EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSONIG00000019140 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpp30
Alias: -
Full Name: ribonuclease P/MRP 30 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Oreochromis_niloticus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4922 bases
Position: chrGL831209.1:2546735-2551656
Accession: ZDB-GENE-050320-45
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSONIP00000024090	RNase_P_p30	PF01876.16	6.6e-62	1	1
ENSONIP00000024091	RNase_P_p30	PF01876.16	5.9e-61	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSONIT00000024112	-	621	-	ENSONIP00000024091	207 (aa)	-	I3KSJ5
ENSONIT00000024111	-	697	-	ENSONIP00000024090	220 (aa)	-	I3KSJ4

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.005	ENSG00000148688	RPP30	90	51.092	Homo_sapiens
ENSONIG00000019140	rpp30	100	80.676	ENSAPOG00000023156	rpp30	71	82.843	Acanthochromis_polyacanthus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	59.420	ENSAMEG00000016776	RPP30	77	59.420	Ailuropoda_melanoleuca
ENSONIG00000019140	rpp30	100	85.990	ENSACIG00000022810	rpp30	73	88.235	Amphilophus_citrinellus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	81.159	ENSAOCG00000016438	rpp30	69	83.333	Amphiprion_ocellaris
ENSONIG00000019140	rpp30	100	81.159	ENSAPEG00000008697	rpp30	71	83.333	Amphiprion_percula
ENSONIG00000019140	rpp30	100	80.676	ENSATEG00000015263	rpp30	74	82.843	Anabas_testudineus
ENSONIG00000019140	rpp30	87	55.000	ENSAPLG00000009959	RPP30	75	55.000	Anas_platyrhynchos
ENSONIG00000019140	rpp30	100	53.623	ENSACAG00000007996	RPP30	77	53.623	Anolis_carolinensis
ENSONIG00000019140	rpp30	100	45.894	ENSANAG00000009439	RPP30	63	45.894	Aotus_nancymaae
ENSONIG00000019140	rpp30	100	95.652	ENSACLG00000015389	-	76	98.039	Astatotilapia_calliptera
ENSONIG00000019140	rpp30	100	61.353	ENSAMXG00000040653	rpp30	75	63.235	Astyanax_mexicanus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.971	ENSBTAG00000002973	RPP30	77	57.971	Bos_taurus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.971	ENSCJAG00000011045	RPP30	77	57.971	Callithrix_jacchus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	58.937	ENSCAFG00000031801	RPP30	77	58.937	Canis_familiaris
ENSONIG00000019140	rpp30	100	58.937	ENSCAFG00020000258	RPP30	77	58.937	Canis_lupus_dingo
ENSONIG00000019140	rpp30	100	54.589	ENSCHIG00000012901	RPP30	76	54.589	Capra_hircus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	56.522	ENSTSYG00000013903	RPP30	77	56.522	Carlito_syrichta
ENSONIG00000019140	rpp30	64	47.826	ENSCAPG00000001326	RPP30	73	47.826	Cavia_aperea
ENSONIG00000019140	rpp30	100	56.039	ENSCPOG00000033174	RPP30	77	56.039	Cavia_porcellus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.971	ENSCCAG00000029514	RPP30	77	57.971	Cebus_capucinus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	58.454	ENSCATG00000042072	RPP30	77	58.454	Cercocebus_atys
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.005	ENSCLAG00000008595	RPP30	77	57.005	Chinchilla_lanigera
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.971	ENSCSAG00000006694	RPP30	77	57.971	Chlorocebus_sabaeus
ENSONIG00000019140	rpp30	70	36.310	ENSCHOG00000007023	-	65	36.310	Choloepus_hoffmanni
ENSONIG00000019140	rpp30	99	57.767	ENSCPBG00000026518	RPP30	76	57.767	Chrysemys_picta_bellii
ENSONIG00000019140	rpp30	52	54.206	ENSCING00000019714	-	77	36.842	Ciona_intestinalis
ENSONIG00000019140	rpp30	98	40.566	ENSCSAVG00000011282	-	70	41.232	Ciona_savignyi
