EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSONIG00000011182 (Gene tree)
Gene ID: 100704609
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oreochromis_niloticus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18194 bases
Position: chrGL831172.1:4440293-4458486
Accession: 100704609
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSONIP00000014076	RRM_1	PF00076.22	5.7e-33	1	2
ENSONIP00000014076	RRM_1	PF00076.22	5.7e-33	2	2
ENSONIP00000014077	RRM_1	PF00076.22	8.3e-33	1	2
ENSONIP00000014077	RRM_1	PF00076.22	8.3e-33	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSONIT00000014087	MSI1-202	1215	-	ENSONIP00000014077	404 (aa)	-	I3JYY2
ENSONIT00000014086	MSI1-201	3463	-	ENSONIP00000014076	348 (aa)	XP_005473073	I3JYY1

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSONIG00000011182	MSI1	54	80.132	ENSONIG00000001972	msi2a	84	80.132
ENSONIG00000011182	MSI1	50	41.243	ENSONIG00000012248	hnrnpa1b	55	40.541
ENSONIG00000011182	MSI1	52	45.000	ENSONIG00000013237	-	82	37.879
ENSONIG00000011182	MSI1	54	45.989	ENSONIG00000012982	hnrnpaba	79	38.519
ENSONIG00000011182	MSI1	57	44.444	ENSONIG00000015390	hnrnpd	81	39.844
ENSONIG00000011182	MSI1	86	30.208	ENSONIG00000017073	rbm38	85	30.208
ENSONIG00000011182	MSI1	54	41.053	ENSONIG00000008607	hnrnpa3	73	34.437
ENSONIG00000011182	MSI1	100	89.286	ENSONIG00000019452	-	100	89.286

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.978	ENSG00000135097	MSI1	100	83.978	Homo_sapiens
ENSONIG00000011182	MSI1	100	92.571	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.571	Acanthochromis_polyacanthus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	98.854	ENSAPOG00000023458	-	100	98.854	Acanthochromis_polyacanthus
ENSONIG00000011182	MSI1	95	73.727	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	73.727	Ailuropoda_melanoleuca
ENSONIG00000011182	MSI1	91	85.061	ENSACIG00000017754	-	78	91.255	Amphilophus_citrinellus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	92.571	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	92.571	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000011182	MSI1	94	89.634	ENSAOCG00000009031	-	89	99.556	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000011182	MSI1	100	98.854	ENSAPEG00000006857	-	84	98.854	Amphiprion_percula
ENSONIG00000011182	MSI1	100	92.571	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	92.571	Amphiprion_percula
ENSONIG00000011182	MSI1	100	94.930	ENSATEG00000017059	MSI1	100	98.529	Anabas_testudineus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	84.463	ENSATEG00000023779	-	100	84.463	Anabas_testudineus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	84.211	ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.765	Anolis_carolinensis
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.978	ENSANAG00000027151	MSI1	100	83.978	Aotus_nancymaae
ENSONIG00000011182	MSI1	82	84.266	ENSANAG00000027901	-	88	84.266	Aotus_nancymaae
ENSONIG00000011182	MSI1	100	100.000	ENSACLG00000000117	-	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSONIG00000011182	MSI1	100	92.593	ENSACLG00000011230	MSI1	100	92.593	Astatotilapia_calliptera
ENSONIG00000011182	MSI1	94	93.730	ENSAMXG00000038960	msi1	76	93.730	Astyanax_mexicanus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.978	ENSBTAG00000009800	MSI1	97	91.870	Bos_taurus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.978	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	83.978	Callithrix_jacchus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.702	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	83.702	Canis_familiaris
ENSONIG00000011182	MSI1	94	85.531	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	85.531	Canis_lupus_dingo
ENSONIG00000011182	MSI1	100	81.744	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	81.744	Capra_hircus
ENSONIG00000011182	MSI1	94	84.709	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.709	Carlito_syrichta
ENSONIG00000011182	MSI1	94	76.358	ENSCAPG00000003919	MSI1	78	84.615	Cavia_aperea
ENSONIG00000011182	MSI1	95	85.174	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	85.380	Cavia_porcellus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.978	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	83.978	Cebus_capucinus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.978	ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.978	Cercocebus_atys
ENSONIG00000011182	MSI1	94	85.380	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	85.380	Chinchilla_lanigera
ENSONIG00000011182	MSI1	78	84.116	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	84.116	Chlorocebus_sabaeus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	87.464	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	87.464	Chrysemys_picta_bellii
