EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOPRG00000016323 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Ochotona_princeps
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 39294 bases
Position: chrGeneScaffold_405:85569-124862
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOPRP00000014917	GTP_EFTU	PF00009.27	2.7e-45	1	1
ENSOPRP00000014917	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	6.2e-13	1	1
ENSOPRP00000014917	EFG_IV	PF03764.18	3.8e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOPRT00000016335	EFTUD2-201	2919	-	ENSOPRP00000014917	972 (aa)	-	UPI0001776F73

Gene Model

Click here to download ENSOPRG00000016323's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOPRG00000016323's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	57	43.836	ENSOPRG00000003490	-	64	43.836

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	ENSG00000108883	EFTUD2	100	97.973	Homo_sapiens
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.259	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	84.053	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	91.461	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	80.761	ENSACIG00000009096	eftud2	100	80.556	Amphilophus_citrinellus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	87	79.176	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	79.176	Amphiprion_ocellaris
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.362	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	84.156	Amphiprion_percula
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.671	ENSATEG00000000457	eftud2	100	84.465	Anabas_testudineus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	99	88.501	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.501	Anas_platyrhynchos
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	89.300	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	89.300	Anolis_carolinensis
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.461	Aotus_nancymaae
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.259	ENSACLG00000001296	eftud2	100	84.053	Astatotilapia_calliptera
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.726	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	83.828	Astyanax_mexicanus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	91.358	Bos_taurus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	99	64.058	WBGene00001166	eftu-2	99	63.955	Caenorhabditis_elegans
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.461	Callithrix_jacchus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	91.461	Canis_familiaris
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.461	Canis_lupus_dingo
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.358	Capra_hircus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.049	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.049	Carlito_syrichta
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.741	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	90.741	Cavia_aperea
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.741	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	90.741	Cavia_porcellus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	91.461	Cebus_capucinus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.461	Cercocebus_atys
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.638	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	90.638	Chinchilla_lanigera
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.461	Chlorocebus_sabaeus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	91	77.703	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	77.703	Choloepus_hoffmanni
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.432	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	90.432	Chrysemys_picta_bellii
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	95	80.169	ENSCING00000009372	-	95	80.169	Ciona_intestinalis
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	94	80.612	ENSCSAVG00000004985	-	95	80.612	Ciona_savignyi
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	91.461	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.152	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.152	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.152	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	91.152	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.848	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	83.642	Cynoglossus_semilaevis
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.465	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	84.156	Cyprinodon_variegatus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.230	ENSDARG00000012261	eftud2	100	83.333	Danio_rerio
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.844	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	90.844	Dasypus_novemcinctus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.255	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.255	Dipodomys_ordii
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	68.615	FBgn0039566	CG4849	100	68.000	Drosophila_melanogaster
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	92	98.913	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	Echinops_telfairi
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	74	92.537	ENSEBUG00000004047	-	85	92.537	Eptatretus_burgeri
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	91.461	Equus_asinus_asinus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	91.358	Equus_caballus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	73	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	81	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.230	ENSELUG00000017169	eftud2	100	83.128	Esox_lucius
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.358	Felis_catus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	89.609	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	89.609	Ficedula_albicollis
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.152	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.152	Fukomys_damarensis
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.568	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	84.259	Fundulus_heteroclitus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.333	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	83.951	Gadus_morhua
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	89.712	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	89.712	Gallus_gallus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.362	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	84.156	Gambusia_affinis
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.951	ENSGACG00000009163	eftud2	100	83.539	Gasterosteus_aculeatus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	91.461	Gorilla_gorilla
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.156	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	83.951	Haplochromis_burtoni
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.741	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	90.741	Heterocephalus_glaber_female
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.741	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	90.741	Heterocephalus_glaber_male
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.333	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	83.333	Hippocampus_comes
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.642	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	84.465	Ictalurus_punctatus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	85.597	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	88.306	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	95	91.205	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	91.205	Jaculus_jaculus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.951	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	83.539	Kryptolebias_marmoratus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	95	83.495	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	83.647	Labrus_bergylta
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	86.111	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	86.639	Latimeria_chalumnae
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.465	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	84.465	Lepisosteus_oculatus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.947	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	90.947	Loxodonta_africana
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	91.461	Macaca_fascicularis
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	93	100.000	Macaca_mulatta
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	91.461	Macaca_nemestrina
