EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000001393 (Gene tree)
Gene ID: 101161427
Gene Symbol: tyw1
Alias: -
Full Name: S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 46300 bases
Position: chr13:3544615-3590914
Accession: 101161427
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000001727	Wyosine_form	PF08608.12	1.1e-26	1	1
ENSORLP00000035409	Wyosine_form	PF08608.12	1.2e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000001728	-	2091	-	ENSORLP00000001727	696 (aa)	-	H2L7B7
ENSORLT00000038256	-	3854	XM_011482222	ENSORLP00000035409	741 (aa)	XP_011480524	UPI0005CC17A0

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000001393	tyw1	98	65.139	ENSG00000198874	TYW1	98	66.575	Homo_sapiens
ENSORLG00000001393	tyw1	98	56.806	ENSG00000277149	TYW1B	98	58.964	Homo_sapiens
ENSORLG00000001393	tyw1	99	80.027	ENSAPOG00000014391	tyw1	100	79.627	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000001393	tyw1	99	75.627	ENSACIG00000007325	tyw1	99	79.184	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000001393	tyw1	99	78.232	ENSAOCG00000016792	tyw1	100	79.920	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000001393	tyw1	99	78.364	ENSAPEG00000015939	tyw1	100	80.053	Amphiprion_percula
ENSORLG00000001393	tyw1	90	77.566	ENSATEG00000006856	tyw1	94	77.566	Anabas_testudineus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.306	ENSANAG00000037051	-	98	65.055	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000001393	tyw1	99	80.321	ENSACLG00000018688	tyw1	100	79.357	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000001393	tyw1	99	70.492	ENSAMXG00000004157	tyw1	99	74.238	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	66.158	ENSBTAG00000008446	TYW1	98	67.265	Bos_taurus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.216	ENSCJAG00000004295	-	98	65.331	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	67.614	ENSCAFG00000010867	-	98	67.549	Canis_familiaris
ENSORLG00000001393	tyw1	92	63.775	ENSCAFG00020005367	-	99	62.734	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000001393	tyw1	98	66.436	ENSCHIG00000019510	-	98	67.403	Capra_hircus
ENSORLG00000001393	tyw1	88	64.297	ENSTSYG00000008236	-	98	65.284	Carlito_syrichta
ENSORLG00000001393	tyw1	86	62.226	ENSCAPG00000013569	-	100	63.396	Cavia_aperea
ENSORLG00000001393	tyw1	98	62.517	ENSCPOG00000011182	-	98	63.934	Cavia_porcellus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.306	ENSCCAG00000026643	-	98	65.608	Cebus_capucinus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.444	ENSCATG00000043677	-	98	65.884	Cercocebus_atys
ENSORLG00000001393	tyw1	98	63.686	ENSCLAG00000006321	-	98	63.973	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000001393	tyw1	89	68.140	ENSCSAG00000018274	-	98	69.835	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000001393	tyw1	52	81.624	ENSCHOG00000003801	-	55	81.624	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00000001393	tyw1	98	67.775	ENSCPBG00000014896	-	99	70.642	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000001393	tyw1	79	60.932	ENSCING00000004125	-	97	61.111	Ciona_intestinalis
ENSORLG00000001393	tyw1	89	55.673	ENSCSAVG00000005712	-	100	57.282	Ciona_savignyi
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.306	ENSCANG00000033209	-	98	65.608	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000001393	tyw1	66	80.990	ENSCGRG00001003679	Tyw1	89	74.222	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000001393	tyw1	99	76.542	ENSCSEG00000005810	tyw1	98	76.005	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000001393	tyw1	90	77.367	ENSCVAG00000001054	tyw1	96	77.367	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000001393	tyw1	99	71.646	ENSDARG00000062987	tyw1	95	74.278	Danio_rerio
ENSORLG00000001393	tyw1	98	65.417	ENSDNOG00000024165	-	98	66.667	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000001393	tyw1	95	57.622	ENSDORG00000014772	Tyw1	97	57.622	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000001393	tyw1	57	72.685	ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000001393	tyw1	98	65.833	ENSEASG00005008818	-	98	66.989	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.826	ENSECAG00000023164	-	98	64.774	Equus_caballus