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.971	ENSCANG00000041084	RPP30	77	57.971	Colobus_angolensis_palliatus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	49.275	ENSCGRG00001000834	-	76	49.275	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSONIG00000019140	rpp30	100	56.039	ENSCGRG00001017068	-	87	56.039	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSONIG00000019140	rpp30	100	49.758	ENSCGRG00000006196	-	76	49.758	Cricetulus_griseus_crigri
ENSONIG00000019140	rpp30	100	56.039	ENSCGRG00000002508	-	77	56.039	Cricetulus_griseus_crigri
ENSONIG00000019140	rpp30	100	70.531	ENSCSEG00000001779	rpp30	70	72.059	Cynoglossus_semilaevis
ENSONIG00000019140	rpp30	100	77.295	ENSCVAG00000003139	rpp30	76	79.412	Cyprinodon_variegatus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	63.285	ENSDARG00000027428	rpp30	76	65.196	Danio_rerio
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.488	ENSDNOG00000010186	RPP30	71	57.488	Dasypus_novemcinctus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.971	ENSDORG00000015333	Rpp30	77	57.971	Dipodomys_ordii
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.488	ENSETEG00000018823	RPP30	77	57.488	Echinops_telfairi
ENSONIG00000019140	rpp30	64	39.259	ENSEBUG00000003989	-	75	39.259	Eptatretus_burgeri
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.971	ENSEASG00005011050	RPP30	77	57.971	Equus_asinus_asinus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.971	ENSECAG00000021917	RPP30	77	57.971	Equus_caballus
ENSONIG00000019140	rpp30	87	41.667	ENSEEUG00000009986	-	68	41.667	Erinaceus_europaeus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	61.353	ENSELUG00000003731	rpp30	72	63.725	Esox_lucius
ENSONIG00000019140	rpp30	100	59.420	ENSFCAG00000029073	RPP30	71	59.420	Felis_catus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	56.522	ENSFALG00000007711	RPP30	77	56.522	Ficedula_albicollis
ENSONIG00000019140	rpp30	100	56.522	ENSFDAG00000019241	RPP30	77	56.522	Fukomys_damarensis
ENSONIG00000019140	rpp30	100	76.329	ENSFHEG00000014739	rpp30	72	78.889	Fundulus_heteroclitus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	61.353	ENSGMOG00000005379	rpp30	82	63.285	Gadus_morhua
ENSONIG00000019140	rpp30	100	55.072	ENSGALG00000006486	RPP30	50	69.355	Gallus_gallus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	74.879	ENSGAFG00000001445	rpp30	76	76.961	Gambusia_affinis
ENSONIG00000019140	rpp30	100	78.744	ENSGACG00000010285	rpp30	82	77.391	Gasterosteus_aculeatus
ENSONIG00000019140	rpp30	99	57.767	ENSGAGG00000000980	RPP30	53	57.767	Gopherus_agassizii
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.488	ENSGGOG00000026917	RPP30	77	57.488	Gorilla_gorilla
ENSONIG00000019140	rpp30	100	95.169	ENSHBUG00000019332	rpp30	76	97.549	Haplochromis_burtoni
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.005	ENSHGLG00000013072	RPP30	77	57.005	Heterocephalus_glaber_female
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.005	ENSHGLG00100017798	RPP30	77	57.005	Heterocephalus_glaber_male
ENSONIG00000019140	rpp30	100	66.667	ENSHCOG00000004763	-	72	68.627	Hippocampus_comes
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ENSONIG00000019140	rpp30	100	56.522	ENSSTOG00000027002	RPP30	77	56.522	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSONIG00000019140	rpp30	100	80.193	ENSKMAG00000015355	rpp30	76	82.353	Kryptolebias_marmoratus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	64.251	ENSLBEG00000019989	rpp30	75	65.196	Labrus_bergylta
ENSONIG00000019140	rpp30	93	47.273	ENSLACG00000002534	RPP30	96	47.273	Latimeria_chalumnae