ENSONIG00000011182	MSI1	94	84.756	ENSCANG00000040651	MSI1	100	84.756	Colobus_angolensis_palliatus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.978	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.978	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSONIG00000011182	MSI1	94	84.802	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	Cricetulus_griseus_crigri
ENSONIG00000011182	MSI1	94	89.602	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	95.588	Cynoglossus_semilaevis
ENSONIG00000011182	MSI1	100	91.714	ENSCSEG00000005834	-	100	91.714	Cynoglossus_semilaevis
ENSONIG00000011182	MSI1	100	98.563	ENSCSEG00000008352	-	100	98.563	Cynoglossus_semilaevis
ENSONIG00000011182	MSI1	62	74.654	ENSCVAG00000017463	-	89	83.824	Cyprinodon_variegatus
ENSONIG00000011182	MSI1	51	66.418	ENSCVAG00000017430	zgc:110796	94	66.418	Cyprinodon_variegatus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	98.851	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	98.851	Cyprinodon_variegatus
ENSONIG00000011182	MSI1	94	89.206	ENSDARG00000010710	msi1	99	97.059	Danio_rerio
ENSONIG00000011182	MSI1	79	92.558	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	98	92.558	Danio_rerio
ENSONIG00000011182	MSI1	94	82.278	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	82.278	Dasypus_novemcinctus
ENSONIG00000011182	MSI1	94	84.132	ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	Dipodomys_ordii
ENSONIG00000011182	MSI1	94	81.707	ENSETEG00000004756	MSI1	100	81.707	Echinops_telfairi
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.978	ENSEASG00005004736	MSI1	97	89.513	Equus_asinus_asinus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.978	ENSECAG00000017526	MSI1	100	83.978	Equus_caballus
ENSONIG00000011182	MSI1	94	87.462	ENSELUG00000023280	-	100	87.156	Esox_lucius
ENSONIG00000011182	MSI1	94	90.544	ENSELUG00000023219	MSI1	92	90.544	Esox_lucius
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.978	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.978	Felis_catus
ENSONIG00000011182	MSI1	94	89.333	ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.333	Ficedula_albicollis
ENSONIG00000011182	MSI1	94	84.451	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.451	Fukomys_damarensis
ENSONIG00000011182	MSI1	100	92.571	ENSFHEG00000003560	-	100	92.571	Fundulus_heteroclitus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	98.281	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	98.281	Fundulus_heteroclitus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	95.977	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.977	Gadus_morhua
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.051	ENSGMOG00000017838	-	100	83.051	Gadus_morhua
ENSONIG00000011182	MSI1	94	88.931	ENSGALG00000007227	MSI1	98	75.959	Gallus_gallus
ENSONIG00000011182	MSI1	83	95.588	ENSGAFG00000005860	-	100	95.588	Gambusia_affinis
ENSONIG00000011182	MSI1	94	92.378	ENSGAFG00000021522	MSI1	93	94.667	Gambusia_affinis
ENSONIG00000011182	MSI1	100	97.708	ENSGACG00000012679	MSI1	100	98.872	Gasterosteus_aculeatus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	84.765	ENSGACG00000008674	-	100	84.765	Gasterosteus_aculeatus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	87.464	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	90.637	Gopherus_agassizii
ENSONIG00000011182	MSI1	94	85.350	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	85.350	Gorilla_gorilla
ENSONIG00000011182	MSI1	100	100.000	ENSHBUG00000011841	-	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSONIG00000011182	MSI1	100	92.593	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	92.593	Haplochromis_burtoni
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.702	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	83.702	Heterocephalus_glaber_female
ENSONIG00000011182	MSI1	94	84.451	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	Heterocephalus_glaber_male
ENSONIG00000011182	MSI1	91	91.083	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	93.852	Hippocampus_comes
ENSONIG00000011182	MSI1	100	92.614	ENSHCOG00000012067	-	100	92.614	Hippocampus_comes
ENSONIG00000011182	MSI1	100	91.977	ENSIPUG00000001976	msi1	100	91.977	Ictalurus_punctatus
ENSONIG00000011182	MSI1	94	85.531	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.531	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.978	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	83.978	Jaculus_jaculus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	72.853	ENSJJAG00000010643	-	97	82.331	Jaculus_jaculus
ENSONIG00000011182	MSI1	94	87.156	ENSKMAG00000019877	-	100	93.878	Kryptolebias_marmoratus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	98.276	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	98.276	Kryptolebias_marmoratus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	92.571	ENSLBEG00000001375	-	100	92.571	Labrus_bergylta
