EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSONIG00000014163 (Gene tree)
Gene ID: 100699288
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: -
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Oreochromis_niloticus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 54436 bases
Position: chrGL831164.1:4248286-4302721
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSONIP00000017804	ResIII	PF04851.15	6.3e-08	1	1
ENSONIP00000017804	BRK	PF07533.16	1.4e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSONIT00000017819	SMARCA2-201	4803	-	ENSONIP00000017804	1601 (aa)	-	I3K9K9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSONIG00000014163	SMARCA2	95	70.925	ENSONIG00000018040	-	99	70.606
ENSONIG00000014163	SMARCA2	94	73.019	ENSONIG00000008196	smarca4a	99	72.581

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSONIG00000014163	SMARCA2	78	87.281	ENSG00000080503	SMARCA2	99	98.000	Homo_sapiens
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	93.295	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	99	93.232	Acanthochromis_polyacanthus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	88	77.512	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	86.953	Ailuropoda_melanoleuca
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	92.028	ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	92.090	Amphilophus_citrinellus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	93.232	ENSAOCG00000009647	-	99	93.169	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	93.359	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	99	93.295	Amphiprion_percula
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	93.062	ENSATEG00000006916	SMARCA2	99	92.812	Anabas_testudineus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	87	77.918	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	78.315	Anas_platyrhynchos
ENSONIG00000014163	SMARCA2	96	79.948	ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	79.634	Anolis_carolinensis
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.732	ENSANAG00000026498	SMARCA2	99	80.769	Aotus_nancymaae
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	95.854	ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	95.854	Astatotilapia_calliptera
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	85.097	ENSAMXG00000012404	smarca2	99	84.981	Astyanax_mexicanus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.385	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	99	80.000	Bos_taurus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.796	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	80.989	Callithrix_jacchus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.077	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	99	80.391	Canis_familiaris
ENSONIG00000014163	SMARCA2	73	87.575	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	87.489	Canis_lupus_dingo
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.385	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	99	80.000	Capra_hircus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	77.664	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.347	Carlito_syrichta
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	78.113	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	77.869	Cavia_aperea
ENSONIG00000014163	SMARCA2	98	79.643	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	99	80.706	Cavia_porcellus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.861	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	99	80.895	Cebus_capucinus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	79.365	ENSCATG00000031470	SMARCA2	99	80.605	Cercocebus_atys
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.295	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	80.730	Chinchilla_lanigera
ENSONIG00000014163	SMARCA2	92	81.868	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	81.420	Chlorocebus_sabaeus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	65	86.131	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	82.120	Choloepus_hoffmanni
ENSONIG00000014163	SMARCA2	96	80.633	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	98	83.997	Chrysemys_picta_bellii
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.989	ENSCANG00000039597	SMARCA2	99	80.958	Colobus_angolensis_palliatus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	85.134	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	99	84.272	Cynoglossus_semilaevis
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	84.789	ENSDARG00000008904	smarca2	99	84.601	Danio_rerio
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.256	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	99	80.050	Dasypus_novemcinctus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	79.683	ENSDORG00000014832	Smarca2	99	80.517	Dipodomys_ordii
ENSONIG00000014163	SMARCA2	81	63.035	ENSEBUG00000002449	-	93	62.874	Eptatretus_burgeri
ENSONIG00000014163	SMARCA2	95	67.339	ENSEBUG00000011442	-	97	67.771	Eptatretus_burgeri
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	79.693	ENSEASG00005010312	SMARCA2	99	80.202	Equus_asinus_asinus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	60	88.235	ENSEEUG00000015540	-	69	83.562	Erinaceus_europaeus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	95	83.735	ENSELUG00000010318	smarca2	99	82.162	Esox_lucius
ENSONIG00000014163	SMARCA2	96	80.142	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	99	80.454	Felis_catus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	96	80.374	ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	82.090	Ficedula_albicollis
ENSONIG00000014163	SMARCA2	80	85.759	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	99	79.450	Fukomys_damarensis
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	91.441	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	99	91.756	Fundulus_heteroclitus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	82.190	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	81.812	Gadus_morhua
ENSONIG00000014163	SMARCA2	96	80.568	ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	80.302	Gallus_gallus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	76	85.434	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	95	83.028	Gambusia_affinis
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	88.602	ENSGACG00000014488	SMARCA2	99	88.224	Gasterosteus_aculeatus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	96	80.439	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	99	80.050	Gopherus_agassizii
ENSONIG00000014163	SMARCA2	87	87.901	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	98	81.001	Gorilla_gorilla
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	97.864	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	99	97.864	Haplochromis_burtoni
ENSONIG00000014163	SMARCA2	80	86.223	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	99	80.062	Heterocephalus_glaber_female
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.167	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	99	80.454	Heterocephalus_glaber_male
ENSONIG00000014163	SMARCA2	83	87.217	ENSHCOG00000015348	-	97	86.945	Hippocampus_comes
