EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSONIG00000013500 (Gene tree)
Gene ID: 100704693
Gene Symbol: skiv2l
Alias: -
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Oreochromis_niloticus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17952 bases
Position: chrGL831186.1:117033-134984
Accession: 100704693
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSONIP00000016975	rRNA_proc-arch	PF13234.6	6.9e-31	1	1
ENSONIP00000016976	rRNA_proc-arch	PF13234.6	4.5e-28	1	1
ENSONIP00000016975	DEAD	PF00270.29	2.3e-16	1	1
ENSONIP00000016976	DEAD	PF00270.29	2.3e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSONIT00000016991	-	3708	-	ENSONIP00000016976	1235 (aa)	-	I3K781
ENSONIT00000016990	-	3735	-	ENSONIP00000016975	1244 (aa)	XP_003447205	I3K780

Gene Model

Click here to download ENSONIG00000013500's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSONIG00000013500's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSONIG00000013500	skiv2l	76	35.865	ENSONIG00000007587	mtrex	90	34.953

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.086	ENSG00000204351	SKIV2L	99	61.912	Homo_sapiens
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	90.273	ENSAPOG00000008257	skiv2l	100	90.273	Acanthochromis_polyacanthus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.247	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	62.141	Ailuropoda_melanoleuca
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	93.025	ENSACIG00000016719	skiv2l	100	93.025	Amphilophus_citrinellus
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	90.836	ENSAOCG00000017352	skiv2l	100	90.836	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	90.595	ENSAPEG00000001055	skiv2l	100	90.595	Amphiprion_percula
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	90.675	ENSATEG00000007601	skiv2l	100	90.675	Anabas_testudineus
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	63.302	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	63.821	Anolis_carolinensis
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.510	ENSANAG00000037992	SKIV2L	99	62.231	Aotus_nancymaae
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	98.473	ENSACLG00000006886	skiv2l	100	98.473	Astatotilapia_calliptera
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	82.814	ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	82.827	Astyanax_mexicanus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.086	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	99	61.833	Bos_taurus
ENSONIG00000013500	skiv2l	95	41.524	WBGene00008502	skih-2	99	41.272	Caenorhabditis_elegans
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.359	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	62.072	Callithrix_jacchus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.047	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	99	61.981	Canis_familiaris
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.047	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	99	61.981	Canis_lupus_dingo
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.328	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	99	62.072	Capra_hircus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.483	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	99	61.673	Carlito_syrichta
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.164	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	99	61.748	Cavia_porcellus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.247	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	99	62.072	Cebus_capucinus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.267	ENSCATG00000036901	SKIV2L	99	61.981	Cercocebus_atys
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.167	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.833	Chinchilla_lanigera
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.490	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	99	62.061	Chlorocebus_sabaeus
ENSONIG00000013500	skiv2l	89	59.934	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	99	59.740	Chrysemys_picta_bellii
ENSONIG00000013500	skiv2l	93	51.115	ENSCING00000005576	-	99	51.117	Ciona_intestinalis
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.510	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	61.569	Colobus_angolensis_palliatus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.368	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	99	62.160	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	86.254	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	86.656	Cynoglossus_semilaevis
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	90.449	ENSCVAG00000003072	skiv2l	100	90.607	Cyprinodon_variegatus
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	83.626	ENSDARG00000062206	skiv2l	100	83.626	Danio_rerio
ENSONIG00000013500	skiv2l	92	66.840	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	99	58.926	Dasypus_novemcinctus
ENSONIG00000013500	skiv2l	93	46.037	FBgn0039117	tst	97	45.907	Drosophila_melanogaster
ENSONIG00000013500	skiv2l	68	80.822	ENSETEG00000009522	SKIV2L	68	80.822	Echinops_telfairi
ENSONIG00000013500	skiv2l	91	55.211	ENSEBUG00000013680	-	98	54.788	Eptatretus_burgeri
ENSONIG00000013500	skiv2l	93	63.153	ENSEASG00005015534	SKIV2L	100	63.208	Equus_asinus_asinus
ENSONIG00000013500	skiv2l	93	62.404	ENSECAG00000021823	SKIV2L	95	62.321	Equus_caballus
ENSONIG00000013500	skiv2l	51	74.704	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	56	74.704	Erinaceus_europaeus
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	84.800	ENSELUG00000000181	skiv2l	99	87.703	Esox_lucius
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.591	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	99	62.220	Felis_catus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	60.936	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.956	Fukomys_damarensis
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	89.888	ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	89.888	Fundulus_heteroclitus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	81.929	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	81.929	Gadus_morhua
ENSONIG00000013500	skiv2l	79	56.517	ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	57.026	Gallus_gallus
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	90.449	ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	90.449	Gambusia_affinis
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	89.139	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	89.139	Gasterosteus_aculeatus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.267	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	99	61.992	Gorilla_gorilla
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	98.392	ENSHBUG00000000726	skiv2l	100	98.392	Haplochromis_burtoni
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.066	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	99	61.734	Heterocephalus_glaber_female
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	60.533	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	99	60.223	Heterocephalus_glaber_male
ENSONIG00000013500	skiv2l	98	81.974	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	82.300	Hippocampus_comes
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	81.775	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	82.859	Ictalurus_punctatus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.231	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.992	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSONIG00000013500	skiv2l	56	64.726	ENSLACG00000002986	-	60	64.726	Latimeria_chalumnae
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.943	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.833	Loxodonta_africana
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.510	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	99	62.220	Macaca_fascicularis
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.510	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	99	62.220	Macaca_mulatta
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.591	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	62.380	Macaca_nemestrina
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.267	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	99	61.981	Mandrillus_leucophaeus
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	90.449	ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	90.449	Mastacembelus_armatus
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	98.392	ENSMZEG00005026415	skiv2l	100	98.392	Maylandia_zebra
