EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOMEG00000013911 (Gene tree)
Gene ID: 112136704
Gene Symbol: syf2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_melastigma
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6180 bases
Position: chrNVQA01000001.1:17891891-17898070
Accession: 112136704
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOMEP00000012525	SYF2	PF08231.12	4.9e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOMET00000019882	-	1206	-	ENSOMEP00000012525	238 (aa)	XP_024114386	UPI000CF7CCB9

Gene Model

Click here to download ENSOMEG00000013911's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOMEG00000013911's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOMEG00000013911	syf2	91	83.796	ENSG00000117614	SYF2	90	83.562	Homo_sapiens
ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.756	ENSAPOG00000001174	syf2	100	90.756	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000013911	syf2	82	83.590	ENSAMEG00000010134	-	100	83.590	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOMEG00000013911	syf2	92	82.648	ENSAMEG00000010115	-	90	82.648	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOMEG00000013911	syf2	98	89.744	ENSACIG00000023688	syf2	94	89.744	Amphilophus_citrinellus
ENSOMEG00000013911	syf2	93	89.593	ENSAOCG00000010912	syf2	69	89.593	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.336	ENSAOCG00000022046	syf2	100	89.916	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.336	ENSAPEG00000018858	syf2	92	90.336	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000013911	syf2	100	89.076	ENSATEG00000007745	syf2	100	89.076	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000013911	syf2	84	85.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.000	Anas_platyrhynchos
ENSOMEG00000013911	syf2	70	70.659	ENSACAG00000026777	-	100	70.659	Anolis_carolinensis
ENSOMEG00000013911	syf2	86	84.314	ENSACAG00000013653	-	100	84.314	Anolis_carolinensis
ENSOMEG00000013911	syf2	91	84.259	ENSANAG00000032473	SYF2	96	78.992	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.336	ENSACLG00000019916	syf2	100	90.336	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000013911	syf2	100	82.353	ENSAMXG00000004051	syf2	100	82.353	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.883	ENSBTAG00000001651	SYF2	94	82.883	Bos_taurus
ENSOMEG00000013911	syf2	87	52.857	WBGene00019402	syf-2	90	52.133	Caenorhabditis_elegans
ENSOMEG00000013911	syf2	91	84.259	ENSCJAG00000046570	SYF2	96	79.412	Callithrix_jacchus
ENSOMEG00000013911	syf2	91	82.870	ENSCAFG00000012895	-	89	82.648	Canis_familiaris
ENSOMEG00000013911	syf2	91	78.241	ENSCAFG00000030331	-	93	77.523	Canis_familiaris
ENSOMEG00000013911	syf2	76	74.176	ENSCAFG00020021094	-	95	74.176	Canis_lupus_dingo
ENSOMEG00000013911	syf2	91	82.870	ENSCAFG00020021091	-	89	82.648	Canis_lupus_dingo
ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.432	ENSCHIG00000020874	SYF2	92	82.432	Capra_hircus
ENSOMEG00000013911	syf2	92	82.648	ENSTSYG00000005114	SYF2	91	81.532	Carlito_syrichta
ENSOMEG00000013911	syf2	83	83.333	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.333	Cavia_aperea
ENSOMEG00000013911	syf2	98	80.769	ENSCPOG00000005326	SYF2	94	80.769	Cavia_porcellus
ENSOMEG00000013911	syf2	91	84.259	ENSCCAG00000022459	SYF2	96	79.412	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000013911	syf2	100	78.151	ENSCATG00000026917	SYF2	96	78.151	Cercocebus_atys
ENSOMEG00000013911	syf2	99	80.335	ENSCLAG00000008474	SYF2	96	80.335	Chinchilla_lanigera
ENSOMEG00000013911	syf2	92	82.648	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	82.648	Chlorocebus_sabaeus
ENSOMEG00000013911	syf2	76	62.431	ENSCHOG00000005273	-	99	61.749	Choloepus_hoffmanni
ENSOMEG00000013911	syf2	93	83.784	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	81.435	Chrysemys_picta_bellii
ENSOMEG00000013911	syf2	89	54.930	ENSCING00000003017	-	89	55.399	Ciona_intestinalis
ENSOMEG00000013911	syf2	89	51.643	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.643	Ciona_savignyi
