EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOMEG00000020548 (Gene tree)
Gene ID: 112141001
Gene Symbol: srp9
Alias: -
Full Name: signal recognition particle 9
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_melastigma
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1750 bases
Position: chrNVQA01005953.1:207848-209597
Accession: 112141001
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOMEP00000034136	SRP9-21	PF05486.12	3.8e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOMET00000027876	-	799	-	ENSOMEP00000034136	86 (aa)	XP_024119814	UPI000CF7DBCC

Gene Model

Click here to download ENSOMEG00000020548's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOMEG00000020548's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOMEG00000020548	srp9	100	75.581	ENSG00000143742	SRP9	100	75.581	Homo_sapiens
ENSOMEG00000020548	srp9	100	94.186	ENSAPOG00000006089	srp9	100	94.186	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSAMEG00000014744	SRP9	100	77.907	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOMEG00000020548	srp9	100	69.767	ENSACIG00000022298	srp9	100	69.767	Amphilophus_citrinellus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	94.186	ENSAOCG00000014643	srp9	100	94.186	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000020548	srp9	100	94.186	ENSAPEG00000004398	srp9	100	94.186	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000020548	srp9	100	96.512	ENSATEG00000014339	srp9	100	96.512	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000020548	srp9	81	82.857	ENSAPLG00000015368	SRP9	100	82.857	Anas_platyrhynchos
ENSOMEG00000020548	srp9	100	81.395	ENSACAG00000005788	SRP9	100	81.395	Anolis_carolinensis
ENSOMEG00000020548	srp9	100	76.744	ENSANAG00000022626	SRP9	100	76.744	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000020548	srp9	100	96.512	ENSACLG00000018392	srp9	100	96.512	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000020548	srp9	100	94.186	ENSAMXG00000010366	srp9	100	94.186	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSBTAG00000033322	SRP9	100	77.907	Bos_taurus
ENSOMEG00000020548	srp9	88	53.947	WBGene00013984	ZK512.4	100	53.947	Caenorhabditis_elegans
ENSOMEG00000020548	srp9	100	76.744	ENSCJAG00000040095	SRP9	100	76.744	Callithrix_jacchus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSCAFG00000016162	SRP9	100	77.907	Canis_familiaris
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSCAFG00020003285	SRP9	100	77.907	Canis_lupus_dingo
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSCHIG00000006407	SRP9	100	77.907	Capra_hircus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	74.419	ENSTSYG00000026832	SRP9	100	74.419	Carlito_syrichta
ENSOMEG00000020548	srp9	100	76.744	ENSCPOG00000033454	SRP9	100	76.744	Cavia_porcellus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	75.581	ENSCCAG00000034464	SRP9	100	75.581	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	74.419	ENSCATG00000041813	SRP9	100	74.419	Cercocebus_atys
ENSOMEG00000020548	srp9	100	75.581	ENSCLAG00000001368	-	100	75.581	Chinchilla_lanigera
ENSOMEG00000020548	srp9	99	67.059	ENSCLAG00000017687	-	99	67.059	Chinchilla_lanigera
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSCHOG00000006096	-	100	77.907	Choloepus_hoffmanni
ENSOMEG00000020548	srp9	100	52.326	ENSCHOG00000012912	-	100	52.326	Choloepus_hoffmanni
ENSOMEG00000020548	srp9	58	76.000	ENSCHOG00000008435	-	100	76.000	Choloepus_hoffmanni
ENSOMEG00000020548	srp9	100	81.395	ENSCPBG00000011999	SRP9	100	81.395	Chrysemys_picta_bellii
