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Description

Ensembl ID: ENSORLG00000003182 (Gene tree)
Gene ID: 101157470
Gene Symbol: tnpo1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 21493 bases
Position: chr12:5286016-5307508
Accession: 101157470
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000003966	IBN_N	PF03810.19	7.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000003967	-	2322	XM_011481493	ENSORLP00000003966	773 (aa)	XP_011479795	H2LDG2

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00000003182	tnpo1	65	83.600	ENSORLG00000011763	TNPO2	99	83.400
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	86.417	ENSORLG00000010363	tnpo2	87	86.287

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSG00000083312	TNPO1	87	92.737	Homo_sapiens
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.536	ENSAPOG00000003453	tnpo1	87	97.536	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	90.886	ENSAMEG00000007147	TNPO1	86	91.784	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.280	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	97.280	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.536	ENSAOCG00000008154	tnpo1	87	97.536	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.536	ENSAPEG00000001112	tnpo1	87	97.536	Amphiprion_percula
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.887	ENSATEG00000010408	tnpo1	87	96.887	Anabas_testudineus
ENSORLG00000003182	tnpo1	98	88.542	ENSAPLG00000009619	-	84	89.376	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	93.774	ENSACAG00000009599	TNPO1	87	93.774	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	82.361	ENSANAG00000025351	-	86	82.361	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.218	ENSANAG00000022453	-	86	92.218	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	57.854	ENSANAG00000027118	-	84	61.772	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	95.703	ENSACLG00000027223	tnpo1	86	95.703	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	94.049	ENSAMXG00000009842	tnpo1	87	93.661	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	ENSBTAG00000007979	TNPO1	86	92.607	Bos_taurus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.348	ENSCJAG00000016409	TNPO1	86	92.348	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000003182	tnpo1	95	92.578	ENSCAFG00000008081	TNPO1	86	92.578	Canis_familiaris
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	90.104	ENSCAFG00020017397	TNPO1	86	89.883	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSCHIG00000023462	TNPO1	86	92.737	Capra_hircus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	88.687	ENSTSYG00000001871	TNPO1	84	91.340	Carlito_syrichta
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.218	ENSCCAG00000026472	TNPO1	87	92.218	Cebus_capucinus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSCATG00000043792	TNPO1	94	92.944	Cercocebus_atys
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.348	ENSCLAG00000016191	TNPO1	87	92.348	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSCSAG00000015616	TNPO1	86	92.737	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	83.724	ENSCHOG00000001746	TNPO1	91	83.724	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	93.645	ENSCPBG00000000260	TNPO1	82	93.645	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	75.676	ENSCSAVG00000010981	-	100	71.912	Ciona_savignyi
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSCANG00000004353	TNPO1	86	92.737	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	86	92.607	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000003182	tnpo1	95	92.693	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	86	92.693	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	95.071	ENSCSEG00000012674	tnpo1	87	95.071	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.757	ENSCVAG00000001010	tnpo1	87	96.757	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	93.912	ENSDARG00000035390	tnpo1	87	93.782	Danio_rerio
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	86.511	ENSDNOG00000006647	TNPO1	86	86.511	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000003182	tnpo1	92	92.857	ENSDORG00000006476	Tnpo1	86	92.847	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	58.366	FBgn0035693	CG8219	86	57.977	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00000003182	tnpo1	88	93.548	ENSETEG00000017805	TNPO1	79	93.548	Echinops_telfairi
ENSORLG00000003182	tnpo1	93	84.254	ENSEBUG00000001895	tnpo1	86	83.978	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSEASG00005018055	TNPO1	87	92.737	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSECAG00000024424	TNPO1	86	92.737	Equus_caballus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	87.234	ENSELUG00000002821	tnpo1	87	86.550	Esox_lucius
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSFCAG00000013181	TNPO1	87	92.737	Felis_catus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	93.515	ENSFALG00000010292	TNPO1	87	93.515	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.348	ENSFDAG00000013345	TNPO1	86	92.348	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.632	ENSFHEG00000019234	tnpo1	87	96.632	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.506	ENSGMOG00000000347	tnpo1	86	92.506	Gadus_morhua
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSGALG00000015014	TNPO1	89	92.737	Gallus_gallus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.248	ENSGAFG00000000943	tnpo1	87	96.248	Gambusia_affinis
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	95.331	ENSGACG00000015841	tnpo1	86	95.331	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	93.645	ENSGAGG00000013419	TNPO1	87	93.645	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSGGOG00000026800	TNPO1	87	92.737	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	79.016	ENSGGOG00000022535	-	86	79.016	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.017	ENSHBUG00000008068	tnpo1	87	97.017	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.348	ENSHGLG00000000970	-	86	92.348	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000003182	tnpo1	95	92.297	ENSHGLG00100017090	-	86	92.297	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000003182	tnpo1	96	70.929	ENSHGLG00100000963	-	84	70.161	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.866	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	84	92.866	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.239	ENSKMAG00000018195	tnpo1	87	96.239	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.516	ENSLBEG00000009521	tnpo1	93	96.516	Labrus_bergylta
