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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSOMEG00000020869 (Gene tree)
Gene ID: 112148342
Gene Symbol: HABP4
Alias: -
Full Name: intracellular hyaluronan-binding protein 4-like
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_melastigma
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7743 bases
Position: chrNVQA01000012.1:19551799-19559541
Accession: 112148342
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOMEP00000034319	HABP4_PAI-RBP1	PF04774.15	5e-24	1	1
ENSOMEP00000034300	HABP4_PAI-RBP1	PF04774.15	5e-24	1	1
ENSOMEP00000034354	HABP4_PAI-RBP1	PF04774.15	5.3e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOMET00000028175	HABP4-201	2596	-	ENSOMEP00000034300	352 (aa)	-	-
ENSOMET00000028219	HABP4-203	1989	-	ENSOMEP00000034319	350 (aa)	XP_024131174	UPI000CF7E7A4
ENSOMET00000028198	HABP4-202	2670	-	ENSOMEP00000034354	362 (aa)	-	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	37.553	ENSOMEG00000002349	serbp1a	55	44.545

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	34.109	ENSG00000142864	SERBP1	99	34.860	Homo_sapiens
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	33.732	ENSG00000130956	HABP4	96	33.580	Homo_sapiens
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	32.614	ENSAPOG00000001006	serbp1a	99	38.596	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000020869	HABP4	98	35.264	ENSAMEG00000012025	HABP4	55	41.589	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	32.598	ENSAMEG00000004536	SERBP1	56	41.485	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOMEG00000020869	HABP4	52	62.162	ENSACIG00000004102	-	96	62.162	Amphilophus_citrinellus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	35.938	ENSACIG00000024386	serbp1a	99	36.267	Amphilophus_citrinellus
ENSOMEG00000020869	HABP4	100	32.297	ENSAOCG00000002731	serbp1a	99	38.250	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000020869	HABP4	100	32.297	ENSAPEG00000009604	serbp1a	99	38.250	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	46.188	ENSATEG00000023637	serbp1a	99	39.848	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000020869	HABP4	95	61.243	ENSATEG00000017443	zgc:103482	87	61.424	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000020869	HABP4	59	52.294	ENSACAG00000012890	HABP4	53	51.818	Anolis_carolinensis
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	41.256	ENSANAG00000035090	HABP4	56	42.593	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000020869	HABP4	87	32.778	ENSANAG00000022432	-	92	32.410	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	40.084	ENSACLG00000012541	serbp1b	99	35.593	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000020869	HABP4	100	63.510	ENSACLG00000013964	HABP4	99	64.624	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	43.333	ENSACLG00000005768	serbp1a	99	38.281	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000020869	HABP4	59	40.476	ENSBTAG00000011586	HABP4	96	33.578	Bos_taurus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	33.162	ENSBTAG00000012957	SERBP1	99	35.025	Bos_taurus
ENSOMEG00000020869	HABP4	100	33.010	ENSCJAG00000012589	HABP4	97	34.321	Callithrix_jacchus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	32.763	ENSCJAG00000017440	SERBP1	99	33.661	Callithrix_jacchus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	32.598	ENSCAFG00000018538	SERBP1	56	41.485	Canis_familiaris
ENSOMEG00000020869	HABP4	65	41.949	ENSCAFG00000001205	HABP4	69	41.509	Canis_familiaris
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	34.080	ENSCAFG00020022704	HABP4	96	34.321	Canis_lupus_dingo
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	32.598	ENSCAFG00020020723	SERBP1	99	33.498	Canis_lupus_dingo
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	42.180	ENSCHIG00000018392	HABP4	96	33.578	Capra_hircus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	31.841	ENSCHIG00000026670	SERBP1	99	34.321	Capra_hircus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	32.598	ENSTSYG00000011047	-	99	34.550	Carlito_syrichta
ENSOMEG00000020869	HABP4	59	40.654	ENSTSYG00000012837	HABP4	57	42.326	Carlito_syrichta
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	41.778	ENSCAPG00000013397	SERBP1	65	42.105	Cavia_aperea
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	44.495	ENSCAPG00000014437	HABP4	71	45.161	Cavia_aperea
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	40.553	ENSCPOG00000002477	HABP4	52	41.204	Cavia_porcellus
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	41.778	ENSCPOG00000020069	SERBP1	99	34.171	Cavia_porcellus
ENSOMEG00000020869	HABP4	87	33.141	ENSCCAG00000022165	-	55	42.342	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	41.256	ENSCCAG00000029535	HABP4	51	42.523	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	39.252	ENSCCAG00000027532	-	65	40.179	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	33.990	ENSCCAG00000018061	-	99	33.661	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	42.661	ENSCATG00000040518	HABP4	96	33.820	Cercocebus_atys
