EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSOPRG00000006595 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: RAB1A
Alias: RAB1|YPT1
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Ochotona_princeps
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 101157 bases
Position: chrGeneScaffold_4418:443004-544160
Accession: 9758
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOPRP00000006039	MMR_HSR1	PF01926.23	7.3e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOPRT00000006593	RAB1A-201	594	-	ENSOPRP00000006039	197 (aa)	-	UPI000002183D

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOPRG00000006595	RAB1A	80	45.860	ENSOPRG00000008255	RAB5C	88	45.860
ENSOPRG00000006595	RAB1A	99	46.970	ENSOPRG00000016163	RAB2B	92	46.970
ENSOPRG00000006595	RAB1A	83	37.423	ENSOPRG00000007436	-	95	37.423
ENSOPRG00000006595	RAB1A	83	37.805	ENSOPRG00000012068	KRAS	86	37.805
ENSOPRG00000006595	RAB1A	59	32.203	ENSOPRG00000003294	ARL8B	61	32.203
ENSOPRG00000006595	RAB1A	82	42.236	ENSOPRG00000010355	RAB6A	85	42.236
ENSOPRG00000006595	RAB1A	80	39.752	ENSOPRG00000012602	RAB34	62	39.752
ENSOPRG00000006595	RAB1A	59	32.500	ENSOPRG00000014853	ARL4D	59	32.500
ENSOPRG00000006595	RAB1A	60	32.308	ENSOPRG00000003002	-	64	32.308
ENSOPRG00000006595	RAB1A	78	53.247	ENSOPRG00000004681	RAB11A	73	53.247
ENSOPRG00000006595	RAB1A	79	39.623	ENSOPRG00000015421	RAB9B	79	39.623
ENSOPRG00000006595	RAB1A	98	43.367	ENSOPRG00000007883	RAB5B	90	43.367
ENSOPRG00000006595	RAB1A	50	33.333	ENSOPRG00000019180	-	51	33.333
ENSOPRG00000006595	RAB1A	98	44.560	ENSOPRG00000016426	RAB14	89	44.560
ENSOPRG00000006595	RAB1A	79	39.623	ENSOPRG00000015018	RAB9A	79	39.623
ENSOPRG00000006595	RAB1A	51	70.297	ENSOPRG00000014416	-	93	70.297
ENSOPRG00000006595	RAB1A	83	47.561	ENSOPRG00000002894	RAB25	77	47.561
ENSOPRG00000006595	RAB1A	68	42.963	ENSOPRG00000004472	RAB33A	69	42.963
ENSOPRG00000006595	RAB1A	98	36.410	ENSOPRG00000001164	RAB6B	94	36.410
ENSOPRG00000006595	RAB1A	80	49.045	ENSOPRG00000011278	RAB5A	89	49.045
ENSOPRG00000006595	RAB1A	50	35.849	ENSOPRG00000006034	-	89	35.849
ENSOPRG00000006595	RAB1A	85	32.544	ENSOPRG00000005358	RHEB	91	32.544
ENSOPRG00000006595	RAB1A	68	42.222	ENSOPRG00000001073	RAB33B	73	45.455
ENSOPRG00000006595	RAB1A	91	33.514	ENSOPRG00000015124	RERG	90	33.514
ENSOPRG00000006595	RAB1A	58	55.263	ENSOPRG00000007511	RAB30	95	55.263
ENSOPRG00000006595	RAB1A	81	38.650	ENSOPRG00000016787	RAB36	51	38.650
ENSOPRG00000006595	RAB1A	83	38.415	ENSOPRG00000019175	NRAS	86	38.415

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSG00000138069	RAB1A	96	100.000	Homo_sapiens
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	95.431	ENSAPOG00000008143	-	98	95.431	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSAMEG00000001127	RAB1A	97	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	95.431	ENSAOCG00000020606	-	99	95.431	Amphiprion_ocellaris
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	95.431	ENSAPEG00000022488	-	98	95.431	Amphiprion_percula
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSANAG00000020929	RAB1A	96	100.000	Aotus_nancymaae
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	95.939	ENSACLG00000003326	-	98	95.939	Astatotilapia_calliptera
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	94.416	ENSAMXG00000034850	-	98	94.416	Astyanax_mexicanus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	100.000	Bos_taurus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	Callithrix_jacchus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00000003187	RAB1A	96	100.000	Canis_familiaris
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00020026971	RAB1A	96	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSCHIG00000014060	RAB1A	96	100.000	Capra_hircus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSCPOG00000015437	RAB1A	96	100.000	Cavia_porcellus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSCCAG00000021869	RAB1A	97	100.000	Cebus_capucinus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSCATG00000030853	RAB1A	97	100.000	Cercocebus_atys
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSCLAG00000014766	RAB1A	96	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	99.492	ENSCPBG00000013243	RAB1A	96	99.492	Chrysemys_picta_bellii
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	97.462	ENSCANG00000035916	RAB1A	99	97.462	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00001012691	-	97	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00000008456	-	97	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSDNOG00000018236	RAB1A	96	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSDORG00000028628	-	96	100.000	Dipodomys_ordii
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	84.343	FBgn0285937	Rab1	96	84.343	Drosophila_melanogaster
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSETEG00000002205	RAB1A	98	100.000	Echinops_telfairi
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSEASG00005007298	RAB1A	96	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSECAG00000009926	RAB1A	96	100.000	Equus_caballus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSEEUG00000011721	RAB1A	98	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	95.477	ENSELUG00000012166	RAB1A	93	95.477	Esox_lucius
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSFCAG00000002536	RAB1A	96	100.000	Felis_catus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	99.492	ENSFALG00000013624	RAB1A	96	99.492	Ficedula_albicollis
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSFDAG00000019505	-	96	100.000	Fukomys_damarensis
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	94.416	ENSFHEG00000014414	-	98	94.416	Fundulus_heteroclitus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	99.492	ENSGALG00000031582	RAB1A	96	99.492	Gallus_gallus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	94.416	ENSGAFG00000000918	-	98	94.416	Gambusia_affinis
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	99.492	ENSGAGG00000006802	RAB1A	96	99.492	Gopherus_agassizii