ENSORLG00000003182	tnpo1	95	90.713	ENSLACG00000012199	TNPO1	86	90.713	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	94.553	ENSLOCG00000011092	tnpo1	84	94.553	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000003182	tnpo1	97	92.000	ENSLAFG00000011796	TNPO1	87	92.000	Loxodonta_africana
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSMFAG00000003636	TNPO1	86	92.737	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	ENSMMUG00000020923	TNPO1	87	92.597	Macaca_mulatta
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSMNEG00000044581	TNPO1	86	92.737	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSMLEG00000030740	TNPO1	86	92.737	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.406	ENSMAMG00000001357	tnpo1	87	97.406	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.266	ENSMZEG00005004913	tnpo1	87	97.266	Maylandia_zebra
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	98	92.571	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	88.586	ENSMICG00000008468	TNPO1	86	88.586	Microcebus_murinus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	86	92.607	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.654	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.654	Mola_mola
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	95.115	ENSMODG00000001721	TNPO1	69	95.115	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	95.720	ENSMALG00000009782	tnpo1	87	95.720	Monopterus_albus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.348	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	98	92.571	Mus_caroli
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	98	92.571	Mus_musculus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.477	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	98	92.571	Mus_pahari
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	98	92.571	Mus_spretus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSMPUG00000014387	TNPO1	86	92.737	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000003182	tnpo1	95	92.194	ENSMLUG00000016317	TNPO1	86	92.194	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	86	92.737	Nannospalax_galili
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.792	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	97.792	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSNLEG00000004572	TNPO1	87	92.737	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000003182	tnpo1	88	85.942	ENSOPRG00000012390	TNPO1	76	85.942	Ochotona_princeps
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.348	ENSODEG00000001771	TNPO1	86	92.348	Octodon_degus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.387	ENSONIG00000011151	tnpo1	86	96.387	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000003182	tnpo1	95	93.775	ENSOANG00000015785	TNPO1	90	93.775	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00000003182	tnpo1	95	85.541	ENSOCUG00000013318	TNPO1	86	85.135	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	99.610	ENSORLG00020011559	tnpo1	87	99.610	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	99.223	ENSORLG00015019113	tnpo1	87	99.223	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	98.316	ENSOMEG00000014567	tnpo1	87	98.316	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSOGAG00000000808	TNPO1	86	92.737	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	ENSOARG00000005038	TNPO1	72	92.607	Ovis_aries
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSPPAG00000042518	TNPO1	86	92.737	Pan_paniscus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSPPRG00000022336	TNPO1	87	92.737	Panthera_pardus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSPTIG00000018839	TNPO1	87	92.737	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSPTRG00000016972	TNPO1	86	92.737	Pan_troglodytes
ENSORLG00000003182	tnpo1	93	81.856	ENSPTRG00000047731	-	89	81.856	Pan_troglodytes
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSPANG00000006074	TNPO1	86	92.737	Papio_anubis
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	90.013	ENSPKIG00000019795	tnpo1	86	90.013	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	93.774	ENSPSIG00000014366	TNPO1	86	93.774	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.617	ENSPMGG00000017014	tnpo1	87	92.876	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000003182	tnpo1	95	92.693	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	86	92.693	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	94.034	ENSPCIG00000026080	TNPO1	89	94.034	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.641	ENSPFOG00000011447	tnpo1	87	96.641	Poecilia_formosa
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.641	ENSPLAG00000018696	tnpo1	87	96.641	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.147	ENSPMEG00000024121	tnpo1	87	97.147	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.507	ENSPREG00000020705	tnpo1	87	96.507	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	ENSPPYG00000015545	TNPO1	86	92.607	Pongo_abelii
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	ENSPCOG00000004254	TNPO1	86	92.737	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	ENSPVAG00000013051	TNPO1	86	92.607	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.762	ENSPNYG00000001522	tnpo1	87	96.762	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	93.402	ENSPNAG00000021484	tnpo1	87	93.402	Pygocentrus_nattereri
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ENSORLG00000003182	tnpo1	99	91.180	ENSXETG00000016812	tnpo1	86	90.532	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.632	ENSXMAG00000005440	tnpo1	87	96.632	Xiphophorus_maculatus