EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOPRG00000008331 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POLR2E
Alias: RPABC1|RPB5|XAP4|hRPB25|hsRPB5
Full Name: RNA polymerase II subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Ochotona_princeps
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4632 bases
Position: chrGeneScaffold_699:334-4965
Accession: 9192
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOPRP00000007621	RNA_pol_Rpb5_N	PF03871.14	1.4e-33	1	1
ENSOPRP00000007621	RNA_pol_Rpb5_C	PF01191.19	8.7e-33	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOPRT00000008326	POLR2E-201	630	-	ENSOPRP00000007621	209 (aa)	-	UPI00017755D1

Gene Model

Click here to download ENSOPRG00000008331's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOPRG00000008331's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	86.667	ENSG00000099817	POLR2E	100	86.667	Homo_sapiens
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSAPOG00000002935	polr2eb	100	84.286	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSAMEG00000003159	POLR2E	100	87.143	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	72.857	ENSACIG00000024371	polr2eb	100	72.857	Amphilophus_citrinellus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSAOCG00000018166	polr2eb	100	84.286	Amphiprion_ocellaris
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSAPEG00000009000	polr2eb	100	84.286	Amphiprion_percula
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSATEG00000023760	polr2eb	100	84.286	Anabas_testudineus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSANAG00000038488	POLR2E	100	87.143	Aotus_nancymaae
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.762	ENSACLG00000005254	polr2eb	100	84.762	Astatotilapia_calliptera
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.762	ENSAMXG00000018915	POLR2E	100	84.762	Astyanax_mexicanus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSBTAG00000020776	POLR2E	100	87.143	Bos_taurus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	99	68.269	WBGene00019246	rpb-5	99	68.269	Caenorhabditis_elegans
ENSOPRG00000008331	POLR2E	67	76.429	ENSCJAG00000007666	-	77	76.429	Callithrix_jacchus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	83.810	ENSCAFG00000019546	POLR2E	100	83.810	Canis_familiaris
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSCAFG00020017111	POLR2E	100	87.143	Canis_lupus_dingo
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSCHIG00000014151	POLR2E	100	87.143	Capra_hircus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	69.626	ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	69.626	Carlito_syrichta
ENSOPRG00000008331	POLR2E	91	85.938	ENSCAPG00000010843	POLR2E	93	85.938	Cavia_aperea
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSCPOG00000001542	POLR2E	100	87.143	Cavia_porcellus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSCCAG00000025658	POLR2E	100	87.143	Cebus_capucinus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSCATG00000008926	POLR2E	100	87.143	Cercocebus_atys
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	86.667	ENSCLAG00000014874	-	100	86.667	Chinchilla_lanigera
ENSOPRG00000008331	POLR2E	98	64.390	ENSCLAG00000009238	-	100	64.390	Chinchilla_lanigera
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSCSAG00000012336	POLR2E	100	87.143	Chlorocebus_sabaeus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	86.667	ENSCPBG00000009702	POLR2E	100	86.667	Chrysemys_picta_bellii
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	75.238	ENSCING00000024933	-	99	75.238	Ciona_intestinalis
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSCANG00000025560	POLR2E	100	87.143	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.619	ENSCGRG00001022927	Polr2e	100	87.619	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	81.395	ENSCGRG00000016441	Polr2e	100	81.395	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	83.333	ENSCSEG00000007107	polr2eb	92	83.333	Cynoglossus_semilaevis
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSCVAG00000019940	polr2eb	100	84.286	Cyprinodon_variegatus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	83.333	ENSDARG00000026183	polr2eb	100	83.333	Danio_rerio
ENSOPRG00000008331	POLR2E	90	85.789	ENSDNOG00000044994	POLR2E	84	85.789	Dasypus_novemcinctus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSDORG00000001154	Polr2e	100	87.143	Dipodomys_ordii
ENSOPRG00000008331	POLR2E	99	75.120	FBgn0033571	Rpb5	99	75.120	Drosophila_melanogaster
ENSOPRG00000008331	POLR2E	75	75.796	ENSEBUG00000010159	-	76	75.796	Eptatretus_burgeri
ENSOPRG00000008331	POLR2E	69	75.172	ENSEASG00005021615	POLR2E	67	70.988	Equus_asinus_asinus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	91	84.817	ENSECAG00000011124	POLR2E	100	75.238	Equus_caballus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	81.905	ENSELUG00000020646	polr2e	100	81.905	Esox_lucius
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	82.857	ENSELUG00000005815	POLR2E	100	82.857	Esox_lucius
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.619	ENSFCAG00000007318	POLR2E	100	87.619	Felis_catus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	91	85.417	ENSFALG00000013986	POLR2E	99	85.417	Ficedula_albicollis
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSFDAG00000014539	POLR2E	100	87.143	Fukomys_damarensis
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSFHEG00000022398	polr2eb	100	84.286	Fundulus_heteroclitus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	82.857	ENSGMOG00000007615	polr2eb	100	82.857	Gadus_morhua
