EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOMEG00000012140 (Gene tree)
Gene ID: 112137253
Gene Symbol: si:dkey-93h22.8
Alias: -
Full Name: peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_melastigma
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 25468 bases
Position: chrNVQA01000036.1:9431829-9457296
Accession: 112137253
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOMEP00000010841	RRM_1	PF00076.22	2.4e-10	1	1
ENSOMEP00000028849	RRM_1	PF00076.22	2.6e-10	1	1
ENSOMEP00000028827	RRM_1	PF00076.22	2.6e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOMET00000017760	-	3434	-	ENSOMEP00000010841	860 (aa)	-	-
ENSOMET00000017732	-	3746	-	ENSOMEP00000028827	927 (aa)	-	-
ENSOMET00000017787	-	3425	-	ENSOMEP00000028849	922 (aa)	XP_024115243	UPI000CF80DE0

Gene Model

Click here to download ENSOMEG00000012140's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOMEG00000012140's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	87	80.128	ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	78	79.747	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	89	78.481	ENSAOCG00000008140	si:dkey-93h22.8	80	78.481	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	88	78.481	ENSAPEG00000014568	si:dkey-93h22.8	79	78.481	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	79	77.070	ENSACLG00000019359	-	68	77.215	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	82	59.740	ENSAMXG00000020783	si:dkey-93h22.8	78	61.789	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	93	60.119	ENSDARG00000098666	si:dkey-93h22.8	82	60.000	Danio_rerio
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	66	37.464	ENSGAFG00000011120	si:dkey-93h22.8	67	37.127	Gambusia_affinis
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	63	77.070	ENSHBUG00000019347	-	55	77.215	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	82	33.949	ENSHCOG00000015325	-	79	72.848	Hippocampus_comes
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	92	59.355	ENSIPUG00000021651	si:dkey-93h22.8	79	59.355	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	78	81.343	ENSKMAG00000019855	si:dkey-93h22.8	88	65.625	Kryptolebias_marmoratus
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	82	79.333	ENSLBEG00000024075	-	72	78.400	Labrus_bergylta
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	62	42.784	ENSMAMG00000011169	-	68	81.600	Mastacembelus_armatus
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	79	77.070	ENSMZEG00005008228	-	71	77.215	Maylandia_zebra
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	77	76.282	ENSMALG00000005052	-	67	79.200	Monopterus_albus
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	100	73.639	ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	100	74.867	Oryzias_latipes
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	100	74.121	ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	100	74.547	Oryzias_latipes_hni
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	100	74.066	ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	100	75.560	Oryzias_latipes_hsok
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	80	84.694	ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	81	76.712	Poecilia_formosa
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	63	77.215	ENSPNYG00000002682	-	57	77.215	Pundamilia_nyererei
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	64	59.355	ENSPNAG00000023094	si:dkey-93h22.8	75	59.355	Pygocentrus_nattereri
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	55	83.838	ENSSMAG00000005915	si:dkey-93h22.8	56	73.418	Scophthalmus_maximus
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	75	76.923	ENSSDUG00000001268	si:dkey-93h22.8	74	76.582	Seriola_dumerili
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	75	76.923	ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	70	76.582	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	59	46.099	ENSSPAG00000010602	si:dkey-93h22.8	74	75.949	Stegastes_partitus