EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOPRG00000008269 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POLR1A
Alias: DKFZP586M0122|FLJ21915|RPA1|RPO1-4
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Ochotona_princeps
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 66512 bases
Position: chrGeneScaffold_333:134466-200977
Accession: 17264
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOPRP00000007613	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	5.5e-79	1	1
ENSOPRP00000007613	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	2.4e-25	1	1
ENSOPRP00000007613	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	8.7e-68	1	1
ENSOPRP00000007613	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	1.6e-36	1	1
ENSOPRP00000007613	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	1.8e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOPRT00000008318	POLR1A-201	5022	-	ENSOPRP00000007613	1674 (aa)	-	UPI00017A25AA

Gene Model

Click here to download ENSOPRG00000008269's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOPRG00000008269's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOPRG00000008269	POLR1A	64	33.708	ENSOPRG00000015116	-	66	33.708

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.540	ENSG00000068654	POLR1A	99	82.598	Homo_sapiens
ENSOPRG00000008269	POLR1A	70	61.752	ENSAPOG00000017945	polr1a	98	63.916	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	83.294	ENSAMEG00000005807	POLR1A	99	85.361	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOPRG00000008269	POLR1A	89	71.277	ENSACIG00000022147	polr1a	92	71.277	Amphilophus_citrinellus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	61.452	ENSAOCG00000017336	polr1a	93	72.340	Amphiprion_ocellaris
ENSOPRG00000008269	POLR1A	91	72.340	ENSAPEG00000016105	polr1a	93	72.340	Amphiprion_percula
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	60.317	ENSATEG00000016773	polr1a	99	60.859	Anabas_testudineus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	85	69.634	ENSAPLG00000013871	POLR1A	98	69.448	Anas_platyrhynchos
ENSOPRG00000008269	POLR1A	99	63.920	ENSACAG00000012141	POLR1A	99	63.429	Anolis_carolinensis
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	81.909	ENSANAG00000033927	POLR1A	99	81.732	Aotus_nancymaae
ENSOPRG00000008269	POLR1A	95	72.340	ENSACLG00000020541	polr1a	99	57.295	Astatotilapia_calliptera
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.370	ENSBTAG00000006481	POLR1A	99	82.488	Bos_taurus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	94	43.023	WBGene00012999	rpoa-1	91	43.023	Caenorhabditis_elegans
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	81.658	ENSCJAG00000019547	POLR1A	99	81.775	Callithrix_jacchus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.803	ENSCAFG00000007613	POLR1A	99	83.392	Canis_familiaris
ENSOPRG00000008269	POLR1A	97	95.556	ENSCAFG00020014752	POLR1A	95	95.745	Canis_lupus_dingo
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	81.475	ENSCHIG00000018204	POLR1A	99	81.812	Capra_hircus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	80.613	ENSTSYG00000002761	POLR1A	99	80.436	Carlito_syrichta
ENSOPRG00000008269	POLR1A	97	77.400	ENSCAPG00000010132	POLR1A	99	77.358	Cavia_aperea
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.141	ENSCPOG00000012350	POLR1A	99	82.318	Cavia_porcellus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	81.952	ENSCCAG00000019839	POLR1A	99	82.038	Cebus_capucinus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.805	ENSCATG00000029786	POLR1A	99	82.923	Cercocebus_atys
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.560	ENSCLAG00000005187	POLR1A	99	82.325	Chinchilla_lanigera
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	83.039	ENSCSAG00000016251	POLR1A	99	83.098	Chlorocebus_sabaeus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	99	69.586	ENSCPBG00000001115	POLR1A	99	69.098	Chrysemys_picta_bellii
ENSOPRG00000008269	POLR1A	95	48.837	ENSCSAVG00000007184	-	94	48.837	Ciona_savignyi