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	86.667	ENSGALG00000002591	POLR2E	100	86.667	Gallus_gallus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.762	ENSGAFG00000005087	polr2eb	100	84.762	Gambusia_affinis
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	82.857	ENSGACG00000013247	polr2eb	100	82.857	Gasterosteus_aculeatus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	86.667	ENSGAGG00000008356	POLR2E	100	86.667	Gopherus_agassizii
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSGGOG00000011267	POLR2E	100	87.143	Gorilla_gorilla
ENSOPRG00000008331	POLR2E	67	73.239	ENSHBUG00000011099	polr2eb	100	73.239	Haplochromis_burtoni
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	86.190	ENSHGLG00000013330	POLR2E	100	86.190	Heterocephalus_glaber_female
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	86.190	ENSHGLG00100011014	POLR2E	100	86.190	Heterocephalus_glaber_male
ENSOPRG00000008331	POLR2E	54	70.536	ENSHCOG00000012099	-	88	70.536	Hippocampus_comes
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	82.857	ENSHCOG00000000906	polr2eb	100	82.857	Hippocampus_comes
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSIPUG00000019801	polr2e	100	84.286	Ictalurus_punctatus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSSTOG00000002853	POLR2E	100	87.143	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.619	ENSJJAG00000016595	-	100	87.619	Jaculus_jaculus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	77	73.913	ENSJJAG00000015812	-	100	73.913	Jaculus_jaculus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	73.113	ENSJJAG00000003145	-	100	73.113	Jaculus_jaculus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSKMAG00000005954	polr2eb	100	84.286	Kryptolebias_marmoratus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSLBEG00000024802	polr2eb	100	84.286	Labrus_bergylta
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	83.810	ENSLACG00000013686	POLR2E	100	83.810	Latimeria_chalumnae
ENSOPRG00000008331	POLR2E	78	82.099	ENSLOCG00000004599	POLR2E	100	82.099	Lepisosteus_oculatus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	67.453	ENSLAFG00000025587	POLR2E	100	67.453	Loxodonta_africana
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSMFAG00000002884	POLR2E	100	87.143	Macaca_fascicularis
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSMMUG00000013927	POLR2E	100	87.143	Macaca_mulatta
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	58.095	ENSMNEG00000033452	-	100	58.095	Macaca_nemestrina
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSMNEG00000034046	-	100	87.143	Macaca_nemestrina
ENSOPRG00000008331	POLR2E	92	78.756	ENSMLEG00000012405	POLR2E	94	78.756	Mandrillus_leucophaeus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSMAMG00000018703	polr2eb	100	84.286	Mastacembelus_armatus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	90	83.158	ENSMZEG00005010796	polr2eb	96	83.158	Maylandia_zebra
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	85.308	ENSMGAG00000003769	POLR2E	100	85.308	Meleagris_gallopavo
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	59.070	ENSMAUG00000011003	-	100	59.070	Mesocricetus_auratus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	92	86.010	ENSMAUG00000010125	-	100	86.387	Mesocricetus_auratus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSMICG00000013063	POLR2E	100	87.143	Microcebus_murinus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.619	ENSMOCG00000013414	Polr2e	100	87.619	Microtus_ochrogaster
ENSOPRG00000008331	POLR2E	91	74.869	ENSMMOG00000001167	polr2eb	88	74.869	Mola_mola
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	70.952	ENSMMOG00000001161	polr2eb	100	70.952	Mola_mola
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	86.667	ENSMODG00000005494	POLR2E	100	86.667	Monodelphis_domestica
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.762	ENSMALG00000021888	polr2eb	100	84.762	Monopterus_albus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.619	MGP_CAROLIEiJ_G0015561	Polr2e	100	87.619	Mus_caroli
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.619	ENSMUSG00000004667	Polr2e	100	87.619	Mus_musculus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.619	MGP_PahariEiJ_G0030974	Polr2e	100	87.619	Mus_pahari
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.619	MGP_SPRETEiJ_G0016379	Polr2e	100	87.619	Mus_spretus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSMPUG00000008953	POLR2E	100	87.143	Mustela_putorius_furo
ENSOPRG00000008331	POLR2E	66	76.087	ENSMLUG00000006376	-	100	67.284	Myotis_lucifugus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSMLUG00000013193	POLR2E	100	87.143	Myotis_lucifugus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.619	ENSNGAG00000001147	Polr2e	100	87.619	Nannospalax_galili
ENSOPRG00000008331	POLR2E	85	69.832	ENSNGAG00000017344	-	96	69.832	Nannospalax_galili
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	72.857	ENSNBRG00000022772	polr2eb	100	72.857	Neolamprologus_brichardi
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	86.256	ENSNLEG00000001207	-	100	86.256	Nomascus_leucogenys
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	67.619	ENSNLEG00000031364	-	100	67.619	Nomascus_leucogenys
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	62.679	ENSODEG00000011490	-	100	62.679	Octodon_degus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	89	78.495	ENSODEG00000007985	-	100	78.495	Octodon_degus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSODEG00000013230	-	100	87.143	Octodon_degus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSONIG00000002519	polr2eb	100	84.286	Oreochromis_niloticus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.762	ENSORLG00000015346	polr2eb	100	84.762	Oryzias_latipes
