EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000001943 (Gene tree)
Gene ID: 101172897
Gene Symbol: ireb2
Alias: -
Full Name: iron responsive element binding protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18741 bases
Position: chr6:10469274-10488014
Accession: 101172897
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000002417	Aconitase	PF00330.20	3.4e-153	1	2
ENSORLP00000002417	Aconitase	PF00330.20	3.4e-153	2	2
ENSORLP00000002417	Aconitase_C	PF00694.19	3.8e-37	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000002418	-	3248	XM_004069484	ENSORLP00000002417	1054 (aa)	XP_004069532	H2L978

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00000001943	ireb2	87	60.150	ENSORLG00000020656	aco1	99	60.150

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.601	ENSG00000136381	IREB2	99	68.601	Homo_sapiens
ENSORLG00000001943	ireb2	91	88.199	ENSAPOG00000015501	-	99	88.199	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	88.199	ENSAPOG00000016684	ireb2	99	88.948	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	88.199	ENSAPOG00000020564	ireb2	99	88.199	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	67.872	ENSAMEG00000012645	IREB2	99	67.872	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000001943	ireb2	91	88.981	ENSACIG00000012557	ireb2	99	88.981	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	88.981	ENSAOCG00000000407	ireb2	99	88.981	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000001943	ireb2	92	88.557	ENSAPEG00000009121	ireb2	99	88.557	Amphiprion_percula
ENSORLG00000001943	ireb2	91	84.823	ENSATEG00000021145	ireb2	99	84.823	Anabas_testudineus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	83.056	ENSATEG00000021210	ireb2	99	83.056	Anabas_testudineus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	67.705	ENSAPLG00000016388	IREB2	99	67.705	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.497	ENSANAG00000021994	IREB2	99	68.497	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000001943	ireb2	92	87.732	ENSACLG00000024688	ireb2	99	87.732	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000001943	ireb2	92	78.243	ENSAMXG00000008756	ireb2	100	78.243	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.640	ENSBTAG00000002504	IREB2	99	68.640	Bos_taurus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.640	ENSCJAG00000010259	IREB2	99	68.640	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.328	ENSCAFG00000001766	IREB2	99	68.328	Canis_familiaris
ENSORLG00000001943	ireb2	92	68.079	ENSCAFG00020021072	IREB2	99	69.528	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.847	ENSCHIG00000023111	IREB2	99	68.847	Capra_hircus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.111	ENSTSYG00000011729	IREB2	99	68.111	Carlito_syrichta
ENSORLG00000001943	ireb2	79	65.079	ENSCAPG00000011854	IREB2	99	65.088	Cavia_aperea
ENSORLG00000001943	ireb2	79	69.288	ENSCPOG00000013905	IREB2	99	69.288	Cavia_porcellus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.497	ENSCCAG00000021202	IREB2	99	68.497	Cebus_capucinus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.808	ENSCATG00000033462	IREB2	99	68.808	Cercocebus_atys
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.951	ENSCLAG00000008985	IREB2	99	68.951	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.808	ENSCSAG00000014904	IREB2	99	68.808	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	65.869	ENSCHOG00000004107	IREB2	99	65.869	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00000001943	ireb2	91	67.876	ENSCPBG00000024247	IREB2	99	68.985	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.705	ENSCANG00000029420	IREB2	99	68.705	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	67.913	ENSCGRG00001019234	Ireb2	99	67.913	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000001943	ireb2	91	67.913	ENSCGRG00000016786	Ireb2	99	67.913	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000001943	ireb2	92	82.371	ENSCSEG00000003080	ireb2	99	82.371	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000001943	ireb2	93	85.949	ENSCVAG00000010739	ireb2	98	85.949	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000001943	ireb2	92	75.640	ENSDARG00000021466	ireb2	99	75.640	Danio_rerio
