EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSONIG00000016345 (Gene tree)
Gene ID: 100706140
Gene Symbol: ago1
Alias: -
Full Name: argonaute RISC catalytic component 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oreochromis_niloticus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16018 bases
Position: chrGL831224.1:2396805-2412822
Accession: ZDB-GENE-110606-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSONIP00000020580	PAZ	PF02170.22	5.8e-29	1	1
ENSONIP00000020580	Piwi	PF02171.17	1.2e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSONIT00000020598	-	2553	-	ENSONIP00000020580	850 (aa)	-	I3KHI5

Gene Model

Click here to download ENSONIG00000016345's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSONIG00000016345's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSONIG00000016345	ago1	99	82.360	ENSONIG00000010747	ago2	97	81.991
ENSONIG00000016345	ago1	99	84.217	ENSONIG00000016349	ago3a	99	84.217
ENSONIG00000016345	ago1	99	83.392	ENSONIG00000013760	AGO3	99	82.710
ENSONIG00000016345	ago1	99	83.294	ENSONIG00000013603	ago4	98	83.294

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSG00000092847	AGO1	100	97.059	Homo_sapiens
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.765	ENSAPOG00000024299	ago1	99	99.765	Acanthochromis_polyacanthus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSAMEG00000000504	AGO1	99	96.340	Ailuropoda_melanoleuca
ENSONIG00000016345	ago1	83	93.305	ENSACIG00000005298	ago1	98	93.305	Amphilophus_citrinellus
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.765	ENSAOCG00000017727	ago1	99	99.765	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.765	ENSAPEG00000004458	ago1	100	99.764	Amphiprion_percula
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.765	ENSATEG00000008523	ago1	99	99.765	Anabas_testudineus
ENSONIG00000016345	ago1	99	90.129	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	90.129	Anas_platyrhynchos
ENSONIG00000016345	ago1	92	96.931	ENSACAG00000029174	AGO1	100	96.931	Anolis_carolinensis
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSANAG00000037711	AGO1	99	96.340	Aotus_nancymaae
ENSONIG00000016345	ago1	100	100.000	ENSACLG00000000890	ago1	99	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSONIG00000016345	ago1	81	99.708	ENSAMXG00000001917	ago1	98	99.708	Astyanax_mexicanus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSBTAG00000012253	AGO1	99	96.340	Bos_taurus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSCJAG00000032023	AGO1	99	96.340	Callithrix_jacchus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSCAFG00000003443	AGO1	99	96.340	Canis_familiaris
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.429	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	Canis_lupus_dingo
ENSONIG00000016345	ago1	99	95.986	ENSCHIG00000011848	-	99	95.540	Capra_hircus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSTSYG00000009767	-	99	96.340	Carlito_syrichta
ENSONIG00000016345	ago1	99	76.520	ENSTSYG00000032426	-	99	78.000	Carlito_syrichta
ENSONIG00000016345	ago1	90	92.324	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.649	Cavia_aperea
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSCPOG00000011568	AGO1	99	96.340	Cavia_porcellus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSCCAG00000011823	AGO1	99	96.340	Cebus_capucinus
ENSONIG00000016345	ago1	100	96.118	ENSCATG00000031521	AGO1	100	97.059	Cercocebus_atys
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSCLAG00000011507	AGO1	99	96.340	Chinchilla_lanigera
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSCSAG00000001091	AGO1	99	96.340	Chlorocebus_sabaeus
ENSONIG00000016345	ago1	86	91.473	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	Choloepus_hoffmanni
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.222	ENSCPBG00000018594	AGO1	99	96.222	Chrysemys_picta_bellii
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSCANG00000039798	AGO1	99	96.340	Colobus_angolensis_palliatus
ENSONIG00000016345	ago1	100	96.000	ENSCGRG00001022708	Ago1	99	96.340	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSONIG00000016345	ago1	100	96.000	ENSCGRG00000010386	Ago1	99	96.340	Cricetulus_griseus_crigri
ENSONIG00000016345	ago1	99	97.683	ENSCSEG00000001051	ago1	100	97.683	Cynoglossus_semilaevis
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.647	ENSCVAG00000018173	ago1	99	99.647	Cyprinodon_variegatus
ENSONIG00000016345	ago1	100	98.824	ENSDARG00000092644	ago1	99	98.824	Danio_rerio
ENSONIG00000016345	ago1	92	97.059	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	97.059	Dasypus_novemcinctus
ENSONIG00000016345	ago1	91	97.087	ENSDORG00000008494	Ago1	99	97.087	Dipodomys_ordii
ENSONIG00000016345	ago1	83	89.675	ENSETEG00000007626	AGO1	99	89.311	Echinops_telfairi
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSEASG00005012086	AGO1	99	96.340	Equus_asinus_asinus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSECAG00000024353	AGO1	99	96.340	Equus_caballus
ENSONIG00000016345	ago1	93	88.691	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.691	Erinaceus_europaeus
