EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOPRG00000003972 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Ochotona_princeps
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10085 bases
Position: chrGeneScaffold_5134:301708-311792
Accession: 10898
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOPRP00000003704	rRNA_proc-arch	PF13234.6	2.8e-41	1	1
ENSOPRP00000003704	DEAD	PF00270.29	5.7e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOPRT00000004022	SKIV2L-201	3741	-	ENSOPRP00000003704	1246 (aa)	-	UPI0001778412

Gene Model

Click here to download ENSOPRG00000003972's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOPRG00000003972's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	68	43.160	ENSOPRG00000008009	MTREX	79	43.160

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.061	ENSG00000204351	SKIV2L	100	94.061	Homo_sapiens
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	61.252	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	61.285	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.660	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	93.660	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	59.776	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.566	Amphilophus_citrinellus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	61.045	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	60.884	Amphiprion_ocellaris
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.887	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	60.723	Amphiprion_percula
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.939	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	60.835	Anabas_testudineus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	65.098	ENSACAG00000011746	SKIV2L	98	65.311	Anolis_carolinensis
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.543	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	94.543	Aotus_nancymaae
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	61.028	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	60.897	Astatotilapia_calliptera
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	98	59.203	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.185	Astyanax_mexicanus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.660	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	93.660	Bos_taurus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	96	38.984	WBGene00008502	skih-2	99	38.906	Caenorhabditis_elegans
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.981	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	93.981	Callithrix_jacchus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.339	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	93.339	Canis_familiaris
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.258	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	93.258	Canis_lupus_dingo
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.981	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	93.981	Capra_hircus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.660	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	93.660	Carlito_syrichta
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	92.135	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	92.135	Cavia_porcellus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.222	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	94.222	Cebus_capucinus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.740	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	93.740	Cercocebus_atys
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	92.777	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.777	Chinchilla_lanigera
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.660	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	93.660	Chlorocebus_sabaeus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	87	64.327	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	96	64.327	Chrysemys_picta_bellii
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	94	51.107	ENSCING00000005576	-	99	50.977	Ciona_intestinalis
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	94.137	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	94.137	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.344	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	93.344	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	61.275	ENSCSEG00000011326	skiv2l	98	60.789	Cynoglossus_semilaevis
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.987	ENSCVAG00000003072	skiv2l	97	65.346	Cyprinodon_variegatus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.079	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	60.096	Danio_rerio
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	94	94.231	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	88.381	Dasypus_novemcinctus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	93	44.081	FBgn0039117	tst	97	44.165	Drosophila_melanogaster
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	72	93.573	ENSETEG00000009522	SKIV2L	72	93.573	Echinops_telfairi
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	89	56.435	ENSEBUG00000013680	-	95	57.007	Eptatretus_burgeri
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	93	94.746	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	94.746	Equus_asinus_asinus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	96	93.782	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	93.782	Equus_caballus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	54	98.419	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	98.419	Erinaceus_europaeus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	59.921	ENSELUG00000000181	skiv2l	94	66.081	Esox_lucius
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.543	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	94.543	Felis_catus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	89.415	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	89.655	Fukomys_damarensis
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.728	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	60.946	Fundulus_heteroclitus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	59.247	ENSGMOG00000005926	skiv2l	98	59.350	Gadus_morhua
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	78	61.350	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.753	Gallus_gallus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	61.124	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.107	Gambusia_affinis
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.159	ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.435	Gasterosteus_aculeatus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.981	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	93.981	Gorilla_gorilla
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.949	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	60.817	Haplochromis_burtoni
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	90.705	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	90.865	Heterocephalus_glaber_female
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	88.301	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	88.462	Heterocephalus_glaber_male
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	98	59.479	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	59.317	Hippocampus_comes
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	59.242	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	59.663	Ictalurus_punctatus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.222	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.222	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	71	58.753	ENSLACG00000002986	-	73	58.438	Latimeria_chalumnae
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.178	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.178	Loxodonta_africana
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.061	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	94.061	Macaca_fascicularis
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.061	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	94.061	Macaca_mulatta
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.981	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	93.981	Macaca_nemestrina
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.740	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	93.740	Mandrillus_leucophaeus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	61.094	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.285	Mastacembelus_armatus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.870	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	60.737	Maylandia_zebra
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	70	51.363	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	50.734	Meleagris_gallopavo
