EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSONIG00000015348 (Gene tree)
Gene ID: 100691483
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oreochromis_niloticus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16659 bases
Position: chrGL831304.1:339159-355817
Accession: 100691483
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSONIP00000019311	ResIII	PF04851.15	2.4e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSONIT00000019328	-	4816	-	ENSONIP00000019311	1403 (aa)	XP_005459708	I3KDW6

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSONIG00000015348	sbno1	69	63.991	ENSONIG00000002490	si:ch73-63e15.2	76	63.991

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.772	ENSG00000139697	SBNO1	99	75.546	Homo_sapiens
ENSONIG00000015348	sbno1	81	94.061	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	94.323	Acanthochromis_polyacanthus
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.647	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.421	Ailuropoda_melanoleuca
ENSONIG00000015348	sbno1	100	89.437	ENSACIG00000008088	sbno1	99	89.577	Amphilophus_citrinellus
ENSONIG00000015348	sbno1	100	91.554	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	92.264	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000015348	sbno1	100	91.483	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	92.193	Amphiprion_percula
ENSONIG00000015348	sbno1	100	92.335	ENSATEG00000006667	sbno1	100	92.335	Anabas_testudineus
ENSONIG00000015348	sbno1	98	76.231	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.160	Anas_platyrhynchos
ENSONIG00000015348	sbno1	98	74.911	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.526	Anolis_carolinensis
ENSONIG00000015348	sbno1	95	83.577	ENSANAG00000029958	-	99	75.510	Aotus_nancymaae
ENSONIG00000015348	sbno1	100	92.445	ENSACLG00000024913	sbno1	100	92.445	Astatotilapia_calliptera
ENSONIG00000015348	sbno1	100	80.652	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	81.219	Astyanax_mexicanus
ENSONIG00000015348	sbno1	100	75.734	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	75.649	Bos_taurus
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.736	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.510	Callithrix_jacchus
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.700	ENSCAFG00000007503	SBNO1	99	78.147	Canis_familiaris
ENSONIG00000015348	sbno1	95	81.047	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	81.047	Canis_lupus_dingo
ENSONIG00000015348	sbno1	95	83.154	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	83.154	Capra_hircus
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.474	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.993	Carlito_syrichta
ENSONIG00000015348	sbno1	95	76.600	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	83.574	Cavia_aperea
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.421	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	83.574	Cavia_porcellus
ENSONIG00000015348	sbno1	99	71.529	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	72.022	Cebus_capucinus
ENSONIG00000015348	sbno1	91	83.213	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	83.213	Cercocebus_atys
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.634	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	83.574	Chinchilla_lanigera
ENSONIG00000015348	sbno1	82	81.803	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	81.724	Chlorocebus_sabaeus
ENSONIG00000015348	sbno1	96	73.371	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	73.246	Choloepus_hoffmanni
ENSONIG00000015348	sbno1	98	75.340	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	74.401	Chrysemys_picta_bellii
ENSONIG00000015348	sbno1	99	72.491	ENSCANG00000042688	-	99	72.042	Colobus_angolensis_palliatus
ENSONIG00000015348	sbno1	96	81.720	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	81.720	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSONIG00000015348	sbno1	96	81.720	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	81.720	Cricetulus_griseus_crigri
ENSONIG00000015348	sbno1	100	88.502	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	88.644	Cynoglossus_semilaevis
ENSONIG00000015348	sbno1	100	89.908	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	89.694	Cyprinodon_variegatus
ENSONIG00000015348	sbno1	100	81.547	ENSDARG00000099080	sbno1	100	81.760	Danio_rerio
