EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000000603 (Gene tree)
Gene ID: 101170420
Gene Symbol: cse1l
Alias: -
Full Name: chromosome segregation 1 like
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 25686 bases
Position: chr5:2550008-2575693
Accession: 101170420
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000000743	IBN_N	PF03810.19	1.7e-12	1	1
ENSORLP00000041429	IBN_N	PF03810.19	3.3e-12	1	1
ENSORLP00000039742	IBN_N	PF03810.19	3.4e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000029533	-	7473	XM_004068469	ENSORLP00000041429	971 (aa)	XP_004068517	UPI0002A4B8A1
ENSORLT00000040928	-	7395	-	ENSORLP00000039742	945 (aa)	-	-
ENSORLT00000000743	-	1680	-	ENSORLP00000000743	559 (aa)	-	H2L4P6

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSG00000124207	CSE1L	100	88.054	Homo_sapiens
ENSORLG00000000603	cse1l	100	95.057	ENSAPOG00000015943	cse1l	100	95.057	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.951	ENSAMEG00000013717	CSE1L	100	87.951	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000000603	cse1l	100	85.216	ENSACIG00000020004	cse1l	100	85.832	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	95.160	ENSAOCG00000004356	cse1l	100	95.160	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000000603	cse1l	100	95.263	ENSAPEG00000016588	cse1l	100	95.263	Amphiprion_percula
ENSORLG00000000603	cse1l	100	95.469	ENSATEG00000005414	cse1l	100	95.469	Anabas_testudineus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSAPLG00000010368	CSE1L	100	88.054	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.848	ENSACAG00000015951	CSE1L	100	87.848	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000000603	cse1l	100	85.891	ENSANAG00000023526	CSE1L	100	85.891	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000000603	cse1l	100	91.246	ENSACLG00000023214	cse1l	99	91.452	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000000603	cse1l	100	91.658	ENSAMXG00000016416	cse1l	100	91.658	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.848	ENSBTAG00000005957	CSE1L	100	87.848	Bos_taurus
ENSORLG00000000603	cse1l	99	30.341	WBGene00002079	xpo-2	100	30.341	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.157	ENSCJAG00000016296	CSE1L	100	88.157	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSCAFG00000011260	CSE1L	99	88.054	Canis_familiaris
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.333	ENSCAFG00020016114	CSE1L	99	87.333	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.745	ENSCHIG00000016579	CSE1L	100	87.745	Capra_hircus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSTSYG00000013400	CSE1L	100	88.054	Carlito_syrichta
ENSORLG00000000603	cse1l	100	78.888	ENSCAPG00000004349	-	100	78.888	Cavia_aperea
ENSORLG00000000603	cse1l	97	74.679	ENSCAPG00000000237	-	100	69.928	Cavia_aperea
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.951	ENSCPOG00000005554	-	100	87.951	Cavia_porcellus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	78.682	ENSCPOG00000023180	-	100	78.682	Cavia_porcellus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSCCAG00000014373	CSE1L	100	88.054	Cebus_capucinus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSCATG00000039153	CSE1L	100	88.054	Cercocebus_atys
ENSORLG00000000603	cse1l	100	85.891	ENSCLAG00000006169	CSE1L	100	85.891	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSCSAG00000014977	CSE1L	100	88.054	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	84.861	ENSCHOG00000004640	CSE1L	100	84.861	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.465	ENSCPBG00000026743	CSE1L	100	88.465	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000000603	cse1l	99	63.814	ENSCING00000002277	-	99	62.887	Ciona_intestinalis
ENSORLG00000000603	cse1l	99	62.461	ENSCSAVG00000003299	-	99	61.944	Ciona_savignyi
ENSORLG00000000603	cse1l	100	86.406	ENSCANG00000041300	CSE1L	100	86.406	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSCGRG00001005670	Cse1l	100	88.054	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSCGRG00000012164	Cse1l	100	88.054	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000000603	cse1l	100	93.100	ENSCSEG00000002471	cse1l	100	93.100	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000000603	cse1l	100	94.130	ENSCVAG00000004319	cse1l	100	94.130	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	90.937	ENSDARG00000006963	cse1l	100	90.937	Danio_rerio
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.951	ENSDNOG00000014906	CSE1L	100	87.951	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000000603	cse1l	91	90.981	ENSDORG00000013960	Cse1l	100	90.981	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000000603	cse1l	96	56.957	FBgn0022213	Cse1	99	51.373	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00000000603	cse1l	88	80.162	ENSEBUG00000011135	cse1l	92	80.404	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000000603	cse1l	99	88.748	ENSEASG00005023345	CSE1L	98	88.748	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.642	ENSECAG00000015543	CSE1L	97	87.642	Equus_caballus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	92.276	ENSELUG00000001309	cse1l	100	92.276	Esox_lucius
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSFCAG00000001446	CSE1L	100	88.054	Felis_catus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.157	ENSFALG00000012932	CSE1L	97	88.157	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.848	ENSFDAG00000005180	CSE1L	100	87.848	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000000603	cse1l	85	95.181	ENSFHEG00000005939	cse1l	92	95.181	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	90.525	ENSGMOG00000007944	cse1l	100	90.525	Gadus_morhua
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.157	ENSGALG00000004707	CSE1L	100	88.157	Gallus_gallus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	94.954	ENSGAFG00000021631	cse1l	100	94.954	Gambusia_affinis
