EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSONIG00000013568 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC100710263
Gene Type: protein_coding
Species: Oreochromis_niloticus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9892 bases
Position: chrGL831238.1:1893988-1903879
Accession: 100710263
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSONIP00000017062	MMR_HSR1	PF01926.23	1.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSONIT00000017077	-	1697	-	ENSONIP00000017062	448 (aa)	XP_019221143	I3K7G7

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	59.735	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	59.735

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	93.750	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	93.750	Acanthochromis_polyacanthus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Acanthochromis_polyacanthus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	59.202	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	59.202	Amphilophus_citrinellus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	96.429	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	96.429	Amphilophus_citrinellus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	94.196	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	94.196	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Amphiprion_percula
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	94.196	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	94.196	Amphiprion_percula
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Anabas_testudineus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Anabas_testudineus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	99	58.259	ENSACAG00000028632	-	99	58.352	Anolis_carolinensis
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	60.177	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	60.177	Astatotilapia_calliptera
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	98.438	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	98.438	Astatotilapia_calliptera
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	81.514	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.514	Astyanax_mexicanus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	60.352	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	60.352	Astyanax_mexicanus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	79	62.640	ENSCING00000020807	-	94	62.640	Ciona_intestinalis
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	98	57.045	ENSCSAVG00000009987	-	98	57.273	Ciona_savignyi
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	87.736	Cynoglossus_semilaevis
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	58.667	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Cyprinodon_variegatus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Cyprinodon_variegatus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	98	84.091	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	84.091	Danio_rerio
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	75.000	Danio_rerio
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	80	56.546	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	96	56.546	Eptatretus_burgeri
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	99	82.063	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	82.063	Esox_lucius
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Fundulus_heteroclitus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	60.089	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Fundulus_heteroclitus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	89	56.110	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	56.110	Gadus_morhua
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	91.964	Gambusia_affinis
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Gambusia_affinis
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	58	94.961	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.961	Gasterosteus_aculeatus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	85	64.491	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	62.438	Gasterosteus_aculeatus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	98.884	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	98.884	Haplochromis_burtoni
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	60.398	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	60.398	Haplochromis_burtoni
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Hippocampus_comes
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	99	85.586	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	85.586	Hippocampus_comes
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	96	60.970	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	60.739	Ictalurus_punctatus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	84	59.043	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	59.043	Ictalurus_punctatus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	77.728	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.728	Ictalurus_punctatus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	93.750	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	93.750	Kryptolebias_marmoratus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Kryptolebias_marmoratus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Labrus_bergylta
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	99	62.697	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	62.921	Latimeria_chalumnae
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	62.361	ENSLACG00000004899	-	99	62.361	Latimeria_chalumnae
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	99	70.270	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	70.270	Latimeria_chalumnae
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	99	76.063	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	76.063	Lepisosteus_oculatus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Mastacembelus_armatus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	96	61.201	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	61.201	Mastacembelus_armatus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	59.956	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	59.956	Maylandia_zebra
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	98.661	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	98.661	Maylandia_zebra
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	58.315	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	58.315	Mola_mola
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	98	91.116	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	91.116	Monopterus_albus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	61.333	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	61.333	Monopterus_albus
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	98.214	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	98.214	Neolamprologus_brichardi
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	96	60.970	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	60.970	Neolamprologus_brichardi
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	87.946	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	87.946	Oryzias_latipes
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Oryzias_latipes
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Oryzias_latipes_hni
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Oryzias_latipes_hni
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	61.333	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	61.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Oryzias_latipes_hsok
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Oryzias_melastigma
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	61.333	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	61.333	Oryzias_melastigma
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	59.020	ENSPKIG00000023918	-	98	59.020	Paramormyrops_kingsleyae
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Paramormyrops_kingsleyae
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	78.619	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	78.619	Paramormyrops_kingsleyae
ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	87.277	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	87.277	Periophthalmus_magnuspinnatus
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