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	79.929	ENSCANG00000031785	POLR1A	99	79.988	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	76.502	ENSCGRG00001006651	Polr1a	99	76.928	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOPRG00000008269	POLR1A	59	80.299	ENSCGRG00000010834	Polr1a	98	81.014	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	57.540	ENSCSEG00000020190	polr1a	99	57.599	Cynoglossus_semilaevis
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	58.926	ENSCVAG00000020941	polr1a	99	59.353	Cyprinodon_variegatus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	99	62.448	ENSDARG00000098375	polr1a	99	62.279	Danio_rerio
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	76.218	ENSDNOG00000010829	POLR1A	99	76.218	Dasypus_novemcinctus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.080	ENSDORG00000008298	Polr1a	99	82.139	Dipodomys_ordii
ENSOPRG00000008269	POLR1A	75	44.093	FBgn0019938	RpI1	91	42.743	Drosophila_melanogaster
ENSOPRG00000008269	POLR1A	67	79.516	ENSETEG00000000412	-	66	79.516	Echinops_telfairi
ENSOPRG00000008269	POLR1A	81	62.963	ENSEBUG00000005667	-	98	45.514	Eptatretus_burgeri
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	83.167	ENSEASG00005001625	POLR1A	99	83.284	Equus_asinus_asinus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	83.225	ENSECAG00000010092	POLR1A	99	85.447	Equus_caballus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	83.225	ENSECAG00000030510	-	99	85.447	Equus_caballus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	83.225	ENSECAG00000036306	-	99	85.447	Equus_caballus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	85	93.617	ENSEEUG00000000676	POLR1A	84	93.617	Erinaceus_europaeus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	62.744	ENSELUG00000012769	polr1a	97	62.906	Esox_lucius
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.637	ENSFCAG00000008966	POLR1A	99	82.901	Felis_catus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	99	66.587	ENSFALG00000010082	POLR1A	99	66.507	Ficedula_albicollis
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	83.058	ENSFDAG00000013726	POLR1A	99	83.058	Fukomys_damarensis
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	56.714	ENSFHEG00000005996	polr1a	99	56.774	Fundulus_heteroclitus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	95	62.766	ENSGMOG00000002230	polr1a	95	62.766	Gadus_morhua
ENSOPRG00000008269	POLR1A	91	64.779	ENSGALG00000038160	-	99	65.020	Gallus_gallus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	95	68.085	ENSGAFG00000015266	polr1a	95	68.085	Gambusia_affinis
ENSOPRG00000008269	POLR1A	95	72.527	ENSGACG00000018791	polr1a	93	72.527	Gasterosteus_aculeatus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	89	72.402	ENSGAGG00000004984	-	96	79.393	Gopherus_agassizii
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.540	ENSGGOG00000001788	POLR1A	99	82.598	Gorilla_gorilla
ENSOPRG00000008269	POLR1A	93	59.242	ENSHBUG00000020021	polr1a	97	59.917	Haplochromis_burtoni
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.783	ENSHGLG00000006334	POLR1A	99	82.862	Heterocephalus_glaber_female
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.422	ENSHGLG00100006614	POLR1A	99	82.356	Heterocephalus_glaber_male
ENSOPRG00000008269	POLR1A	94	68.085	ENSHCOG00000003345	polr1a	95	68.085	Hippocampus_comes
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	61.529	ENSIPUG00000013174	polr1a	99	61.353	Ictalurus_punctatus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	80.981	ENSSTOG00000012580	POLR1A	99	81.099	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	81.636	ENSJJAG00000013113	Polr1a	99	81.342	Jaculus_jaculus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	60.746	ENSKMAG00000007399	polr1a	99	60.568	Kryptolebias_marmoratus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	88	69.149	ENSLBEG00000015401	polr1a	97	64.342	Labrus_bergylta
ENSOPRG00000008269	POLR1A	54	70.294	ENSLACG00000003218	polr1a	100	70.294	Latimeria_chalumnae
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	66.018	ENSLOCG00000010881	polr1a	99	66.018	Lepisosteus_oculatus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	97	94.444	ENSLAFG00000014948	POLR1A	99	81.540	Loxodonta_africana