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	30.469	ENSCATG00000041393	SERBP1	56	41.739	Cercocebus_atys
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	41.333	ENSCLAG00000007459	SERBP1	69	41.667	Chinchilla_lanigera
ENSOMEG00000020869	HABP4	59	43.396	ENSCLAG00000016858	HABP4	98	35.309	Chinchilla_lanigera
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	42.254	ENSCSAG00000001365	SERBP1	54	43.243	Chlorocebus_sabaeus
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	42.857	ENSCSAG00000006711	HABP4	96	34.069	Chlorocebus_sabaeus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	40.519	ENSCPBG00000005444	HABP4	97	39.844	Chrysemys_picta_bellii
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	38.934	ENSCPBG00000001466	SERBP1	53	41.935	Chrysemys_picta_bellii
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	39.738	ENSCANG00000028280	SERBP1	56	41.739	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	42.661	ENSCANG00000035903	HABP4	99	42.408	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	34.236	ENSCGRG00001025040	Habp4	96	33.990	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	39.912	ENSCGRG00001016800	-	99	33.251	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	36.245	ENSCGRG00001001542	-	54	36.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOMEG00000020869	HABP4	52	43.617	ENSCGRG00000004203	-	100	42.553	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	36.245	ENSCGRG00000015284	-	54	36.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOMEG00000020869	HABP4	100	62.431	ENSCSEG00000011016	-	99	62.431	Cynoglossus_semilaevis
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	44.749	ENSCSEG00000007473	serbp1a	99	38.832	Cynoglossus_semilaevis
ENSOMEG00000020869	HABP4	95	54.277	ENSCVAG00000020812	HABP4	85	54.734	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	43.636	ENSCVAG00000010534	serbp1a	99	37.817	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	44.860	ENSDARG00000074242	serbp1a	53	45.794	Danio_rerio
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	45.098	ENSDARG00000025174	zgc:103482	98	45.098	Danio_rerio
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	40.465	ENSDNOG00000007710	HABP4	96	33.995	Dasypus_novemcinctus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	32.041	ENSDNOG00000014249	SERBP1	85	32.031	Dasypus_novemcinctus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	32.598	ENSDORG00000002189	-	99	33.498	Dipodomys_ordii
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	36.404	ENSETEG00000010024	SERBP1	56	41.126	Echinops_telfairi
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	39.655	ENSEBUG00000012593	serbp1b	70	42.534	Eptatretus_burgeri
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	42.593	ENSEASG00005007881	SERBP1	54	42.986	Equus_asinus_asinus
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	40.284	ENSEASG00005020009	HABP4	50	41.395	Equus_asinus_asinus
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	42.593	ENSECAG00000014617	SERBP1	54	42.986	Equus_caballus
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	40.284	ENSECAG00000008748	HABP4	50	41.395	Equus_caballus
ENSOMEG00000020869	HABP4	61	34.234	ENSEEUG00000015755	HABP4	51	33.645	Erinaceus_europaeus
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	40.351	ENSEEUG00000000611	SERBP1	56	41.991	Erinaceus_europaeus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	33.333	ENSELUG00000003727	serbp1a	99	34.266	Esox_lucius
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	31.891	ENSELUG00000004698	serbp1b	99	33.647	Esox_lucius
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	44.086	ENSELUG00000011872	zgc:103482	96	45.333	Esox_lucius
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	34.663	ENSFCAG00000027471	HABP4	96	34.158	Felis_catus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	34.177	ENSFCAG00000000606	SERBP1	54	42.986	Felis_catus
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	42.466	ENSFALG00000012912	SERBP1	51	44.934	Ficedula_albicollis
ENSOMEG00000020869	HABP4	100	37.366	ENSFALG00000003327	HABP4	96	37.366	Ficedula_albicollis
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	42.922	ENSFDAG00000016661	SERBP1	74	42.601	Fukomys_damarensis
ENSOMEG00000020869	HABP4	51	44.086	ENSFDAG00000011255	-	100	43.407	Fukomys_damarensis
ENSOMEG00000020869	HABP4	100	60.955	ENSFHEG00000018366	HABP4	99	61.798	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000020869	HABP4	86	46.847	ENSFHEG00000001151	serbp1a	99	38.903	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000020869	HABP4	77	53.738	ENSGMOG00000007621	zgc:103482	98	42.458	Gadus_morhua
