EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSONIG00000012027 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: caprin2
Alias: -
Full Name: caprin-2
Gene Type: protein_coding
Species: Oreochromis_niloticus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11317 bases
Position: chrGL831213.1:1358419-1369735
Accession: 100690303
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSONIP00000015139	Caprin-1_C	PF12287.8	8.2e-20	1	1
ENSONIP00000015140	Caprin-1_C	PF12287.8	1e-15	1	1

Transcripts

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ENSONIT00000015152	-	3754	XM_005475567	ENSONIP00000015139	905 (aa)	XP_005475624	I3K1Z4
ENSONIT00000015153	-	2712	-	ENSONIP00000015140	903 (aa)	-	I3K1Z5

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSONIG00000012027	caprin2	94	43.706	ENSG00000110888	CAPRIN2	71	71.429	Homo_sapiens
ENSONIG00000012027	caprin2	100	70.996	ENSAPOG00000019808	caprin2	100	72.186	Acanthochromis_polyacanthus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	40.503	ENSAMEG00000009118	CAPRIN2	85	40.341	Ailuropoda_melanoleuca
ENSONIG00000012027	caprin2	100	70.323	ENSACIG00000005589	caprin2	99	70.323	Amphilophus_citrinellus
ENSONIG00000012027	caprin2	60	40.976	ENSACIG00000017913	caprin1b	82	40.976	Amphilophus_citrinellus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	72.294	ENSAOCG00000013014	caprin2	100	72.835	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000012027	caprin2	100	41.317	ENSAPLG00000006703	CAPRIN2	90	41.317	Anas_platyrhynchos
ENSONIG00000012027	caprin2	82	51.675	ENSACAG00000012953	CAPRIN2	72	46.067	Anolis_carolinensis
ENSONIG00000012027	caprin2	94	44.251	ENSANAG00000035460	CAPRIN2	86	44.755	Aotus_nancymaae
ENSONIG00000012027	caprin2	100	94.365	ENSACLG00000015175	-	100	94.365	Astatotilapia_calliptera
ENSONIG00000012027	caprin2	100	50.000	ENSAMXG00000007266	caprin2	97	50.462	Astyanax_mexicanus
ENSONIG00000012027	caprin2	94	44.211	ENSBTAG00000019373	CAPRIN2	82	52.174	Bos_taurus
ENSONIG00000012027	caprin2	88	44.755	ENSCJAG00000001080	CAPRIN2	80	43.494	Callithrix_jacchus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	40.057	ENSCAFG00000010713	CAPRIN2	90	40.057	Canis_familiaris
ENSONIG00000012027	caprin2	94	41.156	ENSCAFG00020018961	-	86	41.156	Canis_lupus_dingo
ENSONIG00000012027	caprin2	94	44.840	ENSCHIG00000026352	CAPRIN2	86	44.681	Capra_hircus
ENSONIG00000012027	caprin2	72	52.575	ENSTSYG00000008590	CAPRIN2	81	40.688	Carlito_syrichta
ENSONIG00000012027	caprin2	94	41.223	ENSCPOG00000006625	CAPRIN2	96	41.422	Cavia_porcellus
ENSONIG00000012027	caprin2	94	44.599	ENSCCAG00000027709	CAPRIN2	100	42.572	Cebus_capucinus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	40.057	ENSCATG00000031463	CAPRIN2	100	42.541	Cercocebus_atys
ENSONIG00000012027	caprin2	94	42.308	ENSCLAG00000001513	CAPRIN2	96	42.551	Chinchilla_lanigera
ENSONIG00000012027	caprin2	100	40.057	ENSCSAG00000007446	CAPRIN2	90	40.057	Chlorocebus_sabaeus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	39.577	ENSCHOG00000008931	CAPRIN2	86	39.270	Choloepus_hoffmanni