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.277	ENSMFAG00000046097	POLR1A	99	82.981	Macaca_fascicularis
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.160	ENSMMUG00000015815	POLR1A	99	82.864	Macaca_mulatta
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.277	ENSMNEG00000043313	POLR1A	99	82.981	Macaca_nemestrina
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.218	ENSMLEG00000042428	POLR1A	99	82.336	Mandrillus_leucophaeus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	60.329	ENSMAMG00000016565	polr1a	99	60.483	Mastacembelus_armatus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	61.134	ENSMZEG00005004915	polr1a	99	60.898	Maylandia_zebra
ENSOPRG00000008269	POLR1A	99	64.328	ENSMGAG00000013111	POLR1A	98	64.387	Meleagris_gallopavo
ENSOPRG00000008269	POLR1A	91	83.967	ENSMAUG00000008497	Polr1a	99	84.373	Mesocricetus_auratus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	83.108	ENSMICG00000000757	POLR1A	99	83.108	Microcebus_murinus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	81.674	ENSMOCG00000000122	Polr1a	99	81.567	Microtus_ochrogaster
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	59.680	ENSMMOG00000010216	polr1a	99	59.432	Mola_mola
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	69.289	ENSMODG00000009335	POLR1A	99	69.464	Monodelphis_domestica
ENSOPRG00000008269	POLR1A	94	71.277	ENSMALG00000013363	polr1a	95	71.277	Monopterus_albus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	80.624	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	99	80.658	Mus_caroli
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	80.742	ENSMUSG00000049553	Polr1a	99	79.767	Mus_musculus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	81.143	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	99	81.143	Mus_pahari
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	78.972	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	99	79.456	Mus_spretus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	83.206	ENSMPUG00000009135	POLR1A	99	83.314	Mustela_putorius_furo
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	81.967	ENSMLUG00000015723	POLR1A	99	82.084	Myotis_lucifugus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	81.567	ENSNGAG00000017907	Polr1a	99	82.107	Nannospalax_galili
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	61.275	ENSNBRG00000000519	polr1a	99	60.957	Neolamprologus_brichardi
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	80.774	ENSNLEG00000002264	POLR1A	99	80.832	Nomascus_leucogenys
ENSOPRG00000008269	POLR1A	70	92.381	ENSMEUG00000011665	-	69	92.381	Notamacropus_eugenii
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.675	ENSODEG00000003542	POLR1A	99	82.793	Octodon_degus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	60.222	ENSONIG00000015895	polr1a	99	61.275	Oreochromis_niloticus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	86.828	ENSOCUG00000010138	POLR1A	99	86.887	Oryctolagus_cuniculus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	60.721	ENSORLG00000008753	polr1a	98	60.601	Oryzias_latipes
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	59.192	ENSORLG00020020726	polr1a	98	59.224	Oryzias_latipes_hni
ENSOPRG00000008269	POLR1A	96	74.468	ENSORLG00015016071	polr1a	98	74.468	Oryzias_latipes_hsok
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.460	ENSOGAG00000004031	POLR1A	99	82.460	Otolemur_garnettii
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.422	ENSOARG00000020601	POLR1A	99	82.588	Ovis_aries
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.305	ENSPPAG00000042450	POLR1A	99	82.363	Pan_paniscus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.960	ENSPPRG00000006702	POLR1A	99	83.078	Panthera_pardus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.374	ENSPTIG00000018783	POLR1A	99	82.491	Panthera_tigris_altaica
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	81.775	ENSPTRG00000012147	POLR1A	99	82.363	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.688	ENSPANG00000025908	POLR1A	99	82.805	Papio_anubis
ENSOPRG00000008269	POLR1A	91	74.468	ENSPKIG00000005468	polr1a	94	74.468	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOPRG00000008269	POLR1A	62	66.886	ENSPSIG00000009321	-	98	67.105	Pelodiscus_sinensis
