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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOMEG00000014567 (Gene tree)
Gene ID: 112163017
Gene Symbol: tnpo1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_melastigma
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 31174 bases
Position: chrNVQA01000031.1:5198069-5229242
Accession: 112163017
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOMEP00000030335	IBN_N	PF03810.19	9.8e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOMET00000020625	-	5566	XM_024299097	ENSOMEP00000030335	888 (aa)	XP_024154865	UPI000CF7F8EE

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOMEG00000014567	tnpo1	100	86.052	ENSOMEG00000014877	TNPO2	100	86.052
ENSOMEG00000014567	tnpo1	100	85.827	ENSOMEG00000013440	TNPO2	100	85.827

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSG00000083312	TNPO1	100	92.746	Homo_sapiens
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.632	ENSAPOG00000003453	tnpo1	99	97.632	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.067	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.179	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOMEG00000014567	tnpo1	87	96.887	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	96.887	Amphilophus_citrinellus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.520	ENSAOCG00000008154	tnpo1	99	97.520	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.520	ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	97.520	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.182	ENSATEG00000010408	tnpo1	99	97.182	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	88.839	ENSAPLG00000009619	-	97	89.564	Anas_platyrhynchos
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.461	ENSACAG00000009599	TNPO1	99	93.461	Anolis_carolinensis
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	82.751	ENSANAG00000025351	-	99	82.751	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	58.287	ENSANAG00000027118	-	97	61.009	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.559	ENSANAG00000022453	-	99	92.559	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	95.265	ENSACLG00000027223	tnpo1	99	95.265	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	94.151	ENSAMXG00000009842	tnpo1	99	93.813	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	92.897	Bos_taurus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.672	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.672	Callithrix_jacchus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	96	92.882	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.882	Canis_familiaris
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	90.530	ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	90.530	Canis_lupus_dingo
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.785	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.785	Capra_hircus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	89.379	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.696	Carlito_syrichta
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.559	ENSCCAG00000026472	TNPO1	99	92.559	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSCATG00000043792	TNPO1	99	93.010	Cercocebus_atys
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.672	ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	92.672	Chinchilla_lanigera
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.010	Chlorocebus_sabaeus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	94	81.699	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.699	Choloepus_hoffmanni
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.687	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.687	Chrysemys_picta_bellii
ENSOMEG00000014567	tnpo1	100	76.708	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.372	Ciona_savignyi
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.010	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.897	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOMEG00000014567	tnpo1	96	92.982	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	92.982	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	95.490	ENSCSEG00000012674	tnpo1	99	95.490	Cynoglossus_semilaevis
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.294	ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	97.294	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	94.369	ENSDARG00000035390	tnpo1	99	93.919	Danio_rerio
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	87.303	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.303	Dasypus_novemcinctus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	93	92.892	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.883	Dipodomys_ordii
ENSOMEG00000014567	tnpo1	100	58.380	FBgn0035693	CG8219	99	58.043	Drosophila_melanogaster
ENSOMEG00000014567	tnpo1	86	94.007	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.007	Echinops_telfairi
ENSOMEG00000014567	tnpo1	95	85.595	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.714	Eptatretus_burgeri
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSEASG00005018055	TNPO1	99	93.010	Equus_asinus_asinus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.010	Equus_caballus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	88.634	ENSELUG00000002821	tnpo1	99	88.197	Esox_lucius
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSFCAG00000013181	TNPO1	99	93.010	Felis_catus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.574	ENSFALG00000010292	TNPO1	99	93.574	Ficedula_albicollis
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.672	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.672	Fukomys_damarensis
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	96.959	ENSFHEG00000019234	tnpo1	99	96.959	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.472	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.472	Gadus_morhua
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSGALG00000015014	TNPO1	99	93.010	Gallus_gallus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	96.738	ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	96.738	Gambusia_affinis
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	95.603	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	95.603	Gasterosteus_aculeatus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.687	ENSGAGG00000013419	TNPO1	99	93.687	Gopherus_agassizii
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSGGOG00000026800	TNPO1	99	93.010	Gorilla_gorilla