ENSONIG00000016345	ago1	92	99.616	ENSELUG00000016803	ago1	100	99.616	Esox_lucius
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSFCAG00000000746	AGO1	99	96.340	Felis_catus
ENSONIG00000016345	ago1	92	90.689	ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.689	Ficedula_albicollis
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.340	ENSFDAG00000017210	AGO1	99	96.340	Fukomys_damarensis
ENSONIG00000016345	ago1	99	95.519	ENSFHEG00000017927	ago1	100	95.519	Fundulus_heteroclitus
ENSONIG00000016345	ago1	88	86.515	ENSGMOG00000019413	ago1	100	86.515	Gadus_morhua
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.560	ENSGALG00000002249	AGO1	99	96.222	Gallus_gallus
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.529	ENSGAFG00000009775	ago1	99	99.529	Gambusia_affinis
ENSONIG00000016345	ago1	88	99.201	ENSGACG00000012443	ago1	100	99.201	Gasterosteus_aculeatus
ENSONIG00000016345	ago1	92	96.931	ENSGAGG00000012893	-	100	96.931	Gopherus_agassizii
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSGGOG00000003316	AGO1	99	96.340	Gorilla_gorilla
ENSONIG00000016345	ago1	100	100.000	ENSHBUG00000010459	ago1	99	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSHGLG00000011540	AGO1	99	96.340	Heterocephalus_glaber_female
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSHGLG00100005568	AGO1	99	96.340	Heterocephalus_glaber_male
ENSONIG00000016345	ago1	99	99.764	ENSHCOG00000005708	ago1	100	99.764	Hippocampus_comes
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.176	ENSIPUG00000023216	ago1	99	99.176	Ictalurus_punctatus
ENSONIG00000016345	ago1	100	96.000	ENSSTOG00000010857	AGO1	99	96.340	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.340	ENSJJAG00000019449	Ago1	99	96.340	Jaculus_jaculus
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.647	ENSKMAG00000019464	ago1	99	99.647	Kryptolebias_marmoratus
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.647	ENSLBEG00000007694	ago1	99	99.647	Labrus_bergylta
ENSONIG00000016345	ago1	99	90.588	ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.588	Latimeria_chalumnae
ENSONIG00000016345	ago1	100	94.471	ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.471	Lepisosteus_oculatus
ENSONIG00000016345	ago1	100	96.000	ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.000	Loxodonta_africana
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSMFAG00000002846	AGO1	99	96.340	Macaca_fascicularis
ENSONIG00000016345	ago1	99	91.934	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	91.934	Macaca_mulatta
ENSONIG00000016345	ago1	99	92.916	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	97.059	Macaca_nemestrina
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSMLEG00000038388	AGO1	99	96.340	Mandrillus_leucophaeus
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.765	ENSMAMG00000008381	ago1	99	99.765	Mastacembelus_armatus
ENSONIG00000016345	ago1	100	100.000	ENSMZEG00005007996	ago1	99	100.000	Maylandia_zebra
ENSONIG00000016345	ago1	99	90.867	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.867	Meleagris_gallopavo
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSMAUG00000015189	Ago1	99	96.340	Mesocricetus_auratus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSMICG00000016147	AGO1	99	96.340	Microcebus_murinus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.560	ENSMOCG00000000537	Ago1	99	96.222	Microtus_ochrogaster
ENSONIG00000016345	ago1	79	99.552	ENSMMOG00000018459	ago1	93	99.552	Mola_mola
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.104	ENSMODG00000023335	AGO1	99	96.104	Monodelphis_domestica
ENSONIG00000016345	ago1	99	99.646	ENSMALG00000011057	ago1	100	99.646	Monopterus_albus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	97.830	Mus_caroli
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	97.830	Mus_musculus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	97.830	Mus_pahari
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	97.830	Mus_spretus
ENSONIG00000016345	ago1	84	97.632	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	97.632	Mustela_putorius_furo
ENSONIG00000016345	ago1	62	94.264	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	94.264	Myotis_lucifugus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.340	ENSNGAG00000017448	Ago1	99	96.340	Nannospalax_galili
ENSONIG00000016345	ago1	92	100.000	ENSNBRG00000010867	ago1	100	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.340	ENSNLEG00000011181	AGO1	99	96.340	Nomascus_leucogenys
ENSONIG00000016345	ago1	85	91.429	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	91.429	Notamacropus_eugenii
ENSONIG00000016345	ago1	92	98.480	ENSOPRG00000012325	AGO1	92	98.480	Ochotona_princeps
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSODEG00000005321	AGO1	99	96.340	Octodon_degus
ENSONIG00000016345	ago1	99	88.353	ENSOANG00000002080	AGO1	99	88.353	Ornithorhynchus_anatinus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.560	ENSOCUG00000023116	AGO1	99	96.222	Oryctolagus_cuniculus
