EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOPRG00000013160 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SRPRA
Alias: SR-alpha|SRP-alpha|SRPR|Sralpha
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Ochotona_princeps
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4639 bases
Position: chrGeneScaffold_3679:58762-63400
Accession: 11307
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOPRP00000012009	SRP54	PF00448.22	9.1e-48	1	1
ENSOPRP00000012009	SRP54_N	PF02881.19	8.4e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOPRT00000013158	SRPRA-201	1911	-	ENSOPRP00000012009	636 (aa)	-	UPI00017A27CE

Gene Model

Click here to download ENSOPRG00000013160's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOPRG00000013160's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.767	ENSG00000182934	SRPRA	100	90.767	Homo_sapiens
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	64.885	ENSAPOG00000017588	srpra	100	64.417	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.358	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	89.358	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	62.519	ENSACIG00000021588	srpra	100	62.519	Amphilophus_citrinellus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	65.038	ENSAOCG00000018884	srpra	92	74.755	Amphiprion_ocellaris
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	64.526	ENSAPEG00000022286	srpra	92	74.755	Amphiprion_percula
ENSOPRG00000013160	SRPRA	83	86.984	ENSATEG00000023578	srpra	93	86.728	Anabas_testudineus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	94	72.578	ENSAPLG00000016079	SRPRA	100	72.742	Anas_platyrhynchos
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	71.649	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	72.000	Anolis_carolinensis
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.610	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	90.610	Aotus_nancymaae
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.497	ENSACLG00000000518	srpra	100	63.902	Astatotilapia_calliptera
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.707	ENSAMXG00000009975	srpra	100	63.183	Astyanax_mexicanus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.688	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	89.688	Bos_taurus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	99	46.646	WBGene00009521	F38A1.8	99	45.884	Caenorhabditis_elegans
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.752	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	90.752	Callithrix_jacchus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	87.011	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	87.011	Canis_familiaris
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.045	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	89.045	Canis_lupus_dingo
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	88.906	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	88.125	Capra_hircus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	86	99.162	ENSTSYG00000005187	SRPRA	100	99.162	Carlito_syrichta
ENSOPRG00000013160	SRPRA	95	81.384	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	98.496	Cavia_aperea
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.358	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	98.496	Cavia_porcellus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.297	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	90.297	Cebus_capucinus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	91.080	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	91.080	Cercocebus_atys
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.297	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	90.297	Chinchilla_lanigera
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.767	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	90.767	Chlorocebus_sabaeus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	54	98.980	ENSCHOG00000010015	-	72	98.980	Choloepus_hoffmanni
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	72.504	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	72.965	Chrysemys_picta_bellii
ENSOPRG00000013160	SRPRA	99	54.769	ENSCING00000008954	-	100	55.436	Ciona_intestinalis
ENSOPRG00000013160	SRPRA	99	55.590	ENSCSAVG00000005602	-	100	55.420	Ciona_savignyi
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.671	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	89.671	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.045	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	89.045	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.045	ENSCGRG00000009892	Srpr	100	89.045	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	64.145	ENSCSEG00000002374	srpra	92	75.610	Cynoglossus_semilaevis
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.872	ENSCVAG00000019881	srpra	100	64.472	Cyprinodon_variegatus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.150	ENSDARG00000061124	srpra	100	63.150	Danio_rerio
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	88.080	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	87.307	Dasypus_novemcinctus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.358	ENSDORG00000016719	Srpr	100	89.358	Dipodomys_ordii
ENSOPRG00000013160	SRPRA	99	49.153	FBgn0010391	Gtp-bp	100	49.538	Drosophila_melanogaster
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	85.848	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	85.692	Echinops_telfairi
ENSOPRG00000013160	SRPRA	51	80.923	ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.357	Eptatretus_burgeri
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	88.263	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	87.480	Equus_asinus_asinus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	88.419	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	87.637	Equus_caballus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.114	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	88.491	Erinaceus_europaeus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	64.231	ENSELUG00000017643	srpra	100	64.894	Esox_lucius