ENSOMEG00000013911	syf2	100	68.908	ENSCANG00000037322	SYF2	96	68.908	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.432	ENSCGRG00001020733	Syf2	92	82.432	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOMEG00000013911	syf2	82	83.673	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.838	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOMEG00000013911	syf2	92	89.450	ENSCSEG00000000117	syf2	99	84.810	Cynoglossus_semilaevis
ENSOMEG00000013911	syf2	93	94.144	ENSCVAG00000019543	syf2	100	89.958	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000013911	syf2	100	82.773	ENSDARG00000004706	syf2	100	82.773	Danio_rerio
ENSOMEG00000013911	syf2	99	80.085	ENSDNOG00000047605	SYF2	95	80.085	Dasypus_novemcinctus
ENSOMEG00000013911	syf2	93	83.333	ENSDORG00000001274	Syf2	91	83.333	Dipodomys_ordii
ENSOMEG00000013911	syf2	92	55.000	FBgn0033556	CG12343	97	55.000	Drosophila_melanogaster
ENSOMEG00000013911	syf2	92	66.210	ENSETEG00000015729	SYF2	94	66.210	Echinops_telfairi
ENSOMEG00000013911	syf2	83	59.391	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	Eptatretus_burgeri
ENSOMEG00000013911	syf2	100	69.421	ENSEASG00005004232	-	100	69.421	Equus_asinus_asinus
ENSOMEG00000013911	syf2	92	84.475	ENSEASG00005004224	-	89	84.475	Equus_asinus_asinus
ENSOMEG00000013911	syf2	92	84.475	ENSECAG00000010440	-	92	84.475	Equus_caballus
ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.883	ENSECAG00000012023	-	91	82.883	Equus_caballus
ENSOMEG00000013911	syf2	70	70.760	ENSEEUG00000015084	SYF2	93	70.760	Erinaceus_europaeus
ENSOMEG00000013911	syf2	100	83.613	ENSELUG00000003465	syf2	100	83.613	Esox_lucius
ENSOMEG00000013911	syf2	92	83.562	ENSFCAG00000043095	-	89	83.562	Felis_catus
ENSOMEG00000013911	syf2	92	84.475	ENSFCAG00000010324	-	76	84.475	Felis_catus
ENSOMEG00000013911	syf2	86	82.843	ENSFALG00000000460	SYF2	89	82.110	Ficedula_albicollis
ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.883	ENSFDAG00000008310	SYF2	91	82.883	Fukomys_damarensis
ENSOMEG00000013911	syf2	95	78.319	ENSFHEG00000007238	syf2	100	78.319	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000013911	syf2	90	88.837	ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.837	Gadus_morhua
ENSOMEG00000013911	syf2	95	81.938	ENSGALG00000013639	SYF2	87	84.862	Gallus_gallus
ENSOMEG00000013911	syf2	100	87.395	ENSGAFG00000019435	syf2	100	87.395	Gambusia_affinis
ENSOMEG00000013911	syf2	94	90.625	ENSGACG00000007305	syf2	100	88.285	Gasterosteus_aculeatus
ENSOMEG00000013911	syf2	93	84.234	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	81.857	Gopherus_agassizii
ENSOMEG00000013911	syf2	91	83.796	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	83.562	Gorilla_gorilla
ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.336	ENSHBUG00000020477	syf2	100	90.558	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.883	ENSHGLG00000014393	SYF2	91	82.883	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000013911	syf2	93	72.973	ENSHGLG00000004304	-	93	73.423	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.883	ENSHGLG00100014722	SYF2	91	82.883	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000013911	syf2	100	88.235	ENSHCOG00000012904	syf2	78	88.235	Hippocampus_comes
ENSOMEG00000013911	syf2	100	83.613	ENSIPUG00000019859	syf2	100	83.613	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000013911	syf2	61	78.082	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	78.082	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOMEG00000013911	syf2	84	83.920	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.920	Jaculus_jaculus
ENSOMEG00000013911	syf2	100	91.597	ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.597	Kryptolebias_marmoratus
ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.336	ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.336	Labrus_bergylta
ENSOMEG00000013911	syf2	92	82.569	ENSLACG00000012064	SYF2	92	82.569	Latimeria_chalumnae
ENSOMEG00000013911	syf2	100	83.193	ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.193	Lepisosteus_oculatus
