000010078	-	82	43.043	ENSOMEG00000012539	-	95	39.850
ENSOMEG00000010078	-	74	50.350	ENSOMEG00000019437	-	78	50.350
ENSOMEG00000010078	-	73	39.216	ENSOMEG00000019346	-	99	39.216
ENSOMEG00000010078	-	77	47.534	ENSOMEG00000010371	-	100	43.850
ENSOMEG00000010078	-	74	43.478	ENSOMEG00000018691	-	94	39.231
ENSOMEG00000010078	-	79	46.099	ENSOMEG00000021556	-	64	46.099
ENSOMEG00000010078	-	75	46.701	ENSOMEG00000016808	-	85	46.701
ENSOMEG00000010078	-	76	46.939	ENSOMEG00000014403	znf341	55	33.333
ENSOMEG00000010078	-	79	43.868	ENSOMEG00000011566	-	94	48.101
ENSOMEG00000010078	-	84	32.544	ENSOMEG00000015658	znf646	89	32.544
ENSOMEG00000010078	-	73	45.909	ENSOMEG00000023774	-	55	45.909
ENSOMEG00000010078	-	78	39.918	ENSOMEG00000001622	-	93	39.918
ENSOMEG00000010078	-	73	40.533	ENSOMEG00000005839	-	92	50.000
ENSOMEG00000010078	-	73	33.542	ENSOMEG00000021420	-	65	34.795
ENSOMEG00000010078	-	78	37.705	ENSOMEG00000018871	-	65	37.705
ENSOMEG00000010078	-	74	46.575	ENSOMEG00000021492	-	65	46.575
ENSOMEG00000010078	-	77	46.667	ENSOMEG00000021945	-	89	46.400
ENSOMEG00000010078	-	79	49.107	ENSOMEG00000012844	-	95	47.573
ENSOMEG00000010078	-	86	40.141	ENSOMEG00000016026	-	72	55.714
ENSOMEG00000010078	-	75	43.860	ENSOMEG00000007730	-	86	44.660
ENSOMEG00000010078	-	82	46.491	ENSOMEG00000008445	-	89	46.491
ENSOMEG00000010078	-	74	42.929	ENSOMEG00000008449	-	98	41.063
ENSOMEG00000010078	-	80	40.741	ENSOMEG00000000376	si:ch211-216l23.1	98	40.741
ENSOMEG00000010078	-	77	42.543	ENSOMEG00000016747	-	80	42.543
ENSOMEG00000010078	-	93	45.588	ENSOMEG00000012263	-	93	45.588
ENSOMEG00000010078	-	74	43.426	ENSOMEG00000010752	-	59	43.426
ENSOMEG00000010078	-	79	39.158	ENSOMEG00000019853	-	95	39.676
ENSOMEG00000010078	-	75	43.590	ENSOMEG00000006208	-	98	43.590
ENSOMEG00000010078	-	73	41.117	ENSOMEG00000016853	-	72	41.117
ENSOMEG00000010078	-	76	47.475	ENSOMEG00000006224	-	84	47.475
ENSOMEG00000010078	-	76	39.558	ENSOMEG00000013868	-	67	39.558
ENSOMEG00000010078	-	66	42.328	ENSOMEG00000018279	-	67	42.328
ENSOMEG00000010078	-	82	46.479	ENSOMEG00000018498	-	89	46.479
ENSOMEG00000010078	-	79	42.138	ENSOMEG00000016766	-	54	42.138
ENSOMEG00000010078	-	75	46.212	ENSOMEG00000015460	-	51	46.212
ENSOMEG00000010078	-	75	39.720	ENSOMEG00000015640	-	78	39.720
ENSOMEG00000010078	-	92	49.351	ENSOMEG00000002268	-	99	49.032
ENSOMEG00000010078	-	77	44.335	ENSOMEG00000018597	-	85	44.335
ENSOMEG00000010078	-	76	47.368	ENSOMEG00000023777	-	99	47.368
ENSOMEG00000010078	-	75	37.195	ENSOMEG00000005578	-	69	37.195
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ENSOMEG00000010078	-	75	39.924	ENSOMEG00000012614	-	58	39.924
ENSOMEG00000010078	-	74	36.856	ENSOMEG00000015591	-	67	41.516
ENSOMEG00000010078	-	81	45.638	ENSOMEG00000010398	-	91	45.614
ENSOMEG00000010078	-	82	45.455	ENSOMEG00000011664	-	80	43.871
ENSOMEG00000010078	-	74	45.614	ENSOMEG00000004077	-	93	45.614
ENSOMEG00000010078	-	85	47.664	ENSOMEG00000009243	-	84	47.664
ENSOMEG00000010078	-	77	37.275	ENSOMEG00000020893	-	95	37.275
ENSOMEG00000010078	-	62	38.281	ENSOMEG00000012273	-	72	36.967
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