EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSONIG00000008213 (Gene tree)
Gene ID: 100690373
Gene Symbol: syf2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Oreochromis_niloticus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9199 bases
Position: chrGL831177.1:3651779-3660977
Accession: 100690373
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSONIP00000010340	SYF2	PF08231.12	1.5e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSONIT00000010349	-	869	-	ENSONIP00000010340	238 (aa)	XP_003446235	I3JN96

Gene Model

Click here to download ENSONIG00000008213's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSONIG00000008213's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSONIG00000008213	syf2	91	81.944	ENSG00000117614	SYF2	90	81.279	Homo_sapiens
ENSONIG00000008213	syf2	100	92.017	ENSAPOG00000001174	syf2	100	92.017	Acanthochromis_polyacanthus
ENSONIG00000008213	syf2	82	81.026	ENSAMEG00000010134	-	100	81.026	Ailuropoda_melanoleuca
ENSONIG00000008213	syf2	94	79.821	ENSAMEG00000010115	-	91	79.821	Ailuropoda_melanoleuca
ENSONIG00000008213	syf2	99	94.894	ENSACIG00000023688	syf2	94	94.894	Amphilophus_citrinellus
ENSONIG00000008213	syf2	100	91.176	ENSAOCG00000022046	syf2	95	92.377	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000008213	syf2	93	90.498	ENSAOCG00000010912	syf2	69	90.498	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000008213	syf2	100	91.176	ENSAPEG00000018858	syf2	92	91.176	Amphiprion_percula
ENSONIG00000008213	syf2	100	93.277	ENSATEG00000007745	syf2	100	93.277	Anabas_testudineus
ENSONIG00000008213	syf2	84	82.915	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.500	Anas_platyrhynchos
ENSONIG00000008213	syf2	70	66.467	ENSACAG00000026777	-	100	66.467	Anolis_carolinensis
ENSONIG00000008213	syf2	86	80.882	ENSACAG00000013653	-	100	80.882	Anolis_carolinensis
ENSONIG00000008213	syf2	91	82.407	ENSANAG00000032473	SYF2	90	81.735	Aotus_nancymaae
ENSONIG00000008213	syf2	100	98.319	ENSACLG00000019916	syf2	100	98.319	Astatotilapia_calliptera
ENSONIG00000008213	syf2	100	83.193	ENSAMXG00000004051	syf2	100	83.193	Astyanax_mexicanus
ENSONIG00000008213	syf2	97	78.112	ENSBTAG00000001651	SYF2	94	81.081	Bos_taurus
ENSONIG00000008213	syf2	87	50.476	WBGene00019402	syf-2	90	49.763	Caenorhabditis_elegans
ENSONIG00000008213	syf2	91	82.407	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	81.735	Callithrix_jacchus
ENSONIG00000008213	syf2	91	75.926	ENSCAFG00000030331	-	93	75.229	Canis_familiaris
ENSONIG00000008213	syf2	91	81.019	ENSCAFG00000012895	-	90	79.821	Canis_familiaris
ENSONIG00000008213	syf2	91	81.019	ENSCAFG00020021091	-	90	79.821	Canis_lupus_dingo
ENSONIG00000008213	syf2	76	71.978	ENSCAFG00020021094	-	95	71.978	Canis_lupus_dingo
ENSONIG00000008213	syf2	99	76.667	ENSCHIG00000020874	SYF2	92	80.631	Capra_hircus
ENSONIG00000008213	syf2	99	77.083	ENSTSYG00000005114	SYF2	91	79.730	Carlito_syrichta
ENSONIG00000008213	syf2	83	81.313	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.313	Cavia_aperea
ENSONIG00000008213	syf2	99	77.637	ENSCPOG00000005326	SYF2	90	81.735	Cavia_porcellus