ENSONIG00000013500	skiv2l	68	49.672	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	95	49.891	Meleagris_gallopavo
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.994	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.791	Mesocricetus_auratus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.591	ENSMICG00000046331	SKIV2L	99	62.311	Microcebus_murinus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.152	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.942	Microtus_ochrogaster
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	85.358	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	85.358	Mola_mola
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.300	ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	62.440	Monodelphis_domestica
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	84.423	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	84.423	Monopterus_albus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.530	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	99	62.160	Mus_caroli
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.530	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	99	62.240	Mus_musculus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.774	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	99	62.480	Mus_pahari
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.368	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	99	62.080	Mus_spretus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.886	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	99	61.962	Mustela_putorius_furo
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.843	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	99	61.594	Myotis_lucifugus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	93.710	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	93.710	Neolamprologus_brichardi
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.595	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	61.272	Nomascus_leucogenys
ENSONIG00000013500	skiv2l	78	65.179	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	64.602	Notamacropus_eugenii
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.843	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	61.643	Ochotona_princeps
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.217	ENSODEG00000017516	SKIV2L	99	61.852	Octodon_degus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.834	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	99	62.470	Oryctolagus_cuniculus
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	88.844	ENSORLG00000002021	skiv2l	100	88.844	Oryzias_latipes
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	88.684	ENSORLG00020009462	skiv2l	100	88.684	Oryzias_latipes_hni
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	88.764	ENSORLG00015016750	skiv2l	100	88.764	Oryzias_latipes_hsok
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	89.309	ENSOMEG00000008531	skiv2l	100	89.309	Oryzias_melastigma
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.278	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	99	62.151	Otolemur_garnettii
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	58.861	ENSOARG00000002411	-	99	58.658	Ovis_aries
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.836	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	61.606	Pan_paniscus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.672	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	99	62.300	Panthera_pardus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.267	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.901	Panthera_tigris_altaica
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.267	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	99	61.992	Pan_troglodytes
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.402	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	61.164	Papio_anubis
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	79.157	ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	79.157	Paramormyrops_kingsleyae
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	86.704	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	86.704	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.044	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	99	61.840	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.420	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	99	62.420	Phascolarctos_cinereus
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	90.048	ENSPFOG00000002424	skiv2l	100	90.048	Poecilia_formosa
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	89.888	ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	89.888	Poecilia_latipinna
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	90.209	ENSPMEG00000006997	skiv2l	100	90.209	Poecilia_mexicana
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	85.158	ENSPREG00000002277	skiv2l	99	84.996	Poecilia_reticulata
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.862	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	61.594	Pongo_abelii
ENSONIG00000013500	skiv2l	77	65.385	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	65.385	Procavia_capensis
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.672	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	99	62.390	Propithecus_coquereli
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.429	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	99	62.330	Pteropus_vampyrus
ENSONIG00000013500	skiv2l	95	96.078	ENSPNYG00000017853	skiv2l	99	96.078	Pundamilia_nyererei
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	84.416	ENSPNAG00000011823	skiv2l	100	84.135	Pygocentrus_nattereri
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.612	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	99	62.320	Rattus_norvegicus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.223	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	60.987	Rhinopithecus_bieti
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.429	ENSRROG00000036429	SKIV2L	99	62.141	Rhinopithecus_roxellana
ENSONIG00000013500	skiv2l	93	38.598	YLR398C	-	78	41.810	Saccharomyces_cerevisiae
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.490	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	62.231	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.171	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	61.275	Sarcophilus_harrisii
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	81.963	ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.963	Scleropages_formosus
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	89.888	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	89.960	Scophthalmus_maximus
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	90.522	ENSSDUG00000019977	skiv2l	100	90.522	Seriola_dumerili
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	83.629	ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	83.629	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	60.573	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	60.573	Sphenodon_punctatus
ENSONIG00000013500	skiv2l	95	90.847	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	90.847	Stegastes_partitus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.380	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	61.366	Sus_scrofa
ENSONIG00000013500	skiv2l	73	86.096	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	69.981	Takifugu_rubripes
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	85.024	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	85.105	Tetraodon_nigroviridis
ENSONIG00000013500	skiv2l	93	63.558	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.558	Tupaia_belangeri
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	58.219	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.928	Tursiops_truncatus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.510	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	62.300	Ursus_americanus
ENSONIG00000013500	skiv2l	93	63.176	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	100	63.199	Ursus_maritimus
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.966	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	61.939	Vulpes_vulpes
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	59.001	ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.525	Xenopus_tropicalis
ENSONIG00000013500	skiv2l	99	88.889	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	88.889	Xiphophorus_couchianus
ENSONIG00000013500	skiv2l	100	89.807	ENSXMAG00000014079	skiv2l	100	89.567	Xiphophorus_maculatus