EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSONIG00000002738 (Gene tree)
Gene ID: 100706354
Gene Symbol: si:dkey-86e18.1
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC100706354
Gene Type: protein_coding
Species: Oreochromis_niloticus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4258 bases
Position: chrGL831140.1:6679196-6683453
Accession: 100706354
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSONIP00000003432	Isy1	PF06246.12	3e-08	1	1
ENSONIP00000003431	Isy1	PF06246.12	3.2e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSONIT00000003432	-	1167	-	ENSONIP00000003431	283 (aa)	XP_003439777	I3J3J1
ENSONIT00000003433	-	777	-	ENSONIP00000003432	259 (aa)	-	I3J3J2

Gene Model

Click here to download ENSONIG00000002738's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSONIG00000002738's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	99	66.561	ENSAPOG00000002792	si:dkey-86e18.1	97	66.340	Acanthochromis_polyacanthus
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	77.606	ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	96	77.689	Amphilophus_citrinellus
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	65.251	ENSAOCG00000014440	si:dkey-86e18.1	96	64.940	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	99	63.607	ENSAPEG00000011831	si:dkey-86e18.1	97	63.300	Amphiprion_percula
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	99	64.310	ENSATEG00000018061	si:dkey-86e18.1	98	63.918	Anabas_testudineus
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	97	93.863	ENSACLG00000012308	si:dkey-86e18.1	97	93.863	Astatotilapia_calliptera
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	54.851	ENSAMXG00000038638	si:dkey-86e18.1	97	55.000	Astyanax_mexicanus
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	99	59.655	ENSCSEG00000007482	-	97	59.507	Cynoglossus_semilaevis
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	57.980	ENSCVAG00000020099	si:dkey-86e18.1	97	58.054	Cyprinodon_variegatus
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	99	54.717	ENSDARG00000043536	si:dkey-86e18.1	97	54.826	Danio_rerio
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	51.839	ENSELUG00000007229	si:dkey-86e18.1	97	51.890	Esox_lucius
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	99	57.655	ENSFHEG00000023250	si:dkey-86e18.1	97	57.525	Fundulus_heteroclitus
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	82	66.949	ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	66.949	Gambusia_affinis
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	97	94.585	ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	97	94.585	Haplochromis_burtoni
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	54.924	ENSIPUG00000012213	si:dkey-86e18.1	97	55.078	Ictalurus_punctatus
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	99	62.420	ENSKMAG00000008387	si:dkey-86e18.1	97	62.092	Kryptolebias_marmoratus
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	97	56.522	ENSLBEG00000008055	si:dkey-86e18.1	96	58.889	Labrus_bergylta
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	99	41.197	ENSLACG00000003926	si:dkey-86e18.1	97	41.758	Latimeria_chalumnae
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	99	52.399	ENSLOCG00000008902	si:dkey-86e18.1	97	53.257	Lepisosteus_oculatus
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	65.079	ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	97	64.706	Mastacembelus_armatus
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	97	93.863	ENSMZEG00005019446	si:dkey-86e18.1	97	93.863	Maylandia_zebra
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	66.923	ENSMMOG00000002257	si:dkey-86e18.1	96	66.667	Mola_mola
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	99	66.667	ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	96	66.270	Monopterus_albus
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	97	80.287	ENSNBRG00000023611	si:dkey-86e18.1	96	80.287	Neolamprologus_brichardi
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	57.792	ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	97	57.525	Oryzias_latipes
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	56.667	ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	97	56.701	Oryzias_latipes_hni
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	57.329	ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	97	57.047	Oryzias_latipes_hsok
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	99	58.224	ENSOMEG00000001778	si:dkey-86e18.1	98	57.383	Oryzias_melastigma
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	99	47.674	ENSPKIG00000009550	si:dkey-86e18.1	100	44.615	Paramormyrops_kingsleyae
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	54.044	ENSPMGG00000008481	si:dkey-86e18.1	96	54.167	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	62.222	ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	97	62.214	Poecilia_formosa
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	58.466	ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	97	58.224	Poecilia_latipinna
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	59.223	ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	97	59.000	Poecilia_mexicana
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	64.093	ENSPREG00000002081	si:dkey-86e18.1	96	64.143	Poecilia_reticulata
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	97	93.502	ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	97	93.502	Pundamilia_nyererei
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	99	55.273	ENSPNAG00000008048	si:dkey-86e18.1	97	55.224	Pygocentrus_nattereri
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	99	47.350	ENSSFOG00015002284	si:dkey-86e18.1	97	46.739	Scleropages_formosus
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	96	64.430	ENSSMAG00000017672	si:dkey-86e18.1	96	64.784	Scophthalmus_maximus
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	67.296	ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	97	66.667	Seriola_dumerili
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	66.771	ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	97	66.129	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	67.516	ENSSPAG00000014712	si:dkey-86e18.1	97	67.541	Stegastes_partitus
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	60.481	ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	97	61.702	Takifugu_rubripes
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	62.162	ENSXCOG00000008851	si:dkey-86e18.1	96	62.151	Xiphophorus_couchianus
ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	60.450	ENSXMAG00000011403	si:dkey-86e18.1	97	60.265	Xiphophorus_maculatus