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	91.461	Mandrillus_leucophaeus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.568	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	84.362	Mastacembelus_armatus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.259	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	84.053	Maylandia_zebra
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	89.733	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	89.733	Meleagris_gallopavo
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.152	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	91.152	Mesocricetus_auratus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	91.461	Microcebus_murinus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.255	ENSMOCG00000009039	-	100	91.255	Microtus_ochrogaster
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	85	83.768	ENSMOCG00000017653	-	84	83.768	Microtus_ochrogaster
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	87	85.059	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	85.059	Mola_mola
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.152	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.152	Monodelphis_domestica
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	87	83.176	ENSMALG00000014501	eftud2	100	83.176	Monopterus_albus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.049	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	91.049	Mus_caroli
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.049	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	91.049	Mus_musculus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.049	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.049	Mus_pahari
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.049	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	91.049	Mus_spretus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	97	90.996	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	90.996	Mustela_putorius_furo
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	91.461	Myotis_lucifugus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.358	Nannospalax_galili
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.156	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	83.951	Neolamprologus_brichardi
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	97	89.373	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.373	Nomascus_leucogenys
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	87.551	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.551	Notamacropus_eugenii
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	93	69.828	ENSODEG00000003385	-	100	69.828	Octodon_degus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.535	ENSODEG00000018041	-	100	90.535	Octodon_degus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.259	ENSONIG00000000912	eftud2	100	84.053	Oreochromis_niloticus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.461	Oryctolagus_cuniculus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.745	ENSORLG00000003109	eftud2	100	83.745	Oryzias_latipes
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.642	ENSORLG00020009865	eftud2	100	83.642	Oryzias_latipes_hni
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.642	ENSORLG00015002611	eftud2	100	85.185	Oryzias_latipes_hsok
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	89.198	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	89.198	Otolemur_garnettii
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	91.358	Ovis_aries
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	91.358	Pan_paniscus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	91.461	Panthera_pardus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	91.461	Panthera_tigris_altaica
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.358	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	91.461	Papio_anubis
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	93	88.313	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	88.313	Pelodiscus_sinensis
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	77.160	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	77.160	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.152	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	91.152	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.255	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	91.255	Phascolarctos_cinereus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.362	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	84.156	Poecilia_formosa
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.362	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	84.156	Poecilia_latipinna
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.362	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	84.156	Poecilia_mexicana
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.021	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.021	Pongo_abelii
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	87.140	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.140	Procavia_capensis
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.358	Propithecus_coquereli
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	86.523	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	86.523	Pteropus_vampyrus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.156	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	83.951	Pundamilia_nyererei
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.951	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	84.671	Pygocentrus_nattereri
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.638	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	90.432	Rattus_norvegicus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	91.358	Rhinopithecus_bieti
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.358	Rhinopithecus_roxellana
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	89	36.095	YKL173W	SNU114	83	37.363	Saccharomyces_cerevisiae
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.461	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	95	91.097	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	91.097	Sarcophilus_harrisii
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.642	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	83.539	Scleropages_formosus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.465	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	84.259	Scophthalmus_maximus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.362	ENSSDUG00000022675	eftud2	96	91.511	Seriola_dumerili
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.465	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	84.259	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	90	98.792	ENSSARG00000008664	EFTUD2	90	98.792	Sorex_araneus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	89.095	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	89.095	Sphenodon_punctatus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.465	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	84.259	Stegastes_partitus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.255	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.255	Sus_scrofa
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	83	88.075	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	88.075	Taeniopygia_guttata
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.539	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	83.333	Takifugu_rubripes
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	78.996	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	78.689	Tetraodon_nigroviridis
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	85.905	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	85.905	Tupaia_belangeri
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	82.613	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	82.613	Tursiops_truncatus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.349	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.349	Ursus_americanus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	91.461	Ursus_maritimus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	91.461	Vulpes_vulpes
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	97	86.141	ENSXETG00000003394	eftud2	98	87.160	Xenopus_tropicalis
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	81	83.673	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	83.673	Xiphophorus_couchianus
ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.362	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	84.156	Xiphophorus_maculatus