EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000001577 (Gene tree)
Gene ID: 101157478
Gene Symbol: papolg
Alias: -
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 23611 bases
Position: chr15:7312022-7335632
Accession: 101157478
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000001961	PAP_RNA-bind	PF04926.15	6e-29	1	2
ENSORLP00000001961	PAP_RNA-bind	PF04926.15	6e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000001962	-	5453	XM_004076964	ENSORLP00000001961	834 (aa)	XP_004077012	H2L7Z4

Gene Model

Click here to download ENSORLG00000001577's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ola03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00000001577's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.439	ENSG00000115421	PAPOLG	100	86.325	Homo_sapiens
ENSORLG00000001577	papolg	100	87.321	ENSAPOG00000004798	papolg	100	87.440	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000001577	papolg	96	69.681	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	69.947	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000001577	papolg	89	81.402	ENSACIG00000010546	papolg	99	79.338	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000001577	papolg	100	87.679	ENSAOCG00000010254	papolg	100	87.799	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000001577	papolg	100	87.440	ENSAPEG00000006944	papolg	100	87.560	Amphiprion_percula
ENSORLG00000001577	papolg	100	88.517	ENSATEG00000009007	papolg	100	88.636	Anabas_testudineus
ENSORLG00000001577	papolg	87	65.282	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.328	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000001577	papolg	71	59.677	ENSACAG00000015048	-	100	59.512	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.000	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	69.854	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000001577	papolg	100	85.848	ENSACLG00000015592	papolg	100	86.316	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000001577	papolg	99	76.821	ENSAMXG00000004611	papolg	100	76.096	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000001577	papolg	96	70.013	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	69.485	Bos_taurus
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.306	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	70.120	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000001577	papolg	96	69.657	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	70.120	Canis_familiaris
ENSORLG00000001577	papolg	98	70.421	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	70.400	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000001577	papolg	96	69.749	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	69.221	Capra_hircus
ENSORLG00000001577	papolg	99	69.669	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	69.867	Carlito_syrichta
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.066	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	69.960	Cavia_porcellus
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.439	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	70.252	Cebus_capucinus
ENSORLG00000001577	papolg	81	80.172	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	80.172	Cercocebus_atys
ENSORLG00000001577	papolg	97	70.238	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	70.306	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.400	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	70.213	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000001577	papolg	86	68.398	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	68.468	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00000001577	papolg	59	64.706	ENSCING00000024664	-	92	64.706	Ciona_intestinalis
ENSORLG00000001577	papolg	58	64.948	ENSCSAVG00000009085	-	97	64.948	Ciona_savignyi
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.281	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	70.080	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000001577	papolg	87	70.485	ENSCGRG00001014951	Papolg	99	69.946	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000001577	papolg	87	70.485	ENSCGRG00000005552	-	99	69.946	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000001577	papolg	89	83.962	ENSCSEG00000000771	papolg	99	82.749	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000001577	papolg	100	84.714	ENSCVAG00000016602	papolg	96	94.477	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000001577	papolg	99	77.527	ENSDARG00000012141	papolg	100	76.862	Danio_rerio
ENSORLG00000001577	papolg	99	67.682	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	67.503	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000001577	papolg	52	84.919	ENSDORG00000016228	Papolg	100	84.919	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000001577	papolg	89	57.825	ENSETEG00000011815	PAPOLG	100	57.257	Echinops_telfairi
ENSORLG00000001577	papolg	53	72.798	ENSEBUG00000004020	papolg	91	72.798	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000001577	papolg	55	58.442	ENSEBUG00000005042	-	79	58.442	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000001577	papolg	96	69.525	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	69.789	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000001577	papolg	96	69.525	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	69.681	Equus_caballus
ENSORLG00000001577	papolg	89	63.151	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.701	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000001577	papolg	89	77.841	ENSELUG00000014497	papolg	99	77.228	Esox_lucius
ENSORLG00000001577	papolg	98	70.053	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	69.669	Felis_catus