ENSOPRG00000008269	POLR1A	50	70.588	ENSPMGG00000009718	polr1a	88	70.588	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.557	ENSPEMG00000022224	Polr1a	99	82.696	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOPRG00000008269	POLR1A	96	72.905	ENSPCIG00000004222	POLR1A	99	72.428	Phascolarctos_cinereus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	59.329	ENSPFOG00000005025	polr1a	99	59.506	Poecilia_formosa
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	59.320	ENSPLAG00000021389	polr1a	99	59.144	Poecilia_latipinna
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	58.053	ENSPMEG00000006463	polr1a	99	57.510	Poecilia_mexicana
ENSOPRG00000008269	POLR1A	95	67.368	ENSPREG00000002389	polr1a	97	67.368	Poecilia_reticulata
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.097	ENSPPYG00000012217	POLR1A	99	82.155	Pongo_abelii
ENSOPRG00000008269	POLR1A	85	96.000	ENSPCAG00000011582	POLR1A	84	96.000	Procavia_capensis
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	83.412	ENSPCOG00000026987	POLR1A	99	83.235	Propithecus_coquereli
ENSOPRG00000008269	POLR1A	95	81.077	ENSPVAG00000012674	POLR1A	94	81.227	Pteropus_vampyrus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	95	72.340	ENSPNYG00000000026	polr1a	99	60.898	Pundamilia_nyererei
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	62.087	ENSPNAG00000019223	polr1a	99	62.148	Pygocentrus_nattereri
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	81.732	ENSRNOG00000009545	Polr1a	99	82.305	Rattus_norvegicus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	81.802	ENSRBIG00000028335	POLR1A	99	82.391	Rhinopithecus_bieti
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	81.743	ENSRROG00000031473	POLR1A	99	82.387	Rhinopithecus_roxellana
ENSOPRG00000008269	POLR1A	94	49.398	YOR341W	RPA190	91	49.398	Saccharomyces_cerevisiae
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	81.492	ENSSBOG00000030262	POLR1A	99	81.159	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	67.037	ENSSHAG00000014739	POLR1A	99	67.366	Sarcophilus_harrisii
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	63.556	ENSSFOG00015019716	polr1a	99	63.615	Scleropages_formosus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	95	71.277	ENSSMAG00000014342	polr1a	96	71.277	Scophthalmus_maximus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	61.910	ENSSDUG00000014631	polr1a	99	62.028	Seriola_dumerili
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	60.118	ENSSLDG00000024095	polr1a	99	58.871	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOPRG00000008269	POLR1A	71	96.809	ENSSARG00000003136	-	73	96.809	Sorex_araneus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	93	76.596	ENSSPUG00000004215	POLR1A	95	76.596	Sphenodon_punctatus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	63	69.149	ENSSPAG00000016341	polr1a	90	69.149	Stegastes_partitus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	84	83.181	ENSSSCG00000008226	POLR1A	99	83.134	Sus_scrofa
ENSOPRG00000008269	POLR1A	99	65.546	ENSTGUG00000010704	POLR1A	99	65.230	Taeniopygia_guttata
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	58.641	ENSTRUG00000002210	polr1a	97	60.568	Takifugu_rubripes
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	55.003	ENSTNIG00000010116	polr1a	99	54.822	Tetraodon_nigroviridis
ENSOPRG00000008269	POLR1A	75	95.133	ENSTBEG00000008646	POLR1A	74	95.133	Tupaia_belangeri
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	78.926	ENSTTRG00000008597	POLR1A	99	78.929	Tursiops_truncatus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	68	83.046	ENSUAMG00000012158	-	93	83.391	Ursus_americanus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	81.754	ENSUMAG00000006700	POLR1A	99	82.343	Ursus_maritimus
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.332	ENSVVUG00000001245	POLR1A	99	82.921	Vulpes_vulpes
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	64.265	ENSXETG00000001952	polr1a	100	64.435	Xenopus_tropicalis
ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	59.799	ENSXMAG00000004032	polr1a	99	59.075	Xiphophorus_maculatus