ENSONIG00000008213	syf2	91	82.407	ENSCCAG00000022459	SYF2	90	81.735	Cebus_capucinus
ENSONIG00000008213	syf2	100	76.050	ENSCATG00000026917	SYF2	90	80.365	Cercocebus_atys
ENSONIG00000008213	syf2	99	78.723	ENSCLAG00000008474	SYF2	91	81.081	Chinchilla_lanigera
ENSONIG00000008213	syf2	100	75.630	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	80.365	Chlorocebus_sabaeus
ENSONIG00000008213	syf2	72	61.494	ENSCHOG00000005273	-	91	62.651	Choloepus_hoffmanni
ENSONIG00000008213	syf2	94	81.333	ENSCPBG00000025073	SYF2	91	81.333	Chrysemys_picta_bellii
ENSONIG00000008213	syf2	98	52.340	ENSCING00000003017	-	89	56.338	Ciona_intestinalis
ENSONIG00000008213	syf2	89	51.643	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.643	Ciona_savignyi
ENSONIG00000008213	syf2	100	67.227	ENSCANG00000037322	SYF2	89	70.776	Colobus_angolensis_palliatus
ENSONIG00000008213	syf2	99	78.243	ENSCGRG00001020733	Syf2	92	81.081	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSONIG00000008213	syf2	82	82.143	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.323	Cricetulus_griseus_crigri
ENSONIG00000008213	syf2	92	88.991	ENSCSEG00000000117	syf2	93	88.739	Cynoglossus_semilaevis
ENSONIG00000008213	syf2	100	90.377	ENSCVAG00000019543	syf2	100	90.377	Cyprinodon_variegatus
ENSONIG00000008213	syf2	100	86.975	ENSDARG00000004706	syf2	100	86.975	Danio_rerio
ENSONIG00000008213	syf2	99	78.390	ENSDNOG00000047605	SYF2	91	80.631	Dasypus_novemcinctus
ENSONIG00000008213	syf2	99	78.481	ENSDORG00000001274	Syf2	91	81.532	Dipodomys_ordii
ENSONIG00000008213	syf2	94	54.825	FBgn0033556	CG12343	98	54.299	Drosophila_melanogaster
ENSONIG00000008213	syf2	92	66.210	ENSETEG00000015729	SYF2	90	67.633	Echinops_telfairi
ENSONIG00000008213	syf2	83	57.360	ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.360	Eptatretus_burgeri
ENSONIG00000008213	syf2	100	76.327	ENSEASG00005004224	-	89	81.735	Equus_asinus_asinus
ENSONIG00000008213	syf2	99	68.750	ENSEASG00005004232	-	92	72.072	Equus_asinus_asinus
ENSONIG00000008213	syf2	95	79.913	ENSECAG00000012023	-	91	81.081	Equus_caballus
ENSONIG00000008213	syf2	95	79.476	ENSECAG00000010440	-	92	81.735	Equus_caballus
ENSONIG00000008213	syf2	74	66.480	ENSEEUG00000015084	SYF2	88	69.565	Erinaceus_europaeus
ENSONIG00000008213	syf2	100	83.613	ENSELUG00000003465	syf2	93	86.937	Esox_lucius
ENSONIG00000008213	syf2	98	77.778	ENSFCAG00000043095	-	89	80.822	Felis_catus
ENSONIG00000008213	syf2	99	77.500	ENSFCAG00000010324	-	76	81.735	Felis_catus
ENSONIG00000008213	syf2	86	80.392	ENSFALG00000000460	SYF2	89	79.091	Ficedula_albicollis
ENSONIG00000008213	syf2	99	77.021	ENSFDAG00000008310	SYF2	90	81.279	Fukomys_damarensis
ENSONIG00000008213	syf2	95	76.991	ENSFHEG00000007238	syf2	99	77.130	Fundulus_heteroclitus
ENSONIG00000008213	syf2	90	88.372	ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.372	Gadus_morhua
ENSONIG00000008213	syf2	95	80.176	ENSGALG00000013639	SYF2	88	81.532	Gallus_gallus
ENSONIG00000008213	syf2	100	89.496	ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.496	Gambusia_affinis