ENSOPRG00000013160	SRPRA	80	86.133	ENSFCAG00000030894	-	99	85.742	Felis_catus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.219	ENSFCAG00000011274	-	100	88.906	Felis_catus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	99	69.531	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	69.531	Ficedula_albicollis
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.297	ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	90.297	Fukomys_damarensis
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.952	ENSFHEG00000016959	srpra	100	64.307	Fundulus_heteroclitus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	64.031	ENSGMOG00000013244	srpra	100	64.551	Gadus_morhua
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	72.994	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	73.148	Gallus_gallus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.339	ENSGAFG00000000453	srpra	92	73.479	Gambusia_affinis
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.609	ENSGACG00000006550	srpra	100	64.142	Gasterosteus_aculeatus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	73.160	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	73.620	Gopherus_agassizii
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.767	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	90.767	Gorilla_gorilla
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.344	ENSHBUG00000000119	srpra	100	63.748	Haplochromis_burtoni
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.358	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.358	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	64.307	ENSHCOG00000010749	srpra	100	64.776	Hippocampus_comes
ENSOPRG00000013160	SRPRA	94	60.032	ENSIPUG00000000867	srpra	99	60.356	Ictalurus_punctatus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.297	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	90.297	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	88.732	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	88.732	Jaculus_jaculus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	64.199	ENSKMAG00000002280	srpra	100	64.072	Kryptolebias_marmoratus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.859	ENSLBEG00000009608	srpra	100	64.580	Labrus_bergylta
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	65.794	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	65.639	Latimeria_chalumnae
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	62.784	ENSLOCG00000002733	srpra	100	62.801	Lepisosteus_oculatus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	87.812	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	87.812	Loxodonta_africana
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.923	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	90.923	Macaca_fascicularis
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.923	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	90.923	Macaca_mulatta
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.767	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	90.767	Macaca_nemestrina
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	91.080	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	91.080	Mandrillus_leucophaeus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	62.991	ENSMAMG00000000473	srpra	100	63.142	Mastacembelus_armatus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.497	ENSMZEG00005013432	srpra	100	63.902	Maylandia_zebra
ENSOPRG00000013160	SRPRA	94	72.277	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	72.442	Meleagris_gallopavo
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.045	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	89.045	Mesocricetus_auratus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.984	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	89.984	Microcebus_murinus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.358	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	89.358	Microtus_ochrogaster
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.707	ENSMMOG00000005019	srpra	100	63.707	Mola_mola
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	83.750	ENSMODG00000004576	-	100	82.786	Monodelphis_domestica
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	64.091	ENSMALG00000011343	srpra	100	64.492	Monopterus_albus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.045	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	100	89.358	Mus_caroli
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.358	ENSMUSG00000032042	Srpr	100	89.358	Mus_musculus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.358	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	100	89.358	Mus_pahari
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	84.799	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	84.799	Mus_spretus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.202	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	89.202	Mustela_putorius_furo
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	87.167	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	87.167	Myotis_lucifugus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	88.732	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	88.732	Nannospalax_galili
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.344	ENSNBRG00000017311	srpra	100	63.748	Neolamprologus_brichardi
ENSOPRG00000013160	SRPRA	99	86.614	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	90.328	Nomascus_leucogenys
ENSOPRG00000013160	SRPRA	94	83.361	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	82.862	Notamacropus_eugenii
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.045	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	89.045	Octodon_degus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.594	ENSONIG00000005324	srpra	100	63.902	Oreochromis_niloticus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.752	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	90.752	Oryctolagus_cuniculus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	61.883	ENSORLG00000014676	srpra	100	64.024	Oryzias_latipes
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	61.883	ENSORLG00020009240	srpra	100	64.024	Oryzias_latipes_hni
