EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSONIG00000002985 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: papolg
Alias: -
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Oreochromis_niloticus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15835 bases
Position: chrGL831247.1:1760177-1776011
Accession: ZDB-GENE-040426-1256
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSONIP00000003738	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5.7e-25	1	2
ENSONIP00000003738	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5.7e-25	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSONIT00000003739	-	2472	-	ENSONIP00000003738	730 (aa)	-	I3J4E8

Gene Model

Click here to download ENSONIG00000002985's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSONIG00000002985's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSONIG00000002985	papolg	67	46.169	ENSONIG00000001062	-	98	46.169

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSONIG00000002985	papolg	100	66.309	ENSG00000115421	PAPOLG	100	87.179	Homo_sapiens
ENSONIG00000002985	papolg	100	83.423	ENSAPOG00000004798	papolg	99	77.808	Acanthochromis_polyacanthus
ENSONIG00000002985	papolg	99	65.147	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	65.013	Ailuropoda_melanoleuca
ENSONIG00000002985	papolg	100	79.645	ENSACIG00000010546	papolg	99	79.645	Amphilophus_citrinellus
ENSONIG00000002985	papolg	100	83.423	ENSAOCG00000010254	papolg	89	83.962	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000002985	papolg	100	83.288	ENSAPEG00000006944	papolg	89	83.827	Amphiprion_percula
ENSONIG00000002985	papolg	100	85.445	ENSATEG00000009007	papolg	89	85.714	Anabas_testudineus
ENSONIG00000002985	papolg	98	61.074	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	60.345	Anas_platyrhynchos
ENSONIG00000002985	papolg	80	52.529	ENSACAG00000015048	-	100	51.774	Anolis_carolinensis
ENSONIG00000002985	papolg	100	66.125	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	65.536	Aotus_nancymaae
ENSONIG00000002985	papolg	100	87.071	ENSACLG00000015592	papolg	89	87.203	Astatotilapia_calliptera
ENSONIG00000002985	papolg	100	70.895	ENSAMXG00000004611	papolg	100	70.573	Astyanax_mexicanus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.737	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	65.107	Bos_taurus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.995	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	65.772	Callithrix_jacchus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.060	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	65.020	Canis_familiaris
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.550	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	65.282	Canis_lupus_dingo
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.604	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	64.973	Capra_hircus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.287	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	65.020	Carlito_syrichta
ENSONIG00000002985	papolg	52	68.586	ENSCAPG00000014901	-	100	68.586	Cavia_aperea
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.374	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	65.107	Cavia_porcellus
ENSONIG00000002985	papolg	100	66.260	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	65.772	Cebus_capucinus
ENSONIG00000002985	papolg	89	81.818	ENSCATG00000044395	PAPOLG	99	81.818	Cercocebus_atys
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.867	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	65.333	Chinchilla_lanigera
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.860	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	65.323	Chlorocebus_sabaeus
ENSONIG00000002985	papolg	89	62.969	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	62.369	Choloepus_hoffmanni
ENSONIG00000002985	papolg	67	57.287	ENSCING00000024664	-	92	57.287	Ciona_intestinalis
ENSONIG00000002985	papolg	66	57.819	ENSCSAVG00000009085	-	97	57.819	Ciona_savignyi
ENSONIG00000002985	papolg	100	66.125	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	65.323	Colobus_angolensis_palliatus
ENSONIG00000002985	papolg	99	65.223	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	64.817	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSONIG00000002985	papolg	99	65.223	ENSCGRG00000005552	-	100	64.817	Cricetulus_griseus_crigri
ENSONIG00000002985	papolg	100	79.400	ENSCSEG00000000771	papolg	99	80.082	Cynoglossus_semilaevis
ENSONIG00000002985	papolg	100	78.740	ENSCVAG00000016602	papolg	99	78.609	Cyprinodon_variegatus
ENSONIG00000002985	papolg	100	72.776	ENSDARG00000012141	papolg	100	71.958	Danio_rerio
ENSONIG00000002985	papolg	100	63.636	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	63.102	Dasypus_novemcinctus
ENSONIG00000002985	papolg	59	75.116	ENSDORG00000016228	Papolg	100	75.116	Dipodomys_ordii
ENSONIG00000002985	papolg	100	54.461	ENSETEG00000011815	PAPOLG	100	53.928	Echinops_telfairi
ENSONIG00000002985	papolg	61	60.881	ENSEBUG00000004020	papolg	90	60.622	Eptatretus_burgeri
ENSONIG00000002985	papolg	63	51.852	ENSEBUG00000005042	-	78	51.852	Eptatretus_burgeri
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.821	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	65.688	Equus_asinus_asinus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.821	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	65.282	Equus_caballus
ENSONIG00000002985	papolg	100	59.893	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	59.492	Erinaceus_europaeus
ENSONIG00000002985	papolg	100	71.879	ENSELUG00000014497	papolg	98	72.701	Esox_lucius
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.821	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	65.287	Felis_catus
