EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOMEG00000023485 (Gene tree)
Gene ID: 112148449
Gene Symbol: MTERF1
Alias: -
Full Name: mitochondrial transcription termination factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_melastigma
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1155 bases
Position: chrNVQA01000001.1:750409-751563
Accession: 112148449
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOMEP00000035955	mTERF	PF02536.14	5.5e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOMET00000036667	MTERF1-201	1155	-	ENSOMEP00000035955	384 (aa)	XP_024131349	UPI000CF82816

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOMEG00000023485	MTERF1	92	48.305	ENSG00000127989	MTERF1	93	48.305	Homo_sapiens
ENSOMEG00000023485	MTERF1	98	72.513	ENSAPOG00000022230	MTERF1	99	72.513	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	71	45.985	ENSAMEG00000007917	-	89	44.089	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOMEG00000023485	MTERF1	87	30.060	ENSAMEG00000018572	MTERF2	86	30.060	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOMEG00000023485	MTERF1	98	75.196	ENSACIG00000017700	MTERF1	98	75.196	Amphilophus_citrinellus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	99	69.430	ENSAOCG00000004345	MTERF1	100	69.430	Amphiprion_ocellaris
ENSOMEG00000023485	MTERF1	99	69.430	ENSAPEG00000005877	MTERF1	100	69.430	Amphiprion_percula
ENSOMEG00000023485	MTERF1	98	65.617	ENSATEG00000011055	MTERF1	99	65.617	Anabas_testudineus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	48.810	ENSACAG00000015777	MTERF1	84	48.810	Anolis_carolinensis
ENSOMEG00000023485	MTERF1	82	51.111	ENSANAG00000022640	MTERF1	84	50.920	Aotus_nancymaae
ENSOMEG00000023485	MTERF1	98	74.935	ENSACLG00000011571	MTERF1	99	74.935	Astatotilapia_calliptera
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	56.213	ENSAMXG00000017008	MTERF1	95	56.213	Astyanax_mexicanus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	83	51.411	ENSBTAG00000045617	MTERF1	90	49.162	Bos_taurus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	82	51.111	ENSCJAG00000014169	MTERF1	82	50.920	Callithrix_jacchus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	83	48.265	ENSCAFG00000001908	MTERF1	83	48.171	Canis_familiaris
ENSOMEG00000023485	MTERF1	83	48.265	ENSCAFG00020015983	MTERF1	83	48.171	Canis_lupus_dingo
ENSOMEG00000023485	MTERF1	93	47.765	ENSCHIG00000013172	MTERF1	90	47.765	Capra_hircus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	83	51.097	ENSTSYG00000012629	MTERF1	83	51.360	Carlito_syrichta
ENSOMEG00000023485	MTERF1	86	49.091	ENSCPOG00000003510	MTERF1	81	49.091	Cavia_porcellus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	82	52.698	ENSCCAG00000026587	MTERF1	83	52.454	Cebus_capucinus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	52.147	ENSCATG00000039620	MTERF1	82	52.147	Cercocebus_atys
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	50.920	ENSCSAG00000012508	MTERF1	82	50.920	Chlorocebus_sabaeus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	95	51.913	ENSCPBG00000021801	MTERF1	91	51.913	Chrysemys_picta_bellii
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	50.613	ENSCANG00000030925	MTERF1	82	50.613	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	87	49.102	ENSCGRG00001009716	-	90	48.830	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	48.810	ENSCGRG00000018838	-	88	48.810	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOMEG00000023485	MTERF1	98	72.823	ENSCVAG00000007837	MTERF1	99	72.823	Cyprinodon_variegatus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	58.235	ENSDARG00000086107	MTERF1	93	58.235	Danio_rerio
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	37.941	ENSDNOG00000032229	MTERF1	73	37.941	Dasypus_novemcinctus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	46.462	ENSDORG00000028877	-	86	46.462	Dipodomys_ordii
ENSOMEG00000023485	MTERF1	87	30.267	ENSEASG00005019198	MTERF2	86	30.267	Equus_asinus_asinus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	50.613	ENSEASG00005019646	MTERF1	84	50.613	Equus_asinus_asinus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	50.307	ENSECAG00000018128	MTERF1	84	50.307	Equus_caballus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	82	50.476	ENSEEUG00000013448	MTERF1	80	50.476	Erinaceus_europaeus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	98	64.156	ENSELUG00000014952	MTERF1	96	64.156	Esox_lucius
