EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOPRG00000016879 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ochotona_princeps
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 21199 bases
Position: chrGeneScaffold_2172:260721-281919
Accession: 7330
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOPRP00000015410	RRM_1	PF00076.22	3.3e-25	1	2
ENSOPRP00000015410	RRM_1	PF00076.22	3.3e-25	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOPRT00000016876	MSI1-201	876	-	ENSOPRP00000015410	292 (aa)	-	UPI000177785B

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOPRG00000016879	MSI1	63	61.842	ENSOPRG00000000872	-	64	61.842

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSG00000135097	MSI1	94	92.063	Homo_sapiens
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	78.413	ENSAPOG00000023458	-	91	78.413	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	ENSAPOG00000003191	MSI1	90	77.778	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	73.842	ENSAMEG00000013302	MSI1	96	73.842	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	75.238	ENSACIG00000017754	-	78	75.238	Amphilophus_citrinellus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	69.206	ENSAOCG00000009031	-	91	69.524	Amphiprion_ocellaris
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	ENSAOCG00000003804	MSI1	90	77.778	Amphiprion_ocellaris
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	78.413	ENSAPEG00000006857	-	76	78.413	Amphiprion_percula
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	ENSAPEG00000003245	MSI1	90	77.778	Amphiprion_percula
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	78.095	ENSATEG00000017059	MSI1	90	78.095	Anabas_testudineus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	74.684	ENSATEG00000023779	-	90	74.684	Anabas_testudineus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	89.524	ENSACAG00000002762	MSI1	91	89.524	Anolis_carolinensis
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSANAG00000027151	MSI1	94	92.063	Aotus_nancymaae
ENSOPRG00000016879	MSI1	83	87.500	ENSANAG00000027901	-	92	87.500	Aotus_nancymaae
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.460	ENSACLG00000011230	MSI1	90	77.460	Astatotilapia_calliptera
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	ENSACLG00000000117	-	96	77.778	Astatotilapia_calliptera
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	76.508	ENSAMXG00000038960	msi1	73	76.508	Astyanax_mexicanus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSBTAG00000009800	MSI1	96	92.063	Bos_taurus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSCJAG00000008578	MSI1	94	92.063	Callithrix_jacchus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	91.746	ENSCAFG00000010283	MSI1	91	91.746	Canis_familiaris
ENSOPRG00000016879	MSI1	99	91.611	ENSCAFG00020020585	MSI1	96	91.611	Canis_lupus_dingo
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	86.025	ENSCHIG00000024304	MSI1	95	86.025	Capra_hircus
ENSOPRG00000016879	MSI1	99	92.038	ENSTSYG00000033949	MSI1	91	92.038	Carlito_syrichta
ENSOPRG00000016879	MSI1	99	81.667	ENSCAPG00000003919	MSI1	85	81.667	Cavia_aperea
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSCPOG00000012361	MSI1	96	92.063	Cavia_porcellus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSCCAG00000035567	MSI1	94	92.063	Cebus_capucinus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSCATG00000030019	MSI1	94	92.063	Cercocebus_atys
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSCLAG00000011329	MSI1	96	92.063	Chinchilla_lanigera
ENSOPRG00000016879	MSI1	73	86.008	ENSCSAG00000002265	MSI1	89	86.008	Chlorocebus_sabaeus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	87.937	ENSCPBG00000011349	MSI1	96	87.937	Chrysemys_picta_bellii
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSCANG00000040651	MSI1	96	92.063	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSCGRG00001018883	Msi1	94	92.063	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSCGRG00000002191	Msi1	69	92.063	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.143	ENSCSEG00000008352	-	91	77.143	Cynoglossus_semilaevis
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	ENSCSEG00000005834	-	90	77.778	Cynoglossus_semilaevis
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	70.476	ENSCSEG00000011032	MSI1	96	70.476	Cynoglossus_semilaevis