ENSONIG00000002985	papolg	98	54.521	ENSFALG00000011079	PAPOLG	96	53.949	Ficedula_albicollis
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.688	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	65.154	Fukomys_damarensis
ENSONIG00000002985	papolg	66	73.293	ENSFHEG00000019080	papolg	90	72.088	Fundulus_heteroclitus
ENSONIG00000002985	papolg	90	83.184	ENSGMOG00000018772	papolg	94	83.184	Gadus_morhua
ENSONIG00000002985	papolg	100	57.219	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	56.675	Gallus_gallus
ENSONIG00000002985	papolg	100	78.940	ENSGAFG00000003263	papolg	89	78.278	Gambusia_affinis
ENSONIG00000002985	papolg	100	81.442	ENSGACG00000002718	papolg	100	81.575	Gasterosteus_aculeatus
ENSONIG00000002985	papolg	100	66.174	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	65.638	Gorilla_gorilla
ENSONIG00000002985	papolg	100	87.071	ENSHBUG00000004882	papolg	89	87.203	Haplochromis_burtoni
ENSONIG00000002985	papolg	99	65.550	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	65.013	Heterocephalus_glaber_female
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.955	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	65.421	Heterocephalus_glaber_male
ENSONIG00000002985	papolg	100	80.894	ENSHCOG00000006782	papolg	89	81.165	Hippocampus_comes
ENSONIG00000002985	papolg	100	71.202	ENSIPUG00000021642	papolg	100	71.409	Ictalurus_punctatus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.554	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	65.154	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSONIG00000002985	papolg	59	75.349	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	75.349	Jaculus_jaculus
ENSONIG00000002985	papolg	100	81.427	ENSKMAG00000016439	papolg	99	80.403	Kryptolebias_marmoratus
ENSONIG00000002985	papolg	100	77.465	ENSLBEG00000023218	papolg	89	78.489	Labrus_bergylta
ENSONIG00000002985	papolg	99	62.727	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	62.613	Latimeria_chalumnae
ENSONIG00000002985	papolg	100	71.240	ENSLOCG00000016130	papolg	100	70.481	Lepisosteus_oculatus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.600	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	74.884	Loxodonta_africana
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.726	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	65.591	Macaca_fascicularis
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.726	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	65.591	Macaca_mulatta
ENSONIG00000002985	papolg	100	59.279	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	59.413	Macaca_nemestrina
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.854	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	65.457	Mandrillus_leucophaeus
ENSONIG00000002985	papolg	100	84.906	ENSMAMG00000010667	papolg	99	78.356	Mastacembelus_armatus
ENSONIG00000002985	papolg	100	87.071	ENSMZEG00005018140	papolg	99	83.840	Maylandia_zebra
ENSONIG00000002985	papolg	100	58.021	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	57.543	Meleagris_gallopavo
ENSONIG00000002985	papolg	99	65.900	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	65.229	Mesocricetus_auratus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.903	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	65.410	Microcebus_murinus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.730	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	65.194	Microtus_ochrogaster
ENSONIG00000002985	papolg	100	83.131	ENSMMOG00000008020	papolg	99	82.861	Mola_mola
ENSONIG00000002985	papolg	98	65.457	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	64.919	Monodelphis_domestica
ENSONIG00000002985	papolg	100	82.075	ENSMALG00000007012	papolg	89	82.480	Monopterus_albus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.730	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	75.878	Mus_caroli
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.730	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	75.878	Mus_musculus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.328	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	64.793	Mus_pahari
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.596	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	75.878	Mus_spretus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.462	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	65.421	Mustela_putorius_furo
ENSONIG00000002985	papolg	99	65.903	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	65.369	Myotis_lucifugus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.596	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	65.596	Nannospalax_galili
ENSONIG00000002985	papolg	99	87.015	ENSNBRG00000011943	papolg	99	87.015	Neolamprologus_brichardi
ENSONIG00000002985	papolg	59	75.116	ENSNLEG00000009507	-	100	75.116	Nomascus_leucogenys
ENSONIG00000002985	papolg	56	76.562	ENSMEUG00000013605	-	59	76.562	Notamacropus_eugenii
ENSONIG00000002985	papolg	100	64.887	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	64.619	Ochotona_princeps
ENSONIG00000002985	papolg	58	71.663	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	71.663	Octodon_degus
ENSONIG00000002985	papolg	98	65.730	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	65.416	Ornithorhynchus_anatinus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.554	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	65.020	Oryctolagus_cuniculus
ENSONIG00000002985	papolg	100	80.671	ENSORLG00000001577	papolg	89	80.940	Oryzias_latipes
ENSONIG00000002985	papolg	100	81.023	ENSORLG00020002482	papolg	89	81.292	Oryzias_latipes_hni
