EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOPRG00000012325 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Ochotona_princeps
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 39332 bases
Position: chrGeneScaffold_1123:483914-523245
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOPRP00000011249	PAZ	PF02170.22	5.7e-29	1	1
ENSOPRP00000011249	Piwi	PF02171.17	8e-108	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOPRT00000012328	AGO1-201	2571	-	ENSOPRP00000011249	856 (aa)	-	UPI000177893C

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOPRG00000012325	AGO1	77	85.714	ENSOPRG00000008795	-	78	85.714
ENSOPRG00000012325	AGO1	91	77.581	ENSOPRG00000012309	AGO4	93	77.581
ENSOPRG00000012325	AGO1	61	93.103	ENSOPRG00000012344	AGO3	59	93.103

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSG00000092847	AGO1	93	100.000	Homo_sapiens
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSAPOG00000024299	ago1	93	98.480	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSAMEG00000000504	AGO1	93	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOPRG00000012325	AGO1	73	97.959	ENSACIG00000005298	ago1	86	97.959	Amphilophus_citrinellus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSAOCG00000017727	ago1	93	98.480	Amphiprion_ocellaris
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSAPEG00000004458	ago1	93	98.480	Amphiprion_percula
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSATEG00000008523	ago1	93	98.480	Anabas_testudineus
ENSOPRG00000012325	AGO1	83	100.000	ENSAPLG00000010440	AGO1	84	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSOPRG00000012325	AGO1	84	100.000	ENSACAG00000029174	AGO1	92	100.000	Anolis_carolinensis
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSANAG00000037711	AGO1	93	100.000	Aotus_nancymaae
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSACLG00000000890	ago1	93	98.480	Astatotilapia_calliptera
ENSOPRG00000012325	AGO1	73	98.480	ENSAMXG00000001917	ago1	89	98.480	Astyanax_mexicanus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSBTAG00000012253	AGO1	93	100.000	Bos_taurus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSCJAG00000032023	AGO1	93	100.000	Callithrix_jacchus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSCAFG00000003443	AGO1	93	100.000	Canis_familiaris
ENSOPRG00000012325	AGO1	91	100.000	ENSCAFG00020009251	AGO1	92	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSCHIG00000011848	-	93	100.000	Capra_hircus
ENSOPRG00000012325	AGO1	84	82.372	ENSTSYG00000032426	-	87	86.957	Carlito_syrichta
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSTSYG00000009767	-	93	100.000	Carlito_syrichta
ENSOPRG00000012325	AGO1	70	100.000	ENSCAPG00000010228	AGO1	83	100.000	Cavia_aperea
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSCPOG00000011568	AGO1	93	100.000	Cavia_porcellus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSCCAG00000011823	AGO1	93	100.000	Cebus_capucinus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSCATG00000031521	AGO1	93	100.000	Cercocebus_atys
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSCLAG00000011507	AGO1	93	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSCSAG00000001091	AGO1	93	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSOPRG00000012325	AGO1	73	95.181	ENSCHOG00000011591	AGO1	73	95.181	Choloepus_hoffmanni
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSCPBG00000018594	AGO1	93	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSCANG00000039798	AGO1	93	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSCGRG00001022708	Ago1	93	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOPRG00000012325	AGO1	92	100.000	ENSCGRG00000010386	Ago1	93	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOPRG00000012325	AGO1	92	98.480	ENSCSEG00000001051	ago1	91	98.480	Cynoglossus_semilaevis
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSCVAG00000018173	ago1	93	98.480	Cyprinodon_variegatus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.176	ENSDARG00000092644	ago1	93	98.176	Danio_rerio
ENSOPRG00000012325	AGO1	84	100.000	ENSDNOG00000008077	AGO1	92	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSOPRG00000012325	AGO1	84	100.000	ENSDORG00000008494	Ago1	92	100.000	Dipodomys_ordii
ENSOPRG00000012325	AGO1	72	100.000	ENSETEG00000007626	AGO1	85	100.000	Echinops_telfairi
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSEASG00005012086	AGO1	93	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSECAG00000024353	AGO1	93	100.000	Equus_caballus
ENSOPRG00000012325	AGO1	85	100.000	ENSEEUG00000005349	AGO1	84	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSOPRG00000012325	AGO1	84	98.480	ENSELUG00000016803	ago1	92	98.480	Esox_lucius
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSFCAG00000000746	AGO1	93	100.000	Felis_catus
ENSOPRG00000012325	AGO1	84	100.000	ENSFALG00000000790	AGO1	92	100.000	Ficedula_albicollis
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSFDAG00000017210	AGO1	93	100.000	Fukomys_damarensis
ENSOPRG00000012325	AGO1	80	98.480	ENSFHEG00000017927	ago1	82	98.480	Fundulus_heteroclitus
ENSOPRG00000012325	AGO1	73	97.576	ENSGMOG00000019413	ago1	83	97.576	Gadus_morhua
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSGALG00000002249	AGO1	93	100.000	Gallus_gallus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSGAFG00000009775	ago1	93	98.480	Gambusia_affinis
ENSOPRG00000012325	AGO1	73	98.299	ENSGACG00000012443	ago1	83	98.299	Gasterosteus_aculeatus
ENSOPRG00000012325	AGO1	84	100.000	ENSGAGG00000012893	-	92	100.000	Gopherus_agassizii
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSGGOG00000003316	AGO1	93	100.000	Gorilla_gorilla
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSHBUG00000010459	ago1	93	98.480	Haplochromis_burtoni
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSHGLG00000011540	AGO1	93	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSHGLG00100005568	AGO1	93	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSOPRG00000012325	AGO1	92	98.480	ENSHCOG00000005708	ago1	92	98.480	Hippocampus_comes
