EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOPRG00000013474 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BAF190|BRM|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Ochotona_princeps
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 201015 bases
Position: chrGeneScaffold_496:289892-490906
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOPRP00000012321	BRK	PF07533.16	1.4e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOPRT00000013502	SMARCA2-201	4731	-	ENSOPRP00000012321	1576 (aa)	-	UPI00017787B0

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	75	72.414	ENSOPRG00000000885	-	74	72.414

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	94	98.200	ENSG00000080503	SMARCA2	100	98.658	Homo_sapiens
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	75.499	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	73.703	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	80	92.645	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	92.645	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	75.422	ENSACIG00000015607	SMARCA2	81	79.812	Amphilophus_citrinellus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	75.529	ENSAOCG00000009647	-	81	80.143	Amphiprion_ocellaris
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	75.499	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	80	80.787	Amphiprion_percula
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	77.183	ENSATEG00000006916	SMARCA2	78	81.970	Anabas_testudineus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	89	84.653	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	73	90.228	Anas_platyrhynchos
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	84.795	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	84.845	Anolis_carolinensis
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	91.445	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	91.508	Aotus_nancymaae
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	76.244	ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	76.083	Astatotilapia_calliptera
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	77.708	ENSAMXG00000012404	smarca2	80	83.043	Astyanax_mexicanus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.558	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	90.494	Bos_taurus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	91.954	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	90.748	Callithrix_jacchus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.875	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	90.938	Canis_familiaris
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	77	89.318	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	98	89.318	Canis_lupus_dingo
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.558	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	90.494	Capra_hircus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.337	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	91.087	Carlito_syrichta
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	86.862	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	100	87.181	Cavia_aperea
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.880	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	90.690	Cavia_porcellus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	91.825	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	91.508	Cebus_capucinus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.599	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	89.930	Cercocebus_atys
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.944	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	90.754	Chinchilla_lanigera
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	94	90.921	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	90.921	Chlorocebus_sabaeus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	86	89.002	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	85.787	Choloepus_hoffmanni
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	86.464	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	99	89.450	Chrysemys_picta_bellii
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	91.318	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	91.318	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	86.612	ENSCGRG00001002323	Smarca2	81	89.897	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	73.359	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	79	77.522	Cynoglossus_semilaevis
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	85	74.446	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	75	80.059	Cyprinodon_variegatus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	77.646	ENSDARG00000008904	smarca2	80	82.938	Danio_rerio
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	88.994	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	83	92.296	Dasypus_novemcinctus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.944	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	90.748	Dipodomys_ordii
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	94	66.445	ENSEBUG00000011442	-	77	72.405	Eptatretus_burgeri
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	86	60.615	ENSEBUG00000002449	-	88	64.179	Eptatretus_burgeri
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.748	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	90.748	Equus_asinus_asinus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	66	95.833	ENSEEUG00000015540	-	68	95.833	Erinaceus_europaeus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	92	76.439	ENSELUG00000010318	smarca2	96	74.393	Esox_lucius
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.494	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	90.558	Felis_catus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	86.174	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	86.826	Ficedula_albicollis
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	89.034	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	100	88.847	Fukomys_damarensis
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	76.259	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	81	80.219	Fundulus_heteroclitus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	98	73.843	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	84	77.531	Gadus_morhua
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	86.641	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	86.367	Gallus_gallus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	95	72.336	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	74	75.781	Gambusia_affinis
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	75.588	ENSGACG00000014488	SMARCA2	83	78.927	Gasterosteus_aculeatus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	86.726	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	86.430	Gopherus_agassizii
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	91	93.873	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	85	91.779	Gorilla_gorilla
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	76.364	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	76.088	Haplochromis_burtoni
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	90.828	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	99	90.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.310	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	90.057	Heterocephalus_glaber_male
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	89	70.297	ENSHCOG00000015348	-	74	80.218	Hippocampus_comes