ENSOMEG00000013911	syf2	99	79.253	ENSLAFG00000023150	-	97	79.253	Loxodonta_africana
ENSOMEG00000013911	syf2	77	54.891	ENSLAFG00000030814	-	100	54.891	Loxodonta_africana
ENSOMEG00000013911	syf2	100	78.151	ENSMFAG00000041831	SYF2	96	78.151	Macaca_fascicularis
ENSOMEG00000013911	syf2	91	82.870	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	82.648	Macaca_mulatta
ENSOMEG00000013911	syf2	100	78.151	ENSMNEG00000030180	SYF2	96	78.151	Macaca_nemestrina
ENSOMEG00000013911	syf2	100	78.151	ENSMLEG00000030248	SYF2	96	78.151	Mandrillus_leucophaeus
ENSOMEG00000013911	syf2	100	88.655	ENSMAMG00000010403	syf2	98	88.655	Mastacembelus_armatus
ENSOMEG00000013911	syf2	100	89.916	ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.916	Maylandia_zebra
ENSOMEG00000013911	syf2	84	84.925	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.925	Meleagris_gallopavo
ENSOMEG00000013911	syf2	93	83.333	ENSMAUG00000018974	Syf2	92	83.333	Mesocricetus_auratus
ENSOMEG00000013911	syf2	84	82.915	ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.915	Microcebus_murinus
ENSOMEG00000013911	syf2	99	79.079	ENSMOCG00000022938	Syf2	99	79.079	Microtus_ochrogaster
ENSOMEG00000013911	syf2	95	89.778	ENSMMOG00000002396	syf2	94	89.778	Mola_mola
ENSOMEG00000013911	syf2	93	77.679	ENSMODG00000013951	-	98	77.679	Monodelphis_domestica
ENSOMEG00000013911	syf2	100	88.382	ENSMALG00000010706	syf2	100	88.797	Monopterus_albus
ENSOMEG00000013911	syf2	93	83.333	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	92	83.333	Mus_caroli
ENSOMEG00000013911	syf2	93	83.333	ENSMUSG00000028821	Syf2	92	83.333	Mus_musculus
ENSOMEG00000013911	syf2	93	83.333	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	92	83.333	Mus_pahari
ENSOMEG00000013911	syf2	93	83.333	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	92	83.333	Mus_spretus
ENSOMEG00000013911	syf2	91	82.870	ENSMPUG00000015802	-	89	82.648	Mustela_putorius_furo
ENSOMEG00000013911	syf2	92	84.475	ENSMPUG00000015801	-	89	84.475	Mustela_putorius_furo
ENSOMEG00000013911	syf2	100	78.571	ENSMLUG00000001885	SYF2	96	78.571	Myotis_lucifugus
ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.432	ENSNGAG00000007912	Syf2	90	82.432	Nannospalax_galili
ENSOMEG00000013911	syf2	100	80.992	ENSNBRG00000010720	syf2	99	80.992	Neolamprologus_brichardi
ENSOMEG00000013911	syf2	91	83.796	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	83.562	Nomascus_leucogenys
ENSOMEG00000013911	syf2	98	79.915	ENSOPRG00000012870	SYF2	95	79.915	Ochotona_princeps
ENSOMEG00000013911	syf2	99	69.456	ENSODEG00000014338	-	99	69.167	Octodon_degus
ENSOMEG00000013911	syf2	97	78.151	ENSODEG00000017664	-	100	78.151	Octodon_degus
ENSOMEG00000013911	syf2	100	89.916	ENSONIG00000008213	syf2	100	89.916	Oreochromis_niloticus
ENSOMEG00000013911	syf2	85	83.663	ENSOANG00000009552	SYF2	100	83.663	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOMEG00000013911	syf2	91	84.259	ENSOCUG00000013050	SYF2	94	80.769	Oryctolagus_cuniculus
ENSOMEG00000013911	syf2	97	95.279	ENSORLG00000028820	syf2	100	95.279	Oryzias_latipes
ENSOMEG00000013911	syf2	100	94.958	ENSORLG00020018333	syf2	100	94.958	Oryzias_latipes_hni
ENSOMEG00000013911	syf2	100	94.118	ENSORLG00015014665	syf2	100	94.118	Oryzias_latipes_hsok
ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.432	ENSOGAG00000009962	SYF2	91	82.432	Otolemur_garnettii
ENSOMEG00000013911	syf2	93	81.696	ENSOARG00000006348	-	91	81.696	Ovis_aries
ENSOMEG00000013911	syf2	82	56.410	ENSOARG00000006269	-	100	56.410	Ovis_aries
ENSOMEG00000013911	syf2	91	83.796	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	83.562	Pan_paniscus
ENSOMEG00000013911	syf2	92	84.475	ENSPPRG00000001638	-	89	84.475	Panthera_pardus
ENSOMEG00000013911	syf2	92	83.562	ENSPPRG00000001651	-	89	83.562	Panthera_pardus
ENSOMEG00000013911	syf2	92	83.562	ENSPTIG00000007036	-	89	83.562	Panthera_tigris_altaica
ENSOMEG00000013911	syf2	91	84.722	ENSPTIG00000005711	-	80	84.404	Panthera_tigris_altaica
ENSOMEG00000013911	syf2	91	83.796	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	83.562	Pan_troglodytes
