EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000003109 (Gene tree)
Gene ID: 101157862
Gene Symbol: eftud2
Alias: -
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15509 bases
Position: chr8:5476552-5492060
Accession: 101157862
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000003876	GTP_EFTU	PF00009.27	5.8e-45	1	1
ENSORLP00000040970	GTP_EFTU	PF00009.27	2.2e-24	1	2
ENSORLP00000040970	GTP_EFTU	PF00009.27	2.2e-24	2	2
ENSORLP00000003876	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.4e-11	1	1
ENSORLP00000040970	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.5e-11	1	1
ENSORLP00000003876	EFG_IV	PF03764.18	1.2e-24	1	1
ENSORLP00000040970	EFG_IV	PF03764.18	1.3e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000003877	-	3700	XM_004071270	ENSORLP00000003876	971 (aa)	XP_004071318	H2LD77
ENSORLT00000039251	-	2868	-	ENSORLP00000040970	955 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00000003109's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ola03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00000003109's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00000003109	eftud2	86	37.500	ENSORLG00000015009	eef2b	99	37.500
ENSORLG00000003109	eftud2	87	36.884	ENSORLG00000004622	-	99	36.884

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.837	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	97.837	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	91.770	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000003109	eftud2	100	93.615	ENSACIG00000009096	eftud2	100	93.615	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000003109	eftud2	88	92.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	92.118	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.734	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	97.734	Amphiprion_percula
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.631	ENSATEG00000000457	eftud2	100	97.631	Anabas_testudineus
ENSORLG00000003109	eftud2	99	88.363	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.363	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.255	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.461	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.872	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.425	ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.425	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000003109	eftud2	100	93.961	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.961	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	91.564	Bos_taurus
ENSORLG00000003109	eftud2	99	71.074	WBGene00001166	eftu-2	99	70.661	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.872	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	91.770	Canis_familiaris
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.770	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.564	Capra_hircus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.872	Carlito_syrichta
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.461	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	91.461	Cavia_aperea
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.461	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.461	Cavia_porcellus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	91.872	Cebus_capucinus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.872	Cercocebus_atys
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.255	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.255	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.872	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000003109	eftud2	91	80.856	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.856	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.564	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000003109	eftud2	100	78.337	ENSCING00000009372	-	100	78.131	Ciona_intestinalis
ENSORLG00000003109	eftud2	99	78.345	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.953	Ciona_savignyi
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	91.872	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.564	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	91.564	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.734	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.734	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.219	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.219	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	93.718	ENSDARG00000012261	eftud2	100	93.718	Danio_rerio
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	91.564	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.667	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.667	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000003109	eftud2	100	75.282	FBgn0039566	CG4849	100	74.564	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00000003109	eftud2	92	97.826	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	Echinops_telfairi
ENSORLG00000003109	eftud2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	87.344	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	91.770	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.667	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	91.667	Equus_caballus
ENSORLG00000003109	eftud2	83	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	93.306	ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.100	Esox_lucius
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.667	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.667	Felis_catus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.564	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.461	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.461	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.425	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	97.425	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	95.057	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	95.057	Gadus_morhua
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.461	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.478	Gallus_gallus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	96.807	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	96.807	Gambusia_affinis
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.116	ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.116	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	91.872	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.322	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.322	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.358	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	91.358	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.358	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.358	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000003109	eftud2	100	95.473	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	94.753	Hippocampus_comes
ENSORLG00000003109	eftud2	100	93.615	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	93.615	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000003109	eftud2	91	92.905	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.710	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000003109	eftud2	95	93.587	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.587	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	96.704	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	96.704	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000003109	eftud2	95	97.300	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	Labrus_bergylta
ENSORLG00000003109	eftud2	100	92.585	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.585	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000003109	eftud2	100	93.821	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	93.718	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.667	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.667	Loxodonta_africana
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	91.872	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	91.872	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	91.872	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.528	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	97.528	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.425	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	97.425	Maylandia_zebra
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.273	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.273	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.667	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	91.667	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	91.872	Microcebus_murinus
ENSORLG00000003109	eftud2	92	74.944	ENSMOCG00000017653	-	90	74.944	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.667	ENSMOCG00000009039	-	100	91.667	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000003109	eftud2	88	98.471	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	98.471	Mola_mola
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.770	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000003109	eftud2	88	96.588	ENSMALG00000014501	eftud2	100	96.588	Monopterus_albus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	91.564	Mus_caroli
ENSORLG00000003109	eftud2	100	92.070	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	92.070	Mus_musculus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.564	Mus_pahari
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	91.564	Mus_spretus
ENSORLG00000003109	eftud2	97	91.314	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	91.314	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	91.770	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.564	Nannospalax_galili
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.322	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.322	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000003109	eftud2	97	89.798	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.798	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000003109	eftud2	100	88.066	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.066	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000003109	eftud2	100	83.745	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.745	Ochotona_princeps
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.358	ENSODEG00000018041	-	100	91.358	Octodon_degus
ENSORLG00000003109	eftud2	94	75.466	ENSODEG00000003385	-	100	75.575	Octodon_degus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.425	ENSONIG00000000912	eftud2	100	97.425	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.770	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	99.897	ENSORLG00020009865	eftud2	100	99.897	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000003109	eftud2	100	99.794	ENSORLG00015002611	eftud2	100	100.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000003109	eftud2	100	90.432	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	90.432	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	91.564	Ovis_aries
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	91.872	Pan_paniscus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	91.770	Panthera_pardus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	91.770	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.872	Pan_troglodytes
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	91.872	Papio_anubis
ENSORLG00000003109	eftud2	93	89.636	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.636	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000003109	eftud2	100	88.363	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	88.363	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	91.564	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	91.770	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	96.910	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	96.910	Poecilia_formosa
ENSORLG00000003109	eftud2	100	96.910	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	96.910	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000003109	eftud2	100	96.910	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	96.910	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000003109	eftud2	100	90.638	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.638	Pongo_abelii
ENSORLG00000003109	eftud2	100	88.066	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.066	Procavia_capensis
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.872	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000003109	eftud2	100	87.346	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.346	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.322	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	97.322	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000003109	eftud2	100	94.439	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.439	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.967	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.967	Rattus_norvegicus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	91.770	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.770	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00000003109	eftud2	97	33.797	YKL173W	SNU114	91	34.644	Saccharomyces_cerevisiae
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.872	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00000003109	eftud2	95	93.478	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.478	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00000003109	eftud2	100	94.439	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	94.233	Scleropages_formosus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	96.704	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	96.704	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.734	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	97.734	Seriola_dumerili
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.837	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	97.837	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000003109	eftud2	100	83.951	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.951	Sorex_araneus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.461	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.461	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.734	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	97.734	Stegastes_partitus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.667	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.667	Sus_scrofa
ENSORLG00000003109	eftud2	83	92.413	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.413	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00000003109	eftud2	100	95.675	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	95.675	Takifugu_rubripes
ENSORLG00000003109	eftud2	100	90.974	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	90.974	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00000003109	eftud2	100	86.523	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.523	Tupaia_belangeri
ENSORLG00000003109	eftud2	91	89.671	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.671	Tursiops_truncatus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	90.638	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.638	Ursus_americanus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	91.770	Ursus_maritimus
ENSORLG00000003109	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	91.770	Vulpes_vulpes
ENSORLG00000003109	eftud2	96	91.979	ENSXETG00000003394	eftud2	98	92.927	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000003109	eftud2	81	97.959	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.959	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00000003109	eftud2	100	96.807	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	96.807	Xiphophorus_maculatus