ENSORLG00000001943	ireb2	89	68.410	ENSDNOG00000009614	IREB2	99	68.303	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000001943	ireb2	83	64.164	ENSDORG00000014339	Ireb2	99	60.166	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000001943	ireb2	68	71.951	ENSETEG00000012717	IREB2	74	71.951	Echinops_telfairi
ENSORLG00000001943	ireb2	91	69.199	ENSEASG00005015622	IREB2	99	69.199	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	69.199	ENSECAG00000016731	IREB2	98	72.363	Equus_caballus
ENSORLG00000001943	ireb2	85	66.556	ENSEEUG00000007999	IREB2	99	66.556	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000001943	ireb2	92	80.864	ENSELUG00000023666	ireb2	99	81.173	Esox_lucius
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.847	ENSFCAG00000001921	IREB2	99	68.847	Felis_catus
ENSORLG00000001943	ireb2	83	69.025	ENSFALG00000010640	IREB2	99	69.025	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.847	ENSFDAG00000009355	IREB2	99	68.847	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000001943	ireb2	93	86.308	ENSFHEG00000017905	ireb2	99	86.308	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	78.387	ENSGMOG00000009184	ireb2	99	78.387	Gadus_morhua
ENSORLG00000001943	ireb2	91	67.497	ENSGALG00000035462	IREB2	99	67.497	Gallus_gallus
ENSORLG00000001943	ireb2	93	84.347	ENSGAFG00000005145	ireb2	99	84.347	Gambusia_affinis
ENSORLG00000001943	ireb2	91	85.005	ENSGACG00000007341	ireb2	99	85.005	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	67.358	ENSGAGG00000006117	IREB2	95	67.358	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.601	ENSGGOG00000015650	IREB2	99	68.601	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000001943	ireb2	92	87.629	ENSHBUG00000007184	ireb2	99	87.629	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000001943	ireb2	91	69.367	ENSHGLG00000000783	Ireb2	99	69.367	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000001943	ireb2	91	69.367	ENSHGLG00100019429	Ireb2	99	69.367	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000001943	ireb2	90	82.632	ENSHCOG00000007424	ireb2	99	82.632	Hippocampus_comes
ENSORLG00000001943	ireb2	92	75.792	ENSIPUG00000014808	Ireb2	99	76.302	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.601	ENSSTOG00000009273	IREB2	99	68.601	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	63.344	ENSJJAG00000019768	Ireb2	99	63.344	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000001943	ireb2	93	87.221	ENSKMAG00000016020	ireb2	99	87.221	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000001943	ireb2	92	87.243	ENSLBEG00000020371	ireb2	99	87.243	Labrus_bergylta
ENSORLG00000001943	ireb2	91	62.462	ENSLACG00000001182	IREB2	99	62.462	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000001943	ireb2	93	75.841	ENSLOCG00000015029	ireb2	100	76.045	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.854	ENSLAFG00000012839	IREB2	99	68.854	Loxodonta_africana
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.808	ENSMFAG00000039630	IREB2	99	68.808	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.808	ENSMMUG00000045680	IREB2	99	68.808	Macaca_mulatta
ENSORLG00000001943	ireb2	91	66.839	ENSMNEG00000039698	IREB2	99	66.839	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.808	ENSMLEG00000031047	IREB2	99	68.808	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000001943	ireb2	92	85.773	ENSMAMG00000023095	ireb2	99	86.461	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000001943	ireb2	92	87.732	ENSMZEG00005010935	ireb2	99	87.732	Maylandia_zebra
ENSORLG00000001943	ireb2	91	67.565	ENSMGAG00000003688	IREB2	99	67.565	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.187	ENSMICG00000005757	IREB2	99	68.187	Microcebus_murinus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	67.809	ENSMOCG00000010784	Ireb2	99	67.809	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000001943	ireb2	91	86.929	ENSMMOG00000001385	ireb2	97	86.929	Mola_mola
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.847	ENSMODG00000011768	IREB2	99	68.847	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000001943	ireb2	91	85.151	ENSMALG00000015314	ireb2	99	85.151	Monopterus_albus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.536	MGP_CAROLIEiJ_G0032235	Ireb2	99	68.536	Mus_caroli