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	76.255	ENSIPUG00000011060	smarca2	79	82.827	Ictalurus_punctatus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	91.260	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	91.134	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.823	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	90.949	Jaculus_jaculus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	76.084	ENSKMAG00000015844	-	79	80.645	Kryptolebias_marmoratus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	98	78.058	ENSLOCG00000011499	smarca2	82	82.691	Lepisosteus_oculatus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	89.723	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	92.067	Loxodonta_africana
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	89.649	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	82	93.844	Macaca_fascicularis
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	91.508	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	91.635	Macaca_mulatta
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.542	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	90.823	Macaca_nemestrina
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	80	93.959	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	83	93.959	Mandrillus_leucophaeus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	76.861	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	79	81.969	Mastacembelus_armatus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	76.445	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	96	76.237	Maylandia_zebra
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	71	92.800	ENSMGAG00000005160	-	92	92.800	Meleagris_gallopavo
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	91.065	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	90.938	Microcebus_murinus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	91.208	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	91.208	Microtus_ochrogaster
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	74.269	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	79	78.935	Mola_mola
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	88.720	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	88.388	Monodelphis_domestica
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	76.583	ENSMALG00000009611	SMARCA2	80	80.366	Monopterus_albus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	94	97.872	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	98	97.872	Mus_caroli
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	94	97.709	ENSMUSG00000024921	Smarca2	98	97.709	Mus_musculus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	94	97.872	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	98	97.872	Mus_pahari
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	94	97.709	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	98	97.709	Mus_spretus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	80	92.740	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	92.740	Mustela_putorius_furo
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	85.669	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	82	87.966	Myotis_lucifugus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	88.903	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	88.604	Nannospalax_galili
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	95	63.415	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	89	73.158	Neolamprologus_brichardi
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	80	93.349	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	83	93.508	Nomascus_leucogenys
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	83.521	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	83.061	Notamacropus_eugenii
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	89.594	ENSODEG00000005452	SMARCA2	99	89.377	Octodon_degus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	76.797	ENSONIG00000014163	SMARCA2	78	82.460	Oreochromis_niloticus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	92.074	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	92.137	Oryctolagus_cuniculus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	75.374	ENSORLG00000020820	SMARCA2	79	81.013	Oryzias_latipes
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	75.421	ENSORLG00015006289	SMARCA2	79	81.013	Oryzias_latipes_hsok
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	76.097	ENSOMEG00000009736	-	81	81.043	Oryzias_melastigma
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	80	93.518	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	80	93.518	Otolemur_garnettii
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	80	93.454	ENSOARG00000013265	SMARCA2	81	93.454	Ovis_aries
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	93	94.066	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	99	92.913	Pan_paniscus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.558	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	90.621	Panthera_pardus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	91.007	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	89.981	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	84.513	ENSPANG00000025121	SMARCA2	80	87.431	Papio_anubis
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	77.890	ENSPKIG00000018469	-	83	83.189	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	86.057	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	85.805	Pelodiscus_sinensis
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	98	70.152	ENSPMGG00000013696	-	97	70.194	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.443	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	89.494	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	94	69.221	ENSPMAG00000005337	-	77	73.625	Petromyzon_marinus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	88.466	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	88.261	Phascolarctos_cinereus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	76.137	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	79	80.851	Poecilia_formosa
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	75.721	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	79	78.447	Poecilia_latipinna
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	76.008	ENSPMEG00000001815	-	79	80.851	Poecilia_mexicana
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	75.868	ENSPREG00000013800	SMARCA2	79	81.087	Poecilia_reticulata
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	91.191	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	100	91.318	Pongo_abelii
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	79	83.270	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	83.143	Procavia_capensis
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	95	98.087	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	96	98.067	Propithecus_coquereli
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	91	95.977	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	94	95.977	Pteropus_vampyrus
ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	73.241	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	80	77.620	Pundamilia_nyererei
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ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	89.925	ENSRNOG00000011931	Smarca2	100	89.925	Rattus_norvegicus
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