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	92.622	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.702	Mesocricetus_auratus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.900	ENSMICG00000046331	SKIV2L	100	93.900	Microcebus_murinus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	91.580	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.580	Microtus_ochrogaster
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.915	ENSMMOG00000014547	skiv2l	98	60.845	Mola_mola
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	87.510	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.510	Monodelphis_domestica
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	59.903	ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.967	Monopterus_albus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	92.943	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	92.943	Mus_caroli
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.023	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	93.023	Mus_musculus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	92.622	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	92.622	Mus_pahari
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	92.943	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	92.943	Mus_spretus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.061	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	94.061	Mustela_putorius_furo
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	92.376	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	92.376	Myotis_lucifugus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.271	ENSNBRG00000018650	skiv2l	98	60.484	Neolamprologus_brichardi
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	98	91.198	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	91.280	Nomascus_leucogenys
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	78	92.035	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	92.035	Notamacropus_eugenii
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	91.493	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	91.493	Octodon_degus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	61.643	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.843	Oreochromis_niloticus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	95.746	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	95.746	Oryctolagus_cuniculus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.787	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	61.058	Oryzias_latipes
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.757	ENSORLG00020009462	skiv2l	96	64.168	Oryzias_latipes_hni
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.695	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	60.737	Oryzias_latipes_hsok
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	61.557	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	61.446	Oryzias_melastigma
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.302	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	94.302	Otolemur_garnettii
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	88.567	ENSOARG00000002411	-	100	88.567	Ovis_aries
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	98	93.193	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	99	93.193	Pan_paniscus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.462	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	94.462	Panthera_pardus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.222	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.222	Panthera_tigris_altaica
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.141	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	94.141	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	98	92.620	ENSPANG00000011501	SKIV2L	99	92.620	Papio_anubis
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	59.828	ENSPKIG00000011876	skiv2l	94	66.392	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.402	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	60.308	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.103	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	92.462	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	87.360	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	87.360	Phascolarctos_cinereus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.697	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	60.562	Poecilia_formosa
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.825	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	60.772	Poecilia_latipinna
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.856	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	60.643	Poecilia_mexicana
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	59.631	ENSPREG00000002277	skiv2l	96	66.287	Poecilia_reticulata
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.499	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	93.499	Pongo_abelii
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	77	93.445	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	93.445	Procavia_capensis
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	95.104	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	95.104	Propithecus_coquereli
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	92.376	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	92.376	Pteropus_vampyrus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	59.116	ENSPNYG00000017853	skiv2l	97	66.219	Pundamilia_nyererei
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	98	60.671	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	60.803	Pygocentrus_nattereri
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.344	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	93.344	Rattus_norvegicus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	98	91.336	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	91.336	Rhinopithecus_bieti
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.820	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	93.820	Rhinopithecus_roxellana
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	92	38.023	YLR398C	-	92	37.780	Saccharomyces_cerevisiae
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.302	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.302	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	87.030	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.989	Sarcophilus_harrisii
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.726	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	60.797	Scleropages_formosus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.814	ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.835	Scophthalmus_maximus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	61.094	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	60.964	Seriola_dumerili
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	59.920	ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.593	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	61.021	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	98	60.989	Sphenodon_punctatus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	94	60.786	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.729	Stegastes_partitus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.543	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.543	Sus_scrofa
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	85	55.288	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.659	Takifugu_rubripes
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	59.283	ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.435	Tetraodon_nigroviridis
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	94	93.497	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.497	Tupaia_belangeri
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	88.844	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	88.844	Tursiops_truncatus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.222	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	94.222	Ursus_americanus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	93	94.488	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	94.488	Ursus_maritimus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	98	93.725	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	98	93.725	Vulpes_vulpes
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	58.016	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	57.957	Xenopus_tropicalis
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.866	ENSXCOG00000019517	skiv2l	96	60.972	Xiphophorus_couchianus
ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.570	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	60.514	Xiphophorus_maculatus