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.647	ENSORLG00000014965	ago1	99	99.647	Oryzias_latipes
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.647	ENSORLG00020018253	ago1	99	99.647	Oryzias_latipes_hni
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.647	ENSORLG00015003287	ago1	99	99.647	Oryzias_latipes_hsok
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.647	ENSOMEG00000020528	ago1	99	99.647	Oryzias_melastigma
ENSONIG00000016345	ago1	100	96.118	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	96.118	Otolemur_garnettii
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSOARG00000019591	AGO1	99	96.340	Ovis_aries
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSPPAG00000034838	AGO1	99	96.340	Pan_paniscus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSPPRG00000006475	AGO1	99	96.340	Panthera_pardus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.441	ENSPTIG00000020991	AGO1	99	96.104	Panthera_tigris_altaica
ENSONIG00000016345	ago1	100	95.765	ENSPTRG00000000528	AGO1	99	96.340	Pan_troglodytes
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSPANG00000009060	AGO1	99	96.340	Papio_anubis
ENSONIG00000016345	ago1	99	95.724	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.724	Pelodiscus_sinensis
ENSONIG00000016345	ago1	81	98.401	ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.401	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSPEMG00000023313	Ago1	99	96.340	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.104	ENSPCIG00000000172	AGO1	99	96.104	Phascolarctos_cinereus
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.529	ENSPFOG00000005867	ago1	99	99.529	Poecilia_formosa
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.529	ENSPLAG00000002824	ago1	99	99.529	Poecilia_latipinna
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.529	ENSPMEG00000001787	ago1	99	99.529	Poecilia_mexicana
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.529	ENSPREG00000006534	ago1	99	99.529	Poecilia_reticulata
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSPPYG00000001551	AGO1	99	96.340	Pongo_abelii
ENSONIG00000016345	ago1	58	98.649	ENSPCAG00000005604	AGO1	65	98.649	Procavia_capensis
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSPCOG00000022061	AGO1	100	97.059	Propithecus_coquereli
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSPVAG00000005082	AGO1	99	96.340	Pteropus_vampyrus
ENSONIG00000016345	ago1	92	94.643	ENSPNYG00000012586	ago1	100	94.643	Pundamilia_nyererei
ENSONIG00000016345	ago1	94	94.612	ENSPNAG00000000597	ago1	99	94.612	Pygocentrus_nattereri
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.560	ENSRNOG00000055915	Ago1	99	96.222	Rattus_norvegicus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSRBIG00000032611	AGO1	99	96.340	Rhinopithecus_bieti
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSRROG00000044469	AGO1	99	96.340	Rhinopithecus_roxellana
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSSBOG00000020867	AGO1	99	96.340	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSONIG00000016345	ago1	100	94.842	ENSSHAG00000017468	AGO1	99	94.842	Sarcophilus_harrisii
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.059	ENSSFOG00015020982	ago1	99	99.059	Scleropages_formosus
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.412	ENSSMAG00000002841	ago1	99	99.412	Scophthalmus_maximus
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.765	ENSSDUG00000010864	ago1	99	99.765	Seriola_dumerili
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.765	ENSSLDG00000000386	ago1	99	99.765	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSONIG00000016345	ago1	73	100.000	ENSSARG00000011520	AGO1	73	100.000	Sorex_araneus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.104	ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.104	Sphenodon_punctatus
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.765	ENSSPAG00000019154	ago1	99	99.765	Stegastes_partitus
ENSONIG00000016345	ago1	100	98.834	ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.111	Takifugu_rubripes
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.530	ENSTNIG00000012102	ago1	99	99.530	Tetraodon_nigroviridis
ENSONIG00000016345	ago1	85	96.533	ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.533	Tupaia_belangeri
ENSONIG00000016345	ago1	99	95.131	ENSTTRG00000015088	AGO1	98	95.131	Tursiops_truncatus
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSUAMG00000027154	AGO1	99	96.340	Ursus_americanus
ENSONIG00000016345	ago1	100	92.479	ENSUMAG00000002480	AGO1	99	92.680	Ursus_maritimus
ENSONIG00000016345	ago1	95	89.583	ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.583	Vicugna_pacos
ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	ENSVVUG00000000405	AGO1	99	98.544	Vulpes_vulpes
ENSONIG00000016345	ago1	99	95.986	ENSXETG00000004364	ago1	99	95.986	Xenopus_tropicalis
ENSONIG00000016345	ago1	92	98.849	ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.849	Xiphophorus_couchianus
ENSONIG00000016345	ago1	100	99.529	ENSXMAG00000021899	ago1	99	99.529	Xiphophorus_maculatus