ENSONIG00000008213	syf2	93	90.541	ENSGACG00000007305	syf2	93	90.541	Gasterosteus_aculeatus
ENSONIG00000008213	syf2	94	81.778	ENSGAGG00000010670	SYF2	91	81.778	Gopherus_agassizii
ENSONIG00000008213	syf2	91	81.944	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	81.279	Gorilla_gorilla
ENSONIG00000008213	syf2	100	97.899	ENSHBUG00000020477	syf2	100	97.899	Haplochromis_burtoni
ENSONIG00000008213	syf2	93	71.493	ENSHGLG00000004304	-	93	71.622	Heterocephalus_glaber_female
ENSONIG00000008213	syf2	100	76.639	ENSHGLG00000014393	SYF2	91	81.081	Heterocephalus_glaber_female
ENSONIG00000008213	syf2	100	76.639	ENSHGLG00100014722	SYF2	91	81.081	Heterocephalus_glaber_male
ENSONIG00000008213	syf2	100	89.916	ENSHCOG00000012904	syf2	78	89.916	Hippocampus_comes
ENSONIG00000008213	syf2	100	83.682	ENSIPUG00000019859	syf2	93	86.099	Ictalurus_punctatus
ENSONIG00000008213	syf2	61	75.342	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	75.342	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSONIG00000008213	syf2	84	81.910	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	81.910	Jaculus_jaculus
ENSONIG00000008213	syf2	100	91.597	ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.176	Kryptolebias_marmoratus
ENSONIG00000008213	syf2	100	90.756	ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.756	Labrus_bergylta
ENSONIG00000008213	syf2	93	80.090	ENSLACG00000012064	SYF2	93	80.090	Latimeria_chalumnae
ENSONIG00000008213	syf2	100	83.193	ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.193	Lepisosteus_oculatus
ENSONIG00000008213	syf2	100	76.327	ENSLAFG00000023150	-	91	81.532	Loxodonta_africana
ENSONIG00000008213	syf2	77	53.804	ENSLAFG00000030814	-	100	53.804	Loxodonta_africana
ENSONIG00000008213	syf2	100	76.050	ENSMFAG00000041831	SYF2	90	80.365	Macaca_fascicularis
ENSONIG00000008213	syf2	91	81.019	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	80.365	Macaca_mulatta
ENSONIG00000008213	syf2	100	76.050	ENSMNEG00000030180	SYF2	90	80.365	Macaca_nemestrina
ENSONIG00000008213	syf2	100	76.050	ENSMLEG00000030248	SYF2	90	80.365	Mandrillus_leucophaeus
ENSONIG00000008213	syf2	100	92.857	ENSMAMG00000010403	syf2	98	92.857	Mastacembelus_armatus
ENSONIG00000008213	syf2	100	97.899	ENSMZEG00005006429	syf2	100	97.899	Maylandia_zebra
ENSONIG00000008213	syf2	84	82.412	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.412	Meleagris_gallopavo
ENSONIG00000008213	syf2	100	78.099	ENSMAUG00000018974	Syf2	92	81.982	Mesocricetus_auratus
ENSONIG00000008213	syf2	84	81.910	ENSMICG00000016191	SYF2	100	81.910	Microcebus_murinus
ENSONIG00000008213	syf2	100	77.686	ENSMOCG00000022938	Syf2	92	81.532	Microtus_ochrogaster
ENSONIG00000008213	syf2	97	88.312	ENSMMOG00000002396	syf2	93	90.090	Mola_mola
ENSONIG00000008213	syf2	93	76.786	ENSMODG00000013951	-	98	76.786	Monodelphis_domestica
ENSONIG00000008213	syf2	100	89.627	ENSMALG00000010706	syf2	100	89.627	Monopterus_albus
ENSONIG00000008213	syf2	100	78.099	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	92	81.982	Mus_caroli
ENSONIG00000008213	syf2	100	78.099	ENSMUSG00000028821	Syf2	92	81.982	Mus_musculus