ENSOMEG00000020548	srp9	100	74.419	ENSCANG00000030765	-	100	74.419	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	73.256	ENSCANG00000012015	-	100	73.256	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSCGRG00001008910	Srp9	100	77.907	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOMEG00000020548	srp9	74	73.438	ENSCGRG00000009651	Srp9	84	73.438	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOMEG00000020548	srp9	100	93.023	ENSCSEG00000018438	srp9	100	93.023	Cynoglossus_semilaevis
ENSOMEG00000020548	srp9	100	95.349	ENSCVAG00000001083	srp9	100	95.349	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	91.860	ENSDARG00000042851	srp9	100	91.860	Danio_rerio
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSDNOG00000013412	-	100	77.907	Dasypus_novemcinctus
ENSOMEG00000020548	srp9	90	41.558	FBgn0035827	Srp9	100	41.558	Drosophila_melanogaster
ENSOMEG00000020548	srp9	100	70.930	ENSETEG00000012291	SRP9	100	70.930	Echinops_telfairi
ENSOMEG00000020548	srp9	98	70.238	ENSEBUG00000009080	srp9	100	70.238	Eptatretus_burgeri
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSECAG00000033839	SRP9	100	77.907	Equus_caballus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	72.093	ENSEEUG00000001344	SRP9	100	72.093	Erinaceus_europaeus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	93.023	ENSELUG00000001506	srp9	100	93.023	Esox_lucius
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSFCAG00000010275	SRP9	62	77.907	Felis_catus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	80.233	ENSFALG00000011689	SRP9	100	80.233	Ficedula_albicollis
ENSOMEG00000020548	srp9	100	79.070	ENSFDAG00000020469	SRP9	100	79.070	Fukomys_damarensis
ENSOMEG00000020548	srp9	100	95.349	ENSFHEG00000011666	srp9	100	95.349	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	91.860	ENSGMOG00000003565	srp9	100	91.860	Gadus_morhua
ENSOMEG00000020548	srp9	100	79.070	ENSGALG00000026009	SRP9	100	79.070	Gallus_gallus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	94.186	ENSGAFG00000009506	srp9	100	94.186	Gambusia_affinis
ENSOMEG00000020548	srp9	100	95.349	ENSGACG00000004110	srp9	100	95.349	Gasterosteus_aculeatus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	81.395	ENSGAGG00000017129	SRP9	100	81.395	Gopherus_agassizii
ENSOMEG00000020548	srp9	100	75.581	ENSGGOG00000011555	SRP9	100	75.581	Gorilla_gorilla
ENSOMEG00000020548	srp9	100	96.512	ENSHBUG00000021430	srp9	100	96.512	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000020548	srp9	98	69.048	ENSHGLG00000006535	-	99	69.048	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000020548	srp9	100	72.093	ENSHGLG00000020168	-	100	72.093	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSHGLG00000002329	SRP9	100	77.907	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000020548	srp9	81	75.714	ENSHGLG00000019830	-	100	75.714	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000020548	srp9	93	77.500	ENSHGLG00000020925	-	100	77.500	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000020548	srp9	98	69.048	ENSHGLG00100009760	-	99	69.048	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000020548	srp9	100	66.279	ENSHGLG00100011806	-	100	66.279	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSHGLG00100019986	-	100	77.907	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000020548	srp9	100	72.093	ENSHGLG00100020800	-	100	72.093	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000020548	srp9	95	76.829	ENSHGLG00100016521	-	100	76.829	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000020548	srp9	100	70.930	ENSHCOG00000006978	srp9	100	70.930	Hippocampus_comes
ENSOMEG00000020548	srp9	100	91.860	ENSIPUG00000020674	srp9	100	91.860	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSSTOG00000026827	SRP9	100	77.907	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	76.744	ENSJJAG00000016583	Srp9	100	76.744	Jaculus_jaculus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	93.023	ENSKMAG00000014117	srp9	100	93.023	Kryptolebias_marmoratus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	96.512	ENSLBEG00000020620	srp9	100	96.512	Labrus_bergylta