ENSONIG00000019140	rpp30	100	60.870	ENSLOCG00000000031	rpp30	76	63.235	Lepisosteus_oculatus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.005	ENSLAFG00000015931	RPP30	77	57.005	Loxodonta_africana
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.971	ENSMFAG00000031109	RPP30	77	57.971	Macaca_fascicularis
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.971	ENSMMUG00000006628	RPP30	77	57.971	Macaca_mulatta
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ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.971	ENSMLEG00000037578	RPP30	77	57.971	Mandrillus_leucophaeus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	79.227	ENSMAMG00000010934	rpp30	76	81.373	Mastacembelus_armatus
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ENSONIG00000019140	rpp30	100	48.792	ENSMGAG00000008452	RPP30	77	49.275	Meleagris_gallopavo
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.005	ENSMAUG00000008797	Rpp30	77	57.005	Mesocricetus_auratus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.971	ENSMICG00000012019	RPP30	77	57.971	Microcebus_murinus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	56.522	ENSMOCG00000016872	Rpp30	77	56.522	Microtus_ochrogaster
ENSONIG00000019140	rpp30	100	75.845	ENSMMOG00000009266	rpp30	75	77.941	Mola_mola
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ENSONIG00000019140	rpp30	100	45.411	ENSMODG00000009342	-	74	45.411	Monodelphis_domestica
ENSONIG00000019140	rpp30	100	79.227	ENSMALG00000011718	rpp30	76	80.882	Monopterus_albus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	54.106	MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	77	54.106	Mus_caroli
ENSONIG00000019140	rpp30	100	54.589	ENSMUSG00000024800	Rpp30	77	54.589	Mus_musculus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	54.589	MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	77	54.589	Mus_pahari
ENSONIG00000019140	rpp30	100	54.589	MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	77	54.589	Mus_spretus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	59.420	ENSMPUG00000017258	RPP30	72	59.420	Mustela_putorius_furo
ENSONIG00000019140	rpp30	100	58.454	ENSMLUG00000017169	RPP30	77	58.454	Myotis_lucifugus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	56.522	ENSNGAG00000012018	-	77	56.522	Nannospalax_galili
ENSONIG00000019140	rpp30	74	54.902	ENSNGAG00000014392	-	65	54.902	Nannospalax_galili
ENSONIG00000019140	rpp30	89	85.326	ENSNBRG00000024170	-	69	87.845	Neolamprologus_brichardi
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.488	ENSNLEG00000012383	RPP30	77	57.488	Nomascus_leucogenys
ENSONIG00000019140	rpp30	100	49.765	ENSMEUG00000015587	-	79	49.765	Notamacropus_eugenii
ENSONIG00000019140	rpp30	56	60.000	ENSOPRG00000007367	-	82	59.483	Ochotona_princeps
ENSONIG00000019140	rpp30	100	56.522	ENSODEG00000004530	-	78	56.522	Octodon_degus
ENSONIG00000019140	rpp30	99	39.806	ENSODEG00000004560	-	75	41.176	Octodon_degus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.488	ENSOANG00000003415	RPP30	77	57.488	Ornithorhynchus_anatinus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	55.556	ENSOCUG00000006896	RPP30	71	55.556	Oryctolagus_cuniculus
ENSONIG00000019140	rpp30	100	79.710	ENSORLG00000020420	rpp30	70	81.863	Oryzias_latipes
ENSONIG00000019140	rpp30	100	81.643	ENSORLG00020009037	-	76	83.824	Oryzias_latipes_hni
ENSONIG00000019140	rpp30	100	81.643	ENSORLG00015008300	rpp30	71	83.824	Oryzias_latipes_hsok
ENSONIG00000019140	rpp30	89	80.435	ENSOMEG00000012640	-	98	82.873	Oryzias_melastigma
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