ENSONIG00000008213	syf2	100	78.099	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	92	81.982	Mus_pahari
ENSONIG00000008213	syf2	100	78.099	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	92	81.982	Mus_spretus
ENSONIG00000008213	syf2	91	81.019	ENSMPUG00000015802	-	89	80.365	Mustela_putorius_furo
ENSONIG00000008213	syf2	92	80.455	ENSMPUG00000015801	-	89	80.455	Mustela_putorius_furo
ENSONIG00000008213	syf2	97	77.350	ENSMLUG00000001885	SYF2	91	80.180	Myotis_lucifugus
ENSONIG00000008213	syf2	100	76.050	ENSNGAG00000007912	Syf2	90	80.631	Nannospalax_galili
ENSONIG00000008213	syf2	100	86.364	ENSNBRG00000010720	syf2	99	86.364	Neolamprologus_brichardi
ENSONIG00000008213	syf2	91	81.944	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	81.279	Nomascus_leucogenys
ENSONIG00000008213	syf2	99	77.215	ENSOPRG00000012870	SYF2	91	80.180	Ochotona_princeps
ENSONIG00000008213	syf2	99	67.932	ENSODEG00000014338	-	92	70.721	Octodon_degus
ENSONIG00000008213	syf2	98	76.923	ENSODEG00000017664	-	93	79.730	Octodon_degus
ENSONIG00000008213	syf2	85	81.188	ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.188	Ornithorhynchus_anatinus
ENSONIG00000008213	syf2	91	82.407	ENSOCUG00000013050	SYF2	91	81.081	Oryctolagus_cuniculus
ENSONIG00000008213	syf2	98	88.841	ENSORLG00000028820	syf2	95	91.441	Oryzias_latipes
ENSONIG00000008213	syf2	100	88.235	ENSORLG00020018333	syf2	100	88.235	Oryzias_latipes_hni
ENSONIG00000008213	syf2	100	88.655	ENSORLG00015014665	syf2	100	88.655	Oryzias_latipes_hsok
ENSONIG00000008213	syf2	100	89.916	ENSOMEG00000013911	syf2	100	89.916	Oryzias_melastigma
ENSONIG00000008213	syf2	99	79.149	ENSOGAG00000009962	SYF2	91	81.532	Otolemur_garnettii
ENSONIG00000008213	syf2	95	78.355	ENSOARG00000006348	-	91	79.911	Ovis_aries
ENSONIG00000008213	syf2	82	54.872	ENSOARG00000006269	-	100	54.872	Ovis_aries
ENSONIG00000008213	syf2	91	81.944	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	81.279	Pan_paniscus
ENSONIG00000008213	syf2	99	77.731	ENSPPRG00000001638	-	89	81.735	Panthera_pardus
ENSONIG00000008213	syf2	98	77.778	ENSPPRG00000001651	-	89	80.822	Panthera_pardus
ENSONIG00000008213	syf2	91	82.407	ENSPTIG00000005711	-	80	82.110	Panthera_tigris_altaica
ENSONIG00000008213	syf2	98	77.778	ENSPTIG00000007036	-	89	80.822	Panthera_tigris_altaica
ENSONIG00000008213	syf2	91	81.944	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	81.279	Pan_troglodytes
ENSONIG00000008213	syf2	100	76.050	ENSPANG00000008139	SYF2	90	80.365	Papio_anubis
ENSONIG00000008213	syf2	100	82.353	ENSPKIG00000008130	syf2	94	86.425	Paramormyrops_kingsleyae
ENSONIG00000008213	syf2	97	79.149	ENSPSIG00000011816	SYF2	85	82.569	Pelodiscus_sinensis
ENSONIG00000008213	syf2	97	89.177	ENSPMGG00000008755	syf2	86	92.308	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSONIG00000008213	syf2	100	77.273	ENSPEMG00000008283	Syf2	92	81.081	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSONIG00000008213	syf2	93	80.631	ENSPCIG00000014235	SYF2	89	80.631	Phascolarctos_cinereus
ENSONIG00000008213	syf2	100	88.285	ENSPFOG00000004116	syf2	92	91.928	Poecilia_formosa