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.609	ENSORLG00015015405	srpra	100	64.526	Oryzias_latipes_hsok
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	64.253	ENSOMEG00000005872	srpra	100	64.634	Oryzias_melastigma
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.671	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	89.671	Otolemur_garnettii
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	85.047	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	85.047	Ovis_aries
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.767	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	90.767	Pan_paniscus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.219	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	88.906	Panthera_pardus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.062	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	88.750	Panthera_tigris_altaica
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.767	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	90.767	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.923	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	90.923	Papio_anubis
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.313	ENSPKIG00000016106	srpra	100	61.810	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOPRG00000013160	SRPRA	94	71.593	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	71.757	Pelodiscus_sinensis
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	64.154	ENSPMGG00000001393	srpra	100	63.932	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.515	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	89.515	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOPRG00000013160	SRPRA	99	57.450	ENSPMAG00000009559	srpra	80	83.333	Petromyzon_marinus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	83.594	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	83.594	Phascolarctos_cinereus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.086	ENSPFOG00000003114	srpra	100	64.962	Poecilia_formosa
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.651	ENSPLAG00000007323	srpra	100	64.962	Poecilia_latipinna
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	62.935	ENSPMEG00000015658	srpra	100	64.812	Poecilia_mexicana
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	64.743	ENSPREG00000004937	srpra	100	65.165	Poecilia_reticulata
ENSOPRG00000013160	SRPRA	89	98.684	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	98.684	Pongo_abelii
ENSOPRG00000013160	SRPRA	64	99.225	ENSPCAG00000003801	-	64	99.225	Procavia_capensis
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.984	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	89.984	Propithecus_coquereli
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	88.732	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	88.732	Pteropus_vampyrus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.497	ENSPNYG00000012371	srpra	100	63.902	Pundamilia_nyererei
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	60.731	ENSPNAG00000013476	srpra	100	62.043	Pygocentrus_nattereri
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.671	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	89.671	Rattus_norvegicus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.610	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	90.610	Rhinopithecus_bieti
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.454	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	90.454	Rhinopithecus_roxellana
ENSOPRG00000013160	SRPRA	55	42.077	YDR292C	-	63	40.050	Saccharomyces_cerevisiae
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.454	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	90.454	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOPRG00000013160	SRPRA	94	82.919	ENSSHAG00000009168	SRPRA	99	87.885	Sarcophilus_harrisii
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	61.189	ENSSFOG00015008837	srpra	100	61.912	Scleropages_formosus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.240	ENSSMAG00000002783	srpra	100	62.191	Scophthalmus_maximus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.438	ENSSDUG00000013920	srpra	100	63.594	Seriola_dumerili
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.429	ENSSLDG00000008601	srpra	93	64.134	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOPRG00000013160	SRPRA	81	100.000	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	Sorex_araneus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	72.179	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	72.377	Sphenodon_punctatus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.914	ENSSPAG00000005103	srpra	100	64.832	Stegastes_partitus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.045	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	89.045	Sus_scrofa
ENSOPRG00000013160	SRPRA	94	69.472	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	69.472	Taeniopygia_guttata
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	62.500	ENSTRUG00000006856	srpra	100	62.801	Takifugu_rubripes
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	60.850	ENSTNIG00000010316	srpra	100	62.064	Tetraodon_nigroviridis
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	88.281	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	87.812	Tursiops_truncatus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.515	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	89.515	Ursus_americanus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	96	80.452	ENSUMAG00000002269	SRPRA	99	80.452	Ursus_maritimus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	69	99.225	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	99.225	Vicugna_pacos
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.202	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	89.202	Vulpes_vulpes
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	58.015	ENSXETG00000003920	srpra	100	58.321	Xenopus_tropicalis
ENSOPRG00000013160	SRPRA	86	87.937	ENSXCOG00000001286	srpra	100	86.486	Xiphophorus_couchianus
ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.897	ENSXMAG00000028401	srpra	100	64.414	Xiphophorus_maculatus