ENSORLG00000001577	papolg	88	58.957	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	58.501	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000001577	papolg	98	70.410	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	69.634	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000001577	papolg	63	82.836	ENSFHEG00000019080	papolg	97	82.022	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000001577	papolg	89	76.716	ENSGMOG00000018772	papolg	92	92.168	Gadus_morhua
ENSORLG00000001577	papolg	87	62.115	ENSGALG00000007853	PAPOLG	99	62.636	Gallus_gallus
ENSORLG00000001577	papolg	100	85.377	ENSGAFG00000003263	papolg	100	85.495	Gambusia_affinis
ENSORLG00000001577	papolg	89	87.583	ENSGACG00000002718	papolg	100	87.450	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.321	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	70.120	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000001577	papolg	100	85.848	ENSHBUG00000004882	papolg	100	86.321	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000001577	papolg	88	70.400	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	70.565	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.503	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	70.667	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000001577	papolg	100	83.852	ENSHCOG00000006782	papolg	100	83.732	Hippocampus_comes
ENSORLG00000001577	papolg	99	77.748	ENSIPUG00000021642	papolg	100	77.584	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.238	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	70.053	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000001577	papolg	52	85.151	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	85.151	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000001577	papolg	100	85.919	ENSKMAG00000016439	papolg	100	85.680	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000001577	papolg	100	83.047	ENSLBEG00000023218	papolg	100	83.276	Labrus_bergylta
ENSORLG00000001577	papolg	96	64.058	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	64.048	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000001577	papolg	99	76.903	ENSLOCG00000016130	papolg	100	76.416	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000001577	papolg	99	70.106	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	97	86.331	Loxodonta_africana
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.040	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	70.252	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.040	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	70.252	Macaca_mulatta
ENSORLG00000001577	papolg	89	63.046	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	63.144	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000001577	papolg	89	69.880	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	70.080	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000001577	papolg	100	88.158	ENSMAMG00000010667	papolg	100	87.937	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000001577	papolg	100	85.848	ENSMZEG00005018140	papolg	100	86.316	Maylandia_zebra
ENSORLG00000001577	papolg	87	63.229	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	99	62.432	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00000001577	papolg	88	71.448	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	71.313	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000001577	papolg	99	69.761	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	69.826	Microcebus_murinus
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.728	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	70.277	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000001577	papolg	99	88.338	ENSMMOG00000008020	papolg	99	86.997	Mola_mola
ENSORLG00000001577	papolg	87	69.814	ENSMODG00000002160	PAPOLG	98	69.241	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000001577	papolg	100	86.842	ENSMALG00000007012	papolg	100	86.722	Monopterus_albus
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.806	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	85.748	Mus_caroli
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.542	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	85.748	Mus_musculus
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.277	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	70.147	Mus_pahari
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.277	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	85.748	Mus_spretus
ENSORLG00000001577	papolg	96	69.525	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	69.657	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000001577	papolg	97	70.828	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	70.365	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.277	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	69.749	Nannospalax_galili
ENSORLG00000001577	papolg	89	76.556	ENSNBRG00000011943	papolg	99	77.616	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000001577	papolg	52	84.651	ENSNLEG00000009507	-	100	84.651	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000001577	papolg	56	66.769	ENSMEUG00000013605	-	67	67.619	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000001577	papolg	89	69.577	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	69.261	Ochotona_princeps
ENSORLG00000001577	papolg	50	82.974	ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	82.974	Octodon_degus
ENSORLG00000001577	papolg	89	80.940	ENSONIG00000002985	papolg	100	80.671	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000001577	papolg	95	69.396	ENSOANG00000012403	PAPOLG	98	69.583	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00000001577	papolg	89	69.709	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	70.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000001577	papolg	100	99.520	ENSORLG00020002482	papolg	100	99.520	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000001577	papolg	100	99.760	ENSORLG00015008836	papolg	100	99.760	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000001577	papolg	100	94.982	ENSOMEG00000001406	papolg	100	94.624	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000001577	papolg	51	58.691	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	58.427	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000001577	papolg	99	69.444	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	69.867	Ovis_aries