ENSOMEG00000023485	MTERF1	90	30.659	ENSELUG00000020338	mterf2	87	30.659	Esox_lucius
ENSOMEG00000023485	MTERF1	83	48.896	ENSFCAG00000044797	MTERF1	87	46.910	Felis_catus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	98	69.895	ENSFHEG00000000224	MTERF1	99	69.895	Fundulus_heteroclitus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	66.667	ENSGMOG00000007262	-	97	66.667	Gadus_morhua
ENSOMEG00000023485	MTERF1	98	69.048	ENSGAFG00000008852	MTERF1	99	69.048	Gambusia_affinis
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	56.575	ENSGAGG00000025333	MTERF1	80	56.575	Gopherus_agassizii
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	50.613	ENSGGOG00000025995	MTERF1	83	50.613	Gorilla_gorilla
ENSOMEG00000023485	MTERF1	98	74.935	ENSHBUG00000022218	MTERF1	99	74.935	Haplochromis_burtoni
ENSOMEG00000023485	MTERF1	96	64.628	ENSHCOG00000016064	MTERF1	98	64.628	Hippocampus_comes
ENSOMEG00000023485	MTERF1	92	57.983	ENSIPUG00000004017	mterf1	93	57.983	Ictalurus_punctatus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	86	50.151	ENSSTOG00000001846	MTERF1	85	50.151	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	51.682	ENSJJAG00000011811	-	88	51.682	Jaculus_jaculus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	98	63.492	ENSKMAG00000009695	MTERF1	98	63.492	Kryptolebias_marmoratus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	74	30.796	ENSLBEG00000010377	mterf2	84	30.796	Labrus_bergylta
ENSOMEG00000023485	MTERF1	95	30.894	ENSLBEG00000000090	mterf2	94	30.894	Labrus_bergylta
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	60.177	ENSLACG00000009880	MTERF1	85	60.177	Latimeria_chalumnae
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	68.035	ENSLOCG00000018348	MTERF1	88	68.035	Lepisosteus_oculatus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	50.000	ENSLAFG00000000054	MTERF1	86	50.000	Loxodonta_africana
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	51.534	ENSMFAG00000038723	MTERF1	82	51.534	Macaca_fascicularis
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	51.534	ENSMMUG00000015516	MTERF1	86	51.534	Macaca_mulatta
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	51.534	ENSMNEG00000041445	MTERF1	82	51.534	Macaca_nemestrina
ENSOMEG00000023485	MTERF1	82	51.746	ENSMLEG00000008543	MTERF1	82	51.534	Mandrillus_leucophaeus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	98	69.816	ENSMAMG00000015682	MTERF1	99	69.816	Mastacembelus_armatus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	98	74.935	ENSMZEG00005026659	MTERF1	99	74.935	Maylandia_zebra
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	48.378	ENSMAUG00000006025	-	89	48.378	Mesocricetus_auratus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	86	51.205	ENSMICG00000046314	MTERF1	84	51.205	Microcebus_murinus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	55	64.815	ENSMALG00000007587	MTERF1	87	64.815	Monopterus_albus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	86	30.448	ENSMUSG00000049038	Mterf2	86	30.448	Mus_musculus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	48.246	ENSMUSG00000040429	Mterf1a	90	48.246	Mus_musculus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	48.538	ENSMUSG00000053178	Mterf1b	90	48.538	Mus_musculus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	47.661	MGP_PahariEiJ_G0021713	-	90	47.661	Mus_pahari
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	47.661	MGP_PahariEiJ_G0021712	-	90	47.661	Mus_pahari
ENSOMEG00000023485	MTERF1	86	30.149	MGP_PahariEiJ_G0031402	Mterf2	86	30.149	Mus_pahari
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	49.415	MGP_SPRETEiJ_G0027937	-	90	49.415	Mus_spretus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	49.415	MGP_SPRETEiJ_G0027936	-	90	49.415	Mus_spretus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	86	30.240	MGP_SPRETEiJ_G0016500	Mterf2	86	30.746	Mus_spretus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	48.171	ENSMPUG00000008568	MTERF1	82	48.171	Mustela_putorius_furo