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.762	ENSORLG00020020700	polr2e	100	84.762	Oryzias_latipes_hni
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.762	ENSORLG00015016842	polr2e	100	84.762	Oryzias_latipes_hsok
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSOMEG00000002709	polr2eb	100	84.286	Oryzias_melastigma
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSOGAG00000012311	POLR2E	100	87.143	Otolemur_garnettii
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSOARG00000010994	POLR2E	100	87.143	Ovis_aries
ENSOPRG00000008331	POLR2E	91	85.864	ENSPPAG00000003145	POLR2E	100	85.864	Pan_paniscus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.619	ENSPPRG00000000777	POLR2E	100	87.619	Panthera_pardus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	91	64.583	ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	78.289	Panthera_tigris_altaica
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSPTRG00000010183	POLR2E	100	87.143	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSPANG00000018011	POLR2E	100	87.143	Papio_anubis
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	83.333	ENSPKIG00000009607	POLR2E	100	83.333	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	83.333	ENSPKIG00000024123	POLR2E	100	83.333	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOPRG00000008331	POLR2E	98	82.439	ENSPSIG00000002870	POLR2E	99	82.439	Pelodiscus_sinensis
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	72.381	ENSPMGG00000014354	polr2eb	100	72.381	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.619	ENSPEMG00000023261	Polr2e	100	87.619	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOPRG00000008331	POLR2E	90	85.185	ENSPCIG00000007312	POLR2E	75	85.185	Phascolarctos_cinereus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.762	ENSPFOG00000005734	polr2eb	100	84.762	Poecilia_formosa
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.762	ENSPLAG00000014496	polr2eb	100	84.762	Poecilia_latipinna
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.762	ENSPMEG00000008053	polr2eb	100	84.762	Poecilia_mexicana
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.762	ENSPREG00000006489	polr2eb	100	84.762	Poecilia_reticulata
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	79.621	ENSPPYG00000009305	POLR2E	100	79.621	Pongo_abelii
ENSOPRG00000008331	POLR2E	53	75.676	ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	75.676	Procavia_capensis
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSPCOG00000014491	POLR2E	100	87.143	Propithecus_coquereli
ENSOPRG00000008331	POLR2E	54	100.000	ENSPVAG00000007718	-	53	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	90	83.158	ENSPNYG00000019797	polr2eb	96	83.158	Pundamilia_nyererei
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSPNAG00000026263	POLR2E	100	84.286	Pygocentrus_nattereri
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.619	ENSRNOG00000013545	Polr2e	100	87.619	Rattus_norvegicus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	65.238	ENSRBIG00000027259	-	100	65.238	Rhinopithecus_bieti
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSRBIG00000028726	-	100	87.143	Rhinopithecus_bieti
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSRROG00000043763	POLR2E	100	87.143	Rhinopithecus_roxellana
ENSOPRG00000008331	POLR2E	99	39.450	YBR154C	RPB5	98	39.450	Saccharomyces_cerevisiae
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSSBOG00000027241	POLR2E	100	87.143	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	86.667	ENSSHAG00000010690	POLR2E	100	86.667	Sarcophilus_harrisii
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSSFOG00015006073	polr2e	100	84.286	Scleropages_formosus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSSMAG00000012782	polr2eb	100	84.286	Scophthalmus_maximus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSSDUG00000003352	polr2eb	100	84.286	Seriola_dumerili
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSSLDG00000004965	polr2eb	100	84.286	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	85.238	ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	85.238	Sphenodon_punctatus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSSPAG00000017556	polr2eb	100	84.286	Stegastes_partitus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSSSCG00000021472	POLR2E	100	87.143	Sus_scrofa
ENSOPRG00000008331	POLR2E	67	72.143	ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	72.143	Taeniopygia_guttata
ENSOPRG00000008331	POLR2E	96	79.104	ENSTRUG00000018238	polr2eb	100	72.381	Takifugu_rubripes
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.286	ENSTNIG00000013187	polr2eb	100	84.286	Tetraodon_nigroviridis
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	86.667	ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	86.667	Tursiops_truncatus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	92	82.990	ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	74.762	Ursus_americanus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	87.143	ENSVVUG00000022818	POLR2E	54	87.143	Vulpes_vulpes
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	85.238	ENSXETG00000003291	polr2e	100	85.238	Xenopus_tropicalis
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	72.857	ENSXCOG00000009197	polr2eb	100	72.857	Xiphophorus_couchianus
ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	84.762	ENSXMAG00000026495	polr2eb	100	84.762	Xiphophorus_maculatus