EuRBPDB

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSONIG00000000019 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo1a
Alias: -
Full Name: exportin 1 (CRM1 homolog%2C yeast) a
Gene Type: protein_coding
Species: Oreochromis_niloticus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 27440 bases
Position: chrGL831280.1:2153-29592
Accession: ZDB-GENE-050309-201
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSONIP00000000024	CRM1_C	PF08767.11	1.5e-131	1	1
ENSONIP00000000023	CRM1_C	PF08767.11	2.2e-131	1	1
ENSONIP00000000023	Xpo1	PF08389.12	6.9e-42	1	1
ENSONIP00000000024	Xpo1	PF08389.12	7.4e-42	1	1
ENSONIP00000000024	IBN_N	PF03810.19	2.8e-11	1	1
ENSONIP00000000023	IBN_N	PF03810.19	2.9e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSONIT00000000023	-	4614	-	ENSONIP00000000023	1013 (aa)	-	I3ITT4
ENSONIT00000000024	-	3198	-	ENSONIP00000000024	1065 (aa)	-	I3ITT5

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSONIG00000000019	xpo1a	93	89.669	ENSONIG00000002969	-	99	89.669

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.246	ENSG00000082898	XPO1	100	89.385	Homo_sapiens
ENSONIG00000000019	xpo1a	88	92.415	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	92.415	Acanthochromis_polyacanthus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.272	ENSAPOG00000004984	-	100	89.272	Acanthochromis_polyacanthus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.910	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	88.910	Ailuropoda_melanoleuca
ENSONIG00000000019	xpo1a	88	94.979	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	94.979	Amphilophus_citrinellus
ENSONIG00000000019	xpo1a	88	89.692	ENSACIG00000010818	-	100	89.692	Amphilophus_citrinellus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.272	ENSAOCG00000010121	-	100	89.272	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	95.408	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	95.408	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.272	ENSAPEG00000007038	-	100	89.272	Amphiprion_percula
ENSONIG00000000019	xpo1a	91	95.036	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	95.036	Amphiprion_percula
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	94.470	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	94.470	Anabas_testudineus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.272	ENSATEG00000008816	-	100	89.272	Anabas_testudineus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.086	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	89.086	Anas_platyrhynchos
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.086	ENSACAG00000002501	XPO1	100	89.086	Anolis_carolinensis
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.246	ENSANAG00000020802	XPO1	100	88.246	Aotus_nancymaae
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.179	ENSACLG00000015192	-	100	89.179	Astatotilapia_calliptera
ENSONIG00000000019	xpo1a	88	95.513	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	95.513	Astatotilapia_calliptera
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.552	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	89.552	Astyanax_mexicanus
ENSONIG00000000019	xpo1a	88	89.947	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	89.947	Astyanax_mexicanus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.993	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	88.993	Bos_taurus
ENSONIG00000000019	xpo1a	98	55.817	WBGene00002078	xpo-1	98	51.695	Caenorhabditis_elegans
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.246	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	88.246	Callithrix_jacchus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.993	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	88.993	Canis_familiaris
ENSONIG00000000019	xpo1a	93	89.089	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	89.089	Canis_lupus_dingo
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.993	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	88.993	Capra_hircus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.993	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	88.993	Carlito_syrichta
ENSONIG00000000019	xpo1a	56	89.007	ENSCAPG00000006454	-	100	89.007	Cavia_aperea
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	87.593	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	87.593	Cavia_porcellus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	78.439	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	78.439	Cebus_capucinus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	86.512	ENSCATG00000032674	XPO1	100	88.523	Cercocebus_atys
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.806	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	88.806	Chinchilla_lanigera
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.246	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	88.246	Chlorocebus_sabaeus
ENSONIG00000000019	xpo1a	83	88.860	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	88.860	Choloepus_hoffmanni
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.086	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	89.086	Chrysemys_picta_bellii
ENSONIG00000000019	xpo1a	99	77.925	ENSCING00000024562	-	99	77.925	Ciona_intestinalis
ENSONIG00000000019	xpo1a	99	80.082	ENSCSAVG00000005965	-	99	76.592	Ciona_savignyi
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	90.310	ENSCANG00000028883	XPO1	100	92.021	Colobus_angolensis_palliatus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.340	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	88.340	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.340	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	88.340	Cricetulus_griseus_crigri
ENSONIG00000000019	xpo1a	88	88.417	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	88.417	Cynoglossus_semilaevis
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.086	ENSCVAG00000016788	-	100	89.086	Cyprinodon_variegatus
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ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.832	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	89.832	Danio_rerio