ENSONIG00000012027	caprin2	100	42.363	ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	84	42.651	Chrysemys_picta_bellii
ENSONIG00000012027	caprin2	100	40.341	ENSCANG00000035343	CAPRIN2	89	40.503	Colobus_angolensis_palliatus
ENSONIG00000012027	caprin2	94	40.476	ENSCGRG00001002901	Caprin2	96	40.837	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSONIG00000012027	caprin2	90	48.908	ENSCGRG00000001249	Caprin2	90	53.535	Cricetulus_griseus_crigri
ENSONIG00000012027	caprin2	100	50.368	ENSDARG00000020749	caprin2	99	51.123	Danio_rerio
ENSONIG00000012027	caprin2	65	52.284	ENSDNOG00000009793	CAPRIN2	80	44.097	Dasypus_novemcinctus
ENSONIG00000012027	caprin2	91	41.455	ENSDORG00000012639	Caprin2	99	41.580	Dipodomys_ordii
ENSONIG00000012027	caprin2	62	61.111	ENSETEG00000011498	-	62	52.980	Echinops_telfairi
ENSONIG00000012027	caprin2	94	43.860	ENSEASG00005005997	CAPRIN2	86	43.706	Equus_asinus_asinus
ENSONIG00000012027	caprin2	93	45.161	ENSECAG00000000608	CAPRIN2	89	52.304	Equus_caballus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	50.669	ENSELUG00000019776	caprin2	100	50.875	Esox_lucius
ENSONIG00000012027	caprin2	94	44.211	ENSFCAG00000007004	CAPRIN2	80	44.056	Felis_catus
ENSONIG00000012027	caprin2	99	42.857	ENSFALG00000009038	CAPRIN2	81	42.857	Ficedula_albicollis
ENSONIG00000012027	caprin2	69	50.253	ENSFDAG00000020134	CAPRIN2	78	44.792	Fukomys_damarensis
ENSONIG00000012027	caprin2	100	67.279	ENSFHEG00000004435	caprin2	100	67.279	Fundulus_heteroclitus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	41.959	ENSGALG00000012947	CAPRIN2	87	42.398	Gallus_gallus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	65.801	ENSGAFG00000020084	caprin2	100	65.801	Gambusia_affinis
ENSONIG00000012027	caprin2	100	62.833	ENSGACG00000019233	caprin2	100	62.833	Gasterosteus_aculeatus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	42.245	ENSGAGG00000015057	CAPRIN2	82	41.374	Gopherus_agassizii
ENSONIG00000012027	caprin2	100	40.341	ENSGGOG00000006182	CAPRIN2	85	40.341	Gorilla_gorilla
ENSONIG00000012027	caprin2	100	96.133	ENSHBUG00000012107	-	100	96.133	Haplochromis_burtoni
ENSONIG00000012027	caprin2	100	45.897	ENSIPUG00000016517	caprin2	100	46.122	Ictalurus_punctatus
ENSONIG00000012027	caprin2	93	52.941	ENSSTOG00000004672	CAPRIN2	74	52.941	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSONIG00000012027	caprin2	94	39.346	ENSJJAG00000018136	Caprin2	98	38.920	Jaculus_jaculus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	63.715	ENSKMAG00000011810	caprin2	100	63.931	Kryptolebias_marmoratus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	71.737	ENSLBEG00000028194	caprin2	100	71.737	Labrus_bergylta
ENSONIG00000012027	caprin2	100	39.008	ENSLACG00000006297	CAPRIN2	100	39.397	Latimeria_chalumnae
ENSONIG00000012027	caprin2	74	64.143	ENSLOCG00000015099	caprin2	87	64.143	Lepisosteus_oculatus
ENSONIG00000012027	caprin2	94	42.759	ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	86	43.448	Loxodonta_africana
ENSONIG00000012027	caprin2	100	40.057	ENSMFAG00000025167	CAPRIN2	86	40.057	Macaca_fascicularis
