EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSONIG00000011151 (Gene tree)
Gene ID: 100706938
Gene Symbol: tnpo1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oreochromis_niloticus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22515 bases
Position: chrGL831211.1:1082503-1105017
Accession: ZDB-GENE-080819-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSONIP00000014040	IBN_N	PF03810.19	1.3e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSONIT00000014050	-	2715	-	ENSONIP00000014040	904 (aa)	-	I3JYU5

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	84.939	ENSONIG00000017706	-	99	84.939
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	84.899	ENSONIG00000002147	tnpo2	99	84.899

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.411	ENSG00000083312	TNPO1	100	92.411	Homo_sapiens
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	97.879	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.879	Acanthochromis_polyacanthus
ENSONIG00000011151	tnpo1	100	90.132	ENSAMEG00000007147	TNPO1	100	90.899	Ailuropoda_melanoleuca
ENSONIG00000011151	tnpo1	86	98.329	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	98.329	Amphilophus_citrinellus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	97.879	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	97.879	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	97.879	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.879	Amphiprion_percula
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	97.433	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.433	Anabas_testudineus
ENSONIG00000011151	tnpo1	98	88.664	ENSAPLG00000009619	-	97	89.384	Anas_platyrhynchos
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.634	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.634	Anolis_carolinensis
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	59.890	ENSANAG00000027118	-	99	59.780	Aotus_nancymaae
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	82.405	ENSANAG00000025351	-	99	82.405	Aotus_nancymaae
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	91.778	ENSANAG00000022453	-	99	91.778	Aotus_nancymaae
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	97.433	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	97.433	Astatotilapia_calliptera
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	93.430	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.762	Astyanax_mexicanus
ENSONIG00000011151	tnpo1	100	91.814	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	91.814	Bos_taurus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	91.889	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	91.889	Callithrix_jacchus
ENSONIG00000011151	tnpo1	95	92.352	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.352	Canis_familiaris
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	90.067	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.067	Canis_lupus_dingo
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.222	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.222	Capra_hircus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	88.889	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.173	Carlito_syrichta
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	91.964	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	91.964	Cebus_capucinus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.411	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	92.411	Cercocebus_atys
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	91.964	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	91.964	Chinchilla_lanigera
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.222	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	92.222	Chlorocebus_sabaeus
ENSONIG00000011151	tnpo1	94	80.683	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.801	Choloepus_hoffmanni
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.865	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	92.865	Chrysemys_picta_bellii
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	75.585	ENSCSAVG00000010981	-	99	74.916	Ciona_savignyi
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.222	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	92.222	Colobus_angolensis_palliatus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.333	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.333	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSONIG00000011151	tnpo1	95	92.683	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	92.683	Cricetulus_griseus_crigri
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	95.546	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	95.536	Cynoglossus_semilaevis
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.205	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.205	Cyprinodon_variegatus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	93.645	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.200	Danio_rerio
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	86.903	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	86.903	Dasypus_novemcinctus
ENSONIG00000011151	tnpo1	92	92.584	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.575	Dipodomys_ordii
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	58.231	FBgn0035693	CG8219	99	57.783	Drosophila_melanogaster
ENSONIG00000011151	tnpo1	86	91.941	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	91.941	Echinops_telfairi
ENSONIG00000011151	tnpo1	94	84.397	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.397	Eptatretus_burgeri
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.411	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	92.411	Equus_asinus_asinus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.222	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	92.222	Equus_caballus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	87.554	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.284	Esox_lucius
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.411	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	92.411	Felis_catus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.969	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	92.969	Ficedula_albicollis
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	91.889	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	91.889	Fukomys_damarensis
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.321	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	96.321	Fundulus_heteroclitus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.111	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.111	Gadus_morhua
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.188	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.188	Gallus_gallus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	95.768	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	95.768	Gambusia_affinis
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	95.556	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	95.556	Gasterosteus_aculeatus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.746	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	92.746	Gopherus_agassizii
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.411	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	92.411	Gorilla_gorilla
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	77.333	ENSGGOG00000022535	-	99	77.333	Gorilla_gorilla
