EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOPRG00000011054 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ochotona_princeps
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 35679 bases
Position: chrGeneScaffold_198:182075-217753
Accession: 22973
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOPRP00000010115	ResIII	PF04851.15	5e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOPRT00000011075	SBNO1-201	4185	-	ENSOPRP00000010115	1394 (aa)	-	UPI00017776F6

Gene Model

Click here to download ENSOPRG00000011054's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOPRG00000011054's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOPRG00000011054	SBNO1	69	67.120	ENSOPRG00000017238	SBNO2	78	67.120

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.261	ENSG00000139697	SBNO1	100	94.333	Homo_sapiens
ENSOPRG00000011054	SBNO1	82	80.846	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.640	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.278	ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	94.349	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.364	ENSACIG00000008088	sbno1	99	73.810	Amphilophus_citrinellus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.912	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	74.666	Amphiprion_ocellaris
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.912	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	74.666	Amphiprion_percula
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.563	ENSATEG00000006667	sbno1	99	75.457	Anabas_testudineus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	89.383	ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	89.391	Anas_platyrhynchos
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	85.522	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	85.593	Anolis_carolinensis
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.122	ENSANAG00000029958	-	99	96.931	Aotus_nancymaae
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	73.854	ENSACLG00000024913	sbno1	99	73.729	Astatotilapia_calliptera
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	78.394	ENSAMXG00000019473	sbno1	99	78.521	Astyanax_mexicanus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	94.405	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	94.476	Bos_taurus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.194	ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	94.265	Callithrix_jacchus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.488	ENSCAFG00000007503	SBNO1	100	94.560	Canis_familiaris
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	93.692	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	95.126	Canis_lupus_dingo
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	94.329	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	97.288	Capra_hircus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.480	ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	94.552	Carlito_syrichta
ENSOPRG00000011054	SBNO1	95	94.069	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	97.473	Cavia_aperea
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	93.759	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	97.473	Cavia_porcellus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	89.756	ENSCCAG00000035316	SBNO1	100	89.327	Cebus_capucinus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	92.595	ENSCATG00000008239	SBNO1	97	97.473	Cercocebus_atys
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	93.763	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	97.473	Chinchilla_lanigera
ENSOPRG00000011054	SBNO1	83	96.207	ENSCSAG00000002064	SBNO1	100	96.207	Chlorocebus_sabaeus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	96	90.096	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	90.192	Choloepus_hoffmanni
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	89.247	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	88.961	Chrysemys_picta_bellii
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	89.327	ENSCANG00000042688	-	100	89.327	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	93.477	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	96.209	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	93.477	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	96.209	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	73.892	ENSCSEG00000011919	sbno1	99	74.437	Cynoglossus_semilaevis
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.614	ENSCVAG00000007038	sbno1	99	74.877	Cyprinodon_variegatus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	77.627	ENSDARG00000099080	sbno1	99	77.643	Danio_rerio
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	91.816	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	93.326	Dasypus_novemcinctus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	81.877	ENSDORG00000015261	Sbno1	84	94.514	Dipodomys_ordii
ENSOPRG00000011054	SBNO1	93	88.125	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	88.125	Echinops_telfairi
ENSOPRG00000011054	SBNO1	75	62.500	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	62.222	Eptatretus_burgeri
ENSOPRG00000011054	SBNO1	51	91.102	ENSEASG00005012595	-	92	91.102	Equus_asinus_asinus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.839	ENSECAG00000006127	SBNO1	100	94.910	Equus_caballus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	83	98.901	ENSEEUG00000003793	SBNO1	83	98.901	Erinaceus_europaeus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	76.528	ENSELUG00000002886	sbno1	99	76.632	Esox_lucius
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	94.620	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	94.692	Felis_catus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	89.598	ENSFALG00000009273	SBNO1	100	89.677	Ficedula_albicollis
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	92.391	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	93.490	Fukomys_damarensis
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.106	ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.317	Fundulus_heteroclitus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	94	77.744	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	77.591	Gadus_morhua
ENSOPRG00000011054	SBNO1	88	89.457	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	89.376	Gallus_gallus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.405	ENSGAFG00000003960	sbno1	99	75.335	Gambusia_affinis
ENSOPRG00000011054	SBNO1	94	78.387	ENSGACG00000015633	sbno1	100	77.896	Gasterosteus_aculeatus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	88.387	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	93.321	Gopherus_agassizii
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.189	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	97.473	Gorilla_gorilla
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	69.027	ENSHBUG00000011910	sbno1	99	68.884	Haplochromis_burtoni
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	93.907	ENSHGLG00000014165	-	99	97.473	Heterocephalus_glaber_female
ENSOPRG00000011054	SBNO1	91	82.941	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	83.235	Hippocampus_comes
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	77.218	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	77.865	Ictalurus_punctatus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.763	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	97.653	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	93.692	ENSJJAG00000001741	Sbno1	100	93.763	Jaculus_jaculus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.770	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	74.718	Kryptolebias_marmoratus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.791	ENSLBEG00000007623	sbno1	99	75.158	Labrus_bergylta
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	79.528	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	81.553	Latimeria_chalumnae
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	80.128	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.554	Lepisosteus_oculatus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	93.190	ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	93.262	Loxodonta_africana
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.265	ENSMFAG00000031429	SBNO1	100	94.337	Macaca_fascicularis
