EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOPRG00000017231 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Ochotona_princeps
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3060 bases
Position: chrGeneScaffold_538:9637-12696
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOPRP00000015726	Ribosomal_S7	PF00177.21	2.4e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOPRT00000017230	-	615	-	ENSOPRP00000015726	204 (aa)	-	UPI0001775EBE

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSG00000083845	RPS5	76	100.000	Homo_sapiens
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSAPOG00000023785	rps5	50	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSAMEG00000007431	RPS5	50	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSACIG00000007319	rps5	50	100.000	Amphilophus_citrinellus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSAOCG00000010721	RPS5	50	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSATEG00000007911	rps5	50	100.000	Anabas_testudineus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSACAG00000010996	RPS5	50	100.000	Anolis_carolinensis
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSANAG00000020231	-	76	100.000	Aotus_nancymaae
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSACLG00000007312	rps5	50	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSAMXG00000029764	rps5	50	100.000	Astyanax_mexicanus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSBTAG00000015989	RPS5	50	100.000	Bos_taurus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSCJAG00000000304	RPS5	76	100.000	Callithrix_jacchus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSCAFG00000002366	RPS5	50	100.000	Canis_familiaris
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSCAFG00020014527	-	72	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSCAFG00020014863	-	76	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSCHIG00000019536	RPS5	50	100.000	Capra_hircus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSTSYG00000000076	-	76	100.000	Carlito_syrichta
ENSOPRG00000017231	-	50	86.364	ENSTSYG00000037300	-	73	86.364	Carlito_syrichta
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSCPOG00000023995	RPS5	50	100.000	Cavia_porcellus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSCCAG00000020744	-	76	100.000	Cebus_capucinus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSCATG00000030198	RPS5	76	100.000	Cercocebus_atys
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSCLAG00000000313	RPS5	50	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSOPRG00000017231	-	50	81.538	ENSCSAG00000009927	-	52	81.538	Chlorocebus_sabaeus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSCSAG00000001598	RPS5	50	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSCPBG00000013028	RPS5	50	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSOPRG00000017231	-	50	96.970	ENSCING00000002448	-	50	96.970	Ciona_intestinalis
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSCANG00000032591	RPS5	76	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOPRG00000017231	-	50	87.692	ENSCANG00000028788	-	56	87.692	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOPRG00000017231	-	50	90.909	ENSCANG00000011369	-	63	90.909	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSCGRG00001014197	Rps5	50	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSCSEG00000011153	rps5	50	100.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSDNOG00000047505	-	50	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSDORG00000002165	-	50	100.000	Dipodomys_ordii
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSETEG00000013543	-	50	100.000	Echinops_telfairi
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSEASG00005020216	RPS5	50	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSELUG00000007527	RS5	50	100.000	Esox_lucius
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSFCAG00000027978	RPS5	76	100.000	Felis_catus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSFDAG00000010753	RPS5	50	100.000	Fukomys_damarensis
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSFHEG00000009134	rps5	50	100.000	Fundulus_heteroclitus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSGAFG00000002691	rps5	50	100.000	Gambusia_affinis
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSGACG00000002835	rps5	50	100.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSGAGG00000008180	RPS5	76	100.000	Gopherus_agassizii
ENSOPRG00000017231	-	50	94.444	ENSGGOG00000022061	-	76	94.444	Gorilla_gorilla
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSGGOG00000004258	RPS5	76	100.000	Gorilla_gorilla
ENSOPRG00000017231	-	50	80.303	ENSGGOG00000026021	-	73	80.303	Gorilla_gorilla
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSHBUG00000009305	rps5	50	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSHGLG00000007229	RPS5	50	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSHGLG00100013944	RPS5	50	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSHCOG00000007396	rps5	50	100.000	Hippocampus_comes
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSIPUG00000004835	rps5	76	100.000	Ictalurus_punctatus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSSTOG00000005935	-	50	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSJJAG00000002076	Rps5	50	100.000	Jaculus_jaculus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSKMAG00000012994	rps5	50	100.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSLBEG00000007150	RPS5	50	100.000	Labrus_bergylta
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSLBEG00000019288	rps5	53	100.000	Labrus_bergylta
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSLACG00000009935	RPS5	50	100.000	Latimeria_chalumnae
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSLAFG00000008734	RPS5	50	100.000	Loxodonta_africana