ENSONIG00000012027	caprin2	100	40.057	ENSMMUG00000001359	CAPRIN2	78	50.886	Macaca_mulatta
ENSONIG00000012027	caprin2	100	40.057	ENSMNEG00000029750	CAPRIN2	100	42.308	Macaca_nemestrina
ENSONIG00000012027	caprin2	94	43.706	ENSMLEG00000034760	CAPRIN2	89	40.227	Mandrillus_leucophaeus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	75.216	ENSMAMG00000023305	caprin2	100	75.216	Mastacembelus_armatus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	94.475	ENSMZEG00005008191	-	100	94.475	Maylandia_zebra
ENSONIG00000012027	caprin2	94	42.071	ENSMGAG00000013350	CAPRIN2	90	42.071	Meleagris_gallopavo
ENSONIG00000012027	caprin2	94	40.270	ENSMAUG00000008195	Caprin2	96	41.302	Mesocricetus_auratus
ENSONIG00000012027	caprin2	94	43.509	ENSMICG00000010650	CAPRIN2	100	43.693	Microcebus_murinus
ENSONIG00000012027	caprin2	75	50.630	ENSMOCG00000001842	Caprin2	84	42.784	Microtus_ochrogaster
ENSONIG00000012027	caprin2	86	46.388	ENSMODG00000012642	-	89	46.212	Monodelphis_domestica
ENSONIG00000012027	caprin2	100	70.022	ENSMALG00000020970	caprin2	100	70.022	Monopterus_albus
ENSONIG00000012027	caprin2	94	38.496	MGP_CAROLIEiJ_G0029073	Caprin2	96	38.047	Mus_caroli
ENSONIG00000012027	caprin2	93	43.103	ENSMUSG00000030309	Caprin2	96	40.720	Mus_musculus
ENSONIG00000012027	caprin2	94	39.977	MGP_PahariEiJ_G0022834	Caprin2	96	39.977	Mus_pahari
ENSONIG00000012027	caprin2	94	43.448	MGP_SPRETEiJ_G0030128	Caprin2	96	40.607	Mus_spretus
ENSONIG00000012027	caprin2	94	44.211	ENSMPUG00000011164	CAPRIN2	87	40.341	Mustela_putorius_furo
ENSONIG00000012027	caprin2	100	41.219	ENSMLUG00000008734	CAPRIN2	93	41.219	Myotis_lucifugus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	39.773	ENSNLEG00000005730	CAPRIN2	86	39.773	Nomascus_leucogenys
ENSONIG00000012027	caprin2	75	50.952	ENSMEUG00000009176	CAPRIN2	65	50.952	Notamacropus_eugenii
ENSONIG00000012027	caprin2	54	41.667	ENSMEUG00000012704	CAPRIN1	80	41.447	Notamacropus_eugenii
ENSONIG00000012027	caprin2	61	68.000	ENSOPRG00000011491	CAPRIN2	85	68.889	Ochotona_princeps
ENSONIG00000012027	caprin2	96	42.384	ENSODEG00000005454	CAPRIN2	91	42.715	Octodon_degus
ENSONIG00000012027	caprin2	96	41.776	ENSOCUG00000017805	CAPRIN2	86	41.776	Oryctolagus_cuniculus
ENSONIG00000012027	caprin2	59	40.097	ENSORLG00000004783	caprin1b	80	40.097	Oryzias_latipes
ENSONIG00000012027	caprin2	100	62.364	ENSORLG00000012576	orla-b2m	100	62.364	Oryzias_latipes
ENSONIG00000012027	caprin2	59	40.580	ENSORLG00020012514	caprin1b	82	40.580	Oryzias_latipes_hni
ENSONIG00000012027	caprin2	59	40.097	ENSORLG00015005783	caprin1b	80	40.097	Oryzias_latipes_hsok
ENSONIG00000012027	caprin2	100	40.909	ENSOGAG00000010071	CAPRIN2	88	40.909	Otolemur_garnettii
ENSONIG00000012027	caprin2	94	44.211	ENSOARG00000019503	CAPRIN2	80	44.056	Ovis_aries
ENSONIG00000012027	caprin2	100	40.057	ENSPPAG00000041410	CAPRIN2	88	40.223	Pan_paniscus
ENSONIG00000012027	caprin2	94	44.211	ENSPPRG00000013738	CAPRIN2	81	44.056	Panthera_pardus
ENSONIG00000012027	caprin2	94	44.211	ENSPTIG00000013003	CAPRIN2	86	40.395	Panthera_tigris_altaica
