EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOMEG00000016333 (Gene tree)
Gene ID: 112150565
Gene Symbol: prpf38a
Alias: -
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_melastigma
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6352 bases
Position: chrNVQA01000014.1:108274-114625
Accession: 112150565
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOMEP00000031467	PRP38	PF03371.15	2.3e-62	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOMET00000022803	-	2979	-	ENSOMEP00000031467	309 (aa)	XP_024134732	UPI000CF7EB79

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSG00000134748	PRPF38A	96	81.879	Homo_sapiens
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	95.146	ENSAPOG00000011652	prpf38a	100	95.146	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	96	81.879	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOMEG00000016333	prpf38a	72	91.892	ENSACIG00000012292	prpf38a	96	86.395	Amphilophus_citrinellus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	95.146	ENSAOCG00000018004	prpf38a	100	95.146	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	95.146	ENSAPEG00000021414	prpf38a	100	95.146	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000016333	prpf38a	72	94.118	ENSATEG00000004608	prpf38a	100	94.498	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	79	77.823	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	94	77.682	Anas_platyrhynchos
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	79.553	ENSACAG00000008249	PRPF38A	96	79.530	Anolis_carolinensis
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	60.317	ENSANAG00000029204	-	95	55.705	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSANAG00000027839	PRPF38A	96	81.879	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000016333	prpf38a	72	93.213	ENSACLG00000021595	prpf38a	100	93.851	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	84.026	ENSAMXG00000029274	prpf38a	100	85.942	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	96	81.879	Bos_taurus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	63	62.564	WBGene00008380	prp-38	59	64.362	Caenorhabditis_elegans
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	96	81.879	Callithrix_jacchus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	96	81.879	Canis_familiaris
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	96	81.879	Canis_lupus_dingo
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	96	81.879	Capra_hircus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	86	78.148	ENSTSYG00000031994	-	90	78.039	Carlito_syrichta
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSTSYG00000009868	-	96	81.879	Carlito_syrichta
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	83.280	ENSCPOG00000005079	PRPF38A	95	84.122	Cavia_porcellus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	75	89.177	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	95	81.544	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSCATG00000032296	PRPF38A	96	81.879	Cercocebus_atys
ENSOMEG00000016333	prpf38a	93	54.671	ENSCATG00000044190	-	57	56.383	Cercocebus_atys
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	96	81.879	Chinchilla_lanigera
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	80.831	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	96	80.872	Chrysemys_picta_bellii
ENSOMEG00000016333	prpf38a	75	66.667	ENSCSAVG00000009580	-	71	70.046	Ciona_savignyi
ENSOMEG00000016333	prpf38a	75	89.177	ENSCANG00000032608	PRPF38A	99	81.879	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSCGRG00001018502	-	96	81.879	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOMEG00000016333	prpf38a	84	72.797	ENSCGRG00001002557	-	74	76.471	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	96	81.879	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOMEG00000016333	prpf38a	72	93.213	ENSCSEG00000001269	prpf38a	100	87.075	Cynoglossus_semilaevis
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	96.117	ENSCVAG00000012305	prpf38a	100	96.117	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	83.706	ENSDARG00000039213	prpf38a	100	85.623	Danio_rerio
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	97	81.879	Dasypus_novemcinctus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	92	72.318	ENSDORG00000023691	-	75	82.110	Dipodomys_ordii
ENSOMEG00000016333	prpf38a	85	96.875	ENSDORG00000023857	-	95	96.875	Dipodomys_ordii
ENSOMEG00000016333	prpf38a	92	72.318	ENSDORG00000025371	-	75	82.110	Dipodomys_ordii
ENSOMEG00000016333	prpf38a	66	72.195	FBgn0050342	Prp38	57	75.000	Drosophila_melanogaster
ENSOMEG00000016333	prpf38a	77	80.753	ENSEBUG00000012588	prpf38a	96	73.913	Eptatretus_burgeri
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSEASG00005014427	PRPF38A	96	81.879	Equus_asinus_asinus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSECAG00000022628	PRPF38A	96	81.879	Equus_caballus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	72	92.760	ENSELUG00000021094	prpf38a	100	93.204	Esox_lucius
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSFCAG00000002518	PRPF38A	96	81.879	Felis_catus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	87	78.676	ENSFALG00000005598	-	95	78.599	Ficedula_albicollis
ENSOMEG00000016333	prpf38a	99	76.129	ENSFALG00000003612	-	73	84.404	Ficedula_albicollis
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	82.958	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	96	81.544	Fukomys_damarensis
ENSOMEG00000016333	prpf38a	91	82.918	ENSFHEG00000014317	prpf38a	99	95.238	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	54	96.988	ENSGMOG00000011384	prpf38a	54	96.988	Gadus_morhua
