EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOPRG00000012870 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Ochotona_princeps
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5410 bases
Position: chrscaffold_6891:106501-111910
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOPRP00000011747	SYF2	PF08231.12	8.2e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOPRT00000012865	SYF2-201	732	-	ENSOPRP00000011747	243 (aa)	-	UPI0001776A88

Gene Model

Click here to download ENSOPRG00000012870's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOPRG00000012870's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.947	ENSG00000117614	SYF2	100	90.947	Homo_sapiens
ENSOPRG00000012870	SYF2	91	82.883	ENSAPOG00000001174	syf2	100	78.601	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOPRG00000012870	SYF2	80	94.359	ENSAMEG00000010134	-	100	94.359	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOPRG00000012870	SYF2	99	89.388	ENSAMEG00000010115	-	99	89.388	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOPRG00000012870	SYF2	98	78.059	ENSACIG00000023688	syf2	94	78.059	Amphilophus_citrinellus
ENSOPRG00000012870	SYF2	93	77.876	ENSAOCG00000010912	syf2	69	77.876	Amphiprion_ocellaris
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	79.424	ENSAOCG00000022046	syf2	97	81.818	Amphiprion_ocellaris
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	79.424	ENSAPEG00000018858	syf2	92	79.424	Amphiprion_percula
ENSOPRG00000012870	SYF2	89	82.028	ENSATEG00000007745	syf2	100	76.955	Anabas_testudineus
ENSOPRG00000012870	SYF2	82	87.437	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.000	Anas_platyrhynchos
ENSOPRG00000012870	SYF2	68	74.850	ENSACAG00000026777	-	94	75.159	Anolis_carolinensis
ENSOPRG00000012870	SYF2	84	84.314	ENSACAG00000013653	-	100	84.314	Anolis_carolinensis
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.358	ENSANAG00000032473	SYF2	100	91.358	Aotus_nancymaae
ENSOPRG00000012870	SYF2	91	80.180	ENSACLG00000019916	syf2	99	77.872	Astatotilapia_calliptera
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	76.955	ENSAMXG00000004051	syf2	100	76.955	Astyanax_mexicanus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.429	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	92.797	Bos_taurus
ENSOPRG00000012870	SYF2	86	50.000	WBGene00019402	syf-2	99	46.352	Caenorhabditis_elegans
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.358	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	91.358	Callithrix_jacchus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.244	ENSCAFG00000012895	-	100	90.244	Canis_familiaris
ENSOPRG00000012870	SYF2	97	83.051	ENSCAFG00000030331	-	97	83.051	Canis_familiaris
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.244	ENSCAFG00020021091	-	100	90.244	Canis_lupus_dingo
ENSOPRG00000012870	SYF2	74	84.615	ENSCAFG00020021094	-	100	67.901	Canis_lupus_dingo
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.535	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	90.535	Capra_hircus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.358	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.358	Carlito_syrichta
ENSOPRG00000012870	SYF2	81	94.949	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	94.949	Cavia_aperea
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.574	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	90.574	Cavia_porcellus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.770	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	91.770	Cebus_capucinus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.535	ENSCATG00000026917	SYF2	100	90.535	Cercocebus_atys
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.623	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	92.623	Chinchilla_lanigera
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.535	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	90.535	Chlorocebus_sabaeus
ENSOPRG00000012870	SYF2	74	74.033	ENSCHOG00000005273	-	100	74.033	Choloepus_hoffmanni
ENSOPRG00000012870	SYF2	93	88.444	ENSCPBG00000025073	SYF2	93	87.446	Chrysemys_picta_bellii
ENSOPRG00000012870	SYF2	87	53.052	ENSCING00000003017	-	89	52.582	Ciona_intestinalis
ENSOPRG00000012870	SYF2	87	50.704	ENSCSAVG00000006627	-	97	50.704	Ciona_savignyi
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	79.835	ENSCANG00000037322	SYF2	100	79.835	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.181	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	92.181	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOPRG00000012870	SYF2	82	95.980	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOPRG00000012870	SYF2	90	77.064	ENSCSEG00000000117	syf2	97	74.249	Cynoglossus_semilaevis
ENSOPRG00000012870	SYF2	91	80.180	ENSCVAG00000019543	syf2	100	75.309	Cyprinodon_variegatus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	76.955	ENSDARG00000004706	syf2	100	76.955	Danio_rerio
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.020	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	91.020	Dasypus_novemcinctus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.623	ENSDORG00000001274	Syf2	100	92.623	Dipodomys_ordii
ENSOPRG00000012870	SYF2	94	56.087	FBgn0033556	CG12343	99	56.087	Drosophila_melanogaster
ENSOPRG00000012870	SYF2	94	76.419	ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.419	Echinops_telfairi
ENSOPRG00000012870	SYF2	81	60.406	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	81.070	ENSEASG00005004232	-	100	81.070	Equus_asinus_asinus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.612	ENSEASG00005004224	-	100	90.612	Equus_asinus_asinus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.837	ENSECAG00000012023	-	100	91.837	Equus_caballus
ENSOPRG00000012870	SYF2	96	92.340	ENSECAG00000010440	-	98	92.340	Equus_caballus
ENSOPRG00000012870	SYF2	75	78.689	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	78.689	Erinaceus_europaeus
ENSOPRG00000012870	SYF2	95	80.426	ENSELUG00000003465	syf2	99	80.426	Esox_lucius