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSGGOG00000026603	RAB1A	99	100.000	Gorilla_gorilla
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00000013585	RAB1A	97	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00100007994	RAB1A	97	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSSTOG00000020693	-	98	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	94.924	ENSLBEG00000028426	RAB1A	98	94.924	Labrus_bergylta
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	98.985	ENSLACG00000012869	RAB1A	96	98.985	Latimeria_chalumnae
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSLAFG00000016666	RAB1A	96	100.000	Loxodonta_africana
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSMFAG00000046246	RAB1A	96	100.000	Macaca_fascicularis
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSMMUG00000021721	RAB1A	91	100.000	Macaca_mulatta
ENSOPRG00000006595	RAB1A	94	99.462	ENSMNEG00000028414	-	93	99.462	Macaca_nemestrina
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSMLEG00000042535	RAB1A	97	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	95.939	ENSMZEG00005013959	-	98	95.939	Maylandia_zebra
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	99.492	ENSMGAG00000004611	RAB1A	98	99.492	Meleagris_gallopavo
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	99.492	ENSMAUG00000012156	Rab1a	97	99.492	Mesocricetus_auratus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSMICG00000012587	RAB1A	96	100.000	Microcebus_murinus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	99.492	ENSMOCG00000017022	Rab1a	98	99.492	Microtus_ochrogaster
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	93.401	ENSMMOG00000018709	RAB1A	97	93.401	Mola_mola
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	99.492	ENSMODG00000003340	RAB1A	96	99.492	Monodelphis_domestica
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	96	100.000	Mus_caroli
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSMUSG00000020149	Rab1a	98	100.000	Mus_musculus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	96	100.000	Mus_pahari
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	98	100.000	Mus_spretus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSMPUG00000006139	RAB1A	78	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSMLUG00000009489	RAB1A	96	100.000	Myotis_lucifugus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSNGAG00000005838	Rab1a	96	100.000	Nannospalax_galili
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	95.939	ENSNBRG00000020492	-	98	95.939	Neolamprologus_brichardi
ENSOPRG00000006595	RAB1A	97	100.000	ENSODEG00000011248	-	96	100.000	Octodon_degus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	93.909	ENSONIG00000006819	-	97	93.909	Oreochromis_niloticus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	99.492	ENSOANG00000012438	RAB1A	96	99.492	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSOCUG00000017003	RAB1A	96	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSOGAG00000026181	RAB1A	96	100.000	Otolemur_garnettii
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSOARG00000019997	RAB1A	97	100.000	Ovis_aries
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSPPAG00000030253	RAB1A	98	100.000	Pan_paniscus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSPPRG00000025077	RAB1A	96	100.000	Panthera_pardus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSPTRG00000011989	RAB1A	98	100.000	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSPANG00000010485	RAB1A	97	100.000	Papio_anubis
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	99.492	ENSPSIG00000008028	RAB1A	96	99.492	Pelodiscus_sinensis
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	95.939	ENSPMGG00000021015	-	96	95.939	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSPEMG00000009340	Rab1a	97	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	99.492	ENSPCIG00000023212	RAB1A	96	99.492	Phascolarctos_cinereus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	93.909	ENSPFOG00000000498	-	95	93.909	Poecilia_formosa
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	93.909	ENSPLAG00000015592	-	98	93.909	Poecilia_latipinna
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	93.909	ENSPMEG00000005288	-	98	93.909	Poecilia_mexicana
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSPPYG00000012360	RAB1A	96	100.000	Pongo_abelii
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSPCOG00000017244	RAB1A	96	100.000	Propithecus_coquereli
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	95.939	ENSPNYG00000015841	-	98	95.939	Pundamilia_nyererei
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSRNOG00000004992	Rab1a	96	100.000	Rattus_norvegicus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSSBOG00000023732	RAB1A	96	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	99.492	ENSSHAG00000003597	RAB1A	96	99.492	Sarcophilus_harrisii
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	95.431	ENSSMAG00000021049	-	98	95.431	Scophthalmus_maximus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	95.939	ENSSDUG00000022535	RAB1A	98	95.939	Seriola_dumerili
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	99.492	ENSSPUG00000012822	RAB1A	96	99.492	Sphenodon_punctatus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	95.431	ENSSPAG00000012564	-	98	95.431	Stegastes_partitus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSSSCG00000008359	RAB1A	100	100.000	Sus_scrofa
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	99.492	ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	99.492	Taeniopygia_guttata
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	94.924	ENSTRUG00000024994	RAB1A	98	94.924	Takifugu_rubripes
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSUMAG00000021038	RAB1A	99	100.000	Ursus_maritimus
ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	ENSVPAG00000005640	RAB1A	98	100.000	Vicugna_pacos
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ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	94.416	ENSXMAG00000015776	-	98	94.416	Xiphophorus_maculatus