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSMFAG00000002766	RPS5	76	100.000	Macaca_fascicularis
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSMMUG00000008729	RPS5	76	100.000	Macaca_mulatta
ENSOPRG00000017231	-	50	94.444	ENSMMUG00000018997	-	51	94.444	Macaca_mulatta
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSMNEG00000039816	RPS5	76	100.000	Macaca_nemestrina
ENSOPRG00000017231	-	50	84.615	ENSMLEG00000040248	-	57	84.615	Mandrillus_leucophaeus
ENSOPRG00000017231	-	50	90.909	ENSMLEG00000035638	-	56	90.909	Mandrillus_leucophaeus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSMLEG00000028037	RPS5	76	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSMAMG00000002747	rps5	50	100.000	Mastacembelus_armatus
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ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSMAUG00000010731	Rps5	50	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSMICG00000016512	RPS5	76	100.000	Microcebus_murinus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSMOCG00000022992	-	50	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSMMOG00000014650	rps5	50	100.000	Mola_mola
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSMALG00000009648	rps5	50	100.000	Monopterus_albus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0029192	Rps5	50	100.000	Mus_caroli
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSMUSG00000012848	Rps5	50	100.000	Mus_musculus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	MGP_PahariEiJ_G0021054	Rps5	50	100.000	Mus_pahari
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0030268	Rps5	50	100.000	Mus_spretus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSNGAG00000015766	Rps5	50	100.000	Nannospalax_galili
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSNBRG00000018402	rps5	50	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSOPRG00000017231	-	50	81.579	ENSNLEG00000034909	-	79	81.579	Nomascus_leucogenys
ENSOPRG00000017231	-	50	94.444	ENSNLEG00000031782	-	73	94.444	Nomascus_leucogenys
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSODEG00000000899	-	50	100.000	Octodon_degus
ENSOPRG00000017231	-	50	87.692	ENSODEG00000018813	-	50	87.692	Octodon_degus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSONIG00000019659	rps5	50	100.000	Oreochromis_niloticus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSOCUG00000024505	RPS5	50	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSORLG00000022059	rps5	50	100.000	Oryzias_latipes
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSORLG00020008989	rps5	50	100.000	Oryzias_latipes_hni
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSORLG00015016306	rps5	50	100.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSOMEG00000008257	rps5	50	100.000	Oryzias_melastigma
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSOGAG00000013088	RPS5	50	100.000	Otolemur_garnettii
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSOARG00000003848	RPS5	50	100.000	Ovis_aries
ENSOPRG00000017231	-	50	83.784	ENSPPAG00000037379	-	57	83.784	Pan_paniscus
ENSOPRG00000017231	-	50	78.788	ENSPPAG00000029021	-	73	78.788	Pan_paniscus
ENSOPRG00000017231	-	50	94.444	ENSPPAG00000041919	-	76	94.444	Pan_paniscus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPPAG00000039568	RPS5	76	100.000	Pan_paniscus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPPRG00000003031	RPS5	76	100.000	Panthera_pardus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPTIG00000019819	RPS5	76	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPTRG00000011591	RPS5	76	100.000	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000017231	-	50	94.444	ENSPTRG00000051033	-	57	94.444	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000017231	-	50	94.444	ENSPTRG00000045716	-	76	94.444	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000017231	-	50	83.784	ENSPTRG00000051381	-	57	83.784	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000017231	-	50	78.462	ENSPTRG00000049806	-	72	78.462	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000017231	-	50	78.462	ENSPTRG00000045137	-	72	78.462	Pan_troglodytes
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPKIG00000011575	rps5	50	100.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPMGG00000000854	rps5	68	100.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPEMG00000015167	Rps5	50	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPCIG00000026774	RPS5	50	100.000	Phascolarctos_cinereus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPFOG00000002010	rps5	50	100.000	Poecilia_formosa
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPLAG00000009866	rps5	50	100.000	Poecilia_latipinna
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPMEG00000005285	rps5	50	100.000	Poecilia_mexicana
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPPYG00000010500	RPS5	50	100.000	Pongo_abelii
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPCAG00000011034	RPS5	50	100.000	Procavia_capensis
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPCOG00000016007	RPS5	76	100.000	Propithecus_coquereli
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPVAG00000013966	RPS5	50	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPNYG00000016183	rps5	50	100.000	Pundamilia_nyererei
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSPNAG00000014022	rps5	50	100.000	Pygocentrus_nattereri
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSRNOG00000019453	Rps5	50	100.000	Rattus_norvegicus
ENSOPRG00000017231	-	50	100.000	ENSRBIG00000027783	RPS5	76	100.000	Rhinopithecus_bieti
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ENSOPRG00000017231	-	50	84.615	ENSRROG00000039369	-	57	84.615	Rhinopithecus_roxellana
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