ENSORLG00000001393	tyw1	55	77.551	ENSEEUG00000005950	-	56	77.551	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000001393	tyw1	99	70.789	ENSELUG00000008449	tyw1	98	72.265	Esox_lucius
ENSORLG00000001393	tyw1	98	66.525	ENSFCAG00000014262	-	98	66.619	Felis_catus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	63.231	ENSFALG00000013810	-	99	65.470	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000001393	tyw1	98	63.056	ENSFDAG00000013270	-	98	64.315	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000001393	tyw1	81	78.990	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	78.630	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.560	ENSGALG00000001110	-	98	66.713	Gallus_gallus
ENSORLG00000001393	tyw1	99	75.000	ENSGACG00000012692	tyw1	99	77.854	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	67.341	ENSGAGG00000022393	-	98	67.241	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000001393	tyw1	88	56.414	ENSGGOG00000001473	TYW1	98	58.218	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000001393	tyw1	99	80.054	ENSHBUG00000002640	tyw1	100	79.088	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000001393	tyw1	87	70.248	ENSHGLG00000012093	-	100	70.049	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000001393	tyw1	98	63.700	ENSHGLG00100011743	TYW1	98	64.828	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000001393	tyw1	99	70.100	ENSHCOG00000019949	tyw1	97	69.373	Hippocampus_comes
ENSORLG00000001393	tyw1	99	70.891	ENSIPUG00000016330	tyw1	96	75.035	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	63.978	ENSSTOG00000004067	-	90	65.746	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	63.128	ENSJJAG00000022959	Tyw1	98	64.615	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000001393	tyw1	100	78.439	ENSKMAG00000018599	tyw1	100	77.616	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000001393	tyw1	96	64.547	ENSLACG00000018917	tyw1	97	65.000	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000001393	tyw1	98	69.359	ENSLOCG00000004035	tyw1	95	70.474	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.722	ENSMFAG00000035457	-	98	66.298	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.722	ENSMMUG00000030374	-	98	66.298	Macaca_mulatta
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.583	ENSMNEG00000041992	-	98	69.835	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.583	ENSMLEG00000039741	-	98	66.022	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000001393	tyw1	97	80.764	ENSMAMG00000016089	tyw1	99	78.752	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000001393	tyw1	90	83.881	ENSMZEG00005024386	tyw1	99	83.482	Maylandia_zebra
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.738	ENSMGAG00000002176	-	98	66.804	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.812	ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	66.852	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	65.139	ENSMICG00000014374	-	99	66.436	Microcebus_murinus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.306	ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.713	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000001393	tyw1	99	73.926	ENSMMOG00000005064	tyw1	99	74.477	Mola_mola
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.958	ENSMODG00000025697	-	98	66.850	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000001393	tyw1	99	78.296	ENSMALG00000010238	tyw1	100	77.867	Monopterus_albus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.903	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	98	66.852	Mus_caroli
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.993	ENSMUSG00000056310	Tyw1	98	66.990	Mus_musculus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	65.406	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	98	66.667	Mus_pahari
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.714	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	98	66.574	Mus_spretus
ENSORLG00000001393	tyw1	92	69.325	ENSMPUG00000016191	-	97	69.124	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000001393	tyw1	98	62.397	ENSMLUG00000013582	-	98	63.973	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.944	ENSNGAG00000002742	Tyw1	98	67.837	Nannospalax_galili
