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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000001593 (Gene tree)
Gene ID: 101170031
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11182 bases
Position: chr12:2586656-2597837
Accession: 101170031
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000001976	ResIII	PF04851.15	1.1e-06	1	1
ENSORLP00000001974	ResIII	PF04851.15	1.1e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000001975	-	5995	XM_020707448	ENSORLP00000001974	1402 (aa)	XP_020563107	H2L806
ENSORLT00000001977	-	6077	-	ENSORLP00000001976	1364 (aa)	-	H2L808

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00000001593	sbno1	70	65.138	ENSORLG00000000913	si:ch73-63e15.2	65	64.399

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000001593	sbno1	99	74.782	ENSG00000139697	SBNO1	99	74.754	Homo_sapiens
ENSORLG00000001593	sbno1	82	92.708	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	92.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.344	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	74.947	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000001593	sbno1	100	85.331	ENSACIG00000008088	sbno1	99	85.261	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000001593	sbno1	100	89.773	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	89.986	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000001593	sbno1	100	89.702	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	89.915	Amphiprion_percula
ENSORLG00000001593	sbno1	100	89.858	ENSATEG00000006667	sbno1	100	89.858	Anabas_testudineus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.163	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.634	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000001593	sbno1	99	74.147	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	73.980	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000001593	sbno1	95	82.577	ENSANAG00000029958	-	96	82.941	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000001593	sbno1	100	83.618	ENSACLG00000024913	sbno1	100	83.476	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000001593	sbno1	100	80.979	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	80.922	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000001593	sbno1	100	75.193	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	75.193	Bos_taurus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	74.927	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	74.895	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.363	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	83.532	Canis_familiaris
ENSORLG00000001593	sbno1	95	80.325	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	80.325	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000001593	sbno1	95	82.852	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	82.852	Capra_hircus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.145	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.087	Carlito_syrichta
ENSORLG00000001593	sbno1	96	76.475	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	83.002	Cavia_aperea
ENSORLG00000001593	sbno1	95	83.002	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	83.002	Cavia_porcellus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	70.836	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	71.429	Cebus_capucinus
ENSORLG00000001593	sbno1	91	82.406	ENSCATG00000008239	SBNO1	99	82.406	Cercocebus_atys
ENSORLG00000001593	sbno1	95	83.002	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	83.002	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000001593	sbno1	82	81.288	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	81.373	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	69.480	ENSCHOG00000008814	SBNO1	99	69.480	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00000001593	sbno1	99	74.545	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	75.018	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000001593	sbno1	99	71.469	ENSCANG00000042688	-	99	71.217	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000001593	sbno1	95	81.441	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	81.441	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000001593	sbno1	95	81.441	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	81.441	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000001593	sbno1	100	87.216	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	87.509	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000001593	sbno1	100	89.276	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	89.631	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	80.000	ENSDARG00000099080	sbno1	99	80.569	Danio_rerio
ENSORLG00000001593	sbno1	99	77.917	ENSDNOG00000017147	SBNO1	95	80.000	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	67.913	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	80.251	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000001593	sbno1	93	72.013	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.013	Echinops_telfairi
ENSORLG00000001593	sbno1	77	61.588	ENSEBUG00000013823	sbno1	77	71.170	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000001593	sbno1	53	73.241	ENSEASG00005012595	-	92	73.343	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.145	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	75.762	Equus_caballus
ENSORLG00000001593	sbno1	81	77.049	ENSEEUG00000003793	SBNO1	82	77.049	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000001593	sbno1	100	82.566	ENSELUG00000002886	sbno1	99	82.873	Esox_lucius
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.345	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	75.018	Felis_catus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.018	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	75.617	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000001593	sbno1	100	74.489	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	74.278	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000001593	sbno1	100	88.920	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	88.770	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000001593	sbno1	94	84.575	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	83.973	Gadus_morhua
ENSORLG00000001593	sbno1	91	75.398	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.796	Gallus_gallus
ENSORLG00000001593	sbno1	100	89.481	ENSGAFG00000003960	sbno1	100	89.268	Gambusia_affinis
ENSORLG00000001593	sbno1	94	87.162	ENSGACG00000015633	sbno1	99	87.237	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000001593	sbno1	96	82.252	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	82.155	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000001593	sbno1	95	82.821	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	82.821	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000001593	sbno1	100	77.399	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	77.612	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000001593	sbno1	95	83.122	ENSHGLG00000014165	-	99	82.616	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000001593	sbno1	94	92.659	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	92.673	Hippocampus_comes