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.455	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	70.252	Pan_paniscus
ENSORLG00000001577	papolg	98	70.317	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	70.066	Panthera_pardus
ENSORLG00000001577	papolg	98	70.185	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	69.934	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.455	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	70.252	Pan_troglodytes
ENSORLG00000001577	papolg	89	66.755	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	67.154	Papio_anubis
ENSORLG00000001577	papolg	95	75.926	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	75.176	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000001577	papolg	99	75.332	ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.816	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000001577	papolg	94	67.244	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	66.980	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000001577	papolg	87	71.120	ENSPEMG00000008960	-	99	70.525	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000001577	papolg	88	52.196	ENSPMAG00000002961	papolg	99	51.948	Petromyzon_marinus
ENSORLG00000001577	papolg	60	64.542	ENSPMAG00000004864	-	99	64.542	Petromyzon_marinus
ENSORLG00000001577	papolg	99	69.725	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.100	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000001577	papolg	100	85.630	ENSPFOG00000012909	papolg	100	85.461	Poecilia_formosa
ENSORLG00000001577	papolg	100	85.259	ENSPLAG00000018445	papolg	100	85.089	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000001577	papolg	100	84.824	ENSPMEG00000003961	papolg	100	85.412	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000001577	papolg	100	84.977	ENSPREG00000010358	papolg	100	84.706	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.040	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	69.721	Pongo_abelii
ENSORLG00000001577	papolg	87	63.795	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	63.501	Procavia_capensis
ENSORLG00000001577	papolg	89	63.697	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	63.926	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000001577	papolg	79	80.755	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	81.091	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00000001577	papolg	100	85.848	ENSPNYG00000006729	papolg	100	86.316	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000001577	papolg	99	78.146	ENSPNAG00000015521	papolg	100	77.748	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.542	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	70.013	Rattus_norvegicus
ENSORLG00000001577	papolg	89	65.733	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	64.768	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.281	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	69.272	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00000001577	papolg	89	70.133	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	70.385	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00000001577	papolg	92	69.391	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	69.114	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00000001577	papolg	89	65.952	ENSSFOG00015011874	papolg	100	65.287	Scleropages_formosus
ENSORLG00000001577	papolg	89	73.850	ENSSFOG00015002383	papolg	100	73.184	Scleropages_formosus
ENSORLG00000001577	papolg	68	93.531	ENSSMAG00000015598	papolg	100	82.373	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000001577	papolg	100	87.919	ENSSDUG00000000912	papolg	100	87.919	Seriola_dumerili
ENSORLG00000001577	papolg	100	87.799	ENSSLDG00000001217	papolg	100	87.799	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000001577	papolg	87	67.962	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	98	67.968	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00000001577	papolg	100	86.433	ENSSPAG00000009004	papolg	100	86.316	Stegastes_partitus
ENSORLG00000001577	papolg	99	70.185	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	70.439	Sus_scrofa
ENSORLG00000001577	papolg	64	72.180	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	72.180	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00000001577	papolg	89	81.818	ENSTRUG00000006410	papolg	99	81.342	Takifugu_rubripes
ENSORLG00000001577	papolg	99	78.191	ENSTNIG00000017106	papolg	100	77.660	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00000001577	papolg	97	63.745	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	63.915	Tupaia_belangeri
ENSORLG00000001577	papolg	96	66.093	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	66.490	Tursiops_truncatus
ENSORLG00000001577	papolg	97	69.456	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	70.336	Ursus_americanus
ENSORLG00000001577	papolg	95	70.296	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	70.604	Ursus_maritimus
ENSORLG00000001577	papolg	88	66.223	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	65.828	Vicugna_pacos
ENSORLG00000001577	papolg	96	69.789	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	70.053	Vulpes_vulpes
ENSORLG00000001577	papolg	89	67.277	ENSXETG00000002208	papolg	100	67.016	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000001577	papolg	60	95.210	ENSXCOG00000006611	papolg	73	95.210	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00000001577	papolg	67	92.629	ENSXMAG00000007383	papolg	96	92.629	Xiphophorus_maculatus