ENSORLG00000001393	tyw1	93	82.132	ENSNBRG00000016996	tyw1	99	81.982	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.534	ENSNLEG00000013210	-	97	65.659	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000001393	tyw1	85	62.085	ENSOPRG00000008734	-	75	67.391	Ochotona_princeps
ENSORLG00000001393	tyw1	98	59.110	ENSODEG00000014729	-	98	60.729	Octodon_degus
ENSORLG00000001393	tyw1	99	79.172	ENSONIG00000005872	tyw1	100	78.075	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.714	ENSOCUG00000003173	-	98	65.934	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000001393	tyw1	100	98.420	ENSORLG00020019361	tyw1	100	98.777	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000001393	tyw1	100	98.520	ENSORLG00015008095	tyw1	100	98.520	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000001393	tyw1	91	69.220	ENSOGAG00000016555	-	99	65.101	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000001393	tyw1	98	66.253	ENSOARG00000010673	-	98	66.804	Ovis_aries
ENSORLG00000001393	tyw1	98	66.571	ENSPPRG00000004945	-	98	66.434	Panthera_pardus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	66.571	ENSPTIG00000019545	-	98	66.434	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000001393	tyw1	98	59.724	ENSPTRG00000023076	TYW1B	100	59.605	Pan_troglodytes
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.722	ENSPANG00000019053	-	98	65.746	Papio_anubis
ENSORLG00000001393	tyw1	99	67.339	ENSPKIG00000006545	tyw1	99	67.785	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000001393	tyw1	93	75.461	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	75.461	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.404	ENSPEMG00000008274	Tyw1	98	67.177	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000001393	tyw1	99	78.505	ENSPFOG00000015855	tyw1	100	78.371	Poecilia_formosa
ENSORLG00000001393	tyw1	99	78.296	ENSPLAG00000000838	tyw1	98	80.338	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000001393	tyw1	99	78.371	ENSPMEG00000019437	tyw1	100	78.238	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000001393	tyw1	98	75.646	ENSPREG00000018773	tyw1	99	75.136	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000001393	tyw1	98	65.090	ENSPPYG00000017514	TYW1	98	66.298	Pongo_abelii
ENSORLG00000001393	tyw1	98	51.528	ENSPCOG00000015294	-	98	53.159	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000001393	tyw1	99	80.455	ENSPNYG00000022381	tyw1	100	79.491	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000001393	tyw1	99	72.176	ENSPNAG00000009001	tyw1	99	75.242	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000001393	tyw1	98	63.961	ENSRNOG00000024352	Tyw1	98	66.252	Rattus_norvegicus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.861	ENSRBIG00000039619	-	98	66.575	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.722	ENSRROG00000039780	-	98	66.436	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00000001393	tyw1	92	40.881	YPL207W	-	76	40.578	Saccharomyces_cerevisiae
ENSORLG00000001393	tyw1	98	63.839	ENSSBOG00000025873	-	98	64.917	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.416	ENSSHAG00000010346	-	99	65.922	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00000001393	tyw1	99	70.464	ENSSFOG00015001054	tyw1	99	71.659	Scleropages_formosus
ENSORLG00000001393	tyw1	97	79.726	ENSSMAG00000020514	tyw1	100	78.552	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000001393	tyw1	99	80.000	ENSSDUG00000001552	tyw1	95	85.351	Seriola_dumerili
ENSORLG00000001393	tyw1	99	79.868	ENSSLDG00000003554	tyw1	100	79.603	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000001393	tyw1	98	65.775	ENSSPUG00000002715	-	98	65.326	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	65.556	ENSSSCG00000007733	-	98	66.483	Sus_scrofa
ENSORLG00000001393	tyw1	89	65.177	ENSTGUG00000003428	-	98	67.328	Taeniopygia_guttata
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ENSORLG00000001393	tyw1	88	81.709	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	80.510	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00000001393	tyw1	98	67.376	ENSUMAG00000015343	-	98	67.188	Ursus_maritimus
ENSORLG00000001393	tyw1	98	67.475	ENSVVUG00000016457	-	98	67.714	Vulpes_vulpes
ENSORLG00000001393	tyw1	99	66.164	ENSXETG00000010094	tyw1	99	68.033	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000001393	tyw1	99	76.542	ENSXMAG00000013125	tyw1	98	83.520	Xiphophorus_maculatus