ENSORLG00000001593	sbno1	100	81.077	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	81.671	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000001593	sbno1	95	82.852	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	82.852	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000001593	sbno1	95	79.242	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	79.242	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	89.822	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	89.680	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000001593	sbno1	100	88.314	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	88.102	Labrus_bergylta
ENSORLG00000001593	sbno1	100	71.569	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.245	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000001593	sbno1	100	80.577	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.155	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	74.782	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	74.736	Loxodonta_africana
ENSORLG00000001593	sbno1	95	79.643	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	79.643	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000001593	sbno1	95	79.643	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	79.643	Macaca_mulatta
ENSORLG00000001593	sbno1	95	82.671	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	82.671	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000001593	sbno1	100	90.547	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	90.547	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.346	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	75.796	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00000001593	sbno1	52	73.249	ENSMAUG00000004834	-	99	73.352	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000001593	sbno1	95	79.673	ENSMICG00000006573	-	99	79.317	Microcebus_murinus
ENSORLG00000001593	sbno1	95	82.310	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	82.310	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000001593	sbno1	100	81.605	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	82.470	Mola_mola
ENSORLG00000001593	sbno1	99	74.690	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	74.876	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000001593	sbno1	100	89.007	ENSMALG00000001056	sbno1	100	89.362	Monopterus_albus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.328	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	91.228	Mus_caroli
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.309	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	91.228	Mus_musculus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.474	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	91.228	Mus_pahari
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.273	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	91.228	Mus_spretus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.581	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	75.246	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.236	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	74.684	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000001593	sbno1	95	82.913	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	83.497	Nannospalax_galili
ENSORLG00000001593	sbno1	100	84.117	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	84.259	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000001593	sbno1	94	79.134	ENSNLEG00000001502	SBNO1	98	79.134	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000001593	sbno1	64	70.625	ENSMEUG00000008768	-	93	71.875	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000001593	sbno1	99	74.579	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.228	Ochotona_princeps
ENSORLG00000001593	sbno1	95	83.183	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	83.183	Octodon_degus
ENSORLG00000001593	sbno1	100	88.423	ENSONIG00000015348	sbno1	100	88.565	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.399	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	74.143	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000001593	sbno1	100	99.287	ENSORLG00020015216	sbno1	100	99.287	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000001593	sbno1	100	99.643	ENSORLG00015002726	sbno1	100	99.643	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000001593	sbno1	100	96.291	ENSOMEG00000019313	sbno1	100	96.291	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000001593	sbno1	52	72.472	ENSOGAG00000010781	-	99	72.574	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000001593	sbno1	100	74.825	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.088	Ovis_aries
ENSORLG00000001593	sbno1	95	82.821	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	82.821	Pan_paniscus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.345	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.018	Panthera_pardus
ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.405	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.123	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000001593	sbno1	95	82.821	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	82.821	Pan_troglodytes
ENSORLG00000001593	sbno1	95	82.671	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	82.671	Papio_anubis
ENSORLG00000001593	sbno1	99	80.306	ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.269	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000001593	sbno1	99	74.511	ENSPSIG00000009572	-	99	74.701	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000001593	sbno1	95	71.896	ENSPSIG00000009256	-	99	72.353	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000001593	sbno1	95	82.130	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.130	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000001593	sbno1	99	74.818	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	74.859	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000001593	sbno1	100	89.694	ENSPFOG00000005069	sbno1	100	89.694	Poecilia_formosa
ENSORLG00000001593	sbno1	100	89.694	ENSPLAG00000015015	sbno1	100	89.694	Poecilia_latipinna
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ENSORLG00000001593	sbno1	100	89.062	ENSPREG00000017746	sbno1	100	89.062	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000001593	sbno1	99	74.982	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	74.947	Pongo_abelii
ENSORLG00000001593	sbno1	84	76.018	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	68.484	Procavia_capensis
ENSORLG00000001593	sbno1	95	82.696	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	82.696	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000001593	sbno1	87	83.499	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	83.499	Pteropus_vampyrus
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