ENSOMEG00000013911	syf2	100	78.151	ENSPANG00000008139	SYF2	96	78.151	Papio_anubis
ENSOMEG00000013911	syf2	100	81.933	ENSPKIG00000008130	syf2	100	81.933	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOMEG00000013911	syf2	99	80.169	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	80.169	Pelodiscus_sinensis
ENSOMEG00000013911	syf2	93	90.498	ENSPMGG00000008755	syf2	86	90.498	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOMEG00000013911	syf2	99	78.661	ENSPEMG00000008283	Syf2	99	78.661	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOMEG00000013911	syf2	92	84.404	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	77.600	Phascolarctos_cinereus
ENSOMEG00000013911	syf2	95	92.000	ENSPFOG00000004116	syf2	93	92.000	Poecilia_formosa
ENSOMEG00000013911	syf2	99	88.085	ENSPLAG00000006691	syf2	97	91.556	Poecilia_latipinna
ENSOMEG00000013911	syf2	100	85.294	ENSPMEG00000011684	syf2	99	86.580	Poecilia_mexicana
ENSOMEG00000013911	syf2	91	94.444	ENSPREG00000003009	syf2	100	88.235	Poecilia_reticulata
ENSOMEG00000013911	syf2	92	83.562	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	83.562	Pongo_abelii
ENSOMEG00000013911	syf2	99	54.622	ENSPCOG00000027011	SYF2	92	54.936	Propithecus_coquereli
ENSOMEG00000013911	syf2	93	72.973	ENSPVAG00000005841	SYF2	91	72.973	Pteropus_vampyrus
ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.336	ENSPNYG00000004979	syf2	100	90.336	Pundamilia_nyererei
ENSOMEG00000013911	syf2	100	83.193	ENSPNAG00000015570	syf2	100	83.193	Pygocentrus_nattereri
ENSOMEG00000013911	syf2	93	83.333	ENSRNOG00000060597	Syf2	92	83.333	Rattus_norvegicus
ENSOMEG00000013911	syf2	100	76.050	ENSRBIG00000042970	SYF2	96	76.050	Rhinopithecus_bieti
ENSOMEG00000013911	syf2	100	78.151	ENSRROG00000001347	SYF2	96	78.151	Rhinopithecus_roxellana
ENSOMEG00000013911	syf2	91	83.796	ENSSBOG00000020184	SYF2	90	83.562	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOMEG00000013911	syf2	93	81.982	ENSSHAG00000015630	-	89	81.982	Sarcophilus_harrisii
ENSOMEG00000013911	syf2	86	83.495	ENSSHAG00000007152	-	100	83.495	Sarcophilus_harrisii
ENSOMEG00000013911	syf2	100	81.933	ENSSFOG00015023647	syf2	100	81.933	Scleropages_formosus
ENSOMEG00000013911	syf2	100	86.975	ENSSMAG00000009867	syf2	100	86.975	Scophthalmus_maximus
ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.336	ENSSDUG00000013072	syf2	100	90.336	Seriola_dumerili
ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.336	ENSSLDG00000012677	syf2	100	90.336	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOMEG00000013911	syf2	99	59.917	ENSSARG00000012889	SYF2	99	59.917	Sorex_araneus
ENSOMEG00000013911	syf2	98	80.687	ENSSPUG00000005251	SYF2	91	80.687	Sphenodon_punctatus
ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.336	ENSSPAG00000009626	syf2	100	90.336	Stegastes_partitus
ENSOMEG00000013911	syf2	99	77.686	ENSSSCG00000037481	SYF2	99	77.686	Sus_scrofa
ENSOMEG00000013911	syf2	63	54.305	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	53.714	Taeniopygia_guttata
ENSOMEG00000013911	syf2	100	84.167	ENSTRUG00000001499	syf2	95	84.810	Takifugu_rubripes
ENSOMEG00000013911	syf2	93	87.838	ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.838	Tetraodon_nigroviridis
ENSOMEG00000013911	syf2	100	59.244	ENSTBEG00000017370	SYF2	95	59.244	Tupaia_belangeri
ENSOMEG00000013911	syf2	91	83.796	ENSTTRG00000003550	SYF2	99	77.686	Tursiops_truncatus
ENSOMEG00000013911	syf2	92	82.648	ENSUAMG00000002897	SYF2	89	82.648	Ursus_americanus
ENSOMEG00000013911	syf2	91	82.407	ENSUMAG00000013108	SYF2	89	82.192	Ursus_maritimus
ENSOMEG00000013911	syf2	99	78.298	ENSVPAG00000005705	SYF2	96	78.298	Vicugna_pacos
ENSOMEG00000013911	syf2	86	82.927	ENSVVUG00000027181	-	88	82.648	Vulpes_vulpes
ENSOMEG00000013911	syf2	91	82.870	ENSVVUG00000027175	-	89	82.648	Vulpes_vulpes
ENSOMEG00000013911	syf2	93	81.081	ENSXETG00000022797	syf2	89	81.081	Xenopus_tropicalis
ENSOMEG00000013911	syf2	100	87.395	ENSXMAG00000022698	syf2	100	87.395	Xiphophorus_maculatus