ENSOMEG00000023485	MTERF1	92	47.025	ENSMLUG00000011330	MTERF1	89	47.025	Myotis_lucifugus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	89	46.921	ENSNGAG00000014383	-	88	46.921	Nannospalax_galili
ENSOMEG00000023485	MTERF1	60	66.809	ENSNBRG00000022238	-	77	66.809	Neolamprologus_brichardi
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	50.920	ENSNLEG00000015192	MTERF1	82	50.920	Nomascus_leucogenys
ENSOMEG00000023485	MTERF1	86	51.515	ENSODEG00000014952	-	82	51.515	Octodon_degus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	86	51.515	ENSODEG00000000904	-	82	51.515	Octodon_degus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	89	79.251	ENSONIG00000019792	MTERF1	91	79.251	Oreochromis_niloticus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	92	30.435	ENSOANG00000005531	MTERF2	93	30.435	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	79	46.557	ENSOANG00000004680	-	98	46.557	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	96	47.554	ENSOCUG00000010902	MTERF1	91	47.554	Oryctolagus_cuniculus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	100	82.292	ENSORLG00000027811	MTERF1	100	82.292	Oryzias_latipes
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	50.462	ENSOGAG00000001378	MTERF1	82	50.462	Otolemur_garnettii
ENSOMEG00000023485	MTERF1	93	47.899	ENSOARG00000016682	MTERF1	90	47.765	Ovis_aries
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	50.613	ENSPPAG00000027361	MTERF1	83	50.613	Pan_paniscus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	93	46.629	ENSPPRG00000002171	MTERF1	87	46.629	Panthera_pardus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	83	49.211	ENSPTIG00000016254	MTERF1	82	49.085	Panthera_tigris_altaica
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	50.613	ENSPTRG00000052592	-	83	50.613	Pan_troglodytes
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	50.613	ENSPTRG00000019388	MTERF1	83	50.613	Pan_troglodytes
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	51.840	ENSPANG00000007445	MTERF1	82	51.840	Papio_anubis
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	60.355	ENSPKIG00000017556	MTERF1	91	60.355	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	60.355	ENSPKIG00000017849	MTERF1	91	60.355	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	54.464	ENSPSIG00000016905	MTERF1	84	54.464	Pelodiscus_sinensis
ENSOMEG00000023485	MTERF1	89	48.680	ENSPEMG00000013884	-	90	48.680	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	47.866	ENSPMAG00000007898	MTERF1	98	47.866	Petromyzon_marinus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	99	68.146	ENSPFOG00000006919	MTERF1	99	68.146	Poecilia_formosa
ENSOMEG00000023485	MTERF1	99	68.668	ENSPLAG00000011584	MTERF1	99	68.668	Poecilia_latipinna
ENSOMEG00000023485	MTERF1	99	67.363	ENSPREG00000012369	MTERF1	100	67.363	Poecilia_reticulata
ENSOMEG00000023485	MTERF1	81	50.000	ENSPPYG00000017826	MTERF1	75	50.000	Pongo_abelii
ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	51.039	ENSPCOG00000013179	MTERF1	85	51.039	Propithecus_coquereli
ENSOMEG00000023485	MTERF1	68	49.425	ENSPVAG00000006613	MTERF1	66	49.425	Pteropus_vampyrus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	98	74.674	ENSPNYG00000009120	MTERF1	99	74.674	Pundamilia_nyererei
ENSOMEG00000023485	MTERF1	91	58.405	ENSPNAG00000022366	MTERF1	92	58.405	Pygocentrus_nattereri
ENSOMEG00000023485	MTERF1	89	48.824	ENSRNOG00000007899	Mterf1	90	48.824	Rattus_norvegicus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	50.613	ENSRBIG00000027323	MTERF1	82	50.613	Rhinopithecus_bieti
ENSOMEG00000023485	MTERF1	85	50.613	ENSRROG00000031256	MTERF1	82	50.613	Rhinopithecus_roxellana
ENSOMEG00000023485	MTERF1	82	52.063	ENSSBOG00000034146	MTERF1	87	51.840	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOMEG00000023485	MTERF1	92	58.791	ENSSFOG00015008650	mterf1	95	58.791	Scleropages_formosus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	98	65.796	ENSSMAG00000004934	MTERF1	83	65.796	Scophthalmus_maximus
ENSOMEG00000023485	MTERF1	98	70.000	ENSSDUG00000013580	MTERF1	98	70.000	Seriola_dumerili
ENSOMEG00000023485	MTERF1	87	45.509	ENSSPUG00000017132	MTERF1	88	45.509	Sphenodon_punctatus
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ENSOMEG00000023485	MTERF1	95	48.787	ENSXETG00000027398	mterf1	98	48.787	Xenopus_tropicalis