ENSORLG00000000603	cse1l	100	94.645	ENSGACG00000000963	cse1l	100	94.645	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000000603	cse1l	97	88.335	ENSGAGG00000012815	CSE1L	99	88.335	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.951	ENSGGOG00000010875	CSE1L	100	87.951	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000000603	cse1l	100	94.851	ENSHBUG00000013599	cse1l	100	94.851	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.848	ENSHGLG00000009067	CSE1L	100	87.848	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000000603	cse1l	97	82.537	ENSHGLG00000014944	-	100	78.991	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000000603	cse1l	97	82.537	ENSHGLG00100014942	-	100	79.300	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.848	ENSHGLG00100001243	CSE1L	100	87.848	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000000603	cse1l	97	94.096	ENSHCOG00000005034	cse1l	97	93.843	Hippocampus_comes
ENSORLG00000000603	cse1l	100	91.349	ENSIPUG00000023752	cse1l	100	91.349	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.745	ENSSTOG00000003600	CSE1L	100	87.745	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.848	ENSJJAG00000016509	Cse1l	100	87.848	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	94.542	ENSKMAG00000021099	cse1l	100	94.542	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	94.130	ENSLBEG00000012480	cse1l	96	94.168	Labrus_bergylta
ENSORLG00000000603	cse1l	100	90.525	ENSLACG00000015970	CSE1L	100	90.525	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000000603	cse1l	100	92.585	ENSLOCG00000003099	cse1l	100	92.585	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	86.831	ENSLAFG00000006607	CSE1L	100	87.551	Loxodonta_africana
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSMFAG00000034230	CSE1L	100	88.054	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000000603	cse1l	100	85.500	ENSMMUG00000019636	CSE1L	100	85.500	Macaca_mulatta
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSMNEG00000031340	CSE1L	100	88.054	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000000603	cse1l	92	87.362	ENSMLEG00000042388	CSE1L	100	84.606	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	93.718	ENSMAMG00000023931	cse1l	100	93.718	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	94.748	ENSMZEG00005010674	cse1l	100	94.748	Maylandia_zebra
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSMAUG00000001362	Cse1l	100	88.054	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.745	ENSMICG00000001988	CSE1L	100	87.745	Microcebus_murinus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.951	ENSMOCG00000013597	Cse1l	100	87.951	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000000603	cse1l	96	94.063	ENSMMOG00000021787	cse1l	100	88.671	Mola_mola
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.848	ENSMODG00000016269	CSE1L	100	87.848	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000000603	cse1l	100	93.615	ENSMALG00000017385	cse1l	100	93.615	Monopterus_albus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.951	MGP_CAROLIEiJ_G0024698	Cse1l	100	87.951	Mus_caroli
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.848	ENSMUSG00000002718	Cse1l	100	87.848	Mus_musculus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.157	MGP_PahariEiJ_G0026140	Cse1l	100	88.157	Mus_pahari
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.848	MGP_SPRETEiJ_G0025618	Cse1l	100	87.848	Mus_spretus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.848	ENSMPUG00000017586	CSE1L	99	87.848	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000000603	cse1l	100	86.097	ENSMLUG00000008368	CSE1L	100	86.097	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.757	ENSNGAG00000001115	Cse1l	100	87.757	Nannospalax_galili
ENSORLG00000000603	cse1l	100	94.851	ENSNBRG00000005053	cse1l	100	94.851	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.024	ENSNLEG00000006945	CSE1L	100	87.024	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000000603	cse1l	73	85.326	ENSMEUG00000005658	-	73	78.667	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000000603	cse1l	90	86.016	ENSOPRG00000014530	CSE1L	90	86.016	Ochotona_princeps
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.848	ENSODEG00000006918	-	100	87.848	Octodon_degus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	94.954	ENSONIG00000018970	cse1l	100	94.954	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSOANG00000006402	CSE1L	99	88.054	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.449	ENSOCUG00000005459	CSE1L	100	87.449	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	89.392	ENSORLG00020007653	cse1l	100	90.937	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000000603	cse1l	100	99.821	ENSORLG00015003694	cse1l	100	99.821	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000000603	cse1l	100	97.219	ENSOMEG00000014357	cse1l	100	97.219	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000000603	cse1l	100	85.832	ENSOGAG00000002126	CSE1L	100	85.832	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.757	ENSOARG00000012031	CSE1L	100	87.757	Ovis_aries
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSPPAG00000038391	CSE1L	100	88.054	Pan_paniscus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSPPRG00000022681	CSE1L	100	88.054	Panthera_pardus
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSPTIG00000011919	CSE1L	99	88.054	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.054	ENSPTRG00000013599	CSE1L	100	88.054	Pan_troglodytes
ENSORLG00000000603	cse1l	100	85.170	ENSPANG00000026147	CSE1L	100	85.170	Papio_anubis
ENSORLG00000000603	cse1l	100	92.593	ENSPKIG00000024520	cse1l	100	92.593	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000000603	cse1l	100	88.568	ENSPSIG00000010864	CSE1L	99	88.568	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000000603	cse1l	68	82.275	ENSPMGG00000017602	cse1l	90	82.586	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSORLG00000000603	cse1l	100	87.951	ENSPCIG00000023472	CSE1L	100	87.951	Phascolarctos_cinereus
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