ENSOPRG00000016879	MSI1	67	62.564	ENSCVAG00000017463	-	82	62.564	Cyprinodon_variegatus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	78.413	ENSCVAG00000009100	MSI1	91	78.413	Cyprinodon_variegatus
ENSOPRG00000016879	MSI1	87	70.833	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	84	70.833	Danio_rerio
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	74.286	ENSDARG00000010710	msi1	100	75.771	Danio_rerio
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	81.587	ENSDNOG00000005713	MSI1	87	81.587	Dasypus_novemcinctus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSDORG00000005610	Msi1	89	92.063	Dipodomys_ordii
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	87.619	ENSETEG00000004756	MSI1	96	87.619	Echinops_telfairi
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSEASG00005004736	MSI1	94	92.063	Equus_asinus_asinus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSECAG00000017526	MSI1	94	92.063	Equus_caballus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	74.390	ENSELUG00000023219	MSI1	87	74.390	Esox_lucius
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	73.016	ENSELUG00000023280	-	96	72.698	Esox_lucius
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSFCAG00000011007	MSI1	94	92.063	Felis_catus
ENSOPRG00000016879	MSI1	99	87.248	ENSFALG00000007574	MSI1	96	87.248	Ficedula_albicollis
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	91.746	ENSFDAG00000019586	MSI1	96	91.746	Fukomys_damarensis
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	78.730	ENSFHEG00000022446	MSI1	91	78.730	Fundulus_heteroclitus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	78.095	ENSFHEG00000003560	-	90	78.095	Fundulus_heteroclitus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	69.524	ENSGMOG00000017838	-	86	69.524	Gadus_morhua
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	75.873	ENSGMOG00000001006	MSI1	90	75.556	Gadus_morhua
ENSOPRG00000016879	MSI1	99	85.769	ENSGALG00000007227	MSI1	94	81.214	Gallus_gallus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.143	ENSGAFG00000021522	MSI1	90	77.143	Gambusia_affinis
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	68.730	ENSGAFG00000005860	-	85	68.730	Gambusia_affinis
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.143	ENSGACG00000012679	MSI1	91	77.143	Gasterosteus_aculeatus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	73.651	ENSGACG00000008674	-	91	73.651	Gasterosteus_aculeatus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	87.937	ENSGAGG00000016037	MSI1	91	87.937	Gopherus_agassizii
ENSOPRG00000016879	MSI1	99	91.694	ENSGGOG00000010328	MSI1	96	91.694	Gorilla_gorilla
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.460	ENSHBUG00000021921	MSI1	90	77.460	Haplochromis_burtoni
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	ENSHBUG00000011841	-	91	77.778	Haplochromis_burtoni
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	91.746	ENSHGLG00000012782	MSI1	94	91.746	Heterocephalus_glaber_female
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	91.746	ENSHGLG00100016848	MSI1	96	91.746	Heterocephalus_glaber_male
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	76.825	ENSHCOG00000012067	-	76	91.453	Hippocampus_comes
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	75.873	ENSHCOG00000012019	MSI1	95	75.873	Hippocampus_comes
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	75.873	ENSIPUG00000001976	msi1	91	75.873	Ictalurus_punctatus
ENSOPRG00000016879	MSI1	99	91.611	ENSSTOG00000009799	MSI1	96	91.611	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSJJAG00000010463	Msi1	94	92.063	Jaculus_jaculus
ENSOPRG00000016879	MSI1	98	75.728	ENSJJAG00000010643	-	90	75.405	Jaculus_jaculus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.460	ENSKMAG00000011251	MSI1	90	77.460	Kryptolebias_marmoratus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	75.238	ENSKMAG00000019877	-	96	75.238	Kryptolebias_marmoratus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.143	ENSLBEG00000001375	-	90	77.143	Labrus_bergylta
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	ENSLBEG00000008789	MSI1	91	77.778	Labrus_bergylta
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	79.365	ENSLACG00000018287	MSI1	96	79.365	Latimeria_chalumnae
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	80.757	ENSLAFG00000009412	MSI1	96	80.757	Loxodonta_africana