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	99.219	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	99.219	Haplochromis_burtoni
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	91.871	ENSHGLG00000000970	-	99	91.871	Heterocephalus_glaber_female
ENSONIG00000011151	tnpo1	95	91.995	ENSHGLG00100017090	-	99	91.995	Heterocephalus_glaber_male
ENSONIG00000011151	tnpo1	96	71.940	ENSHGLG00100000963	-	99	71.363	Heterocephalus_glaber_male
ENSONIG00000011151	tnpo1	100	91.814	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	98	91.814	Jaculus_jaculus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	95.982	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	95.982	Kryptolebias_marmoratus
ENSONIG00000011151	tnpo1	91	92.467	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.620	Labrus_bergylta
ENSONIG00000011151	tnpo1	95	86.259	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.143	Latimeria_chalumnae
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	93.333	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	93.333	Lepisosteus_oculatus
ENSONIG00000011151	tnpo1	96	91.743	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	91.743	Loxodonta_africana
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.222	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	92.222	Macaca_fascicularis
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.377	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.377	Macaca_mulatta
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.222	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	92.222	Macaca_nemestrina
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.222	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	92.222	Mandrillus_leucophaeus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	97.879	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.879	Mastacembelus_armatus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	98.772	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	98.772	Maylandia_zebra
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.428	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	Mesocricetus_auratus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	88.753	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	88.753	Microcebus_murinus
ENSONIG00000011151	tnpo1	100	91.814	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	91.814	Microtus_ochrogaster
ENSONIG00000011151	tnpo1	86	96.282	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.282	Mola_mola
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.437	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	92.437	Monodelphis_domestica
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.540	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.540	Monopterus_albus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.522	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.820	Mus_caroli
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.522	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.820	Mus_musculus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.444	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	Mus_pahari
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.111	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.820	Mus_spretus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.222	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	92.222	Mustela_putorius_furo
ENSONIG00000011151	tnpo1	95	92.023	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.023	Myotis_lucifugus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.539	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	92.539	Nannospalax_galili
ENSONIG00000011151	tnpo1	86	98.586	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	98.586	Neolamprologus_brichardi
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.411	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	92.411	Nomascus_leucogenys
ENSONIG00000011151	tnpo1	90	86.667	ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	86.667	Ochotona_princeps
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	91.648	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	91.648	Octodon_degus
ENSONIG00000011151	tnpo1	91	93.099	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.099	Ornithorhynchus_anatinus
ENSONIG00000011151	tnpo1	95	86.311	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.079	Oryctolagus_cuniculus
ENSONIG00000011151	tnpo1	86	96.387	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.387	Oryzias_latipes
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.417	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.417	Oryzias_latipes_hni
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.753	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	96.753	Oryzias_latipes_hsok
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.305	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	96.305	Oryzias_melastigma
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.222	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	92.222	Otolemur_garnettii
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.333	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	92.333	Ovis_aries
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.222	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	92.222	Pan_paniscus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.411	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	92.411	Panthera_pardus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.411	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	92.411	Panthera_tigris_altaica
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.222	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	92.222	Pan_troglodytes
ENSONIG00000011151	tnpo1	93	82.044	ENSPTRG00000047731	-	100	82.044	Pan_troglodytes
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.222	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	92.222	Papio_anubis
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	89.955	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	89.955	Paramormyrops_kingsleyae
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.865	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	92.865	Pelodiscus_sinensis
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	93.645	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.311	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSONIG00000011151	tnpo1	95	92.683	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.683	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	93.415	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.415	Phascolarctos_cinereus
ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.107	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	96.107	Poecilia_formosa
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ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.325	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	96.325	Poecilia_reticulata
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ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.222	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	92.222	Propithecus_coquereli
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ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.321	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	96.321	Xiphophorus_maculatus