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	90.951	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	90.951	Danio_rerio
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.086	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	89.086	Dasypus_novemcinctus
ENSONIG00000000019	xpo1a	91	85.235	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	85.235	Dipodomys_ordii
ENSONIG00000000019	xpo1a	99	68.638	FBgn0020497	emb	99	68.638	Drosophila_melanogaster
ENSONIG00000000019	xpo1a	94	89.677	ENSETEG00000018045	XPO1	94	89.677	Echinops_telfairi
ENSONIG00000000019	xpo1a	89	77.097	ENSEBUG00000012580	-	99	81.959	Eptatretus_burgeri
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.993	ENSEASG00005007223	XPO1	100	88.993	Equus_asinus_asinus
ENSONIG00000000019	xpo1a	96	93.020	ENSECAG00000024920	XPO1	100	93.020	Equus_caballus
ENSONIG00000000019	xpo1a	92	97.917	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	97.917	Erinaceus_europaeus
ENSONIG00000000019	xpo1a	87	86.417	ENSELUG00000014306	-	99	86.417	Esox_lucius
ENSONIG00000000019	xpo1a	88	91.711	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	91.711	Esox_lucius
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.993	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	88.993	Felis_catus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.993	ENSFALG00000010989	XPO1	100	88.993	Ficedula_albicollis
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	87.407	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	87.407	Fukomys_damarensis
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	94.189	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	94.189	Fundulus_heteroclitus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	91.659	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	91.659	Gadus_morhua
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ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.086	ENSGALG00000029476	XPO1	100	89.086	Gallus_gallus
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ENSONIG00000000019	xpo1a	88	94.017	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	94.017	Gambusia_affinis
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	94.752	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	94.752	Gasterosteus_aculeatus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.366	ENSGACG00000002743	-	100	89.366	Gasterosteus_aculeatus
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ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.246	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	88.246	Gorilla_gorilla
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ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.272	ENSHBUG00000020037	-	100	89.272	Haplochromis_burtoni
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.713	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	88.713	Heterocephalus_glaber_female
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.713	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	88.713	Heterocephalus_glaber_male
ENSONIG00000000019	xpo1a	88	89.586	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	89.586	Hippocampus_comes
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ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.552	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	89.552	Ictalurus_punctatus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.806	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	88.806	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.899	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	88.899	Jaculus_jaculus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.179	ENSKMAG00000016218	-	100	89.179	Kryptolebias_marmoratus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	94.377	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	94.377	Kryptolebias_marmoratus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.366	ENSLBEG00000005740	-	100	89.366	Labrus_bergylta
ENSONIG00000000019	xpo1a	88	91.915	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	91.915	Labrus_bergylta
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	68.416	ENSLACG00000018213	XPO1	100	68.416	Latimeria_chalumnae
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.739	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	89.739	Lepisosteus_oculatus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.713	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	88.713	Loxodonta_africana
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.246	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	88.246	Macaca_fascicularis
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.246	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	88.246	Macaca_mulatta
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.246	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	88.246	Macaca_nemestrina
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	86.524	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	86.524	Mandrillus_leucophaeus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	94.845	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	94.845	Mastacembelus_armatus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.272	ENSMAMG00000010568	-	100	89.272	Mastacembelus_armatus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	89.179	ENSMZEG00005018158	-	98	89.300	Maylandia_zebra
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	96.064	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	96.064	Maylandia_zebra
ENSONIG00000000019	xpo1a	71	92.828	ENSMGAG00000001496	-	100	92.424	Meleagris_gallopavo
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.340	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	88.340	Mesocricetus_auratus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.993	ENSMICG00000027770	XPO1	100	88.993	Microcebus_murinus
ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.526	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	88.526	Microtus_ochrogaster
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