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.688	ENSFCAG00000043095	-	100	90.688	Felis_catus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.429	ENSFCAG00000010324	-	85	91.429	Felis_catus
ENSOPRG00000012870	SYF2	84	84.314	ENSFALG00000000460	SYF2	96	78.661	Ficedula_albicollis
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.358	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.358	Fukomys_damarensis
ENSOPRG00000012870	SYF2	99	60.816	ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.071	Fundulus_heteroclitus
ENSOPRG00000012870	SYF2	96	78.541	ENSGMOG00000019138	syf2	100	78.541	Gadus_morhua
ENSOPRG00000012870	SYF2	93	86.667	ENSGALG00000013639	SYF2	92	85.281	Gallus_gallus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	74.074	ENSGAFG00000019435	syf2	100	74.074	Gambusia_affinis
ENSOPRG00000012870	SYF2	88	82.791	ENSGACG00000007305	syf2	99	75.833	Gasterosteus_aculeatus
ENSOPRG00000012870	SYF2	93	88.938	ENSGAGG00000010670	SYF2	93	88.312	Gopherus_agassizii
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.358	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	91.358	Gorilla_gorilla
ENSOPRG00000012870	SYF2	97	78.390	ENSHBUG00000020477	syf2	100	78.390	Haplochromis_burtoni
ENSOPRG00000012870	SYF2	93	81.498	ENSHGLG00000004304	-	100	76.543	Heterocephalus_glaber_female
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.984	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	90.984	Heterocephalus_glaber_female
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.984	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	90.984	Heterocephalus_glaber_male
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	76.016	ENSHCOG00000012904	syf2	78	76.016	Hippocampus_comes
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	78.601	ENSIPUG00000019859	syf2	100	78.601	Ictalurus_punctatus
ENSOPRG00000012870	SYF2	60	93.151	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	93.151	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOPRG00000012870	SYF2	82	97.487	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	Jaculus_jaculus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	76.132	ENSKMAG00000013856	syf2	100	76.132	Kryptolebias_marmoratus
ENSOPRG00000012870	SYF2	90	82.192	ENSLBEG00000014425	syf2	99	78.814	Labrus_bergylta
ENSOPRG00000012870	SYF2	90	83.945	ENSLACG00000012064	SYF2	92	83.945	Latimeria_chalumnae
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	79.835	ENSLOCG00000002728	syf2	95	79.835	Lepisosteus_oculatus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.020	ENSLAFG00000023150	-	100	91.020	Loxodonta_africana
ENSOPRG00000012870	SYF2	75	63.587	ENSLAFG00000030814	-	100	63.587	Loxodonta_africana
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.947	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	90.947	Macaca_fascicularis
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.535	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	90.535	Macaca_mulatta
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.947	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	90.947	Macaca_nemestrina
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.535	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	90.535	Mandrillus_leucophaeus
ENSOPRG00000012870	SYF2	89	80.645	ENSMAMG00000010403	syf2	98	75.720	Mastacembelus_armatus
ENSOPRG00000012870	SYF2	95	77.119	ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.119	Maylandia_zebra
ENSOPRG00000012870	SYF2	82	87.437	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.437	Meleagris_gallopavo
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.770	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	91.770	Mesocricetus_auratus
ENSOPRG00000012870	SYF2	82	95.477	ENSMICG00000016191	SYF2	100	95.477	Microcebus_murinus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	93.004	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	93.004	Microtus_ochrogaster
ENSOPRG00000012870	SYF2	96	76.824	ENSMMOG00000002396	syf2	96	76.824	Mola_mola
ENSOPRG00000012870	SYF2	92	86.283	ENSMODG00000013951	-	99	86.283	Monodelphis_domestica
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	75.820	ENSMALG00000010706	syf2	100	76.230	Monopterus_albus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.181	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	92.181	Mus_caroli
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.181	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	92.181	Mus_musculus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.181	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	92.181	Mus_pahari
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.181	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	92.181	Mus_spretus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	89.837	ENSMPUG00000015801	-	100	89.837	Mustela_putorius_furo
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	89.837	ENSMPUG00000015802	-	100	89.837	Mustela_putorius_furo
ENSOPRG00000012870	SYF2	97	92.405	ENSMLUG00000001885	SYF2	97	92.405	Myotis_lucifugus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.870	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.870	Nannospalax_galili
ENSOPRG00000012870	SYF2	95	70.464	ENSNBRG00000010720	syf2	99	70.042	Neolamprologus_brichardi
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.358	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	91.358	Nomascus_leucogenys
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	81.557	ENSODEG00000014338	-	99	82.979	Octodon_degus
ENSOPRG00000012870	SYF2	95	92.672	ENSODEG00000017664	-	97	92.672	Octodon_degus
ENSOPRG00000012870	SYF2	91	80.180	ENSONIG00000008213	syf2	99	77.215	Oreochromis_niloticus
ENSOPRG00000012870	SYF2	83	90.099	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	94.262	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.262	Oryctolagus_cuniculus
ENSOPRG00000012870	SYF2	95	79.130	ENSORLG00000028820	syf2	99	79.130	Oryzias_latipes