ENSOMEG00000020548	srp9	100	82.558	ENSLACG00000007546	SRP9	100	82.558	Latimeria_chalumnae
ENSOMEG00000020548	srp9	100	87.209	ENSLOCG00000015903	srp9	100	87.209	Lepisosteus_oculatus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	79.070	ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	Loxodonta_africana
ENSOMEG00000020548	srp9	100	74.419	ENSMFAG00000002641	SRP9	100	74.419	Macaca_fascicularis
ENSOMEG00000020548	srp9	100	74.419	ENSMMUG00000000134	SRP9	100	74.419	Macaca_mulatta
ENSOMEG00000020548	srp9	100	74.419	ENSMNEG00000043512	SRP9	100	74.419	Macaca_nemestrina
ENSOMEG00000020548	srp9	100	74.419	ENSMLEG00000037309	SRP9	100	74.419	Mandrillus_leucophaeus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	96.512	ENSMAMG00000004755	srp9	100	96.512	Mastacembelus_armatus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	96.512	ENSMZEG00005015517	srp9	100	96.512	Maylandia_zebra
ENSOMEG00000020548	srp9	100	79.070	ENSMGAG00000008061	SRP9	100	79.070	Meleagris_gallopavo
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSMAUG00000017552	Srp9	100	77.907	Mesocricetus_auratus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSMICG00000030104	-	100	77.907	Microcebus_murinus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSMOCG00000012590	Srp9	100	77.907	Microtus_ochrogaster
ENSOMEG00000020548	srp9	100	91.954	ENSMMOG00000014838	srp9	100	91.954	Mola_mola
ENSOMEG00000020548	srp9	100	79.070	ENSMODG00000025664	SRP9	100	79.070	Monodelphis_domestica
ENSOMEG00000020548	srp9	100	94.186	ENSMALG00000004262	srp9	100	94.186	Monopterus_albus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	MGP_CAROLIEiJ_G0014997	Srp9	100	77.907	Mus_caroli
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSMUSG00000026511	Srp9	100	77.907	Mus_musculus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	75.581	MGP_PahariEiJ_G0028229	Srp9	100	75.581	Mus_pahari
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	MGP_SPRETEiJ_G0015797	Srp9	100	77.907	Mus_spretus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	79.070	ENSMLUG00000014914	SRP9	100	79.070	Myotis_lucifugus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	79.070	ENSNGAG00000019936	Srp9	100	79.070	Nannospalax_galili
ENSOMEG00000020548	srp9	100	96.512	ENSNBRG00000010915	srp9	100	96.512	Neolamprologus_brichardi
ENSOMEG00000020548	srp9	100	75.581	ENSNLEG00000013740	SRP9	100	75.581	Nomascus_leucogenys
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSOPRG00000012133	SRP9	100	77.907	Ochotona_princeps
ENSOMEG00000020548	srp9	100	67.045	ENSODEG00000010125	-	76	67.045	Octodon_degus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	70.930	ENSODEG00000015075	-	100	70.930	Octodon_degus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	95.349	ENSONIG00000011409	srp9	100	95.349	Oreochromis_niloticus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	79.070	ENSOANG00000001472	SRP9	100	79.070	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSOCUG00000010791	SRP9	100	77.907	Oryctolagus_cuniculus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	98.837	ENSORLG00020003090	srp9	100	98.837	Oryzias_latipes_hni
ENSOMEG00000020548	srp9	100	98.837	ENSORLG00015001636	srp9	89	98.837	Oryzias_latipes_hsok
ENSOMEG00000020548	srp9	100	73.256	ENSOGAG00000001752	-	100	73.256	Otolemur_garnettii
ENSOMEG00000020548	srp9	100	73.256	ENSOGAG00000031299	-	100	73.256	Otolemur_garnettii
ENSOMEG00000020548	srp9	100	75.581	ENSPPAG00000042680	SRP9	100	75.581	Pan_paniscus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSPPRG00000011732	SRP9	100	77.907	Panthera_pardus
ENSOMEG00000020548	srp9	71	78.689	ENSPTIG00000014838	SRP9	71	78.689	Panthera_tigris_altaica