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.333	ENSMMUG00000011496	SBNO1	100	94.405	Macaca_mulatta
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	92.545	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	97.473	Mandrillus_leucophaeus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.982	ENSMAMG00000005473	sbno1	99	74.982	Mastacembelus_armatus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	89.455	ENSMGAG00000003274	SBNO1	100	89.534	Meleagris_gallopavo
ENSOPRG00000011054	SBNO1	50	89.971	ENSMAUG00000004834	-	100	90.544	Mesocricetus_auratus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	93.047	ENSMICG00000006573	-	99	94.404	Microcebus_murinus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	96	95.382	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	96.570	Microtus_ochrogaster
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	71.388	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	71.358	Mola_mola
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	91.679	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	91.463	Monodelphis_domestica
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.982	ENSMALG00000001056	sbno1	99	74.772	Monopterus_albus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	92.821	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	98.246	Mus_caroli
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	93.539	ENSMUSG00000038095	Sbno1	99	93.611	Mus_musculus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	93.826	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	98.246	Mus_pahari
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	93.396	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	98.246	Mus_spretus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.480	ENSMPUG00000001658	SBNO1	100	94.552	Mustela_putorius_furo
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.194	ENSMLUG00000017159	SBNO1	100	94.265	Myotis_lucifugus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.409	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	97.441	Nannospalax_galili
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	73.944	ENSNBRG00000019189	sbno1	99	73.500	Neolamprologus_brichardi
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	90.531	ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	90.603	Nomascus_leucogenys
ENSOPRG00000011054	SBNO1	62	88.608	ENSMEUG00000008768	-	93	82.911	Notamacropus_eugenii
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.189	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	97.473	Octodon_degus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.771	ENSONIG00000015348	sbno1	99	74.771	Oreochromis_niloticus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	98	94.023	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	94.096	Oryctolagus_cuniculus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.228	ENSORLG00000001593	sbno1	99	74.579	Oryzias_latipes
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.350	ENSORLG00020015216	sbno1	99	74.701	Oryzias_latipes_hni
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.384	ENSORLG00015002726	sbno1	99	74.666	Oryzias_latipes_hsok
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.824	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	75.035	Oryzias_melastigma
ENSOPRG00000011054	SBNO1	50	87.536	ENSOGAG00000010781	-	100	87.536	Otolemur_garnettii
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	94.122	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	94.194	Ovis_aries
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.050	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	97.292	Pan_paniscus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	94.620	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	94.692	Panthera_pardus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.337	ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	94.624	Panthera_tigris_altaica
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.122	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	97.473	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.405	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	97.473	Papio_anubis
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	79.357	ENSPKIG00000001441	sbno1	99	79.143	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOPRG00000011054	SBNO1	92	85.016	ENSPSIG00000009256	-	100	85.016	Pelodiscus_sinensis
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	88.302	ENSPSIG00000009572	-	100	88.214	Pelodiscus_sinensis
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	93.190	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	96.209	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	91.039	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	91.111	Phascolarctos_cinereus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.915	ENSPFOG00000005069	sbno1	99	75.527	Poecilia_formosa
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.563	ENSPLAG00000015015	sbno1	99	75.457	Poecilia_latipinna
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.932	ENSPMEG00000021212	sbno1	99	75.545	Poecilia_mexicana
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.581	ENSPREG00000017746	sbno1	96	81.389	Poecilia_reticulata
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	93.974	ENSPPYG00000005084	SBNO1	100	93.472	Pongo_abelii
ENSOPRG00000011054	SBNO1	84	97.297	ENSPCAG00000008634	SBNO1	84	97.297	Procavia_capensis
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.194	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	97.096	Propithecus_coquereli
ENSOPRG00000011054	SBNO1	87	97.228	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	97.228	Pteropus_vampyrus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.088	ENSPNYG00000004291	sbno1	99	74.947	Pundamilia_nyererei
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	78.023	ENSPNAG00000015622	sbno1	99	77.738	Pygocentrus_nattereri
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	93.472	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	97.288	Rattus_norvegicus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.409	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	97.473	Rhinopithecus_roxellana
ENSOPRG00000011054	SBNO1	96	89.079	ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	89.153	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	78.571	ENSSFOG00015019025	sbno1	99	78.500	Scleropages_formosus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.930	ENSSMAG00000013640	sbno1	99	75.000	Scophthalmus_maximus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.158	ENSSDUG00000023480	sbno1	99	75.229	Seriola_dumerili
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.229	ENSSLDG00000007928	sbno1	99	75.299	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOPRG00000011054	SBNO1	89	95.638	ENSSARG00000002594	SBNO1	89	95.638	Sorex_araneus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	87.088	ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	87.088	Sphenodon_punctatus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.613	ENSSPAG00000016244	sbno1	99	74.613	Stegastes_partitus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.405	ENSSSCG00000009776	SBNO1	100	94.476	Sus_scrofa
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	89.527	ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	89.606	Taeniopygia_guttata
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.560	ENSTRUG00000018490	sbno1	99	74.473	Takifugu_rubripes
ENSOPRG00000011054	SBNO1	56	69.517	ENSTNIG00000013506	sbno1	99	69.863	Tetraodon_nigroviridis
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.624	ENSUAMG00000019671	SBNO1	100	94.695	Ursus_americanus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.624	ENSUMAG00000004002	SBNO1	100	94.695	Ursus_maritimus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	95	93.478	ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	Vicugna_pacos
ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.624	ENSVVUG00000027807	SBNO1	100	94.695	Vulpes_vulpes
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	80.542	ENSXETG00000031930	SBNO1	99	80.385	Xenopus_tropicalis
ENSOPRG00000011054	SBNO1	89	73.634	ENSXCOG00000011607	sbno1	99	70.892	Xiphophorus_couchianus
ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.369	ENSXMAG00000002140	sbno1	99	75.369	Xiphophorus_maculatus