ENSOPRG00000012870	SYF2	99	75.934	ENSORLG00020018333	syf2	94	81.081	Oryzias_latipes_hni
ENSOPRG00000012870	SYF2	99	76.763	ENSORLG00015014665	syf2	99	76.763	Oryzias_latipes_hsok
ENSOPRG00000012870	SYF2	95	79.915	ENSOMEG00000013911	syf2	98	79.915	Oryzias_melastigma
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.213	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.213	Otolemur_garnettii
ENSOPRG00000012870	SYF2	80	64.103	ENSOARG00000006269	-	100	64.103	Ovis_aries
ENSOPRG00000012870	SYF2	99	91.020	ENSOARG00000006348	-	99	91.020	Ovis_aries
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.358	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	91.358	Pan_paniscus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.688	ENSPPRG00000001651	-	100	90.688	Panthera_pardus
ENSOPRG00000012870	SYF2	99	90.984	ENSPPRG00000001638	-	99	90.984	Panthera_pardus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.057	ENSPTIG00000007036	-	100	91.057	Panthera_tigris_altaica
ENSOPRG00000012870	SYF2	89	95.833	ENSPTIG00000005711	-	80	95.872	Panthera_tigris_altaica
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.358	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	91.358	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.947	ENSPANG00000008139	SYF2	100	90.947	Papio_anubis
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	78.189	ENSPKIG00000008130	syf2	100	78.189	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOPRG00000012870	SYF2	99	84.232	ENSPSIG00000011816	SYF2	94	84.232	Pelodiscus_sinensis
ENSOPRG00000012870	SYF2	96	78.112	ENSPMGG00000008755	syf2	90	78.112	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.593	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.593	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOPRG00000012870	SYF2	92	91.071	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	84.400	Phascolarctos_cinereus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	74.486	ENSPFOG00000004116	syf2	95	77.489	Poecilia_formosa
ENSOPRG00000012870	SYF2	95	77.489	ENSPLAG00000006691	syf2	98	77.489	Poecilia_latipinna
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	72.428	ENSPMEG00000011684	syf2	98	74.892	Poecilia_mexicana
ENSOPRG00000012870	SYF2	89	80.556	ENSPREG00000003009	syf2	100	74.486	Poecilia_reticulata
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.358	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	91.358	Pongo_abelii
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	64.609	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	64.198	Propithecus_coquereli
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	78.776	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	78.776	Pteropus_vampyrus
ENSOPRG00000012870	SYF2	91	80.180	ENSPNYG00000004979	syf2	98	78.205	Pundamilia_nyererei
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	79.012	ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	Pygocentrus_nattereri
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.181	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	92.181	Rattus_norvegicus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	88.477	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	88.477	Rhinopithecus_bieti
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.947	ENSRROG00000001347	SYF2	100	90.947	Rhinopithecus_roxellana
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.947	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	90.947	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOPRG00000012870	SYF2	84	91.262	ENSSHAG00000007152	-	100	91.262	Sarcophilus_harrisii
ENSOPRG00000012870	SYF2	92	90.625	ENSSHAG00000015630	-	100	83.534	Sarcophilus_harrisii
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	77.366	ENSSFOG00015023647	syf2	100	77.366	Scleropages_formosus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	74.486	ENSSMAG00000009867	syf2	100	74.486	Scophthalmus_maximus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	75.720	ENSSDUG00000013072	syf2	100	76.132	Seriola_dumerili
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	75.720	ENSSLDG00000012677	syf2	100	76.132	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	72.951	ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.951	Sorex_araneus
ENSOPRG00000012870	SYF2	99	82.231	ENSSPUG00000005251	SYF2	96	82.231	Sphenodon_punctatus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	75.720	ENSSPAG00000009626	syf2	100	75.720	Stegastes_partitus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.429	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	91.429	Sus_scrofa
ENSOPRG00000012870	SYF2	61	57.616	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	57.714	Taeniopygia_guttata
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	75.820	ENSTRUG00000001499	syf2	92	78.448	Takifugu_rubripes
ENSOPRG00000012870	SYF2	92	78.924	ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.924	Tetraodon_nigroviridis
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	69.959	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.547	Tupaia_belangeri
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.213	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.213	Tursiops_truncatus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	89.431	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	89.431	Ursus_americanus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	89.431	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	89.837	Ursus_maritimus
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.164	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	90.164	Vicugna_pacos
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	87.500	ENSVVUG00000027181	-	100	87.500	Vulpes_vulpes
ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.244	ENSVVUG00000027175	-	100	90.244	Vulpes_vulpes
ENSOPRG00000012870	SYF2	95	83.117	ENSXETG00000022797	syf2	93	83.117	Xenopus_tropicalis
ENSOPRG00000012870	SYF2	88	80.000	ENSXMAG00000022698	syf2	100	73.663	Xiphophorus_maculatus