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSIPUG00000023216	ago1	93	98.480	Ictalurus_punctatus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSSTOG00000010857	AGO1	93	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSJJAG00000019449	Ago1	93	100.000	Jaculus_jaculus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSKMAG00000019464	ago1	93	98.480	Kryptolebias_marmoratus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSLBEG00000007694	ago1	93	98.480	Labrus_bergylta
ENSOPRG00000012325	AGO1	90	89.841	ENSLACG00000017009	AGO1	90	89.841	Latimeria_chalumnae
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	91.185	ENSLOCG00000000504	AGO1	91	91.185	Lepisosteus_oculatus
ENSOPRG00000012325	AGO1	92	100.000	ENSLAFG00000010835	AGO1	92	100.000	Loxodonta_africana
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSMFAG00000002846	AGO1	93	100.000	Macaca_fascicularis
ENSOPRG00000012325	AGO1	92	91.489	ENSMMUG00000006251	AGO1	92	91.489	Macaca_mulatta
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	91.185	ENSMNEG00000028881	AGO1	92	100.000	Macaca_nemestrina
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSMLEG00000038388	AGO1	93	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSMAMG00000008381	ago1	93	98.480	Mastacembelus_armatus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSMZEG00005007996	ago1	93	98.480	Maylandia_zebra
ENSOPRG00000012325	AGO1	92	99.396	ENSMGAG00000003822	AGO1	92	99.396	Meleagris_gallopavo
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSMAUG00000015189	Ago1	93	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSMICG00000016147	AGO1	93	100.000	Microcebus_murinus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSMOCG00000000537	Ago1	93	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSOPRG00000012325	AGO1	70	99.029	ENSMMOG00000018459	ago1	84	99.029	Mola_mola
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSMODG00000023335	AGO1	93	100.000	Monodelphis_domestica
ENSOPRG00000012325	AGO1	92	98.480	ENSMALG00000011057	ago1	92	98.480	Monopterus_albus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	93	100.000	Mus_caroli
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSMUSG00000041530	Ago1	93	100.000	Mus_musculus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	93	100.000	Mus_pahari
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	93	100.000	Mus_spretus
ENSOPRG00000012325	AGO1	73	100.000	ENSMPUG00000014872	AGO1	87	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSOPRG00000012325	AGO1	54	86.245	ENSMLUG00000009628	AGO1	87	86.245	Myotis_lucifugus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSNGAG00000017448	Ago1	93	100.000	Nannospalax_galili
ENSOPRG00000012325	AGO1	84	98.480	ENSNBRG00000010867	ago1	92	98.480	Neolamprologus_brichardi
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSNLEG00000011181	AGO1	93	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSOPRG00000012325	AGO1	77	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	83	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSODEG00000005321	AGO1	93	100.000	Octodon_degus
ENSOPRG00000012325	AGO1	92	98.480	ENSONIG00000016345	ago1	92	98.480	Oreochromis_niloticus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSOANG00000002080	AGO1	93	100.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSOCUG00000023116	AGO1	93	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSORLG00000014965	ago1	93	98.480	Oryzias_latipes
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSORLG00020018253	ago1	93	98.480	Oryzias_latipes_hni
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSORLG00015003287	ago1	93	98.480	Oryzias_latipes_hsok
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSOMEG00000020528	ago1	93	98.480	Oryzias_melastigma
ENSOPRG00000012325	AGO1	92	100.000	ENSOGAG00000010279	AGO1	92	100.000	Otolemur_garnettii
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSOARG00000019591	AGO1	93	100.000	Ovis_aries
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSPPAG00000034838	AGO1	93	100.000	Pan_paniscus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSPPRG00000006475	AGO1	93	100.000	Panthera_pardus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	99.392	ENSPTIG00000020991	AGO1	93	99.392	Panthera_tigris_altaica
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSPTRG00000000528	AGO1	93	100.000	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSPANG00000009060	AGO1	93	100.000	Papio_anubis
ENSOPRG00000012325	AGO1	91	97.885	ENSPSIG00000017482	AGO1	92	97.885	Pelodiscus_sinensis
ENSOPRG00000012325	AGO1	73	98.299	ENSPMGG00000024099	ago1	89	98.299	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSPEMG00000023313	Ago1	93	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSPCIG00000000172	AGO1	93	100.000	Phascolarctos_cinereus
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSPFOG00000005867	ago1	93	98.480	Poecilia_formosa
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSPLAG00000002824	ago1	93	98.480	Poecilia_latipinna
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSPMEG00000001787	ago1	93	98.480	Poecilia_mexicana
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	ENSPREG00000006534	ago1	93	98.480	Poecilia_reticulata
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSPPYG00000001551	AGO1	93	100.000	Pongo_abelii
ENSOPRG00000012325	AGO1	51	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	58	100.000	Procavia_capensis
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSPCOG00000022061	AGO1	93	100.000	Propithecus_coquereli
ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	ENSPVAG00000005082	AGO1	93	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSOPRG00000012325	AGO1	77	98.480	ENSPNYG00000012586	ago1	83	98.480	Pundamilia_nyererei
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