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	83.970	ENSIPUG00000011060	smarca2	99	83.489	Ictalurus_punctatus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.616	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	99	80.643	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	79.949	ENSJJAG00000010867	Smarca2	99	80.189	Jaculus_jaculus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	92.206	ENSKMAG00000015844	-	99	92.143	Kryptolebias_marmoratus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	96	83.758	ENSLOCG00000011499	smarca2	99	83.292	Lepisosteus_oculatus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.064	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	79.899	Loxodonta_africana
ENSONIG00000014163	SMARCA2	90	87.202	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	99	80.328	Macaca_fascicularis
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.989	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	99	80.895	Macaca_mulatta
ENSONIG00000014163	SMARCA2	78	87.202	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	99	80.542	Macaca_nemestrina
ENSONIG00000014163	SMARCA2	89	87.580	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	99	78.685	Mandrillus_leucophaeus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	92.100	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	99	92.163	Mastacembelus_armatus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	97.739	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	99	97.739	Maylandia_zebra
ENSONIG00000014163	SMARCA2	75	69.617	ENSMGAG00000005160	-	100	69.221	Meleagris_gallopavo
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	79.706	ENSMICG00000005162	SMARCA2	99	80.643	Microcebus_murinus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	81	86.451	ENSMOCG00000001611	Smarca2	99	80.643	Microtus_ochrogaster
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	85.974	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	99	85.022	Mola_mola
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.809	ENSMODG00000003578	SMARCA2	99	80.643	Monodelphis_domestica
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	90.226	ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	90.038	Monopterus_albus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	80	86.682	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	99	80.050	Mus_caroli
ENSONIG00000014163	SMARCA2	80	86.604	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.000	Mus_musculus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	96	81.008	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	99	80.353	Mus_pahari
ENSONIG00000014163	SMARCA2	80	86.526	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	90.909	Mus_spretus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	78	86.635	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	93	86.746	Mustela_putorius_furo
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	76.904	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	76.543	Myotis_lucifugus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	78.746	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	78.532	Nannospalax_galili
ENSONIG00000014163	SMARCA2	95	80.435	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	84.577	Neolamprologus_brichardi
ENSONIG00000014163	SMARCA2	90	86.832	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	78.180	Nomascus_leucogenys
ENSONIG00000014163	SMARCA2	91	75.067	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	99	72.880	Notamacropus_eugenii
ENSONIG00000014163	SMARCA2	78	82.460	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	76.797	Ochotona_princeps
ENSONIG00000014163	SMARCA2	78	86.619	ENSODEG00000005452	SMARCA2	99	80.150	Octodon_degus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	78	87.879	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	99	79.887	Oryctolagus_cuniculus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	90.651	ENSORLG00000020820	SMARCA2	99	90.587	Oryzias_latipes
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	90.840	ENSORLG00015006289	SMARCA2	99	90.840	Oryzias_latipes_hsok
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	90.576	ENSOMEG00000009736	-	99	90.512	Oryzias_melastigma
ENSONIG00000014163	SMARCA2	79	86.798	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.800	Otolemur_garnettii
ENSONIG00000014163	SMARCA2	78	86.746	ENSOARG00000013265	SMARCA2	99	79.297	Ovis_aries
ENSONIG00000014163	SMARCA2	89	87.964	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	98	81.999	Pan_paniscus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	96	80.206	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	99	80.517	Panthera_pardus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.732	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	99	80.769	Pan_troglodytes
ENSONIG00000014163	SMARCA2	80	80.122	ENSPANG00000025121	SMARCA2	99	75.729	Papio_anubis
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	84.191	ENSPKIG00000018469	-	99	83.944	Paramormyrops_kingsleyae
ENSONIG00000014163	SMARCA2	96	80.000	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	99	79.811	Pelodiscus_sinensis
ENSONIG00000014163	SMARCA2	100	82.441	ENSPMGG00000013696	-	99	82.441	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	80	86.090	ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	79.773	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSONIG00000014163	SMARCA2	95	70.013	ENSPMAG00000005337	-	97	70.245	Petromyzon_marinus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.745	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	99	80.580	Phascolarctos_cinereus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	91.156	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	99	91.409	Poecilia_formosa
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	90.920	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	97	90.858	Poecilia_latipinna
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	90.835	ENSPMEG00000001815	-	99	90.960	Poecilia_mexicana
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	90.590	ENSPREG00000013800	SMARCA2	99	90.652	Poecilia_reticulata
ENSONIG00000014163	SMARCA2	78	86.804	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	99	80.391	Pongo_abelii
ENSONIG00000014163	SMARCA2	76	74.126	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	76	74.126	Procavia_capensis
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	78.805	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	99	78.689	Propithecus_coquereli
ENSONIG00000014163	SMARCA2	90	81.896	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	93	81.089	Pteropus_vampyrus
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	93.612	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	99	93.359	Pundamilia_nyererei
ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	86.036	ENSPNAG00000014635	smarca2	98	86.036	Pygocentrus_nattereri
ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.076	ENSRNOG00000011931	Smarca2	99	79.304	Rattus_norvegicus
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ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	79.255	ENSRROG00000019271	SMARCA2	99	80.932	Rhinopithecus_roxellana
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