ENSONIG00000015348	sbno1	99	77.143	ENSDNOG00000017147	SBNO1	96	77.143	Dasypus_novemcinctus
ENSONIG00000015348	sbno1	99	69.128	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	80.957	Dipodomys_ordii
ENSONIG00000015348	sbno1	93	71.429	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	71.429	Echinops_telfairi
ENSONIG00000015348	sbno1	75	61.730	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	60.639	Eptatretus_burgeri
ENSONIG00000015348	sbno1	52	72.940	ENSEASG00005012595	-	92	72.802	Equus_asinus_asinus
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.806	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	76.180	Equus_caballus
ENSONIG00000015348	sbno1	82	76.503	ENSEEUG00000003793	SBNO1	82	76.503	Erinaceus_europaeus
ENSONIG00000015348	sbno1	100	81.657	ENSELUG00000002886	sbno1	99	81.953	Esox_lucius
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.806	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	75.581	Felis_catus
ENSONIG00000015348	sbno1	98	76.160	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	76.231	Ficedula_albicollis
ENSONIG00000015348	sbno1	95	80.797	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	74.103	Fukomys_damarensis
ENSONIG00000015348	sbno1	100	89.979	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	89.694	Fundulus_heteroclitus
ENSONIG00000015348	sbno1	94	84.222	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	84.523	Gadus_morhua
ENSONIG00000015348	sbno1	88	76.070	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.452	Gallus_gallus
ENSONIG00000015348	sbno1	100	90.334	ENSGAFG00000003960	sbno1	100	89.979	Gambusia_affinis
ENSONIG00000015348	sbno1	94	89.189	ENSGACG00000015633	sbno1	99	89.339	Gasterosteus_aculeatus
ENSONIG00000015348	sbno1	98	74.768	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	74.179	Gopherus_agassizii
ENSONIG00000015348	sbno1	95	83.394	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	83.394	Gorilla_gorilla
ENSONIG00000015348	sbno1	100	85.633	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	85.633	Haplochromis_burtoni
ENSONIG00000015348	sbno1	95	84.124	ENSHGLG00000014165	-	99	75.229	Heterocephalus_glaber_female
ENSONIG00000015348	sbno1	92	91.765	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	91.765	Hippocampus_comes
ENSONIG00000015348	sbno1	100	80.865	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	81.250	Ictalurus_punctatus
ENSONIG00000015348	sbno1	95	83.574	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.574	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSONIG00000015348	sbno1	95	79.820	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	79.820	Jaculus_jaculus
ENSONIG00000015348	sbno1	100	91.756	ENSKMAG00000009696	sbno1	100	91.756	Kryptolebias_marmoratus
ENSONIG00000015348	sbno1	100	89.802	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	90.297	Labrus_bergylta
ENSONIG00000015348	sbno1	100	71.378	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.127	Latimeria_chalumnae
ENSONIG00000015348	sbno1	100	80.450	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.098	Lepisosteus_oculatus
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.245	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.282	Loxodonta_africana
ENSONIG00000015348	sbno1	95	80.357	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	80.357	Macaca_fascicularis
ENSONIG00000015348	sbno1	95	80.357	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	80.357	Macaca_mulatta
ENSONIG00000015348	sbno1	95	83.394	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	83.394	Mandrillus_leucophaeus
ENSONIG00000015348	sbno1	100	91.684	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	91.542	Mastacembelus_armatus
ENSONIG00000015348	sbno1	98	76.306	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	76.372	Meleagris_gallopavo
ENSONIG00000015348	sbno1	51	73.045	ENSMAUG00000004834	-	99	73.007	Mesocricetus_auratus
ENSONIG00000015348	sbno1	95	80.657	ENSMICG00000006573	-	99	74.243	Microcebus_murinus
ENSONIG00000015348	sbno1	95	82.437	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	82.437	Microtus_ochrogaster
ENSONIG00000015348	sbno1	100	83.404	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	84.043	Mola_mola
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.245	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	75.387	Monodelphis_domestica
ENSONIG00000015348	sbno1	100	91.264	ENSMALG00000001056	sbno1	100	91.619	Monopterus_albus