ENSONIG00000011182	MSI1	100	98.567	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	98.567	Labrus_bergylta
ENSONIG00000011182	MSI1	94	83.918	ENSLACG00000018287	MSI1	100	83.918	Latimeria_chalumnae
ENSONIG00000011182	MSI1	52	79.091	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	79.091	Lepisosteus_oculatus
ENSONIG00000011182	MSI1	91	75.529	ENSLAFG00000009412	MSI1	95	84.615	Loxodonta_africana
ENSONIG00000011182	MSI1	94	85.380	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	85.380	Macaca_fascicularis
ENSONIG00000011182	MSI1	94	85.380	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	84.483	Macaca_mulatta
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.978	ENSMNEG00000040034	MSI1	97	89.513	Macaca_nemestrina
ENSONIG00000011182	MSI1	94	84.756	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	84.756	Mandrillus_leucophaeus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	92.000	ENSMAMG00000018426	-	100	92.000	Mastacembelus_armatus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	99.138	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	99.138	Mastacembelus_armatus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	100.000	ENSMZEG00005000340	-	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSONIG00000011182	MSI1	100	92.593	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	92.593	Maylandia_zebra
ENSONIG00000011182	MSI1	63	94.083	ENSMGAG00000016518	-	100	94.083	Meleagris_gallopavo
ENSONIG00000011182	MSI1	70	89.300	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	89.300	Mesocricetus_auratus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.978	ENSMICG00000033181	MSI1	100	83.978	Microcebus_murinus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.702	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.702	Microtus_ochrogaster
ENSONIG00000011182	MSI1	100	82.471	ENSMMOG00000012265	-	100	86.842	Mola_mola
ENSONIG00000011182	MSI1	94	86.585	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	98.222	Mola_mola
ENSONIG00000011182	MSI1	91	57.831	ENSMODG00000003189	-	100	57.831	Monodelphis_domestica
ENSONIG00000011182	MSI1	94	92.661	ENSMALG00000001426	-	100	94.286	Monopterus_albus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	99.713	ENSMALG00000017889	MSI1	100	99.713	Monopterus_albus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.425	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	98	91.026	Mus_caroli
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.425	ENSMUSG00000054256	Msi1	98	91.026	Mus_musculus
ENSONIG00000011182	MSI1	100	86.286	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	98	91.416	Mus_pahari
ENSONIG00000011182	MSI1	100	83.425	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	98	91.026	Mus_spretus
ENSONIG00000011182	MSI1	94	85.531	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	85.531	Mustela_putorius_furo
ENSONIG00000011182	MSI1	94	76.190	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	76.190	Myotis_lucifugus
ENSONIG00000011182	MSI1	94	84.802	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	Nannospalax_galili
ENSONIG00000011182	MSI1	100	100.000	ENSNBRG00000000841	-	100	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSONIG00000011182	MSI1	89	84.836	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	85.294	Neolamprologus_brichardi
ENSONIG00000011182	MSI1	90	75.305	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.305	Nomascus_leucogenys
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ENSONIG00000011182	MSI1	100	99.140	ENSORLG00015013672	-	76	98.529	Oryzias_latipes_hsok
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ENSONIG00000011182	MSI1	100	93.678	ENSPKIG00000023575	-	100	93.678	Paramormyrops_kingsleyae
ENSONIG00000011182	MSI1	79	81.140	ENSPSIG00000009621	-	100	81.140	Pelodiscus_sinensis
ENSONIG00000011182	MSI1	94	85.976	ENSPSIG00000011608	-	93	85.976	Pelodiscus_sinensis
ENSONIG00000011182	MSI1	94	74.545	ENSPMGG00000007743	-	98	68.768	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSONIG00000011182	MSI1	91	93.333	ENSPMGG00000000514	MSI1	97	99.187	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSONIG00000011182	MSI1	100	98.854	ENSPFOG00000013113	MSI1	100	98.854	Poecilia_formosa
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ENSONIG00000011182	MSI1	100	92.000	ENSPLAG00000012431	-	97	92.000	Poecilia_latipinna
ENSONIG00000011182	MSI1	100	91.429	ENSPMEG00000007025	-	87	94.667	Poecilia_mexicana
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ENSONIG00000011182	MSI1	94	85.380	ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.380	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSONIG00000011182	MSI1	94	75.305	ENSXCOG00000017605	MSI1	89	85.294	Xiphophorus_couchianus
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ENSONIG00000011182	MSI1	100	98.851	ENSXMAG00000027103	MSI1	100	97.059	Xiphophorus_maculatus