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	77.953	ENSGGOG00000022535	-	98	77.953	Gorilla_gorilla
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.069	ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	97.069	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.446	ENSHGLG00000000970	-	99	92.446	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000014567	tnpo1	97	72.558	ENSHGLG00100000963	-	99	71.977	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000014567	tnpo1	96	92.407	ENSHGLG00100017090	-	99	92.407	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.123	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	96	93.123	Jaculus_jaculus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	96.843	ENSKMAG00000018195	tnpo1	99	96.843	Kryptolebias_marmoratus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	91	93.441	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	92.946	Labrus_bergylta
ENSOMEG00000014567	tnpo1	96	87.209	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.209	Latimeria_chalumnae
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	94.701	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.701	Lepisosteus_oculatus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	98	92.263	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.263	Loxodonta_africana
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.010	Macaca_fascicularis
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.897	Macaca_mulatta
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.010	Macaca_nemestrina
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.010	Mandrillus_leucophaeus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.632	ENSMAMG00000001357	tnpo1	99	97.632	Mastacembelus_armatus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	96.618	ENSMZEG00005004913	tnpo1	99	96.618	Maylandia_zebra
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	92.897	Mesocricetus_auratus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	89.402	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.402	Microcebus_murinus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.897	Microtus_ochrogaster
ENSOMEG00000014567	tnpo1	87	96.248	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.248	Mola_mola
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.404	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.404	Monodelphis_domestica
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	95.941	ENSMALG00000009782	tnpo1	99	95.941	Monopterus_albus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.672	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	99	93.035	Mus_caroli
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	99	93.284	Mus_musculus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.785	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	99	93.159	Mus_pahari
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	99	93.284	Mus_spretus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.010	Mustela_putorius_furo
ENSOMEG00000014567	tnpo1	96	92.549	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.549	Myotis_lucifugus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.010	Nannospalax_galili
ENSOMEG00000014567	tnpo1	87	96.628	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.628	Neolamprologus_brichardi
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSNLEG00000004572	TNPO1	99	93.010	Nomascus_leucogenys
ENSOMEG00000014567	tnpo1	90	87.730	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.730	Ochotona_princeps
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.446	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.446	Octodon_degus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	96.305	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.305	Oreochromis_niloticus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	92	94.268	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.268	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	96	86.799	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.799	Oryctolagus_cuniculus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	87	98.316	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	98.316	Oryzias_latipes
ENSOMEG00000014567	tnpo1	100	98.761	ENSORLG00020011559	tnpo1	100	98.761	Oryzias_latipes_hni
ENSOMEG00000014567	tnpo1	100	99.099	ENSORLG00015019113	tnpo1	100	99.099	Oryzias_latipes_hsok
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.010	Otolemur_garnettii
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	ENSOARG00000005038	TNPO1	83	92.897	Ovis_aries
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.010	Pan_paniscus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSPPRG00000022336	TNPO1	99	93.010	Panthera_pardus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSPTIG00000018839	TNPO1	99	93.010	Panthera_tigris_altaica
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.010	Pan_troglodytes
ENSOMEG00000014567	tnpo1	94	81.994	ENSPTRG00000047731	-	99	81.579	Pan_troglodytes
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.010	Papio_anubis
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	90.755	ENSPKIG00000019795	tnpo1	99	90.755	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.574	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.574	Pelodiscus_sinensis
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.243	ENSPMGG00000017014	tnpo1	99	93.018	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	96	92.982	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.982	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	94.025	ENSPCIG00000026080	TNPO1	99	94.025	Phascolarctos_cinereus
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.191	ENSPFOG00000011447	tnpo1	99	97.191	Poecilia_formosa
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.191	ENSPLAG00000018696	tnpo1	99	97.191	Poecilia_latipinna
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.632	ENSPMEG00000024121	tnpo1	99	97.632	Poecilia_mexicana
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.188	ENSPREG00000020705	tnpo1	99	97.188	Poecilia_reticulata
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.897	Pongo_abelii
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.010	Propithecus_coquereli
ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	92.897	Pteropus_vampyrus
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ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.026	ENSPNAG00000021484	tnpo1	99	93.363	Pygocentrus_nattereri
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