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.617	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	90.351	Mus_caroli
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.882	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	90.351	Mus_musculus
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.670	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	90.351	Mus_pahari
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.794	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	90.351	Mus_spretus
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.806	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	75.581	Mustela_putorius_furo
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.634	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	75.282	Myotis_lucifugus
ENSONIG00000015348	sbno1	92	84.180	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	84.180	Nannospalax_galili
ENSONIG00000015348	sbno1	100	93.728	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	93.728	Neolamprologus_brichardi
ENSONIG00000015348	sbno1	99	72.893	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.271	Nomascus_leucogenys
ENSONIG00000015348	sbno1	63	71.069	ENSMEUG00000008768	-	91	76.259	Notamacropus_eugenii
ENSONIG00000015348	sbno1	99	74.771	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.771	Ochotona_princeps
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.775	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	83.755	Octodon_degus
ENSONIG00000015348	sbno1	100	73.791	ENSOCUG00000002441	SBNO1	96	73.488	Oryctolagus_cuniculus
ENSONIG00000015348	sbno1	100	88.565	ENSORLG00000001593	sbno1	100	88.423	Oryzias_latipes
ENSONIG00000015348	sbno1	100	88.557	ENSORLG00020015216	sbno1	100	88.486	Oryzias_latipes_hni
ENSONIG00000015348	sbno1	100	88.699	ENSORLG00015002726	sbno1	100	88.628	Oryzias_latipes_hsok
ENSONIG00000015348	sbno1	99	88.968	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	88.675	Oryzias_melastigma
ENSONIG00000015348	sbno1	51	71.967	ENSOGAG00000010781	-	99	71.967	Otolemur_garnettii
ENSONIG00000015348	sbno1	100	75.594	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.509	Ovis_aries
ENSONIG00000015348	sbno1	95	83.394	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	83.394	Pan_paniscus
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.806	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.581	Panthera_pardus
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.755	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.529	Panthera_tigris_altaica
ENSONIG00000015348	sbno1	95	83.394	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	83.394	Pan_troglodytes
ENSONIG00000015348	sbno1	95	83.394	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	83.394	Papio_anubis
ENSONIG00000015348	sbno1	100	79.211	ENSPKIG00000001441	sbno1	100	79.323	Paramormyrops_kingsleyae
ENSONIG00000015348	sbno1	92	71.818	ENSPSIG00000009256	-	99	71.570	Pelodiscus_sinensis
ENSONIG00000015348	sbno1	98	75.018	ENSPSIG00000009572	-	99	74.298	Pelodiscus_sinensis
ENSONIG00000015348	sbno1	95	82.437	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.437	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.387	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	75.334	Phascolarctos_cinereus
ENSONIG00000015348	sbno1	100	90.689	ENSPFOG00000005069	sbno1	100	90.618	Poecilia_formosa
ENSONIG00000015348	sbno1	100	90.760	ENSPLAG00000015015	sbno1	100	90.689	Poecilia_latipinna
ENSONIG00000015348	sbno1	100	90.625	ENSPMEG00000021212	sbno1	100	90.554	Poecilia_mexicana
ENSONIG00000015348	sbno1	100	89.915	ENSPREG00000017746	sbno1	100	89.844	Poecilia_reticulata
ENSONIG00000015348	sbno1	99	76.023	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	75.529	Pongo_abelii
ENSONIG00000015348	sbno1	89	69.485	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	68.742	Procavia_capensis
ENSONIG00000015348	sbno1	95	83.883	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	83.883	Propithecus_coquereli
ENSONIG00000015348	sbno1	87	83.600	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	83.600	Pteropus_vampyrus
ENSONIG00000015348	sbno1	100	99.073	ENSPNYG00000004291	sbno1	100	99.073	Pundamilia_nyererei
ENSONIG00000015348	sbno1	100	81.400	ENSPNAG00000015622	sbno1	100	81.330	Pygocentrus_nattereri
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