ENSONIG00000012027	caprin2	100	40.057	ENSPTRG00000004802	CAPRIN2	86	43.706	Pan_troglodytes
ENSONIG00000012027	caprin2	100	40.057	ENSPANG00000005858	CAPRIN2	88	40.223	Papio_anubis
ENSONIG00000012027	caprin2	98	45.435	ENSPKIG00000017980	caprin2	100	45.417	Paramormyrops_kingsleyae
ENSONIG00000012027	caprin2	100	42.145	ENSPSIG00000016188	CAPRIN2	91	42.145	Pelodiscus_sinensis
ENSONIG00000012027	caprin2	94	41.236	ENSPEMG00000006778	Caprin2	96	41.592	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSONIG00000012027	caprin2	95	42.414	ENSPCIG00000015197	CAPRIN2	84	42.414	Phascolarctos_cinereus
ENSONIG00000012027	caprin2	80	59.164	ENSPFOG00000009034	caprin2	99	59.164	Poecilia_formosa
ENSONIG00000012027	caprin2	60	42.211	ENSPLAG00000014342	caprin1b	82	42.211	Poecilia_latipinna
ENSONIG00000012027	caprin2	100	66.595	ENSPMEG00000020786	caprin2	100	66.595	Poecilia_mexicana
ENSONIG00000012027	caprin2	94	43.706	ENSPPYG00000004394	CAPRIN2	80	43.706	Pongo_abelii
ENSONIG00000012027	caprin2	100	39.051	ENSPCAG00000015746	CAPRIN2	91	38.640	Procavia_capensis
ENSONIG00000012027	caprin2	66	52.304	ENSPCOG00000024022	CAPRIN2	80	40.223	Propithecus_coquereli
ENSONIG00000012027	caprin2	86	58.108	ENSPVAG00000006083	CAPRIN2	74	54.667	Pteropus_vampyrus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	47.799	ENSPNAG00000017781	caprin2	99	47.934	Pygocentrus_nattereri
ENSONIG00000012027	caprin2	94	39.863	ENSRNOG00000047319	Caprin2	96	40.229	Rattus_norvegicus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	39.854	ENSRBIG00000033178	CAPRIN2	100	41.818	Rhinopithecus_bieti
ENSONIG00000012027	caprin2	89	37.917	ENSRROG00000033123	CAPRIN2	91	38.750	Rhinopithecus_roxellana
ENSONIG00000012027	caprin2	100	40.793	ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	86	45.105	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSONIG00000012027	caprin2	95	41.311	ENSSHAG00000004287	CAPRIN2	86	41.311	Sarcophilus_harrisii
ENSONIG00000012027	caprin2	51	54.878	ENSSFOG00015022679	caprin2	94	54.878	Scleropages_formosus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	73.391	ENSSMAG00000016174	caprin2	100	73.501	Scophthalmus_maximus
ENSONIG00000012027	caprin2	100	74.730	ENSSDUG00000019919	caprin2	100	74.622	Seriola_dumerili
ENSONIG00000012027	caprin2	59	40.580	ENSSLDG00000005156	caprin1b	84	40.976	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSONIG00000012027	caprin2	94	44.056	ENSSSCG00000022611	CAPRIN2	84	44.056	Sus_scrofa
ENSONIG00000012027	caprin2	95	44.254	ENSTGUG00000011456	-	83	44.444	Taeniopygia_guttata
ENSONIG00000012027	caprin2	88	44.097	ENSTTRG00000008463	CAPRIN2	66	50.253	Tursiops_truncatus
ENSONIG00000012027	caprin2	56	43.364	ENSUAMG00000012343	-	100	43.364	Ursus_americanus
ENSONIG00000012027	caprin2	85	51.762	ENSUMAG00000002576	CAPRIN2	93	51.762	Ursus_maritimus
ENSONIG00000012027	caprin2	94	43.440	ENSVPAG00000007238	CAPRIN2	83	43.393	Vicugna_pacos
ENSONIG00000012027	caprin2	91	52.304	ENSVVUG00000007217	CAPRIN2	75	52.304	Vulpes_vulpes
ENSONIG00000012027	caprin2	95	37.037	ENSXETG00000007516	caprin2	99	36.533	Xenopus_tropicalis