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.470	ENSGALG00000010627	PRPF38A	96	81.544	Gallus_gallus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	95.793	ENSGAFG00000012422	prpf38a	100	95.793	Gambusia_affinis
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	93.891	ENSGACG00000005423	prpf38a	100	93.891	Gasterosteus_aculeatus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	80.831	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	96	80.872	Gopherus_agassizii
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSGGOG00000003940	PRPF38A	96	81.879	Gorilla_gorilla
ENSOMEG00000016333	prpf38a	61	95.767	ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	95.745	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	73.312	ENSHGLG00000007918	-	95	71.088	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSHGLG00000000475	PRPF38A	96	81.879	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	73.312	ENSHGLG00100003928	-	95	71.088	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSHGLG00100008935	PRPF38A	96	81.879	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000016333	prpf38a	59	94.505	ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	94.681	Hippocampus_comes
ENSOMEG00000016333	prpf38a	90	78.947	ENSIPUG00000005757	prpf38a	96	83.946	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSSTOG00000015610	PRPF38A	96	81.879	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.150	ENSJJAG00000015811	Prpf38a	96	81.208	Jaculus_jaculus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	96.117	ENSKMAG00000006588	prpf38a	100	96.117	Kryptolebias_marmoratus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	93.204	ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	93.204	Labrus_bergylta
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSLACG00000011495	PRPF38A	96	81.879	Latimeria_chalumnae
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	91.290	ENSLOCG00000006262	prpf38a	95	91.864	Lepisosteus_oculatus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSLAFG00000025862	PRPF38A	96	81.879	Loxodonta_africana
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSMFAG00000039449	PRPF38A	96	81.879	Macaca_fascicularis
ENSOMEG00000016333	prpf38a	87	79.044	ENSMMUG00000014333	PRPF38A	93	78.682	Macaca_mulatta
ENSOMEG00000016333	prpf38a	93	53.979	ENSMNEG00000040242	-	68	58.140	Macaca_nemestrina
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSMNEG00000031221	PRPF38A	96	81.879	Macaca_nemestrina
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSMLEG00000041105	PRPF38A	96	81.879	Mandrillus_leucophaeus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	72	94.570	ENSMAMG00000015431	prpf38a	100	95.146	Mastacembelus_armatus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	72	93.213	ENSMZEG00005017838	prpf38a	100	93.851	Maylandia_zebra
ENSOMEG00000016333	prpf38a	75	88.745	ENSMGAG00000011176	PRPF38A	99	81.544	Meleagris_gallopavo
ENSOMEG00000016333	prpf38a	85	83.712	ENSMAUG00000018029	-	84	85.068	Mesocricetus_auratus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSMICG00000014193	PRPF38A	96	81.879	Microcebus_murinus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSMOCG00000013080	Prpf38a	96	81.879	Microtus_ochrogaster
ENSOMEG00000016333	prpf38a	91	89.716	ENSMMOG00000016972	prpf38a	95	88.514	Mola_mola
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	79.618	ENSMODG00000000644	PRPF38A	96	79.599	Monodelphis_domestica
ENSOMEG00000016333	prpf38a	72	94.570	ENSMALG00000019363	prpf38a	97	94.822	Monopterus_albus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.470	MGP_CAROLIEiJ_G0026269	Prpf38a	96	81.544	Mus_caroli
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.470	ENSMUSG00000063800	Prpf38a	96	81.544	Mus_musculus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.470	MGP_PahariEiJ_G0028602	Prpf38a	96	81.544	Mus_pahari
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.150	MGP_SPRETEiJ_G0027238	Prpf38a	93	92.553	Mus_spretus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSMPUG00000006896	PRPF38A	96	81.879	Mustela_putorius_furo
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	83.601	ENSNGAG00000011884	Prpf38a	96	81.879	Nannospalax_galili
ENSOMEG00000016333	prpf38a	72	91.892	ENSNBRG00000004013	prpf38a	94	86.054	Neolamprologus_brichardi
ENSOMEG00000016333	prpf38a	93	57.388	ENSNLEG00000033398	-	60	52.968	Nomascus_leucogenys
ENSOMEG00000016333	prpf38a	97	63.487	ENSNLEG00000012592	-	97	57.047	Nomascus_leucogenys
ENSOMEG00000016333	prpf38a	93	80.690	ENSNLEG00000017999	PRPF38A	88	80.727	Nomascus_leucogenys
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	77.955	ENSMEUG00000003860	PRPF38A	96	77.852	Notamacropus_eugenii
ENSOMEG00000016333	prpf38a	74	89.474	ENSOPRG00000008985	PRPF38A	92	90.045	Ochotona_princeps
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSODEG00000005869	PRPF38A	96	81.879	Octodon_degus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	72	92.760	ENSONIG00000007816	prpf38a	100	93.528	Oreochromis_niloticus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	75	45.923	ENSOANG00000009541	-	96	46.667	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSOCUG00000000963	PRPF38A	96	81.879	Oryctolagus_cuniculus
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ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	97.735	ENSORLG00015021393	prpf38a	100	97.966	Oryzias_latipes_hsok
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSOGAG00000005423	PRPF38A	96	81.879	Otolemur_garnettii
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSOARG00000005373	PRPF38A	96	81.879	Ovis_aries
ENSOMEG00000016333	prpf38a	93	69.416	ENSPPAG00000033867	-	68	70.588	Pan_paniscus
ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	ENSPPAG00000030905	PRPF38A	96	81.879	Pan_paniscus
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