ENSONIG00000008213	syf2	98	89.700	ENSPLAG00000006691	syf2	96	91.480	Poecilia_latipinna
ENSONIG00000008213	syf2	100	87.395	ENSPMEG00000011684	syf2	100	87.395	Poecilia_mexicana
ENSONIG00000008213	syf2	100	89.496	ENSPREG00000003009	syf2	100	89.496	Poecilia_reticulata
ENSONIG00000008213	syf2	100	76.471	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	81.279	Pongo_abelii
ENSONIG00000008213	syf2	99	54.468	ENSPCOG00000027011	SYF2	88	55.405	Propithecus_coquereli
ENSONIG00000008213	syf2	98	70.386	ENSPVAG00000005841	SYF2	91	71.622	Pteropus_vampyrus
ENSONIG00000008213	syf2	100	97.899	ENSPNYG00000004979	syf2	100	97.899	Pundamilia_nyererei
ENSONIG00000008213	syf2	100	84.454	ENSPNAG00000015570	syf2	100	84.454	Pygocentrus_nattereri
ENSONIG00000008213	syf2	100	78.099	ENSRNOG00000060597	Syf2	92	81.982	Rattus_norvegicus
ENSONIG00000008213	syf2	100	73.950	ENSRBIG00000042970	SYF2	90	78.082	Rhinopithecus_bieti
ENSONIG00000008213	syf2	100	76.050	ENSRROG00000001347	SYF2	90	80.365	Rhinopithecus_roxellana
ENSONIG00000008213	syf2	91	81.944	ENSSBOG00000020184	SYF2	90	81.279	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSONIG00000008213	syf2	93	79.730	ENSSHAG00000015630	-	89	79.730	Sarcophilus_harrisii
ENSONIG00000008213	syf2	86	81.068	ENSSHAG00000007152	-	100	81.068	Sarcophilus_harrisii
ENSONIG00000008213	syf2	97	84.052	ENSSFOG00015023647	syf2	93	87.330	Scleropages_formosus
ENSONIG00000008213	syf2	100	89.076	ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.076	Scophthalmus_maximus
ENSONIG00000008213	syf2	100	90.336	ENSSDUG00000013072	syf2	100	90.336	Seriola_dumerili
ENSONIG00000008213	syf2	100	90.336	ENSSLDG00000012677	syf2	100	90.336	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSONIG00000008213	syf2	99	59.336	ENSSARG00000012889	SYF2	91	61.712	Sorex_araneus
ENSONIG00000008213	syf2	99	78.099	ENSSPUG00000005251	SYF2	88	81.532	Sphenodon_punctatus
ENSONIG00000008213	syf2	100	91.597	ENSSPAG00000009626	syf2	100	91.597	Stegastes_partitus
ENSONIG00000008213	syf2	93	80.995	ENSSSCG00000037481	SYF2	90	80.995	Sus_scrofa
ENSONIG00000008213	syf2	63	51.656	ENSTGUG00000001126	SYF2	81	53.333	Taeniopygia_guttata
ENSONIG00000008213	syf2	100	86.250	ENSTRUG00000001499	syf2	90	89.238	Takifugu_rubripes
ENSONIG00000008213	syf2	93	90.090	ENSTNIG00000016912	syf2	99	90.090	Tetraodon_nigroviridis
ENSONIG00000008213	syf2	100	57.563	ENSTBEG00000017370	SYF2	89	59.459	Tupaia_belangeri
ENSONIG00000008213	syf2	97	74.897	ENSTTRG00000003550	SYF2	91	80.180	Tursiops_truncatus
ENSONIG00000008213	syf2	98	77.350	ENSUAMG00000002897	SYF2	90	79.821	Ursus_americanus
ENSONIG00000008213	syf2	91	80.556	ENSUMAG00000013108	SYF2	90	79.372	Ursus_maritimus
ENSONIG00000008213	syf2	99	76.349	ENSVPAG00000005705	SYF2	91	80.180	Vicugna_pacos
ENSONIG00000008213	syf2	91	81.019	ENSVVUG00000027175	-	90	79.821	Vulpes_vulpes
ENSONIG00000008213	syf2	86	80.488	ENSVVUG00000027181	-	90	79.372	Vulpes_vulpes
ENSONIG00000008213	syf2	97	78.017	ENSXETG00000022797	syf2	89	80.180	Xenopus_tropicalis
ENSONIG00000008213	syf2	100	88.235	ENSXMAG00000022698	syf2	100	88.235	Xiphophorus_maculatus