ENSOMEG00000020869	HABP4	77	35.275	ENSGMOG00000011759	-	77	34.951	Gadus_morhua
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	35.733	ENSGALG00000012628	HABP4	97	36.022	Gallus_gallus
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	43.049	ENSGALG00000011229	SERBP1	53	43.388	Gallus_gallus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	39.788	ENSGAFG00000006060	serbp1a	99	39.572	Gambusia_affinis
ENSOMEG00000020869	HABP4	100	55.738	ENSGACG00000006722	HABP4	97	54.098	Gasterosteus_aculeatus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	33.933	ENSGACG00000014467	serbp1a	99	35.294	Gasterosteus_aculeatus
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	42.128	ENSGAGG00000013865	SERBP1	52	43.515	Gopherus_agassizii
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	33.971	ENSGGOG00000012317	HABP4	96	33.002	Gorilla_gorilla
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	32.518	ENSGGOG00000010396	SERBP1	99	33.661	Gorilla_gorilla
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	40.084	ENSHBUG00000014305	serbp1b	99	35.593	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000020869	HABP4	100	63.231	ENSHBUG00000003616	HABP4	99	64.345	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	43.333	ENSHBUG00000010298	serbp1a	99	38.281	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	42.180	ENSHGLG00000016106	HABP4	53	43.458	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	43.256	ENSHGLG00000004565	SERBP1	99	35.162	Heterocephalus_glaber_female
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	43.256	ENSHGLG00100005538	SERBP1	99	35.162	Heterocephalus_glaber_male
ENSOMEG00000020869	HABP4	100	59.944	ENSHCOG00000003516	HABP4	99	60.224	Hippocampus_comes
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	41.071	ENSIPUG00000005252	serbp1a	99	34.328	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	43.296	ENSIPUG00000004762	zgc:103482	98	42.737	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	34.921	ENSIPUG00000006028	serbp1b	99	34.653	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	32.593	ENSSTOG00000026587	SERBP1	56	41.485	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	33.413	ENSJJAG00000015599	Habp4	96	33.416	Jaculus_jaculus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	32.353	ENSJJAG00000023871	Serbp1	56	41.485	Jaculus_jaculus
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	44.286	ENSKMAG00000006722	serbp1a	99	37.824	Kryptolebias_marmoratus
ENSOMEG00000020869	HABP4	100	62.466	ENSKMAG00000000193	HABP4	99	63.288	Kryptolebias_marmoratus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	36.058	ENSLBEG00000009964	serbp1b	99	35.096	Labrus_bergylta
ENSOMEG00000020869	HABP4	100	64.835	ENSLBEG00000018951	HABP4	99	64.286	Labrus_bergylta
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	37.371	ENSLACG00000011025	HABP4	96	37.887	Latimeria_chalumnae
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ENSOMEG00000020869	HABP4	100	33.097	ENSSLDG00000005983	serbp1a	99	38.083	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	34.783	ENSSLDG00000020011	serbp1b	99	34.783	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	39.474	ENSSARG00000000803	SERBP1	75	41.048	Sorex_araneus
ENSOMEG00000020869	HABP4	59	43.750	ENSSARG00000004558	HABP4	71	43.556	Sorex_araneus
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	39.098	ENSSPUG00000004571	HABP4	97	38.710	Sphenodon_punctatus
ENSOMEG00000020869	HABP4	58	42.152	ENSSPAG00000014054	serbp1a	99	36.842	Stegastes_partitus
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ENSOMEG00000020869	HABP4	99	31.373	ENSSSCG00000003798	SERBP1	88	32.231	Sus_scrofa
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ENSOMEG00000020869	HABP4	100	36.207	ENSTRUG00000023406	serbp1b	99	35.012	Takifugu_rubripes
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ENSOMEG00000020869	HABP4	58	43.694	ENSTNIG00000013171	serbp1a	99	35.443	Tetraodon_nigroviridis
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ENSOMEG00000020869	HABP4	52	43.229	ENSUMAG00000009860	-	99	42.553	Ursus_maritimus
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ENSOMEG00000020869	HABP4	99	34.336	ENSVVUG00000022970	HABP4	96	34.577	Vulpes_vulpes
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	34.177	ENSVVUG00000015590	SERBP1	99	34.171	Vulpes_vulpes
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	34.491	ENSXETG00000012394	serbp1	99	34.837	Xenopus_tropicalis
ENSOMEG00000020869	HABP4	99	39.566	ENSXETG00000014841	habp4	99	36.702	Xenopus_tropicalis
ENSOMEG00000020869	HABP4	57	35.616	ENSXCOG00000010063	serbp1b	99	34.250	Xiphophorus_couchianus
ENSOMEG00000020869	HABP4	100	38.172	ENSXMAG00000011677	serbp1a	99	39.516	Xiphophorus_maculatus
ENSOMEG00000020869	HABP4	96	63.506	ENSXMAG00000015986	HABP4	99	64.266	Xiphophorus_maculatus