ENSONIG00000002985	papolg	100	80.671	ENSORLG00015008836	papolg	89	80.940	Oryzias_latipes_hsok
ENSONIG00000002985	papolg	100	81.477	ENSOMEG00000001406	papolg	89	81.477	Oryzias_melastigma
ENSONIG00000002985	papolg	57	53.364	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	52.436	Otolemur_garnettii
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.471	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	64.840	Ovis_aries
ENSONIG00000002985	papolg	100	66.309	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	65.906	Pan_paniscus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.688	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	65.287	Panthera_pardus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.554	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	65.154	Panthera_tigris_altaica
ENSONIG00000002985	papolg	100	66.309	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	65.906	Pan_troglodytes
ENSONIG00000002985	papolg	100	62.198	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	62.064	Papio_anubis
ENSONIG00000002985	papolg	92	70.000	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	70.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSONIG00000002985	papolg	100	69.960	ENSPKIG00000003313	papolg	100	70.121	Paramormyrops_kingsleyae
ENSONIG00000002985	papolg	98	61.860	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	61.745	Pelodiscus_sinensis
ENSONIG00000002985	papolg	99	65.629	ENSPEMG00000008960	-	100	65.359	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSONIG00000002985	papolg	98	46.772	ENSPMAG00000002961	papolg	99	47.098	Petromyzon_marinus
ENSONIG00000002985	papolg	68	57.341	ENSPMAG00000004864	-	99	57.341	Petromyzon_marinus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.390	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	64.861	Phascolarctos_cinereus
ENSONIG00000002985	papolg	100	79.283	ENSPFOG00000012909	papolg	99	78.619	Poecilia_formosa
ENSONIG00000002985	papolg	100	79.122	ENSPLAG00000018445	papolg	99	78.457	Poecilia_latipinna
ENSONIG00000002985	papolg	100	78.912	ENSPMEG00000003961	papolg	99	78.912	Poecilia_mexicana
ENSONIG00000002985	papolg	100	77.339	ENSPREG00000010358	papolg	99	77.297	Poecilia_reticulata
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.726	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	65.638	Pongo_abelii
ENSONIG00000002985	papolg	99	57.739	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	57.470	Procavia_capensis
ENSONIG00000002985	papolg	100	60.729	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	59.865	Propithecus_coquereli
ENSONIG00000002985	papolg	90	73.741	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	73.741	Pteropus_vampyrus
ENSONIG00000002985	papolg	100	87.071	ENSPNYG00000006729	papolg	99	82.055	Pundamilia_nyererei
ENSONIG00000002985	papolg	100	71.696	ENSPNAG00000015521	papolg	100	71.220	Pygocentrus_nattereri
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.863	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	65.462	Rattus_norvegicus
ENSONIG00000002985	papolg	100	61.911	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	61.911	Rhinopithecus_bieti
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.410	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	65.410	Rhinopithecus_roxellana
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.860	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	65.591	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSONIG00000002985	papolg	94	65.358	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	64.937	Sarcophilus_harrisii
ENSONIG00000002985	papolg	100	61.005	ENSSFOG00015011874	papolg	100	60.734	Scleropages_formosus
ENSONIG00000002985	papolg	100	68.742	ENSSFOG00015002383	papolg	100	68.477	Scleropages_formosus
ENSONIG00000002985	papolg	87	87.928	ENSSMAG00000015598	papolg	99	77.150	Scophthalmus_maximus
ENSONIG00000002985	papolg	100	83.558	ENSSDUG00000000912	papolg	99	83.875	Seriola_dumerili
ENSONIG00000002985	papolg	100	83.423	ENSSLDG00000001217	papolg	99	83.740	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSONIG00000002985	papolg	100	61.569	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	61.367	Sphenodon_punctatus
ENSONIG00000002985	papolg	100	81.365	ENSSPAG00000009004	papolg	99	76.944	Stegastes_partitus
ENSONIG00000002985	papolg	100	66.088	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	65.421	Sus_scrofa
ENSONIG00000002985	papolg	73	64.595	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	64.595	Taeniopygia_guttata
ENSONIG00000002985	papolg	100	77.959	ENSTRUG00000006410	papolg	99	76.871	Takifugu_rubripes
ENSONIG00000002985	papolg	100	74.700	ENSTNIG00000017106	papolg	100	74.565	Tetraodon_nigroviridis
ENSONIG00000002985	papolg	99	61.104	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	60.565	Tupaia_belangeri
ENSONIG00000002985	papolg	100	61.282	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	61.015	Tursiops_truncatus
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.270	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	65.317	Ursus_americanus
ENSONIG00000002985	papolg	99	65.359	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	65.317	Ursus_maritimus
ENSONIG00000002985	papolg	99	61.538	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	61.943	Vicugna_pacos
ENSONIG00000002985	papolg	100	65.287	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	65.154	Vulpes_vulpes
ENSONIG00000002985	papolg	100	62.418	ENSXETG00000002208	papolg	100	62.286	Xenopus_tropicalis
ENSONIG00000002985	papolg	68	85.800	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.800	Xiphophorus_couchianus
ENSONIG00000002985	papolg	75	83.633	ENSXMAG00000007383	papolg	95	83.633	Xiphophorus_maculatus