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSMFAG00000001798	MSI1	96	92.063	Macaca_fascicularis
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSMMUG00000031527	MSI1	92	92.063	Macaca_mulatta
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSMNEG00000040034	MSI1	94	92.063	Macaca_nemestrina
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSMLEG00000003921	MSI1	96	92.063	Mandrillus_leucophaeus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.143	ENSMAMG00000002279	MSI1	90	77.143	Mastacembelus_armatus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	ENSMAMG00000018426	-	90	77.778	Mastacembelus_armatus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.460	ENSMZEG00005026892	MSI1	90	77.460	Maylandia_zebra
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	ENSMZEG00005000340	-	91	77.778	Maylandia_zebra
ENSOPRG00000016879	MSI1	62	85.207	ENSMGAG00000016518	-	100	85.207	Meleagris_gallopavo
ENSOPRG00000016879	MSI1	71	89.520	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	89.520	Mesocricetus_auratus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSMICG00000033181	MSI1	94	92.063	Microcebus_murinus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	91.746	ENSMOCG00000002286	Msi1	94	91.746	Microtus_ochrogaster
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	67.619	ENSMMOG00000010492	MSI1	92	67.619	Mola_mola
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	74.286	ENSMMOG00000012265	-	92	74.286	Mola_mola
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	65.300	ENSMODG00000003189	-	96	65.300	Monodelphis_domestica
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	ENSMALG00000017889	MSI1	91	77.778	Monopterus_albus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	76.825	ENSMALG00000001426	-	96	76.825	Monopterus_albus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	91.429	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	94	91.429	Mus_caroli
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	91.429	ENSMUSG00000054256	Msi1	94	91.429	Mus_musculus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	91.111	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	94	91.111	Mus_pahari
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	91.429	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	94	91.429	Mus_spretus
ENSOPRG00000016879	MSI1	99	91.611	ENSMPUG00000003168	MSI1	96	91.611	Mustela_putorius_furo
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	83.230	ENSMLUG00000010313	MSI1	96	83.230	Myotis_lucifugus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSNGAG00000014508	Msi1	87	92.063	Nannospalax_galili
ENSOPRG00000016879	MSI1	97	67.623	ENSNBRG00000018012	MSI1	94	67.623	Neolamprologus_brichardi
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	ENSNBRG00000000841	-	91	77.778	Neolamprologus_brichardi
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	95.890	ENSNLEG00000015636	MSI1	96	95.890	Nomascus_leucogenys
ENSOPRG00000016879	MSI1	86	96.183	ENSMEUG00000015759	MSI1	84	96.183	Notamacropus_eugenii
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	ENSODEG00000006328	MSI1	96	92.063	Octodon_degus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	ENSONIG00000019452	-	90	77.778	Oreochromis_niloticus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	ENSONIG00000011182	MSI1	91	77.778	Oreochromis_niloticus
ENSOPRG00000016879	MSI1	99	91.611	ENSOCUG00000027716	MSI1	96	91.611	Oryctolagus_cuniculus
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	ENSORLG00000029593	MSI1	91	77.778	Oryzias_latipes
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	78.413	ENSORLG00000019978	-	91	78.413	Oryzias_latipes
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	78.413	ENSORLG00020001208	-	64	78.413	Oryzias_latipes_hni
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	ENSORLG00020008266	MSI1	96	74.603	Oryzias_latipes_hni
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	78.413	ENSORLG00015013672	-	68	74.603	Oryzias_latipes_hsok
ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	ENSORLG00015003916	MSI1	96	74.603	Oryzias_latipes_hsok
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ENSOPRG00000016879	MSI1	100	91.195	ENSOGAG00000003847	MSI1	94	91.195	Otolemur_garnettii
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