EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOPRG00000012390 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ochotona_princeps
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 185403 bases
Position: chrGeneScaffold_533:173-185575
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOPRP00000011329	IBN_N	PF03810.19	3.9e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOPRT00000012410	TNPO1-201	2667	-	ENSOPRP00000011329	888 (aa)	-	UPI0001776DEF

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSG00000083312	TNPO1	100	96.891	Homo_sapiens
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.525	ENSAPOG00000003453	tnpo1	90	88.548	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	92.698	ENSAMEG00000007147	TNPO1	90	92.879	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOPRG00000012390	TNPO1	76	86.901	ENSACIG00000003711	tnpo1	88	86.901	Amphilophus_citrinellus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.730	ENSAOCG00000008154	tnpo1	90	88.753	Amphiprion_ocellaris
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.730	ENSAPEG00000001112	tnpo1	90	88.753	Amphiprion_percula
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.320	ENSATEG00000010408	tnpo1	90	88.344	Anabas_testudineus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	89.431	ENSAPLG00000009619	-	89	89.431	Anas_platyrhynchos
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	91.054	ENSACAG00000009599	TNPO1	90	91.054	Anolis_carolinensis
ENSOPRG00000012390	TNPO1	82	68.485	ENSANAG00000027118	-	87	68.485	Aotus_nancymaae
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSANAG00000022453	-	91	93.272	Aotus_nancymaae
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	85.685	ENSANAG00000025351	-	93	85.685	Aotus_nancymaae
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	86.901	ENSACLG00000027223	tnpo1	90	86.901	Astatotilapia_calliptera
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.498	ENSAMXG00000009842	tnpo1	90	88.498	Astyanax_mexicanus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	ENSBTAG00000007979	TNPO1	91	92.966	Bos_taurus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSCJAG00000016409	TNPO1	91	93.272	Callithrix_jacchus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	86	94.014	ENSCAFG00000008081	TNPO1	90	94.014	Canis_familiaris
ENSOPRG00000012390	TNPO1	86	93.617	ENSCAFG00020017397	TNPO1	89	93.617	Canis_lupus_dingo
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	ENSCHIG00000023462	TNPO1	91	92.966	Capra_hircus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	91.411	ENSTSYG00000001871	TNPO1	89	91.411	Carlito_syrichta
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSCCAG00000026472	TNPO1	91	93.272	Cebus_capucinus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSCATG00000043792	TNPO1	91	93.272	Cercocebus_atys
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.661	ENSCLAG00000016191	TNPO1	91	92.661	Chinchilla_lanigera
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	ENSCSAG00000015616	TNPO1	91	92.966	Chlorocebus_sabaeus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	85	81.651	ENSCHOG00000001746	TNPO1	91	81.651	Choloepus_hoffmanni
ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	90.798	ENSCPBG00000000260	TNPO1	90	90.798	Chrysemys_picta_bellii
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	71.400	ENSCSAVG00000010981	-	91	71.400	Ciona_savignyi
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSCANG00000004353	TNPO1	91	93.272	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	91	92.966	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOPRG00000012390	TNPO1	86	93.662	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	90	93.662	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	87.090	ENSCSEG00000012674	tnpo1	90	87.117	Cynoglossus_semilaevis
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.115	ENSCVAG00000001010	tnpo1	90	88.139	Cyprinodon_variegatus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.220	ENSDARG00000035390	tnpo1	90	87.220	Danio_rerio
ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	92.547	ENSDNOG00000006647	TNPO1	90	92.547	Dasypus_novemcinctus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	83	93.050	ENSDORG00000006476	Tnpo1	90	93.023	Dipodomys_ordii
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	55.624	FBgn0035693	CG8219	91	55.624	Drosophila_melanogaster
ENSOPRG00000012390	TNPO1	73	97.753	ENSETEG00000017805	TNPO1	76	97.753	Echinops_telfairi
ENSOPRG00000012390	TNPO1	84	80.297	ENSEBUG00000001895	tnpo1	90	80.297	Eptatretus_burgeri
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSEASG00005018055	TNPO1	91	93.272	Equus_asinus_asinus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	ENSECAG00000024424	TNPO1	91	92.966	Equus_caballus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	86.901	ENSELUG00000002821	tnpo1	90	86.901	Esox_lucius
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSFCAG00000013181	TNPO1	91	93.272	Felis_catus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	91.054	ENSFALG00000010292	TNPO1	90	91.054	Ficedula_albicollis
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	ENSFDAG00000013345	TNPO1	91	92.966	Fukomys_damarensis
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.548	ENSFHEG00000019234	tnpo1	90	88.548	Fundulus_heteroclitus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	85.331	ENSGMOG00000000347	tnpo1	90	85.481	Gadus_morhua
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	90.184	ENSGALG00000015014	TNPO1	91	90.184	Gallus_gallus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.705	ENSGAFG00000000943	tnpo1	90	87.730	Gambusia_affinis
ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	87.705	ENSGACG00000015841	tnpo1	91	87.730	Gasterosteus_aculeatus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	90.798	ENSGAGG00000013419	TNPO1	90	90.798	Gopherus_agassizii
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSGGOG00000026800	TNPO1	91	93.272	Gorilla_gorilla
ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	78.528	ENSGGOG00000022535	-	90	78.528	Gorilla_gorilla
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.935	ENSHBUG00000008068	tnpo1	90	87.935	Haplochromis_burtoni
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.661	ENSHGLG00000000970	-	91	92.661	Heterocephalus_glaber_female
ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	73.926	ENSHGLG00100000963	-	93	73.926	Heterocephalus_glaber_male
ENSOPRG00000012390	TNPO1	86	92.982	ENSHGLG00100017090	-	90	92.982	Heterocephalus_glaber_male
ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	92.879	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	88	92.879	Jaculus_jaculus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.859	ENSKMAG00000018195	tnpo1	90	87.859	Kryptolebias_marmoratus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	79	86.901	ENSLBEG00000009521	tnpo1	86	86.901	Labrus_bergylta
ENSOPRG00000012390	TNPO1	86	87.413	ENSLACG00000012199	TNPO1	90	87.413	Latimeria_chalumnae
ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	89.754	ENSLOCG00000011092	tnpo1	89	89.775	Lepisosteus_oculatus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	86	93.662	ENSLAFG00000011796	TNPO1	91	93.662	Loxodonta_africana
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSMFAG00000003636	TNPO1	91	93.272	Macaca_fascicularis
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	ENSMMUG00000020923	TNPO1	91	92.966	Macaca_mulatta
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSMNEG00000044581	TNPO1	91	93.272	Macaca_nemestrina
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSMLEG00000030740	TNPO1	91	93.272	Mandrillus_leucophaeus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.525	ENSMAMG00000001357	tnpo1	90	88.548	Mastacembelus_armatus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.730	ENSMZEG00005004913	tnpo1	90	87.730	Maylandia_zebra
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.615	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	97	99.419	Mesocricetus_auratus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	92.025	ENSMICG00000008468	TNPO1	90	92.025	Microcebus_murinus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	92.570	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	90	92.570	Microtus_ochrogaster
ENSOPRG00000012390	TNPO1	76	86.581	ENSMMOG00000005551	tnpo1	88	86.581	Mola_mola
ENSOPRG00000012390	TNPO1	85	90.301	ENSMODG00000001721	TNPO1	68	90.415	Monodelphis_domestica
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.115	ENSMALG00000009782	tnpo1	90	88.139	Monopterus_albus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	97	99.419	Mus_caroli
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	97	99.419	Mus_musculus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	97	99.419	Mus_pahari
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	97	99.419	Mus_spretus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	ENSMPUG00000014387	TNPO1	91	92.966	Mustela_putorius_furo
ENSOPRG00000012390	TNPO1	86	93.662	ENSMLUG00000016317	TNPO1	90	93.662	Myotis_lucifugus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	91	92.966	Nannospalax_galili
ENSOPRG00000012390	TNPO1	76	86.901	ENSNBRG00000009998	tnpo1	88	86.901	Neolamprologus_brichardi
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSNLEG00000004572	TNPO1	91	93.272	Nomascus_leucogenys
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.355	ENSODEG00000001771	TNPO1	91	92.355	Octodon_degus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	86.667	ENSONIG00000011151	tnpo1	90	86.667	Oreochromis_niloticus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	82	91.901	ENSOANG00000015785	TNPO1	90	91.901	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	86	94.014	ENSOCUG00000013318	TNPO1	92	94.014	Oryctolagus_cuniculus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	76	85.942	ENSORLG00000003182	tnpo1	88	85.942	Oryzias_latipes
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.730	ENSORLG00020011559	tnpo1	90	87.730	Oryzias_latipes_hni
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.935	ENSORLG00015019113	tnpo1	90	87.935	Oryzias_latipes_hsok
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.730	ENSOMEG00000014567	tnpo1	90	87.730	Oryzias_melastigma
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	ENSOGAG00000000808	TNPO1	91	92.966	Otolemur_garnettii
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	ENSOARG00000005038	TNPO1	77	92.966	Ovis_aries
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSPPAG00000042518	TNPO1	91	93.272	Pan_paniscus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSPPRG00000022336	TNPO1	91	93.272	Panthera_pardus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSPTIG00000018839	TNPO1	91	93.272	Panthera_tigris_altaica
ENSOPRG00000012390	TNPO1	84	81.366	ENSPTRG00000047731	-	89	81.366	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSPTRG00000016972	TNPO1	91	93.272	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSPANG00000006074	TNPO1	91	93.272	Papio_anubis
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.934	ENSPKIG00000019795	tnpo1	90	88.957	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	90.593	ENSPSIG00000014366	TNPO1	91	90.593	Pelodiscus_sinensis
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	85.773	ENSPMGG00000017014	tnpo1	90	85.918	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	86	93.662	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	90	93.662	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	92.013	ENSPCIG00000026080	TNPO1	90	92.013	Phascolarctos_cinereus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.910	ENSPFOG00000011447	tnpo1	90	87.935	Poecilia_formosa
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.910	ENSPLAG00000018696	tnpo1	90	87.935	Poecilia_latipinna
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.910	ENSPMEG00000024121	tnpo1	90	87.935	Poecilia_mexicana
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.115	ENSPREG00000020705	tnpo1	90	88.139	Poecilia_reticulata
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	ENSPPYG00000015545	TNPO1	91	92.966	Pongo_abelii
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	ENSPCOG00000004254	TNPO1	91	93.272	Propithecus_coquereli
ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	ENSPVAG00000013051	TNPO1	91	92.966	Pteropus_vampyrus
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.935	ENSPNYG00000001522	tnpo1	90	87.935	Pundamilia_nyererei
ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.179	ENSPNAG00000021484	tnpo1	90	88.179	Pygocentrus_nattereri
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