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.536	ENSMUSG00000032293	Ireb2	98	70.455	Mus_musculus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.470	MGP_PahariEiJ_G0015103	Ireb2	99	68.470	Mus_pahari
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.536	MGP_SPRETEiJ_G0033375	Ireb2	99	68.536	Mus_spretus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	69.055	ENSMPUG00000010978	IREB2	94	69.055	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000001943	ireb2	91	67.802	ENSMLUG00000006783	IREB2	99	67.802	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.991	ENSNGAG00000017333	Ireb2	99	68.991	Nannospalax_galili
ENSORLG00000001943	ireb2	92	87.629	ENSNBRG00000017676	ireb2	99	87.629	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.808	ENSNLEG00000008549	IREB2	99	68.808	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000001943	ireb2	68	75.728	ENSMEUG00000001630	-	74	75.728	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000001943	ireb2	91	65.349	ENSOPRG00000000340	IREB2	99	65.349	Ochotona_princeps
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.640	ENSODEG00000015993	IREB2	99	68.640	Octodon_degus
ENSORLG00000001943	ireb2	92	87.938	ENSONIG00000012838	ireb2	99	87.938	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.224	ENSOANG00000013218	-	98	68.224	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00000001943	ireb2	86	69.604	ENSOCUG00000009907	IREB2	99	69.604	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000001943	ireb2	98	99.027	ENSORLG00020000623	ireb2	99	99.597	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000001943	ireb2	92	99.588	ENSORLG00015014057	ireb2	98	99.588	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000001943	ireb2	92	96.186	ENSOMEG00000005120	ireb2	98	96.186	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000001943	ireb2	91	65.599	ENSOGAG00000010622	IREB2	99	65.599	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.318	ENSOARG00000000881	IREB2	99	68.318	Ovis_aries
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.808	ENSPPAG00000038956	IREB2	99	68.808	Pan_paniscus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.951	ENSPPRG00000003145	IREB2	99	68.951	Panthera_pardus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.744	ENSPTIG00000021418	IREB2	86	68.744	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.808	ENSPTRG00000007342	IREB2	99	68.808	Pan_troglodytes
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.808	ENSPANG00000015813	IREB2	99	68.808	Papio_anubis
ENSORLG00000001943	ireb2	92	75.334	ENSPKIG00000012755	ireb2	99	75.334	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000001943	ireb2	83	69.416	ENSPSIG00000009905	IREB2	98	69.416	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000001943	ireb2	91	82.952	ENSPMGG00000016828	ireb2	99	82.952	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.328	ENSPEMG00000020204	Ireb2	99	68.328	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000001943	ireb2	90	69.304	ENSPCIG00000019022	IREB2	86	69.304	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000001943	ireb2	93	87.245	ENSPFOG00000014509	ireb2	99	87.245	Poecilia_formosa
ENSORLG00000001943	ireb2	93	86.925	ENSPLAG00000002220	ireb2	99	86.925	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000001943	ireb2	93	87.245	ENSPMEG00000010284	ireb2	99	87.539	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000001943	ireb2	93	87.054	ENSPREG00000012857	ireb2	99	87.054	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000001943	ireb2	53	71.836	ENSPPYG00000006696	-	99	71.836	Pongo_abelii
ENSORLG00000001943	ireb2	82	69.403	ENSPCAG00000001992	IREB2	89	69.403	Procavia_capensis
ENSORLG00000001943	ireb2	91	68.394	ENSPCOG00000021988	IREB2	99	68.394	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000001943	ireb2	80	67.292	ENSPVAG00000014630	IREB2	86	67.292	Pteropus_vampyrus
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ENSORLG00000001943	ireb2	92	67.769	ENSRNOG00000013271	Ireb2	99	68.017	Rattus_norvegicus
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ENSORLG00000001943	ireb2	64	68.521	ENSSHAG00000017490	-	97	68.521	Sarcophilus_harrisii
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