ENSOMEG00000020548	srp9	100	75.581	ENSPTRG00000002038	SRP9	100	75.581	Pan_troglodytes
ENSOMEG00000020548	srp9	100	74.419	ENSPANG00000030164	SRP9	100	74.419	Papio_anubis
ENSOMEG00000020548	srp9	100	87.209	ENSPKIG00000015012	srp9	100	87.209	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOMEG00000020548	srp9	100	81.395	ENSPSIG00000014842	SRP9	100	81.395	Pelodiscus_sinensis
ENSOMEG00000020548	srp9	100	69.767	ENSPMGG00000002318	srp9	100	69.767	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	79.070	ENSPEMG00000022774	Srp9	100	79.070	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOMEG00000020548	srp9	100	79.070	ENSPCIG00000017399	SRP9	100	79.070	Phascolarctos_cinereus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	94.186	ENSPREG00000020242	srp9	100	94.186	Poecilia_reticulata
ENSOMEG00000020548	srp9	97	75.904	ENSPPYG00000000174	SRP9	100	75.904	Pongo_abelii
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSPCAG00000014886	SRP9	100	77.907	Procavia_capensis
ENSOMEG00000020548	srp9	71	77.049	ENSPCOG00000021743	-	98	77.049	Propithecus_coquereli
ENSOMEG00000020548	srp9	100	62.921	ENSPCOG00000012531	-	100	62.921	Propithecus_coquereli
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSPVAG00000008142	SRP9	100	77.907	Pteropus_vampyrus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	96.512	ENSPNYG00000010536	srp9	100	96.512	Pundamilia_nyererei
ENSOMEG00000020548	srp9	100	94.186	ENSPNAG00000008264	srp9	100	94.186	Pygocentrus_nattereri
ENSOMEG00000020548	srp9	100	80.233	ENSRNOG00000003211	Srp9	100	80.233	Rattus_norvegicus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	74.419	ENSRBIG00000040480	SRP9	100	74.419	Rhinopithecus_bieti
ENSOMEG00000020548	srp9	100	74.419	ENSRROG00000028703	SRP9	100	74.419	Rhinopithecus_roxellana
ENSOMEG00000020548	srp9	100	76.744	ENSSBOG00000034573	SRP9	100	76.744	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOMEG00000020548	srp9	100	79.070	ENSSHAG00000013504	SRP9	100	79.070	Sarcophilus_harrisii
ENSOMEG00000020548	srp9	100	86.047	ENSSFOG00015000310	srp9	100	86.047	Scleropages_formosus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	95.349	ENSSMAG00000001318	srp9	100	95.349	Scophthalmus_maximus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	95.349	ENSSDUG00000008772	srp9	100	95.349	Seriola_dumerili
ENSOMEG00000020548	srp9	87	94.667	ENSSLDG00000019141	srp9	95	94.667	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOMEG00000020548	srp9	74	78.125	ENSSPUG00000014436	SRP9	84	78.125	Sphenodon_punctatus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	96.512	ENSSPAG00000017244	srp9	100	96.512	Stegastes_partitus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSSSCG00000031664	-	100	77.907	Sus_scrofa
ENSOMEG00000020548	srp9	100	80.233	ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	Taeniopygia_guttata
ENSOMEG00000020548	srp9	100	90.698	ENSTRUG00000024107	srp9	100	90.698	Takifugu_rubripes
ENSOMEG00000020548	srp9	100	90.698	ENSTNIG00000007254	srp9	100	90.698	Tetraodon_nigroviridis
ENSOMEG00000020548	srp9	100	76.744	ENSTBEG00000005634	SRP9	100	76.744	Tupaia_belangeri
ENSOMEG00000020548	srp9	71	78.689	ENSTTRG00000010081	SRP9	98	78.689	Tursiops_truncatus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSUAMG00000020489	SRP9	100	77.907	Ursus_americanus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSUMAG00000015908	SRP9	100	77.907	Ursus_maritimus
ENSOMEG00000020548	srp9	71	78.689	ENSVPAG00000001698	SRP9	98	78.689	Vicugna_pacos
ENSOMEG00000020548	srp9	100	77.907	ENSVVUG00000002065	SRP9	100	77.907	Vulpes_vulpes
ENSOMEG00000020548	srp9	100	93.023	ENSXCOG00000000662	srp9	100	93.023	Xiphophorus_couchianus
ENSOMEG00000020548	srp9	100	93.023	ENSXMAG00000029514	srp9	100	93.023	Xiphophorus_maculatus